Mani Arumugam

Mani Arumugam

ORCID: 0000-0002-0886-9101

Udgivelsesår:
Alle
26 - 50 ud af 77Pr. side: 25
Sortering: Titel
  1. Udgivet

    Genetic studies of abdominal MRI data identify genes regulating hepcidin as major determinants of liver iron concentration

    Wilman, H. R., Parisinos, C. A., Atabaki-Pasdar, N., Kelly, M., Thomas, E. L., Neubauer, S., Jennison, C., Ehrhardt, B., Baum, P., Schoelsch, C., Freijer, J., Grempler, R., Graefe-Mody, U., Hennige, A., Dings, C., Lehr, T., Scherer, N., Sihinecich, I., Pattou, F., Raverdi, V. & 31 flere, Caiazzo, R., Torres, F., Verkindt, H., Mari, A., Tura, A., Giorgino, T., Bizzotto, Froguel, P., Brorsson, C., Brunak, Søren, De Masi, F., Pedersen, H., Banasik, Karina, Thomas, Cecilia Engel, Lundgaard, Agnete Troen, Nielsen, A., Mazzoni, G., Karaderi, Tugce, Rasmussen, Simon, Johansen, Joachim, Allesøe, R., Arumugam, Mani, Allin, K., Hansen, Torben, Hansen, T., Jonsson, Anna Elisabet, Pedersen, Oluf Borbye, Dutta, A., Vogt, J., drb459, drb459 & IMI-DIRECT consortium, I. C., 2019, I: Journal of Hepatology. 71, 3, s. 594-602 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution

    Gibbs, R. A., Weinstock, G. M., Metzker, M. L., Muzny, D. M., Sodergren, E. J., Scherer, S., Scott, G., Steffen, D., Worley, K. C., Burch, P. E., Okwuonu, G., Hines, S., Lewis, L., DeRamo, C., Delgado, O., Dugan-Rocha, S., Miner, G., Morgan, M., Hawes, A., Gill, R. & 31 flere, Celera, Holt, R. A., Adams, M. D., Amanatides, P. G., Baden-Tillson, H., Barnstead, M., Chin, S., Evans, C. A., Ferriera, S., Fosler, C., Glodek, A., Gu, Z., Jennings, D., Kraft, C. L., Nguyen, T., Pfannkoch, C. M., Sitter, C., Sutton, G. G., Venter, J. C., Woodage, T., Smith, D., Lee, H., Gustafson, E., Cahill, P., Kana, A., Doucette-Stamm, L., Weinstock, K., Fechtel, K., Weiss, R. B., Arumugam, Mani & Rat Genome Sequencing Project Consortium, R. G. S. P. C., 2004, I: Nature. 428, 6982, s. 493-521 29 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Genomic diversity and ecology of human-associated Akkermansia species in the gut microbiome revealed by extensive metagenomic assembly

    Karcher, N., Nigro, E., Puncochar, M., Blanco-Miguez, A., Ciciani, M., Manghi, P., Zolfo, M., Cumbo, F., Manara, S., Golzato, D., Cereseto, A., Arumugam, Mani, Bui, T. P. N., Tytgat, H. L. P., Valles-Colomer, M., de Vos, W. M. & Segata, N., 2021, I: Genome Biology. 22, 24 s., 209.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Genomic variation landscape of the human gut microbiome

    Schloissnig, S., Arumugam, Mani, Sunagawa, S., Mitreva, M., Tap, J., Zhu, A., Waller, A., Mende, D. R., Kultima, J. R., Martin, J., Kota, K., Sunyaev, S. R., Weinstock, G. M. & Bork, P., 2013, I: Nature. 493, 7430, s. 45-50 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Gut microbiome development along the colorectal adenoma-carcinoma sequence

    Feng, Q., Liang, S., Jia, H., Stadlmayr, A., Tang, L., Lan, Z., Zhang, D., Xia, H., Xu, X., Jie, Z., Su, L., Li, X., Li, X., Li, J., Xiao, L., Huber-Schönauer, U., Niederseer, D., Xu, X., Al-Aama, J. Y., Yang, H. & 6 flere, Wang, J., Kristiansen, Karsten, Arumugam, Mani, Tilg, H., Datz, C. & Wang, J., 2015, I: Nature Communications. 6, 13 s., 6528.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    High-fat feeding rather than obesity drives taxonomical and functional changes in the gut microbiota in mice

    Xiao, L., Sonne, S. B., Feng, Q., Chen, N., Xia, Z., Li, X., Fang, Z., Zhang, D., Fjære, E., Midtbø, L. K., Derrien, M., Hugenholtz, F., Tang, L., Li, J., Zhang, J., Liu, C., Hao, Q., Vogel, U. B., Mortensen, A., Kleerebezem, M. & 8 flere, Licht, T. R., Yang, H., Wang, J., Li, Y., Arumugam, Mani, Wang, J., Madsen, L. & Kristiansen, Karsten, 8 apr. 2017, I: Microbiome. 5, 12 s., 43.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

    Pedersen, H. K., Gudmundsdottir, V., Nielsen, H. B., Hyotylainen, T., Nielsen, T., Jensen, B. A. H., Forslund, K., Hildebrand, F., Prifti, E., Falony, G., Le Chatelier, E., Levenez, F., Doré, J., Mattila, I., Plichta, D. R., Pöhö, P., Hellgren, L. I., Arumugam, M., Sunagawa, S., Vieira-Silva, S. & 14 flere, Jørgensen, T., Holm, J. B., Trošt, K., Kristiansen, Karsten, Brix, Susanne, Raes, J., Wang, J., Hansen, Torben, Bork, P., Brunak, Søren, Oresic, M., Ehrlich, S. D., Pedersen, Oluf Borbye & MetaHIT Consortium, M. C., 2016, I: Nature. 535, 7612, s. 376-381 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes

    Nielsen, H. B., Almeida, M., Juncker, A., Rasmussen, S., Li, J., Sunagawa, S., Plichta, D. R., Gautier, L., Pedersen, A. G., Le Chatelier, E., Pelletier, E., Bonde, I., Nielsen, T., Manichanh, C., Arumugam, M., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Blom, N., Borruel, N., Burgdorf, K. S. & 31 flere, Boumezbeur, F., Casellas, F., Doré, J., Dworzynski, P., Guarner, F., Hansen, Torben, Hildebrand, F., Kaas, R. S., Kennedy, S., Kristiansen, Karsten, Kultima, J. R., Léonard, P., Levenez, F., Lund, O., Moumen, B., Le Paslier, D., Pons, N., Pedersen, Oluf Borbye, Prifti, E., Qin, J., Raes, J., Sørensen, Søren Johannes, Tap, J., Tims, S., Ussery, D., Yamada, T., Renault, P., Sicheritz-Pontén, T., Bork, P., Wang, J. & MetaHIT Consortium, M. C., 2014, I: Nature Biotechnology. 32, 8, s. 822–828 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Identification of Novel Bioactive Metabolites Produced During the Cocultivation of Probiotic Strains and Clostridium Difficile in In Vitro Setup

    Gnanasekaran, Thiyagarajan, Saenz, C., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2020, I: Journal of Clinical Gastroenterology. 54, Suppl. 1, s. S12 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

  10. Udgivet

    Identification of rat genes by TWINSCAN gene prediction, RT-PCR, and direct sequencing

    Wu, J. Q., Shteynberg, D., Arumugam, Mani, Gibbs, R. A. & Brent, M. R., 2004, I: Genome Research. 14, 4, s. 665-71 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Impact of acute alcohol consumption on circulating microbiome in asymptomatic alcohol-related liver disease

    Israelsen, M., Alvarez Silva, Maria Camila, Madsen, B. S., Hansen, C. D., Torp, N. C., Johansen, S., Hansen, J. K., Prier Lindvig, K., Insonere, J., Riviere, V., Juel, H. B., Brejnrod, A., Jensen, Lars Juhl, Thiele, M., Lelouvier, B., Hansen, Torben, Arumugam, Mani & Krag, A., 2024, I: Gut. 73, 6, s. 1041-1044 gutjnl-2023-330360.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Impaired glucose metabolism and altered gut microbiome despite calorie restriction of ob/ob mice

    Kashani, A., Brejnrod, A. D., Jin, C., Kern, T., Madsen, A. N., Holm, L. A., Gerber, G. K., Holm, Jens-Christian, Hansen, Torben, Holst, Birgitte & Arumugam, Mani, 2019, I: Animal Microbiome. 1, 1, 16 s., 11.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Insight into structure and assembly of the nuclear pore complex by utilizing the genome of a eukaryotic thermophile

    Amlacher, S., Sarges, P., Flemming, D., van Noort, V., Kunze, R., Devos, D. P., Arumugam, Mani, Bork, P. & Hurt, E., 2011, I: Cell. 146, 2, s. 277-89 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Interplay between FGF21 and insulin action in the liver regulates metabolism

    Emanuelli, Brice, Vienberg, S. G., Smyth, G., Cheng, C., Stanford, K. I., Arumugam, Mani, Michael, M. D., Adams, A. C., Kharitonenkov, A. & Kahn, C. R., jan. 2015, I: The Journal of Clinical Investigation. 125, 1, s. 458

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Interplay between FGF21 and insulin action in the liver regulates metabolism

    Emanuelli, Brice, Vienberg, S. G., Smyth, G., Cheng, C., Stanford, K. I., Arumugam, Mani, Michael, M. D., Adams, A. C., Kharitonenkov, A. & Kahn, C. R., 3 feb. 2014, I: The Journal of Clinical Investigation. 124, 2, s. 515-27 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration

    Saenz, C., Nigro, E., Gunalan, V. & Arumugam, Mani, 2022, I: Frontiers in Bioinformatics. 2, 15 s., 846922.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. MOCAT: a metagenomics assembly and gene prediction toolkit

    Kultima, J. R., Sunagawa, S., Li, J., Chen, W., Chen, H., Mende, D. R., Arumugam, Mani, Pan, Q., Liu, B., Qin, J., Wang, J. & Bork, P., 2012, I: PLOS ONE. 7, 10, s. e47656

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer

    Wirbel, J., Pyl, P. T., Kartal, E., Zych, K., Kashani, A., Milanese, A., Fleck, J. S., Voigt, A. Y., Palleja, A., Ponnudurai, R., Sunagawa, S., Coelho, L. P., Schrotz-King, P., Vogtmann, E., Habermann, N., Niméus, E., Thomas, A. M., Manghi, P., Gandini, S., Serrano, D. & 15 flere, Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S., Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Waldron, L., Naccarati, A., Segata, N., Sinha, R., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P. & Zeller, G., 2019, I: Nature Medicine. 25, 4, s. 679-689 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation

    Thomas, A. M., Manghi, P., Asnicar, F., Pasolli, E., Armanini, F., Zolfo, M., Beghini, F., Manara, S., Karcher, N., Pozzi, C., Gandini, S., Serrano, D., Tarallo, S., Francavilla, A., Gallo, G., Trompetto, M., Ferrero, G., Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S. & 19 flere, Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Wirbel, J., Schrotz-King, P., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P., Zeller, G., Cordero, F., Dias-Neto, E., Setubal, J. C., Tett, A., Pardini, B., Rescigno, M., Waldron, L., Naccarati, A. & Segata, N., 2019, I: Nature Medicine. 25, 4, s. 667-678 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Metagenomic analysis of faecal microbiome as a tool towards targeted non-invasive biomarkers for colorectal cancer

    Yu, J., Feng, Q., Wong, S. H., Zhang, D., Liang, Q. Y., Qin, Y., Tang, L., Zhao, H., Stenvang, J., Li, Y., Wang, X., Xu, X., Chen, N., Wu, W. K. K., Al-Aama, J., Nielsen, H. J., Kiilerich, P., Jensen, B. A. H., Yau, T. O., Lan, Z. & 19 flere, Jia, H., Li, J., Xiao, L., Lam, T. Y. T., Ng, S. C., Cheng, A. S., Wong, V. W., Chan, F. K. L., Xu, X., Yang, H., Madsen, L., Datz, C., Tilg, H., Wang, J., Brünner, N., Kristiansen, Karsten, Arumugam, Mani, Sung, J. J. & Wang, J., 2017, I: Gut. 66, s. 70-78 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs

    Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Metagenomic species profiling using universal phylogenetic marker genes

    Sunagawa, S., Mende, D. R., Zeller, G., Izquierdo-Carrasco, F., Berger, S. A., Kultima, J. R., Coelho, L. P., Arumugam, M., Tap, J., Nielsen, H. B., Rasmussen, S., Brunak, S., Pedersen, O. B., Guarner, F., de Vos, W. M., Wang, J., Li, J., Doré, J., Ehrlich, S. D., Stamatakis, A. & 1 flere, Bork, P., 2013, I: Nature Methods. 10, 12, s. 1196-1199 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Minimum information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications

    Yilmaz, P., Kottmann, R., Field, D., Knight, R., Cole, J. R., Amaral-Zettler, L., Gilbert, J. A., Karsch-Mizrachi, I., Johnston, A., Cochrane, G., Vaughan, R., Hunter, C., Park, J., Morrison, N., Rocca-Serra, P., Sterk, P., Arumugam, M., Bailey, M., Baumgartner, L., Birren, B. W. & 78 flere, Blaser, M. J., Bonazzi, V., Booth, T., Bork, P., Bushman, F. D., Buttigieg, P. L., Chain, P. S. G., Charlson, E., Costello, E. K., Huot-Creasy, H., Dawyndt, P., DeSantis, T., Fierer, N., Fuhrman, J. A., Gallery, R. E., Gevers, D., Gibbs, R. A., San Gil, I., Gonzalez, A., Gordon, J. I., Guralnick, R., Hankeln, W., Highlander, S., Hugenholtz, P., Jansson, J., Kau, A. L., Kelley, S. T., Kennedy, J., Knights, D., Koren, O., Kuczynski, J., Kyrpides, N., Larsen, R., Lauber, C. L., Legg, T., Ley, R. E., Lozupone, C. A., Ludwig, W., Lyons, D., Maguire, E., Methé, B. A., Meyer, F., Muegge, B., Nakielny, S., Nelson, K. E., Nemergut, D., Neufeld, J. D., Newbold, L. K., Oliver, A. E., Pace, N. R., Palanisamy, G., Peplies, J., Petrosino, J., Proctor, L., Pruesse, E., Quast, C., Raes, J., Ratnasingham, S., Ravel, J., Relman, D. A., Assunta-Sansone, S., Schloss, P. D., Schriml, L., Sinha, R., Smith, M. I., Sodergren, E., Spo, A., Stombaugh, J., Tiedje, J. M., Ward, D. V., Weinstock, G. M., Wendel, D., White, O., Whiteley, A., Wilke, A., Wortman, J. R., Yatsunenko, T. & Glöckner, F. O., 2011, I: Nature Biotechnology. 29, 5, s. 415-20 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Molecular properties of adult mouse gastric and intestinal epithelial progenitors in their niches

    Giannakis, M., Stappenbeck, T. S., Mills, J. C., Leip, D. G., Lovett, M., Clifton, S. W., Ippolito, J. E., Glasscock, J. I., Arumugam, Mani, Brent, M. R. & Gordon, J. I., 2006, I: Journal of Biological Chemistry. 281, 16, s. 11292-300 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. E-pub ahead of print

    Opportunities and barriers in omics-based biomarker discovery for steatotic liver diseases

    Thiele, M., Villesen, I. F., Niu, L., Johansen, S., Sulek, K., Nishijima, S., Espen, L. V., Keller, M., Israelsen, M., Suvitaival, T., Zawadzki, A. D., Juel, H. B., Brol, M. J., Stinson, S. E., Huang, Y., Silva, M. C. A., Kuhn, M., Anastasiadou, E., Leeming, D. J., Karsdal, M. & 12 flere, Matthijnssens, J., Arumugam, Mani, Dalgaard, L. T., Legido-Quigley, C., Mann, Matthias, Trebicka, J., Bork, P., Jensen, Lars Juhl, Hansen, Torben, Krag, A., MicrobLiver Consortium, M. C. & GALAXY Consortium, G. C., 2024, (E-pub ahead of print) I: Journal of Hepatology.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 Næste

ID: 41056735