Matthias Mann

Matthias Mann

Professor, forskningschef, Professor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0003-1292-4799

    Udgivelsesår:
    Alle
    301 - 350 ud af 359Pr. side: 50
    Sortering: Udgivelsesår
    1. 2013
    2. Udgivet

      Phosphorylation Variation during the Cell Cycle Scales with Structural Propensities of Proteins

      Tyanova, S., Frishman, D., Cox, J., Mann, Matthias & Olsen, Jesper Velgaard, 10 jan. 2013, I: P L o S Computational Biology (Online). 9, 1, s. e1002842 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. A DNA-Centric Protein Interaction Map of Ultraconserved Elements Reveals Contribution of Transcription Factor Binding Hubs to Conservation

      Viturawong, T., Meissner, F., Butter, F. & Mann, Matthias, 31 okt. 2013, I: Plant Cell Reports. 5, 2, s. 531-45 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

    4. Udgivet

      In Vivo SILAC-Based Proteomics Reveals Phosphoproteome Changes during Mouse Skin Carcinogenesis

      Zanivan, S., Meves, A., Behrendt, K., Schoof, E., Neilson, L. J., Cox, J., Tang, H. R., Kalna, G., van Ree, J. H., van Deursen, J. M., Trempus, C. S., Machesky, L. M., Linding, R., Wickström, S. A., Fässler, R. & Mann, Matthias, 21 feb. 2013, I: Cell Reports. 3, 2, s. 552-566 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. SILAC-based proteomics of human primary endothelial cell morphogenesis unveils tumor angiogenic markers

      Zanivan, S., Maione, F., Hein, M. Y., Hernández-Fernaud, J. R., Ostasiewicz, P., Giraudo, E. & Mann, Matthias, 26 aug. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. 2012
    7. Udgivet

      Proteomic investigations reveal a role for RNA processing factor THRAP3 in the DNA damage response

      Beli, P., Lukashchuk, N., Wagner, S. A., Weinert, B. T., Olsen, Jesper Velgaard, Baskcomb, L., Mann, Matthias, Jackson, S. P. & Choudhary, Chunaram, 2012, I: Molecular Cell. 46, 2, s. 212-25 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    8. 1D and 2D annotation enrichment: a statistical method integrating quantitative proteomics with complementary high-throughput data

      Cox, J. & Mann, Matthias, 2012, I: B M C Bioinformatics. 13 Suppl 16, s. S12

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      Advancing cell biology through proteomics in space and time (PROSPECTS)

      Lamond, A. I., Uhlen, M., Horning, S., Makarov, A., Robinson, C. V., Serrano, L., Hartl, F. U., Baumeister, W., Werenskiold, A. K., Mann, Matthias, Andersen, J. S., Vorm, O., Linial, M. & Aebersold, R., 1 mar. 2012, I: Molecular & Cellular Proteomics. 11, 3, 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      Proteomics for biomedicine: A half-completed journey

      Mann, Matthias, 1 feb. 2012, I: EMBO Molecular Medicine. 4, 2, s. 75-77 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. Udgivet

      Correction to Feasibility of Large-Scale Phosphoproteomics with Higher Energy Collisional Dissociation Fragmentation

      Nagaraj, N., D'Souza, R. C. J., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2012, I: Journal of Proteome Research.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    12. Extensive quantitative remodeling of the proteome between normal colon tissue and adenocarcinoma

      Wiśniewski, J. R., Ostasiewicz, P., Duś, K., Zielińska, D. F., Gnad, F. & Mann, Matthias, 1 jan. 2012, I: Molecular Systems Biology. 8, 611.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. 2011
    14. Udgivet

      Quantitative, high-resolution proteomics for data-driven systems biology

      Cox, J. & Mann, Matthias, 7 jul. 2011, I: Annual Review of Biochemistry. 80, s. 273-299 27 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    15. Udgivet

      Andromeda - a peptide search engine integrated into the MaxQuant environment

      Cox, J., Neuhauser, N., Michalski, A., Scheltema, R. A., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 apr. 2011, I: Journal of Proteome Research. 10, 4, s. 1794-805 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    16. Udgivet

      Effective representation and storage of mass spectrometry-based proteomic data sets for the scientific community

      Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 jan. 2011, I: Science Signaling. 4, 160, s. pe7

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. Udgivet

      System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation

      Rigbolt, K. T. G., Prokhorova, T., Akimov, V., Løkkegaard, Jeanette, Johansen, P. T., Kratchmarova, I., Kassem, M. S. E., Mann, Matthias, Olsen, Jesper Velgaard & Blagoev, B., 2011, I: Science Signaling. 4, 164, s. rs3

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      A Proteome-wide, Quantitative Survey of In Vivo Ubiquitylation Sites Reveals Widespread Regulatory Roles

      Wagner, S. A., Beli, P., Weinert, B. T., Nielsen, Michael Lund, Cox, J., Mann, Matthias & Choudhary, Chunaram, 1 okt. 2011, I: Molecular and Cellular Proteomics. 10, 10, s. M111.013284

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. 2010
    20. Udgivet

      Decoding signalling networks by mass spectrometry-based proteomics

      Choudhary, Chunaram & Mann, Matthias, 1 jun. 2010, I: Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 11, 6, s. 427-39 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    21. MSQuant, an Open Source Platform for Mass Spectrometry-Based Quantitative Proteomics

      Mortensen, P., Gouw, J. W., Olsen, Jesper Velgaard, Ong, S., Rigbolt, K. T. G., Bunkenborg, J., Cox, J., Foster, L. J., Heck, A. J. R., Blagoev, B., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, jan. 2010, I: Journal of Proteome Research.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    22. Udgivet

      Quantitative phosphoproteomics reveals widespread full phosphorylation site occupancy during mitosis

      Olsen, Jesper Velgaard, Vermeulen, M., Santamaria, A., Kumar, C., Miller, M. L., Jensen, Lars Juhl, Gnad, F., Cox, J., Jensen, T. S., Nigg, E. A., Brunak, Søren & Mann, Matthias, 2010, I: Science Signaling. 3, 104, s. ra3 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    23. Udgivet

      Yeast expression proteomics by high-resolution mass spectrometry

      Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 jan. 2010, I: Methods in Enzymology. 470, s. 259-80 22 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. 2009
    25. Udgivet

      Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions

      Choudhary, Chunaram, Kumar, C., Gnad, F., Nielsen, Michael Lund, Rehman, M., Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Science. 325, 5942, s. 834-40 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    26. Udgivet

      Mislocalized activation of oncogenic RTKs switches downstream signaling outcomes

      Choudhary, Chunaram, Olsen, Jesper Velgaard, Brandts, C., Cox, J., Reddy, P. N. G., Böhmer, F. D., Gerke, V., Schmidt-Arras, D., Berdel, W. E., Müller-Tidow, C., Mann, Matthias & Serve, H., 2009, I: Molecular Cell. 36, 2, s. 326-39 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    27. Udgivet

      High-accuracy identification and bioinformatic analysis of in vivo protein phosphorylation sites in yeast

      Gnad, F., de Godoy, L. M. F., Cox, J., Neuhauser, N., Ren, S., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Proteomics. 9, 20, s. 4642-4652 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    28. Global and site-specific quantitative phosphoproteomics: principles and applications

      Macek, B., Mann, Matthias & Olsen, J. V., 2009, I: Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 49, s. 199-221 22 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    29. A dual pressure linear ion trap orbitrap instrument with very high sequencing speed

      Olsen, Jesper Velgaard, Schwartz, J. C., Griep-Raming, J., Nielsen, Michael Lund, Damoc, E., Denisov, E., Lange, O., Remes, P., Taylor, D., Splendore, M., Wouters, E. R., Senko, M., Makarov, A., Mann, Matthias & Horning, S., 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2759-69 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    30. Udgivet

      Global effects of kinase inhibitors on signaling networks revealed by quantitative phosphoproteomics

      Pan, C., Olsen, Jesper Velgaard, Daub, H. & Mann, Matthias, 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2796-808 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    31. 2008

    32. The serine/threonine/tyrosine phosphoproteome of the model bacterium Bacillus subtilis

      Macek, B., Mijakovic, I., Olsen, Jesper Velgaard, Gnad, F., Kumar, C., Jensen, P. R. & Mann, Matthias, feb. 2008, I: Molecular and Cellular Proteomics. 6, 4, s. 697-707 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    33. Identification of new chicken egg proteins by mass spectrometry-based proteomic analysis

      Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, MaĉEk, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, jun. 2008, I: World's Poultry Science Journal. 64, 2, s. 209-218 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    34. Quantitative phosphoproteome analysis of a mouse liver cell line reveals specificity of phosphatase inhibitors

      Pan, C., Gnad, F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2008, I: Proteomics. 8, 21, s. 4534-46 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    35. 2007

    36. Quantitative proteomic assessment of very early cellular signaling events

      Dengjel, J., Akimov, V., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Mann, Matthias, Blagoev, B. & Andersen, J. S., 2007, I: Nature Biotechnology. 25, 5, s. 566-8 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    37. PHOSIDA (phosphorylation site database): management, structural and evolutionary investigation, and prediction of phosphosites

      Gnad, F., Ren, S., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Oroshi, M. & Mann, Matthias, 2007, I: Genome Biology. 8, 11, s. R250

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    38. The low molecular weight proteome of Halobacterium salinarum

      Klein, C., Aivaliotis, M., Olsen, Jesper Velgaard, Falb, M., Besir, H., Scheffer, B., Bisle, B., Tebbe, A., Konstantinidis, K., Siedler, F., Pfeiffer, F., Mann, Matthias & Oesterhelt, D., 2007, I: Journal of Proteome Research. 6, 4, s. 1510-8 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    39. Noncovalent interaction between Ubc9 and SUMO promotes SUMO chain formation

      Knipscheer, P., van Dijk, W. J., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: EMBO Journal. 26, 11, s. 2797-807 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    40. Nanoelectrospray peptide mapping revisited: Composite survey spectra allow high dynamic range protein characterization without LCMS on an orbitrap mass spectrometer

      Lu, A., Waanders, L. F., Almeida, R., Li, G., Allen, M., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Bonaldi, T. & Mann, Matthias, 1 dec. 2007, I: International Journal of Mass Spectrometry. 268, 2-3, s. 158-167 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    41. Phosphoproteome analysis of E. coli reveals evolutionary conservation of bacterial Ser/Thr/Tyr phosphorylation

      Macek, B., Gnad, F., Soufi, B., Kumar, C., Olsen, Jesper Velgaard, Mijakovic, I. & Mann, Matthias, 2007, I: Molecular and Cellular Proteomics. 7, 2, s. 299-307 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    42. Phosphoproteins of the chicken eggshell calcified layer

      Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, 2007, I: Proteomics. 7, 1, s. 106-15 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    43. Functional characterization of Rad18 domains for Rad6, ubiquitin, DNA binding and PCNA modification

      Notenboom, V., Hibbert, R. G., van Rossum-Fikkert, S. E., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, 17, s. 5819-30 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    44. Higher-energy C-trap dissociation for peptide modification analysis

      Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Lange, O., Makarov, A., Horning, S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 9, s. 709-12 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    45. Quantitative proteomic profiling of membrane proteins from the mouse brain cortex, hippocampus, and cerebellum using the HysTag reagent: mapping of neurotransmitter receptors and ion channels

      Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, P. A., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2007, I: Brain Research. 1134, 1, s. 95-106 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    46. A mass spectrometry-friendly database for cSNP identification

      Schandorff, S., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Blagoev, B., Zhang, Y., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 6, s. 465-6 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    47. MAPU: Max-Planck Unified database of organellar, cellular, tissue and body fluid proteomes

      Zhang, Y., Zhang, Y., Adachi, J., Olsen, Jesper Velgaard, Shi, R., de Souza, G., Pasini, E., Foster, L. J., Macek, B., Zougman, A., Kumar, C., Wisniewski, J. R., Jun, W. & Mann, Matthias, jan. 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, Database issue, s. D771-9

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    48. 2006

    49. The human urinary proteome contains more than 1500 proteins, including a large proportion of membrane proteins

      Adachi, J., Kumar, C., Zhang, Y., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 9, s. R80

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    50. Udgivet

      Actin homolog MreB and RNA polymerase interact and are both required for chromosome segregation in Escherichia coli

      Kruse, Thomas, Blagoev, B., Løbner-Olesen, Anders, Wachi, M., Sasaki, K., Iwai, N., Mann, Matthias & Gerdes, K., 1 jan. 2006, I: Genes & Development. 20, 1, s. 113-124 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    51. Top-down protein sequencing and MS3 on a hybrid linear quadrupole ion trap-orbitrap mass spectrometer

      Macek, B., Waanders, L. F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Molecular and Cellular Proteomics. 5, 5, s. 949-58 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    52. Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks

      Olsen, Jesper Velgaard, Blagoev, B., Gnad, F., Macek, B., Kumar, C., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Cell. 127, 3, s. 635-48 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    53. In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes

      Shevchenko, A., Tomas, H., Havlis, J., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Nature Protocols (Print Edition). 1, 6, s. 2856-60 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    54. Status of complete proteome analysis by mass spectrometry: SILAC labeled yeast as a model system

      de Godoy, L. M. F., Olsen, Jesper Velgaard, de Souza, G. A., Li, G., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 6, s. R50

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    55. 2005

    56. Quantitative phosphoproteomics applied to the yeast pheromone signaling pathway

      Gruhler, A., Olsen, Jesper Velgaard, Mohammed, S., Mortensen, P., Faergeman, N. J., Mann, Matthias & Jensen, O. N., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 3, s. 310-27 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    57. Proteomic mapping of brain plasma membrane proteins

      Nielsen, P. A., Olsen, Jesper Velgaard, Podtelejnikov, A. V., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 4, s. 402-8 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    58. Parts per million mass accuracy on an Orbitrap mass spectrometer via lock mass injection into a C-trap

      Olsen, Jesper Velgaard, de Godoy, L. M. F., Li, G., Macek, B., Mortensen, P., Pesch, R., Makarov, A., Lange, O., Horning, S. & Mann, Matthias, 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 12, s. 2010-21 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    59. 2004

    60. Tyrosine phosphoproteomics of fibroblast growth factor signaling: a role for insulin receptor substrate-4

      Hinsby, A. M., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2004, I: Journal of Biological Chemistry. 279, 45, s. 46438-47 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    Forrige 1...3 4 5 6 7 8 Næste

    ID: 5650809