Joachim Lütken Weischenfeldt
Gruppeleder, Klinisk professor
Weischenfeldt Group
Københavns Universitet, BRIC, Ole Maaløes Vej 5
2200 København N
Medlem af:
- 2020
- Udgivet
Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing
Cortés-Ciriano, I., Lee, J. J. K., Xi, R., Jain, D., Jung, Y. L., Yang, L., Gordenin, D., Klimczak, L. J., Zhang, C. Z., Pellman, D. S., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B., Burns, K. H., Campbell, P. J., Chan, K. & 32 flere, , 6 feb. 2020, I: Nature Genetics.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data
Paczkowska, M., Barenboim, J., Sintupisut, N., Fox, N. S., Zhu, H., Abd-Rabbo, D., Mee, M. W., Boutros, P. C., Abascal, F., Amin, S. B., Bader, G. D., Beroukhim, R., Bertl, J., Boroevich, K. A., Brunak, S., Campbell, P. J., Carlevaro-Fita, J., Chakravarty, D., Chan, C. W. Y., Chen, K. & 30 flere, , 5 feb. 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 735.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes
Rheinbay, E., Nielsen, M. M., Abascal, F., Wala, J. A., Shapira, O., Tiao, G., Hornshøj, H., Hess, J. M., Juul, R. I., Lin, Z., Feuerbach, L., Sabarinathan, R., Madsen, T., Kim, J., Mularoni, L., Shuai, S., Lanzós, A., Herrmann, C., Maruvka, Y. E., Shen, C. & 31 flere, , feb. 2020, I: Nature. 578, 7793, s. 102-111 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Novel Gene Signature-Based Model Predicts Biochemical Recurrence-Free Survival in Prostate Cancer Patients after Radical Prostatectomy
Shi, R., Bao, X., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Schaefer, C., Rogowski, P., Schmidt-Hegemann, N., Unger, K., Lauber, K., Wang, X., Buchner, A., Stief, C., Schlomm, T., Belka, C. & Li, M., 2020, I: Cancers. 12, 1, s. 1-12 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes
Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Technical Working Group, P. T. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Biotechnology. 38, 3, s. 288-292 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis
Carlevaro-Fita, J., Lanzós, A., Feuerbach, L., Hong, C., Mas-Ponte, D., Pedersen, J. S., Johnson, R., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Brunak, Søren, 2020, I: Communications Biology. 3, 1, s. 1-16 56.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Clinical impact of clonal hematopoiesis in patients with lymphoma undergoing ASCT: a national population-based cohort study
Husby, S., Favero, F., Nielsen, C., Sørensen, B. S., Bæch, J., Grell, K., Hansen, J. W., Rodriguez-Gonzalez, F. G., Haastrup, E. K., Fischer-Nielsen, A., Andersen, P., Arboe, B., Sækmose, S. G., Hansen, P. B., Christiansen, I., Clasen-Linde, E., Meldgaard, L., Ebbesen, L. H., Segel, E. K., Josefsson, P. & 6 flere, , 2020, I: Leukemia. 34, s. 3256-3268 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Clonal hematopoiesis evolves from pretreatment clones and stabilizes after end of chemotherapy in patients with MCL
Eskelund, C. W., Husby, Simon, Favero, Francesco, Klausen, T. W., Rodriguez Gonzalez, Francisco G, Kolstad, A., Pedersen, L. B., Räty, R. K., Geisler, C. H., Jerkeman, M., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Grønbæk, Kirsten, 2020, I: Blood. 135, 22, s. 2000-2004Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Clonal hematopoiesis in elderly twins: concordance, discordance, and mortality
Hansen, Jakob Werner, Pedersen, D. A., Larsen, L. A., Husby, Simon, Clemmensen, S. B., Hjelmborg, J., Favero, Francesco, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Christensen, K. & Grønbæk, Kirsten, 2020, I: Blood. 135, 4, s. 261-268Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower
Shuai, S., Abascal, F., Amin, S. B., Bader, G. D., Bandopadhayay, P., Barenboim, J., Beroukhim, R., Bertl, J., Boroevich, K. A., Brunak, S., Campbell, P. J., Carlevaro-Fita, J., Chakravarty, D., Chan, C. W. Y., Chen, K., Choi, J. K., Deu-Pons, J., Dhingra, P., Diamanti, K., Feuerbach, L. & 32 flere, , 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 12 s., 734.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer
Akdemir, K. C., Le, V. T., Chandran, S., Li, Y., Verhaak, R. G., Beroukhim, R., Campbell, P. J., Chin, L., Dixon, J. R., Futreal, P. A., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B., Burns, K. H., Campbell, P. J., Chan, K. & 32 flere, , 2020, I: Nature Genetics. s. 294-305Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic footprints of activated telomere maintenance mechanisms in cancer
Sieverling, L., Hong, C., Koser, S. D., Ginsbach, P., Kleinheinz, K., Hutter, B., Braun, D. M., Cortés-Ciriano, I., Xi, R., Kabbe, R., Park, P. J., Eils, R., Schlesner, M., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B. & 32 flere, , 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 733.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterations
Zhang, Y., Chen, F., Fonseca, N. A., He, Y., Fujita, M., Nakagawa, H., Zhang, Z., Brazma, A., Amin, S. B., Awadalla, P., Bailey, P. J., Brazma, A., Brooks, A. N., Calabrese, C., Chateigner, A., Cortés-Ciriano, I., Craft, B., Craft, D., Creighton, C. J., Davidson, N. R. & 33 flere, , 2020, I: Nature Communications. 11, 1, s. 1-14 736.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of unique and shared mitochondrial DNA mutations in neurodegeneration and cancer by single-cell mitochondrial DNA structural variation sequencing (MitoSV-seq)
Jaberi, E., Tresse-Gommeaux, Emilie, Grønbæk, Kirsten, Weischenfeldt, Joachim Lütken & Issazadeh-Navikas, Shohreh, 2020, I: EBioMedicine. 57, s. 1-17 102868.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pan-cancer analysis of whole genomes
ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium, I. P. A. O. W. G. C., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Sidiropoulos, N., Brunak, Søren & Rodriguez Gonzalez, Francisco G, 2020, I: Nature. 578, 7793, s. 82-93 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition
Rodriguez-Martin, B., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Zamora, J., Supek, F., Demeulemeester, J., Santamarina, M., Ju, Y. S., Temes, J., Garcia-Souto, D., Detering, H., Li, Y., Rodriguez-Castro, J., Dueso-Barroso, A., Bruzos, A. L., Dentro, S. C., Blanco, M. G., Contino, G., Ardeljan, D., Tojo, M. & 32 flere, , 2020, I: Nature Genetics. 52, 3, s. 306-319 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes
Reyna, M. A., Haan, D., Paczkowska, M., Verbeke, L. P. C., Vazquez, M., Kahraman, A., Pulido-Tamayo, S., Barenboim, J., Wadi, L., Dhingra, P., Shrestha, R., Getz, G., Lawrence, M. S., Pedersen, J. S., Rubin, M. A., Wheeler, D. A., Brunak, S., Izarzugaza, J. M. G., Khurana, E., Marchal, K. & 32 flere, , 2020, I: Nature Communications. 11, 1, s. 1-17 729.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes
Li, Y., Roberts, N. D., Wala, J. A., Shapira, O., Schumacher, S. E., Kumar, K., Khurana, E., Waszak, S., Korbel, J. O., Haber, J. E., Imielinski, M., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B., Burns, K. H., Campbell, P. J. & 29 flere, , 2020, I: Nature. 578, 7793, s. 112-121 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples
Bailey, M. H., Meyerson, W. U., Dursi, L. J., Wang, L. B., Dong, G., Liang, W. W., Weerasinghe, A., Li, S., Kelso, S., Akbani, R., Anur, P., Bailey, M. H., Buchanan, A., Chiotti, K., Covington, K., Creason, A., Ding, L., Weischenfeldt, J., Brunak, S., Ding, L. & 4 flere, , 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 4748.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 3997200
Flest downloads
-
2750
downloads
Mammalian tissues defective in nonsense-mediated mRNA decay display highly aberrant splicing patterns
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
415
downloads
The landscape of genomic alterations across childhood cancers
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
253
downloads
The whole-genome landscape of medulloblastoma subtypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet