Kim Sneppen
Professor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- 2024
- Udgivet
Diversity and ecotones in a model ecosystems of sessile species
Hofer, M. & Sneppen, Kim, 20 feb. 2024, I: Physical Review E. 109, 2, 7 s., 024309.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The dynamics of phage predation on a microcolony
Eriksen, R. S., Larsen, Frej Andreas Nøhr, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2024, I: Biophysical Journal. 123, 2, s. 147-156 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
The counterintuitive implications of superspreading diseases
Nielsen, B. F., Sneppen, Kim & Simonsen, L., 31 okt. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 3 s., 6954.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetic switching with asymmetric bridging interactions
Skjegstad, L. E. J., Nickels, Jan Fabio, Sneppen, Kim & Kirkegaard, Julius Bier, 20 jun. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 12, s. 2421-2429 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tradeoff between speed and reproductive number in pathogen evolution
Eilersen, Andreas Thomas, Nielsen, Bjarke Frost & Sneppen, Kim, 12 jun. 2023, I: Physical Review Research. 5, 2, 8 s., 023003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainable diversity of phage-bacteria systems
Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Host heterogeneity and epistasis explain punctuated evolution of SARS-CoV-2
Nielsen, Bjarke Frost, Saad-roy, C. M., Li, Y., Sneppen, Kim, Simonsen, L., Viboud, C., Levin, S. A., Grenfell, B. T. & Morozov, A. V. (red.), 15 feb. 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 2, 24 s., e1010896.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Jag1-Notch cis-interaction determines cell fate segregation in pancreatic development
sgk681, sgk681, Seymour, Philip Allan, Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Egeskov-Madsen, A. L. R., Jørgensen, Mette Christine, Jensen, Mogens Høgh & Serup, Palle, 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 348.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Emerging diversity in a population of evolving intransitive dice
Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 17 nov. 2022, I: Physical Review E. 106, 5, 6 s., 054409.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lockdowns exert selection pressure on overdispersion of SARS-CoV-2 variants
Nielsen, Bjarke Frost, Eilersen, Andreas Thomas, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 2 sep. 2022, I: Epidemics. 40, 7 s., 100613.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems
Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pancreatic alpha and beta cells are globally phase-locked
Ren, H., Li, Y., Han, C., Yu, Y., Shi, B., Peng, X., Wu, S., Yang, X., Sneppen, Kim, Chen, L., Tang, C. & Zhang, T., 28 jun. 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 16 s., 3721.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protection of bacteriophage-sensitive Escherichia coli by lysogens
Brown, Stanley, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2 apr. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 119, 4, e2106005119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatial model of Ebola outbreaks contained by behavior change
Halvorsen, G. S., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 14 mar. 2022, I: Plos One. 17, 3, 11 s., e0264425.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of networks of shared restriction-modification systems in phage-bacteria ecosystems
Eriksen, R. S., Malhotra, N., Seshasayee, A. S. N., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2022, I: Journal of Biosciences. 47, 3, 19 s., 38.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The transcription factor Atf1 lowers the transition barrier for nucleosome-mediated establishment of heterochromatin
Nickels, Jan Fabio, Della-Rosa, M. E., Miguelez Goyeneche, I., Charlton, Sebastian Jespersen, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2022, I: Cell Reports. 39, 7, 17 s., 110828.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Superspreading quantified from bursty epidemic trajectories
Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 16 dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 7 s., 24124.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differences in social activity increase efficiency of contact tracing
Nielsen, Bjarke Frost, Sneppen, Kim, Simonsen, L. & Mathiesen, Joachim, 2 okt. 2021, I: European Physical Journal B. 94, 10, 11 s., 209.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The COVID-19 pandemic: key considerations for the epidemic and its control
Ørskov, S., Nielsen, Bjarke Frost, Føns, S., Sneppen, Kim & Simonsen, L., jul. 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 408-420 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Superspreading of airborne pathogens in a heterogeneous world
Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 maj 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 9 s., 11191.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts
Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Overdispersion in COVID-19 increases the effectiveness of limiting nonrepetitive contacts for transmission control
Sneppen, Kim, Nielsen, Bjarke Frost, Taylor, R. J. & Simonsen, L., 6 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 14, 6 s., 2016623118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
COVID-19 superspreading suggests mitigation by social network modulation
Nielsen, Bjarke Frost, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 15 mar. 2021, I: Physical Review Letters. 126, 6 s., 118301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SARS-CoV-2 superspreading in cities vs the countryside
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 23 feb. 2021, I: A P M I S. Acta Pathologica, Microbiologica et Immunologica Scandinavica. 129, 7, s. 401-407 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Social contagion in a world with asymmetric influence
Halvorsen, G. S., Pedersen, B. N. & Sneppen, Kim, 3 feb. 2021, I: Physical Review E. 103, 2, 5 s., 022303.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variability of Individual Infectiousness Derived from Aggregate Statistics of COVID-19
Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 15 jan. 2021, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
On Phage Adsorption to Bacterial Chains
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cost-benefit of limited isolation and testing in COVID-19 mitigation
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 29 okt. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 7 s., 18543.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Airborne Pathogens in a Heterogeneous World: Superspreading & Mitigation
Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 okt. 2020, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Hitchhiking, collapse, and contingency in phage infections of migrating bacterial populations
Ping, D., Wang, T., Fraebel, D. T., Maslov, S., Sneppen, Kim & Kuehn, S., 1 aug. 2020, I: ISME Journal. 14, 8, s. 2007-2018 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The uneasy coexistence of predators and pathogens
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 2 jul. 2020, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 7, 7 s., 42.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Repression of the lysogenic PR promoter in bacteriophage TP901-1 through binding of a CI-MOR complex to a composite OM-OR operator
Pedersen, M., Neergaard, J. T., Cassias, J., Rasmussen, K. K., Lo Leggio, Leila, Sneppen, Kim, Hammer, K. & Kilstrup, M., 26 maj 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 13 s., 8659.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimal Transport Flows for Distributed Production Networks
Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 22 maj 2020, I: Physical Review Letters. 124, 20, 5 s., 208101.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chaos in disease outbreaks among prey
Eilersen, Andreas Thomas, Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 3 mar. 2020, I: Scientific Reports. 10, 7 s., 3907.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling value bubbles in an attention based economy
Toftdahl Olesen, C. & Sneppen, Kim, 2 mar. 2020, I: European Physical Journal B. 93, 3, 5 s., 36.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Model to Link Cell Shape and Polarity with Organogenesis
Nielsen, Bjarke Frost, Nissen, Silas Boye, Sneppen, Kim, Mathiesen, Joachim & Trusina, Ala, 10 jan. 2020, I: iScience. 23, 2, s. 1-10 10 s., 100830.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Kronik: Risikobaseret genåbning af Danmark kan give færre alvorligt syge og en hurtigere genåbning
Kirkeby, Carsten, Græsbøll, K., Halasa, T., Sneppen, Kim & Christiansen, L. E., 2020, I: Ingenøren.dk.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
- Udgivet
Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Regime Shifts in a Phage-Bacterium Ecosystem and Strategies for Its Control
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 nov. 2019, I: mSystems. 5, 4(6), e00470-19.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-assembly, buckling and density-invariant growth of three-dimensional vascular networks
Kirkegaard, Julius Bier, Nielsen, Bjarke Frost, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 31 okt. 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 159, 8 s., 20190517.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent
Sneppen, Kim & Ringrose, L., 13 maj 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Applying allometric scaling to predator-prey systems
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 8 feb. 2019, I: Physical Review E. 99, 2, 8 s., 022405.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the contribution of exposure heterogeneity to the cessation of the 2014 Ebola epidemic
Uekermann, F., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: PLoS ONE. 14, 2, 11 s., e0210638.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multi stability and global bifurcations in epidemic model with distributed delay SIRnS-model
Jensen, G. G., Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: European Physical Journal B. 92, 2, 28.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli
Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Theoretical tool bridging cell polarities with development of robust morphologies
Nissen, Silas Boye, Rønhild, S., Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 27 nov. 2018, I: eLife. 7, 25 s., e38407.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Globalization in a nutshell
Sneppen, Kim & Bornholdt, S., 29 okt. 2018, I: Physical Review E. 98, 4, 6 s., 022314.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theory of invasion extinction dynamics in minimal food webs
Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 12 feb. 2018, I: Physical Review E. 97, 2, 10 s., 022404.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the Link between Nucleosome Occupancy and DNA Methylation
Lövkvist, Cecilia, Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 12 jan. 2018, I: Frontiers in Genetics. 8, 7 s., 232.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages
Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10093
Flest downloads
-
2298
downloads
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2145
downloads
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1918
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet