Rasmus Nielsen

Rasmus Nielsen

Professor


  1. 2007
  2. Udgivet

    A Bayesian multilocus association method: allowing for higher-order interaction in association studies

    Albrechtsen, Anders, Castella, S., Andersen, G., Hansen, T., Pedersen, O. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: Genetics. 176, 2, s. 1197-208 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Adaptive genic evolution in the Drosophila genomes

    Shapiro, J. A., Huang, W., Zhang, C., Hubisz, M. J., Lu, J., Turissini, D. A., Fang, S., Wang, H., Hudson, R. R., Nielsen, Rasmus, Chen, Z. & Wu, C., 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 7, s. 2271-6 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Ancient bacteria show evidence of DNA repair.

    Johnson, S. S., Hebsgaard, M. B., Christensen, T. R., Mastepanov, M., Nielsen, Rasmus, Munch, K., Brand, T., Gilbert, M Thomas P, Zuber, M. T., Bunce, M., Rønn, Regin, Gilichinsky, D., Froese, D. & Willerslev, Eske, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 36, s. 14401-5 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Ancient biomolecules from deep ice cores reveal a forested southern Greenland.

    Willerslev, E., Cappellini, E., Boomsma, W. K., Nielsen, R., Hebsgaard, M. B., Brand, T. B., Hofreiter, M., Bunce, M., Poinar, H. N., Dahl-Jensen, D., Johnsen, S. J., Steffensen, J. P., Bennike, O., Schwenninger, J-L., Nathan, R., Armitage, S., de Hoog, C-J., Alfimov, V., Christl, M., Beer, J. & 10 flere, Muscheler, R., Barker, J., Sharp, M., Penkman, K. E. H., Haile, J., Taberlet, P., Gilbert, M Thomas P, Casoli, A., Campani, E. & Collins, M. J., 2007, I: Science. 317, 5834, s. 111-114 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Demographic histories and patterns of linkage disequilibrium in Chinese and Indian rhesus macaques

    Hernandez, R. D., Hubisz, M. J., Wheeler, D. A., Smith, D. G., Ferguson, B., Rogers, J., Nazareth, L., Indap, A., Bourquin, T., McPherson, J., Muzny, D., Gibbs, R., Nielsen, Rasmus & Bustamante, C. D., 2007, I: Science. 316, 5822, s. 240-3 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Dependence of paracentric inversion rate on tract length

    York, T. L., Durrett, R. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, s. 115

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Evolution of genes and genomes on the Drosophila phylogeny. Drosophila 12 Genomes Consortium

    Clark, A. G., Eisen, M. B., Smith, D. R., Bergman, C. M., Oliver, B., Markow, T. A., Kaufman, T. C., Kellis, M., Gelbart, W., Iyer, V. N., Pollard, D. A., Sackton, T. B., Larracuente, A. M., Singh, N. D., Abad, J. P., Abt, D. N., Adryan, B., Aguade, M., Akashi, H., Anderson, W. W. & 31 flere, Aquadro, C. F., Ardell, D. H., Arguello, R., Artieri, C. G., Barbash, D. A., Barker, D., Barsanti, P., Batterham, P., Batzoglou, S., Begun, D., Bhutkar, A., Blanco, E., Bosak, S. A., Bradley, R. K., Brand, A. D., Brent, M. R., Brooks, A. N., Brown, R. H., Butlin, R. K., Caggese, C., Calvi, B. R., Bernardo de Carvalho, A., Caspi, A., Castrezana, S., Celniker, S. E., Chang, J. L., Garcia, A. C. L., Nielsen, Rasmus, Pedersen, Jakob Skou, Vieira, Filipe Garrett & Drosophila 12 Genomes Consortium, D. 1. G. C., 2007, I: Nature. 450, 7167, s. 203-18 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Evolutionary and biomedical insights from the rhesus macaque genome

    Gibbs, R. A., Rogers, J., Katze, M. G., Bumgarner, R., Weinstock, G. M., Mardis, E. R., Remington, K. A., Strausberg, R. L., Venter, J. C., Wilson, R. K., Batzer, M. A., Bustamante, C. D., Eichler, E. E., Hahn, M. W., Hardison, R. C., Makova, K. D., Miller, W., Milosavljevic, A., Palermo, R. E., Siepel, A. & 31 flere, Sikela, J. M., Attaway, T., Bell, S., Bernard, K. E., Buhay, C. J., Chandrabose, M. N., Dao, M., Davis, C., Delehaunty, K. D., Ding, Y., Dinh, H. H., Dugan-Rocha, S., Fulton, L. A., Gabisi, R. A., Garner, T. T., Godfrey, J., Hawes, A. C., Hernandez, J., Hines, S., Holder, M., Hume, J., Jhangiani, S. N., Joshi, V., Khan, Z. M., Kirkness, E. F., Cree, A., Fowler, R. G., Lee, S., Lewis, L. R., Nielsen, Rasmus & Rhesus Macaque Genome Sequencing and Analysis Consortium, R. M. G. S. A. A. C., 2007, I: Science. 316, 5822, s. 222-34 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Exploring variation in the d(N)/d(S) ratio among sites and lineages using mutational mappings: applications to the influenza virus

    Zhai, W., Slatkin, M. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: Journal of Molecular Evolution. 65, 3, s. 340-8 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Finding cis-regulatory modules in Drosophila using phylogenetic hidden Markov models

    Wong, W. S. W. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: Bioinformatics. 23, 16, s. 2031-7 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Genes under positive selection in Escherichia coli

    Petersen, L., Bollback, J. P., Dimmic, M., Hubisz, M. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: Genome Research. 17, 9, s. 1336-43 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Genome-wide patterns of nucleotide polymorphism in domesticated rice

    Caicedo, A. L., Williamson, S. H., Hernandez, R. D., Boyko, A., Fledel-Alon, A., York, T. L., Polato, N. R., Olsen, K. M., Nielsen, Rasmus, McCouch, S. R., Bustamante, C. D. & Purugganan, M. D., 2007, I: PLoS Genetics. 3, 9, s. 1745-56 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Integration within the Felsenstein equation for improved Markov chain Monte Carlo methods in population genetics

    Hey, J. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 8, s. 2785-90 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Localizing recent adaptive evolution in the human genome

    Williamson, S. H., Hubisz, M. J., Clark, A. G., Payseur, B. A., Bustamante, C. D. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: PLoS Genetics. 3, 6, s. e90

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Maximum likelihood estimation of ancestral codon usage bias parameters in Drosophila

    Nielsen, Rasmus, Bauer DuMont, V. L., Hubisz, M. J. & Aquadro, C. F., 2007, I: Molecular Biology and Evolution. 24, 1, s. 228-35 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Patterns of mutation and selection at synonymous sites in Drosophila

    Singh, N. D., Bauer DuMont, V. L., Hubisz, M. J., Nielsen, Rasmus & Aquadro, C. F., 2007, I: Molecular Biology and Evolution. 24, 12, s. 2687-97 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Population size changes reshape genomic patterns of diversity

    Pool, J. E. & Nielsen, Rasmus, 2007, I: Evolution. 61, 12, s. 3001-6 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Radiation and speciation of pelagic organisms during periods of global warming: the case of the common minke whale, Balaenoptera acutorostrata

    Pastene, L. A., Goto, M., Kanda, N., Zerbini, A. N., Kerem, D., Watanabe, K., Bessho, Y., Hasegawa, M., Nielsen, Rasmus, Larsen, F. & Palsbøll, P. J., 2007, I: Molecular Ecology. 16, 7, s. 1481-1495 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Recent and ongoing selection in the human genome

    Nielsen, Rasmus, Hellmann, I., Hubisz, M., Bustamante, C. & Clark, A. G., 2007, I: Nature Reviews. Genetics. 8, 11, s. 857-68 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    The use of coded PCR primers enables high-throughput sequencing of multiple homolog amplification products by 454 parallel sequencing.

    Binladen, J., Gilbert, M Thomas P, Bollback, J. P., Panitz, F., Bendixen, C., Nielsen, Rasmus & Willerslev, Eske, 2007, I: PLoS ONE. 2, 2, s. e197

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 3311