Jesper Velgaard Olsen

Jesper Velgaard Olsen

Professor, vicecenterleder, Professor

Medlem af:


    1. 2011
    2. Udgivet

      System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation

      Rigbolt, K. T. G., Prokhorova, T., Akimov, V., Løkkegaard, Jeanette, Johansen, P. T., Kratchmarova, I., Kassem, M. S. E., Mann, Matthias, Olsen, Jesper Velgaard & Blagoev, B., 2011, I: Science Signaling. 4, 164, s. rs3

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. 2010
    4. Udgivet

      Feasibility of large-scale phosphoproteomics with higher energy collisional dissociation fragmentation

      Nagaraj, N., D'Souza, R. C. J., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, M., 3 dec. 2010, I: Journal of Proteome Research. 9, 12, s. 6786-94 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Quantitative interaction proteomics and genome-wide profiling of epigenetic histone marks and their readers

      Vermeulen, M., Eberl, H. C., Matarese, F., Marks, H., Denissov, S., Butter, F., Lee, K. K., Olsen, Jesper Velgaard, Hyman, A. A., Stunnenberg, H. G. & Mann, M., 17 sep. 2010, I: Cell. 142, 6, s. 967-80 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Quantitative phosphoproteomics dissection of 7TM receptor signaling using full and biased agonists

      Christensen, G. L., Kelstrup, C., Lyngsø, C., Sarwar, U., Bøgebo, R., Sheikh, S. P., Gammeltoft, S., Olsen, Jesper Velgaard & Hansen, J. L., jul. 2010, I: Molecular and Cellular Proteomics. 9, 7, s. 1540-53 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      The phosphoproteome of toll-like receptor-activated macrophages

      Weintz, G., Olsen, Jesper Velgaard, Frühauf, K., Niedzielska, M., Amit, I., Jantsch, J., Mages, J., Frech, C., Dölken, L., Mann, M. & Lang, R., 8 jun. 2010, I: Molecular Systems Biology. 6, s. 371

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Yeast expression proteomics by high-resolution mass spectrometry

      Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 jan. 2010, I: Methods in Enzymology. 470, s. 259-80 22 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. MSQuant, an Open Source Platform for Mass Spectrometry-Based Quantitative Proteomics

      Mortensen, P., Gouw, J. W., Olsen, Jesper Velgaard, Ong, S., Rigbolt, K. T. G., Bunkenborg, J., Cox, J., Foster, L. J., Heck, A. J. R., Blagoev, B., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, jan. 2010, I: Journal of Proteome Research.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Quantitative phosphoproteomics reveals widespread full phosphorylation site occupancy during mitosis

      Olsen, Jesper Velgaard, Vermeulen, M., Santamaria, A., Kumar, C., Miller, M. L., Jensen, Lars Juhl, Gnad, F., Cox, J., Jensen, T. S., Nigg, E. A., Brunak, Søren & Mann, Matthias, 2010, I: Science Signaling. 3, 104, s. ra3 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. 2009
    12. A dual pressure linear ion trap orbitrap instrument with very high sequencing speed

      Olsen, Jesper Velgaard, Schwartz, J. C., Griep-Raming, J., Nielsen, Michael Lund, Damoc, E., Denisov, E., Lange, O., Remes, P., Taylor, D., Splendore, M., Wouters, E. R., Senko, M., Makarov, A., Mann, Matthias & Horning, S., 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2759-69 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. A practical guide to the MaxQuant computational platform for SILAC-based quantitative proteomics

      Cox, J., Matic, I., Hilger, M., Nagaraj, N., Selbach, M., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, M., 2009, I: Nature Protocols (Print Edition). 4, 5, s. 698-705 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      Global analysis of the yeast osmotic stress response by quantitative proteomics

      Soufi, B., Kelstrup, C. D., Stoehr, G., Fröhlich, F., Walther, T. C. & Olsen, Jesper Velgaard, 2009, I: Molecular BioSystems. 5, 11, s. 1337-46 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Global effects of kinase inhibitors on signaling networks revealed by quantitative phosphoproteomics

      Pan, C., Olsen, Jesper Velgaard, Daub, H. & Mann, Matthias, 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2796-808 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. High accuracy mass spectrometry in large-scale analysis of protein phosphorylation

      Olsen, Jesper Velgaard & Macek, B., 2009, I: Methods in Molecular Biology. 492, s. 131-42 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      High-accuracy identification and bioinformatic analysis of in vivo protein phosphorylation sites in yeast

      Gnad, F., de Godoy, L. M. F., Cox, J., Neuhauser, N., Ren, S., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Proteomics. 9, 20, s. 4642-4652 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Large-scale proteomics analysis of the human kinome

      Oppermann, F. S., Gnad, F., Olsen, Jesper Velgaard, Hornberger, R., Greff, Z., Kéri, G., Mann, M. & Daub, H., 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 7, s. 1751-64 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions

      Choudhary, Chunaram, Kumar, C., Gnad, F., Nielsen, Michael Lund, Rehman, M., Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Science. 325, 5942, s. 834-40 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Mislocalized activation of oncogenic RTKs switches downstream signaling outcomes

      Choudhary, Chunaram, Olsen, Jesper Velgaard, Brandts, C., Cox, J., Reddy, P. N. G., Böhmer, F. D., Gerke, V., Schmidt-Arras, D., Berdel, W. E., Müller-Tidow, C., Mann, Matthias & Serve, H., 2009, I: Molecular Cell. 36, 2, s. 326-39 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. Phosphorylation of histone H3 Thr-45 is linked to apoptosis

      Hurd, P. J., Bannister, A. J., Halls, K., Dawson, M. A., Vermeulen, M., Olsen, Jesper Velgaard, Ismail, H., Somers, J., Mann, M., Owen-Hughes, T., Gout, I. & Kouzarides, T., 2009, I: Journal of Biological Chemistry. 284, 24, s. 16575-83 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Proteomics strategy for quantitative protein interaction profiling in cell extracts

      Sharma, K., Weber, C., Bairlein, M., Greff, Z., Kéri, G., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard & Daub, H., 2009, I: Nature Methods. 6, 10, s. 741-4 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. 2008
    24. Identification of new chicken egg proteins by mass spectrometry-based proteomic analysis

      Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, MaĉEk, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, jun. 2008, I: World's Poultry Science Journal. 64, 2, s. 209-218 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. The serine/threonine/tyrosine phosphoproteome of the model bacterium Bacillus subtilis

      Macek, B., Mijakovic, I., Olsen, Jesper Velgaard, Gnad, F., Kumar, C., Jensen, P. R. & Mann, Matthias, feb. 2008, I: Molecular and Cellular Proteomics. 6, 4, s. 697-707 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Investigation of protein-tyrosine phosphatase 1B function by quantitative proteomics

      Mertins, P., Eberl, H. C., Renkawitz, J., Olsen, Jesper Velgaard, Tremblay, M. L., Mann, M., Ullrich, A. & Daub, H., 2008, I: Molecular and Cellular Proteomics. 7, 9, s. 1763-77 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Kinase-selective enrichment enables quantitative phosphoproteomics of the kinome across the cell cycle

      Daub, H., Olsen, Jesper Velgaard, Bairlein, M., Gnad, F., Oppermann, F. S., Körner, R., Greff, Z., Kéri, G., Stemmann, O. & Mann, M., 2008, I: Molecular Cell. 31, 3, s. 438-48 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    28. Multi-spectra peptide sequencing and its applications to multistage mass spectrometry

      Bandeira, N., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, M. & Pevzner, P. A., 2008, I: Bioinformatics. 24, 13, s. i416-23

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    29. Profiling the phospho-status of the BKCa channel alpha subunit in rat brain reveals unexpected patterns and complexity

      Yan, J., Olsen, Jesper Velgaard, Park, K., Li, W., Bildl, W., Schulte, U., Aldrich, R. W., Fakler, B. & Trimmer, J. S., 2008, I: Molecular and Cellular Proteomics. 7, 11, s. 2188-98 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    30. Quantitative phosphoproteome analysis of a mouse liver cell line reveals specificity of phosphatase inhibitors

      Pan, C., Gnad, F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2008, I: Proteomics. 8, 21, s. 4534-46 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    31. Ubc9 sumoylation regulates SUMO target discrimination

      Knipscheer, P., Flotho, A., Klug, H., Olsen, Jesper Velgaard, van Dijk, W. J., Fish, A., Johnson, E. S., Mann, M., Sixma, T. K. & Pichler, A., 2008, I: Molecular Cell. 31, 3, s. 371-82 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    32. 2007
    33. Nanoelectrospray peptide mapping revisited: Composite survey spectra allow high dynamic range protein characterization without LCMS on an orbitrap mass spectrometer

      Lu, A., Waanders, L. F., Almeida, R., Li, G., Allen, M., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Bonaldi, T. & Mann, Matthias, 1 dec. 2007, I: International Journal of Mass Spectrometry. 268, 2-3, s. 158-167 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    34. MAPU: Max-Planck Unified database of organellar, cellular, tissue and body fluid proteomes

      Zhang, Y., Zhang, Y., Adachi, J., Olsen, Jesper Velgaard, Shi, R., de Souza, G., Pasini, E., Foster, L. J., Macek, B., Zougman, A., Kumar, C., Wisniewski, J. R., Jun, W. & Mann, Matthias, jan. 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, Database issue, s. D771-9

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    35. A mass spectrometry-friendly database for cSNP identification

      Schandorff, S., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Blagoev, B., Zhang, Y., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 6, s. 465-6 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    36. Functional characterization of Rad18 domains for Rad6, ubiquitin, DNA binding and PCNA modification

      Notenboom, V., Hibbert, R. G., van Rossum-Fikkert, S. E., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, 17, s. 5819-30 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    37. Higher-energy C-trap dissociation for peptide modification analysis

      Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Lange, O., Makarov, A., Horning, S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 9, s. 709-12 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    38. Noncovalent interaction between Ubc9 and SUMO promotes SUMO chain formation

      Knipscheer, P., van Dijk, W. J., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: EMBO Journal. 26, 11, s. 2797-807 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    39. PHOSIDA (phosphorylation site database): management, structural and evolutionary investigation, and prediction of phosphosites

      Gnad, F., Ren, S., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Oroshi, M. & Mann, Matthias, 2007, I: Genome Biology. 8, 11, s. R250

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    40. Phosphoproteins of the chicken eggshell calcified layer

      Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, 2007, I: Proteomics. 7, 1, s. 106-15 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    41. Phosphoproteome analysis of E. coli reveals evolutionary conservation of bacterial Ser/Thr/Tyr phosphorylation

      Macek, B., Gnad, F., Soufi, B., Kumar, C., Olsen, Jesper Velgaard, Mijakovic, I. & Mann, Matthias, 2007, I: Molecular and Cellular Proteomics. 7, 2, s. 299-307 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    42. Quantitative proteomic assessment of very early cellular signaling events

      Dengjel, J., Akimov, V., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Mann, Matthias, Blagoev, B. & Andersen, J. S., 2007, I: Nature Biotechnology. 25, 5, s. 566-8 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    43. Quantitative proteomic profiling of membrane proteins from the mouse brain cortex, hippocampus, and cerebellum using the HysTag reagent: mapping of neurotransmitter receptors and ion channels

      Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, P. A., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2007, I: Brain Research. 1134, 1, s. 95-106 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    44. The low molecular weight proteome of Halobacterium salinarum

      Klein, C., Aivaliotis, M., Olsen, Jesper Velgaard, Falb, M., Besir, H., Scheffer, B., Bisle, B., Tebbe, A., Konstantinidis, K., Siedler, F., Pfeiffer, F., Mann, Matthias & Oesterhelt, D., 2007, I: Journal of Proteome Research. 6, 4, s. 1510-8 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    45. 2006
    46. Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks

      Olsen, Jesper Velgaard, Blagoev, B., Gnad, F., Macek, B., Kumar, C., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Cell. 127, 3, s. 635-48 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    47. In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes

      Shevchenko, A., Tomas, H., Havlis, J., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Nature Protocols (Print Edition). 1, 6, s. 2856-60 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    48. Proteomic analysis of the acid-soluble organic matrix of the chicken calcified eggshell layer

      Mann, K., Macek, B. & Olsen, Jesper Velgaard, 2006, I: Proteomics. 6, 13, s. 3801-10 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    49. Status of complete proteome analysis by mass spectrometry: SILAC labeled yeast as a model system

      de Godoy, L. M. F., Olsen, Jesper Velgaard, de Souza, G. A., Li, G., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 6, s. R50

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    50. The human urinary proteome contains more than 1500 proteins, including a large proportion of membrane proteins

      Adachi, J., Kumar, C., Zhang, Y., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 9, s. R80

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    51. Top-down protein sequencing and MS3 on a hybrid linear quadrupole ion trap-orbitrap mass spectrometer

      Macek, B., Waanders, L. F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Molecular and Cellular Proteomics. 5, 5, s. 949-58 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    52. 2005
    53. Parts per million mass accuracy on an Orbitrap mass spectrometer via lock mass injection into a C-trap

      Olsen, Jesper Velgaard, de Godoy, L. M. F., Li, G., Macek, B., Mortensen, P., Pesch, R., Makarov, A., Lange, O., Horning, S. & Mann, Matthias, 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 12, s. 2010-21 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    54. Proteomic mapping of brain plasma membrane proteins

      Nielsen, P. A., Olsen, Jesper Velgaard, Podtelejnikov, A. V., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 4, s. 402-8 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    55. Quantitative phosphoproteomics applied to the yeast pheromone signaling pathway

      Gruhler, A., Olsen, Jesper Velgaard, Mohammed, S., Mortensen, P., Faergeman, N. J., Mann, Matthias & Jensen, O. N., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 3, s. 310-27 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    56. SUMO modification of the ubiquitin-conjugating enzyme E2-25K

      Pichler, A., Knipscheer, P., Oberhofer, E., van Dijk, W. J., Körner, R., Olsen, Jesper Velgaard, Jentsch, S., Melchior, F. & Sixma, T. K., 2005, I: Nature Structural and Molecular Biology. 12, 3, s. 264-9 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    57. 2004
    58. HysTag--a novel proteomic quantification tool applied to differential display analysis of membrane proteins from distinct areas of mouse brain

      Olsen, Jesper Velgaard, Andersen, J. R., Nielsen, P. A., Nielsen, Michael Lund, Figeys, D., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., jan. 2004, I: Molecular and Cellular Proteomics. 3, 1, s. 82-92 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 9925376