Mani Arumugam

Mani Arumugam


  1. 2012
  2. MOCAT: a metagenomics assembly and gene prediction toolkit

    Kultima, J. R., Sunagawa, S., Li, J., Chen, W., Chen, H., Mende, D. R., Arumugam, Mani, Pan, Q., Liu, B., Qin, J., Wang, J. & Bork, P., 2012, I: PLOS ONE. 7, 10, s. e47656

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    The human small intestinal microbiota is driven by rapid uptake and conversion of simple carbohydrates

    Zoetendal, E. G., Raes, J., van den Bogert, B., Arumugam, Mani, Booijink, C. C. G. M., Troost, F. J., Bork, P., Wels, M., de Vos, W. M. & Kleerebezem, M., 2012, I: I S M E Journal. 6, 7, s. 1415-26 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. 2011
  5. Udgivet

    Enterotypes of the human gut microbiome: [Plus]Corrigendum [Plus]Addendum

    Arumugam, M., Raes, J., Pelletier, E., Le Paslier, D., Yamada, T., Mende, D. R., Fernandes, G. R., Tap, J., Bruls, T., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Borruel, N., Casellas, F., Fernandez, L., Gautier, L., Hansen, T., Hattori, M., Hayashi, T., Kleerebezem, M., Kurokawa, K. & 31 flere, Leclerc, M., Levenez, F., Manichanh, C., Nielsen, H. B., Nielsen, T., Pons, N., Poulain, J., Qin, J., Sicheritz-Ponten, T., Tims, S., Torrents, D., Ugarte, E., Zoetendal, E. G., Wang, J., Guarner, F., Pedersen, Oluf Borbye, de Vos, W. M., Brunak, Søren, Doré, J., Antolín, M., Artiguenave, F., Blottiere, H. M., Almeida, M., Brechot, C., Cara, C., Chervaux, C., Cultrone, A., Delorme, C., Denariaz, G., Kristiansen, Karsten & MetaHIT Consortium, M. C., 2011, I: Nature. 473, 7346, s. 174-180 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Insight into structure and assembly of the nuclear pore complex by utilizing the genome of a eukaryotic thermophile

    Amlacher, S., Sarges, P., Flemming, D., van Noort, V., Kunze, R., Devos, D. P., Arumugam, Mani, Bork, P. & Hurt, E., 2011, I: Cell. 146, 2, s. 277-89 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Minimum information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications

    Yilmaz, P., Kottmann, R., Field, D., Knight, R., Cole, J. R., Amaral-Zettler, L., Gilbert, J. A., Karsch-Mizrachi, I., Johnston, A., Cochrane, G., Vaughan, R., Hunter, C., Park, J., Morrison, N., Rocca-Serra, P., Sterk, P., Arumugam, M., Bailey, M., Baumgartner, L., Birren, B. W. & 78 flere, Blaser, M. J., Bonazzi, V., Booth, T., Bork, P., Bushman, F. D., Buttigieg, P. L., Chain, P. S. G., Charlson, E., Costello, E. K., Huot-Creasy, H., Dawyndt, P., DeSantis, T., Fierer, N., Fuhrman, J. A., Gallery, R. E., Gevers, D., Gibbs, R. A., San Gil, I., Gonzalez, A., Gordon, J. I., Guralnick, R., Hankeln, W., Highlander, S., Hugenholtz, P., Jansson, J., Kau, A. L., Kelley, S. T., Kennedy, J., Knights, D., Koren, O., Kuczynski, J., Kyrpides, N., Larsen, R., Lauber, C. L., Legg, T., Ley, R. E., Lozupone, C. A., Ludwig, W., Lyons, D., Maguire, E., Methé, B. A., Meyer, F., Muegge, B., Nakielny, S., Nelson, K. E., Nemergut, D., Neufeld, J. D., Newbold, L. K., Oliver, A. E., Pace, N. R., Palanisamy, G., Peplies, J., Petrosino, J., Proctor, L., Pruesse, E., Quast, C., Raes, J., Ratnasingham, S., Ravel, J., Relman, D. A., Assunta-Sansone, S., Schloss, P. D., Schriml, L., Sinha, R., Smith, M. I., Sodergren, E., Spo, A., Stombaugh, J., Tiedje, J. M., Ward, D. V., Weinstock, G. M., Wendel, D., White, O., Whiteley, A., Wilke, A., Wortman, J. R., Yatsunenko, T. & Glöckner, F. O., 2011, I: Nature Biotechnology. 29, 5, s. 415-20 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. 2010
  9. Udgivet

    SmashCell: A software framework for the analysis of single-cell amplified genome sequences.

    Harrington, E. D., Arumugam, Mani, Raes, J., Bork, P. & Relman, D. A., okt. 2010, I: Bioinformatics. 26, 23, s. 2979-2980 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    SmashCommunity: A metagenomic annotation and analysis tool.

    Arumugam, Mani, Harrington, E. D., Foerstner, K. U., Raes, J. & Bork, P., okt. 2010, I: Bioinformatics. 26, 23, s. 2977-2978 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing

    MetaHIT Consortium, M. C., 2010, I: Nature. 464, 7285, s. 59-65 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. 2009
  13. Udgivet

    Transcriptome complexity in a genome-reduced bacterium.

    Güell, M., van Noort, V., Yus, E., Chen, W., Leigh-Bell, J., Michalodimitrakis, K., Yamada, T., Arumugam, Mani, Doerks, T., Kühner, S., Rode, M., Suyama, M., Schmidt, S., Gavin, A., Bork, P. & Serrano, L., nov. 2009, I: Science. 326, 5957, s. 1268-1271 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Pairagon: a highly accurate, HMM-based cDNA-to-genome aligner.

    Lu, D. V., Brown, R. H., Arumugam, Mani & Brent, M. R., jul. 2009, I: Bioinformatics. 25, 13, s. 1587-1593 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 41056735