Junil Kim
Gæsteforsker
Won Group
Ole Maaløes Vej 5, 2200 København N.
- 2023
- Udgivet
CellNeighborEX: deciphering neighbor-dependent gene expression from spatial transcriptomics data
Kim, H., Kumar, A., Lövkvist, Cecilia, Palma, A. M., Martin, Patrick Cédric Nathan, Kim, Junil, Bhoopathi, P., Trevino, J., Fisher, P., Madan, E., Gogna, R. & Won, K. J., 2023, I: Molecular Systems Biology. 19, 11, 18 s., e11670.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Neighbor-specific gene expression revealed from physically interacting cells during mouse embryonic development
Kim, Junil, Rothová, M. M., Madan, E., Rhee, S., Weng, Guangzheng, Palma, A. M., Liao, Linbu, David, E., Amit, I., Hajkarim, M. C., Vudatha, V., Gutiérrez-García, A., Moreno, E., Winn, R., Trevino, J., Fisher, P. B., Brickman, Joshua Mark, Gogna, R. & Won, K. J., 2023, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 120, 2, 10 s., e2205371120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
A PDX1 cistrome and single-cell transcriptome resource of the developing pancreas
Yang, X., Raum, J. C., Kim, Junil, Yu, R., Yang, J., Rice, G., Li, C., Won, K., Stanescu, D. E. & Stoffers, D. A., 2022, I: Development. 149, 13, 8 s., 200432.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Neighbor-specific gene expression revealed from physically interacting cells during mouse embryonic development
Kim, Junil, Rothová, M. M., Liao, Linbu, Rhee, S., Weng, Guangzheng, David, E., Amit, I., Hajkarim, M. C., Brickman, Joshua Mark & Won, K. J., 2022, Cold Spring Harbor Laboratory, 26 s. (bioRxiv).Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Systemic approaches using single cell transcriptome reveal that C/EBPγ regulates autophagy under amino acid starved condition
Kim, D., Kim, Junil, Yu, Y. S., Kim, Y. R., Baek, S. H. & Won, K. J., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 13, s. 7298-7309 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Decreased KATPChannel Activity Contributes to the Low Glucose Threshold for Insulin Secretion of Rat Neonatal Islets
Yang, J., Hammoud, B., Li, C., Ridler, A., Yau, D., Kim, Junil, Won, K. J., Stanley, C. A., Hoshi, T. & Stanescu, D. E., 2021, I: Endocrinology. 162, 9, 14 s., bqab121.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
TENET: Gene network reconstruction using transfer entropy reveals key regulatory factors from single cell transcriptomic data
Kim, Junil, Jakobsen, S. T., Natarajan, K. N. & Won, K. J., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 1, e1.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
VeTra: a tool for trajectory inference based on RNA velocity
Weng, Guangzheng, Kim, Junil & Won, K. J., 2021, I: Bioinformatics. 37, 20, s. 3509-3513 btab364.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
A Critical Role for Estrogen-Related Receptor Signaling in Cardiac Maturation
Sakamoto, T., Matsuura, T. R., Wan, S., Ryba, D. M., Kim, Junil, Won, K. J., Lai, L., Petucci, C., Petrenko, N., Musunuru, K., Vega, R. B. & Kelly, D. P., 2020, I: Circulation Research. 126, 12, s. 1685-1702Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SHARP: hyperfast and accurate processing of single-cell RNA-seq data via ensemble random projection
Wan, S., Kim, Junil & Won, K. J., 2020, I: Genome Research. 30, 2, s. 205-213Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 196990335
Flest downloads
-
95
downloads
CellBIC: bimodality-based top-down clustering of single-cell RNA sequencing data reveals hierarchical structure of the cell type
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
61
downloads
SHARP: hyperfast and accurate processing of single-cell RNA-seq data via ensemble random projection
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
27
downloads
Neighbor-specific gene expression revealed from physically interacting cells during mouse embryonic development
Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
Udgivet