Robin Andersson

Robin Andersson

Lektor

ORCID: 0000-0003-1516-879X

Udgivelsesår:
Alle
51 - 73 ud af 73Pr. side: 50
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2018
  2. Udgivet

    Transcriptional decomposition reveals active chromatin architectures and cell specific regulatory interactions

    Rennie, Sarah, Dalby, M., van Duin, Lucas & Andersson, Robin, 2018, I: Nature Communications. 9, 16 s., 487.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    CAGEfightR: Cap Analysis of Gene Expression (CAGE) in R/Bioconductor

    Thodberg, Malte, Thieffry, A., Vitting-Seerup, K., Andersson, Robin & Sandelin, Albin Gustav, apr. 2018

    Publikation: Andet › Andet bidrag › Forskning

  4. 2019
  5. Udgivet

    CAGEfightR: analysis of 5'-end data using R/Bioconductor

    Thodberg, Malte, Thieffry, A., Vitting-Seerup, K., Andersson, Robin & Sandelin, Albin Gustav, 2019, I: BMC Bioinformatics. 20, 13 s., 487.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    PLZF targets developmental enhancers for activation during osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells

    Agrawal-Singh, S., Lerdrup, Mads, Gomes, A. R., van de Werken, H. J. G., Johansen, Jens Vilstrup, Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Helin, K. & Hansen, K., 2019, I: eLife. 8, s. 1-32 32 s., e40364.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. 2020
  8. Udgivet

    Comparative transcriptomics of primary cells in vertebrates

    Alam, T., Agrawal, S., Severin, J., Young, R. S., Andersson, R., Arner, E., Hasegawa, A., Lizio, M., Ramilowski, J. A., Abugessaisa, I., Ishizu, Y., Noma, S., Tarui, H., Taylor, M. S., Lassmann, T., Itoh, M., Kasukawa, T., Kawaji, H., Marchionni, L., Sheng, G. & 5 flere, Forrest, A. R. R., Khachigian, L. M., Hayashizaki, Y., Carninci, P. & de Hoon, M. J. L., 2020, I: Genome Research. 30, 7, s. 951-961 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements

    Andersson, Robin & Sandelin, Albin Gustav, 2020, I: Nature Reviews Genetics. 21, 2, s. 71-87 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    The Transcriptional Network That Controls Growth Arrest and Macrophage Differentiation in the Human Myeloid Leukemia Cell Line THP-1

    Gazova, I., Lefevre, L., Bush, S. J., Clohisey, S., Arner, E., de Hoon, M., Severin, J., van Duin, Lucas, Andersson, Robin, Lengeling, A., Hume, D. A. & Summers, K. M., 2020, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 8, 21 s., 498.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. 2021
  12. Udgivet

    Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network

    Grapotte, M., Saraswat, M., Bessière, C., Menichelli, C., Ramilowski, J. A., Severin, J., Hayashizaki, Y., Itoh, M., Tagami, M., Murata, M., Kojima-Ishiyama, M., Noma, S., Noguchi, S., Kasukawa, T., Hasegawa, A., Suzuki, H., Nishiyori-Sueki, H., Frith, M. C., Abugessaisa, I., Aitken, S. & 31 flere, Aken, B. L., Alam, I., Alam, T., Alasiri, R., Alhendi, A. M. N., Alinejad-Rokny, H., Alvarez, M. J., Andersson, Robin, Arakawa, T., Araki, M., Arbel, T., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Chen, Y., Coskun, M., Dalby, M., Ienasescu, H., Jørgensen, M., Kaczkowski, B., Kere, J., Li, K., Lilje, B., Nepal, C., Nguyen, Q. H., Nielsen, L. K., Rennie, Sarah, Sandelin, Albin Gustav, Valen, E., Vitezic, M., Vitting-Seerup, K. & FANTOM Consortium, F. C., 2021, I: Nature Communications. 12, 18 s., 3297.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Genome-wide and sister chromatid-resolved profiling of protein occupancy in replicated chromatin with ChOR-seq and SCAR-seq

    Petryk, N., Reveron-Gomez, Nazaret, González-Aguilera, C., Dalby, M., Andersson, Robin & Groth, Anja, 2021, I: Nature Protocols. 16, s. 4446-4493

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Principles of mRNA targeting via the Arabidopsis m6A-binding protein ECT2

    Arribas Hernandez, Laura, Rennie, Sarah, Köster, T., Porcelli, C., Lewinski, M., Staiger, D., Andersson, Robin & Brodersen, Peter, 2021, I: eLife. 10, 33 s., e72375.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    The YTHDF proteins ECT2 and ECT3 bind largely overlapping target sets and influence target mRNA abundance, not alternative polyadenylation

    Arribas Hernandez, Laura, Rennie, Sarah, Schon, M., Porcelli, C., Enugutti, B., Andersson, Robin, Nodine, M. D. & Brodersen, Peter, 2021, I: eLife. 10, 27 s., e72377.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    hyperTRIBER: a flexible R package for the analysis of differential RNA editing

    Rennie, Sarah, Magnusson, D. H. & Andersson, Robin, 2021, 12 s.

    Publikation: Working paper › Preprint

  17. 2022
  18. Udgivet

    Current challenges in understanding the role of enhancers in disease

    Zaugg, J. B., Sahlén, P., Andersson, Robin, Alberich-Jorda, M., de Laat, W., Deplancke, B., Ferrer, J., Mandrup, S., Natoli, G., Plewczynski, D., Rada-Iglesias, A. & Spicuglia, S., 2022, I: Nature Structural and Molecular Biology. 29, 12, s. 1148-1158 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Endogenous retroviruses co-opted as divergently transcribed regulatory elements shape the regulatory landscape of embryonic stem cells

    Bakoulis, Stylianos, Krautz, Robert, Alcaraz, N., Salvatore, Marco & Andersson, Robin, 2022, I: Nucleic acids symposium series. 50, 4, s. 2111-2127 17 s., 088.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Methods for fighting emerging pathogens

    Alcantara, L. C. J., Amenga-Etego, L., Andersson, Robin, Bhaumik, M., Choi, Y. K., Decaluwe, H., Geoghegan, J., Haagmans, B. L., López, S., Mukhtar, M. M., Nelwan, E., Rahal, E. A., Sato, K., Sklan, E. H. & Fang, Y. S. C., 2022, I: Nature Methods. 19, 4, s. 395-397 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Promoter sequence and architecture determine expression variability and confer robustness to genetic variants

    Einarsson, H., Salvatore, Marco, Vaagenso, C., Alcaraz, N., Lange, Jette Bornholdt, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2022, I: eLife. 2022, 36 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Transcription factor expression is the main determinant of variability in gene co-activity

    van Duin, Lucas, Krautz, Robert, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2022, 30 s.

    Publikation: Working paper › Preprint

  23. Udgivet

    Transfer learning reveals sequence determinants of regulatory element accessibility

    Salvatore, Marco, Horlacher, M., Winther, Ole & Andersson, Robin, 2022, bioRxiv, 24 s.

    Publikation: Working paper › Preprint

  24. 2023
  25. Udgivet

    Pooled analysis of frontal lobe transcriptomic data identifies key mitophagy gene changes in Alzheimer's disease brain

    Mei, T., Li, Yuan, Orduña Dolado, A., Li, Zhiquan, Andersson, Robin, Berliocchi, Laura & Rasmussen, Lene Juel, 2023, I: Frontiers in Aging Neuroscience. 15, 14 s., 1101216.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Symmetric inheritance of parental histones governs epigenome maintenance and embryonic stem cell identity

    Wenger, Alice, Biran, Alva Ada, Alcaraz, N., Redó-Riveiro, A., Sell, Annika Charlotte, Krautz, Robert, Flury, Valentin, Reveron-Gomez, Nazaret, Solis-Mezarino, V., Völker-Albert, M., Imhof, A., Andersson, Robin, Brickman, Joshua Mark & Groth, Anja, 2023, I: Nature Genetics. 55, 9, s. 1567-1578 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Transcription factor expression is the main determinant of variability in gene co-activity

    van Duin, Lucas, Krautz, Robert, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2023, I: Molecular Systems Biology. 19, 7, 17 s., e11392.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Transfer learning identifies sequence determinants of cell-type specific regulatory element accessibility

    Salvatore, Marco, Horlacher, M., Marsico, A., Winther, Ole & Andersson, Robin, 2023, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 5, 2, 10 s., 026.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. 2024
  30. Udgivet

    MYC activity at enhancers drives prognostic transcriptional programs through an epigenetic switch

    Jakobsen, S. T., Jensen, R. A. M., Madsen, M. S., Ravnsborg, T., Vaagenso, C. S., Siersbæk, M. S., Einarsson, H., Andersson, Robin, Jensen, O. N. & Siersbæk, R., 2024, I: Nature Genetics. 56, s. 663–674 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 32384007