Matthias Mann

Matthias Mann

Professor, forskningschef, Professor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0003-1292-4799

    Udgivelsesår:
    Alle
    1 - 100 ud af 359Pr. side: 100
    Sortering: Udgivelsesdato
    1. 1994
    2. Udgivet

      Error-tolerant identification of peptides in sequence databases by peptide sequence tags

      Mann, Matthias & Wilm, M., 15 dec. 1994, I: Analytical Chemistry. 66, 24, s. 4390-9 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. 1996
    4. Udgivet

      Femtomole sequencing of proteins from polyacrylamide gels by nano-electrospray mass spectrometry

      Wilm, M., Shevchenko, A., Houthaeve, T., Breit, S., Schweigerer, L., Fotsis, T. & Mann, Matthias, 1 feb. 1996, I: Nature. 379, 6564, s. 466-9 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. 1997

    6. Identification of a novel membrane protein that interacts specifically with the upar-prourokinase complex

      Behrendt, Niels, Engelholm, Lars Henning, Jensen, O. N., Mörtz, E., Ranne, E., Mann, Matthias & Dan, K., 1997, I: Fibrinolysis and Proteolysis. 11, Supl. 3, s. 10 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

    7. 2000

    8. A urokinase receptor-associated protein with specific collagen binding properties

      Behrendt, Niels, Jensen, O. N., Engelholm, Lars Henning, Mørtz, E., Mann, Matthias & Danø, K., 2000, I: The Journal of Biological Chemistry. 275, 3, s. 1993-2002 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. 2003

    10. Integrated analysis of protein composition, tissue diversity, and gene regulation in mouse mitochondria

      Mootha, V. K., Bunkenborg, J., Olsen, Jesper Velgaard, Hjerrild, M., Wisniewski, J. R., Stahl, E., Bolouri, M. S., Ray, H. N., Sihag, S., Kamal, M., Patterson, N., Lander, E. S. & Mann, Matthias, 2003, I: Cell. 115, 5, s. 629-40 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. Signaling initiated by overexpression of the fibroblast growth factor receptor-1 investigated by mass spectrometry

      Hinsby, A. M., Olsen, Jesper Velgaard, Bennett, K. L. & Mann, Matthias, 2003, I: Molecular and Cellular Proteomics. 2, 1, s. 29-36 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    12. 2004

    13. Improved peptide identification in proteomics by two consecutive stages of mass spectrometric fragmentation

      Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2004, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 101, 37, s. 13417-22 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Trypsin cleaves exclusively C-terminal to arginine and lysine residues

      Olsen, Jesper Velgaard, Ong, S. & Mann, Matthias, 2004, I: Molecular and Cellular Proteomics. 3, 6, s. 608-14 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    15. Tyrosine phosphoproteomics of fibroblast growth factor signaling: a role for insulin receptor substrate-4

      Hinsby, A. M., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2004, I: Journal of Biological Chemistry. 279, 45, s. 46438-47 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    16. HysTag--a novel proteomic quantification tool applied to differential display analysis of membrane proteins from distinct areas of mouse brain

      Olsen, Jesper Velgaard, Andersen, J. R., Nielsen, P. A., Nielsen, Michael Lund, Figeys, D., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., jan. 2004, I: Molecular and Cellular Proteomics. 3, 1, s. 82-92 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. 2005

    18. Parts per million mass accuracy on an Orbitrap mass spectrometer via lock mass injection into a C-trap

      Olsen, Jesper Velgaard, de Godoy, L. M. F., Li, G., Macek, B., Mortensen, P., Pesch, R., Makarov, A., Lange, O., Horning, S. & Mann, Matthias, 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 12, s. 2010-21 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Proteomic mapping of brain plasma membrane proteins

      Nielsen, P. A., Olsen, Jesper Velgaard, Podtelejnikov, A. V., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 4, s. 402-8 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. Quantitative phosphoproteomics applied to the yeast pheromone signaling pathway

      Gruhler, A., Olsen, Jesper Velgaard, Mohammed, S., Mortensen, P., Faergeman, N. J., Mann, Matthias & Jensen, O. N., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 3, s. 310-27 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    21. 2006

    22. Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks

      Olsen, Jesper Velgaard, Blagoev, B., Gnad, F., Macek, B., Kumar, C., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Cell. 127, 3, s. 635-48 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    23. In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes

      Shevchenko, A., Tomas, H., Havlis, J., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Nature Protocols (Print Edition). 1, 6, s. 2856-60 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. Status of complete proteome analysis by mass spectrometry: SILAC labeled yeast as a model system

      de Godoy, L. M. F., Olsen, Jesper Velgaard, de Souza, G. A., Li, G., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 6, s. R50

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    25. The human urinary proteome contains more than 1500 proteins, including a large proportion of membrane proteins

      Adachi, J., Kumar, C., Zhang, Y., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 9, s. R80

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    26. Top-down protein sequencing and MS3 on a hybrid linear quadrupole ion trap-orbitrap mass spectrometer

      Macek, B., Waanders, L. F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Molecular and Cellular Proteomics. 5, 5, s. 949-58 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    27. Udgivet

      Actin homolog MreB and RNA polymerase interact and are both required for chromosome segregation in Escherichia coli

      Kruse, Thomas, Blagoev, B., Løbner-Olesen, Anders, Wachi, M., Sasaki, K., Iwai, N., Mann, Matthias & Gerdes, K., 1 jan. 2006, I: Genes & Development. 20, 1, s. 113-124 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    28. 2007

    29. A mass spectrometry-friendly database for cSNP identification

      Schandorff, S., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Blagoev, B., Zhang, Y., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 6, s. 465-6 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    30. Functional characterization of Rad18 domains for Rad6, ubiquitin, DNA binding and PCNA modification

      Notenboom, V., Hibbert, R. G., van Rossum-Fikkert, S. E., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, 17, s. 5819-30 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    31. Higher-energy C-trap dissociation for peptide modification analysis

      Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Lange, O., Makarov, A., Horning, S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 9, s. 709-12 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    32. Noncovalent interaction between Ubc9 and SUMO promotes SUMO chain formation

      Knipscheer, P., van Dijk, W. J., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: EMBO Journal. 26, 11, s. 2797-807 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    33. PHOSIDA (phosphorylation site database): management, structural and evolutionary investigation, and prediction of phosphosites

      Gnad, F., Ren, S., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Oroshi, M. & Mann, Matthias, 2007, I: Genome Biology. 8, 11, s. R250

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    34. Phosphoproteins of the chicken eggshell calcified layer

      Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, 2007, I: Proteomics. 7, 1, s. 106-15 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    35. Phosphoproteome analysis of E. coli reveals evolutionary conservation of bacterial Ser/Thr/Tyr phosphorylation

      Macek, B., Gnad, F., Soufi, B., Kumar, C., Olsen, Jesper Velgaard, Mijakovic, I. & Mann, Matthias, 2007, I: Molecular and Cellular Proteomics. 7, 2, s. 299-307 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    36. Quantitative proteomic assessment of very early cellular signaling events

      Dengjel, J., Akimov, V., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Mann, Matthias, Blagoev, B. & Andersen, J. S., 2007, I: Nature Biotechnology. 25, 5, s. 566-8 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    37. Quantitative proteomic profiling of membrane proteins from the mouse brain cortex, hippocampus, and cerebellum using the HysTag reagent: mapping of neurotransmitter receptors and ion channels

      Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, P. A., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2007, I: Brain Research. 1134, 1, s. 95-106 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    38. The low molecular weight proteome of Halobacterium salinarum

      Klein, C., Aivaliotis, M., Olsen, Jesper Velgaard, Falb, M., Besir, H., Scheffer, B., Bisle, B., Tebbe, A., Konstantinidis, K., Siedler, F., Pfeiffer, F., Mann, Matthias & Oesterhelt, D., 2007, I: Journal of Proteome Research. 6, 4, s. 1510-8 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    39. MAPU: Max-Planck Unified database of organellar, cellular, tissue and body fluid proteomes

      Zhang, Y., Zhang, Y., Adachi, J., Olsen, Jesper Velgaard, Shi, R., de Souza, G., Pasini, E., Foster, L. J., Macek, B., Zougman, A., Kumar, C., Wisniewski, J. R., Jun, W. & Mann, Matthias, jan. 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, Database issue, s. D771-9

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    40. Nanoelectrospray peptide mapping revisited: Composite survey spectra allow high dynamic range protein characterization without LCMS on an orbitrap mass spectrometer

      Lu, A., Waanders, L. F., Almeida, R., Li, G., Allen, M., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Bonaldi, T. & Mann, Matthias, 1 dec. 2007, I: International Journal of Mass Spectrometry. 268, 2-3, s. 158-167 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    41. 2008

    42. Quantitative phosphoproteome analysis of a mouse liver cell line reveals specificity of phosphatase inhibitors

      Pan, C., Gnad, F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2008, I: Proteomics. 8, 21, s. 4534-46 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    43. The serine/threonine/tyrosine phosphoproteome of the model bacterium Bacillus subtilis

      Macek, B., Mijakovic, I., Olsen, Jesper Velgaard, Gnad, F., Kumar, C., Jensen, P. R. & Mann, Matthias, feb. 2008, I: Molecular and Cellular Proteomics. 6, 4, s. 697-707 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    44. Identification of new chicken egg proteins by mass spectrometry-based proteomic analysis

      Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, MaĉEk, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, jun. 2008, I: World's Poultry Science Journal. 64, 2, s. 209-218 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    45. 2009

    46. A dual pressure linear ion trap orbitrap instrument with very high sequencing speed

      Olsen, Jesper Velgaard, Schwartz, J. C., Griep-Raming, J., Nielsen, Michael Lund, Damoc, E., Denisov, E., Lange, O., Remes, P., Taylor, D., Splendore, M., Wouters, E. R., Senko, M., Makarov, A., Mann, Matthias & Horning, S., 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2759-69 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    47. Global and site-specific quantitative phosphoproteomics: principles and applications

      Macek, B., Mann, Matthias & Olsen, J. V., 2009, I: Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 49, s. 199-221 22 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    48. Udgivet

      Global effects of kinase inhibitors on signaling networks revealed by quantitative phosphoproteomics

      Pan, C., Olsen, Jesper Velgaard, Daub, H. & Mann, Matthias, 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2796-808 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    49. Udgivet

      High-accuracy identification and bioinformatic analysis of in vivo protein phosphorylation sites in yeast

      Gnad, F., de Godoy, L. M. F., Cox, J., Neuhauser, N., Ren, S., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Proteomics. 9, 20, s. 4642-4652 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    50. Udgivet

      Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions

      Choudhary, Chunaram, Kumar, C., Gnad, F., Nielsen, Michael Lund, Rehman, M., Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Science. 325, 5942, s. 834-40 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    51. Udgivet

      Mislocalized activation of oncogenic RTKs switches downstream signaling outcomes

      Choudhary, Chunaram, Olsen, Jesper Velgaard, Brandts, C., Cox, J., Reddy, P. N. G., Böhmer, F. D., Gerke, V., Schmidt-Arras, D., Berdel, W. E., Müller-Tidow, C., Mann, Matthias & Serve, H., 2009, I: Molecular Cell. 36, 2, s. 326-39 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    52. 2010
    53. Udgivet

      Quantitative phosphoproteomics reveals widespread full phosphorylation site occupancy during mitosis

      Olsen, Jesper Velgaard, Vermeulen, M., Santamaria, A., Kumar, C., Miller, M. L., Jensen, Lars Juhl, Gnad, F., Cox, J., Jensen, T. S., Nigg, E. A., Brunak, Søren & Mann, Matthias, 2010, I: Science Signaling. 3, 104, s. ra3 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    54. MSQuant, an Open Source Platform for Mass Spectrometry-Based Quantitative Proteomics

      Mortensen, P., Gouw, J. W., Olsen, Jesper Velgaard, Ong, S., Rigbolt, K. T. G., Bunkenborg, J., Cox, J., Foster, L. J., Heck, A. J. R., Blagoev, B., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, jan. 2010, I: Journal of Proteome Research.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    55. Udgivet

      Yeast expression proteomics by high-resolution mass spectrometry

      Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 jan. 2010, I: Methods in Enzymology. 470, s. 259-80 22 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    56. Udgivet

      Decoding signalling networks by mass spectrometry-based proteomics

      Choudhary, Chunaram & Mann, Matthias, 1 jun. 2010, I: Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 11, 6, s. 427-39 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    57. 2011
    58. Udgivet

      System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation

      Rigbolt, K. T. G., Prokhorova, T., Akimov, V., Løkkegaard, Jeanette, Johansen, P. T., Kratchmarova, I., Kassem, M. S. E., Mann, Matthias, Olsen, Jesper Velgaard & Blagoev, B., 2011, I: Science Signaling. 4, 164, s. rs3

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    59. Udgivet

      Effective representation and storage of mass spectrometry-based proteomic data sets for the scientific community

      Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 jan. 2011, I: Science Signaling. 4, 160, s. pe7

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    60. Udgivet

      Andromeda - a peptide search engine integrated into the MaxQuant environment

      Cox, J., Neuhauser, N., Michalski, A., Scheltema, R. A., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 apr. 2011, I: Journal of Proteome Research. 10, 4, s. 1794-805 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    61. Udgivet

      Quantitative, high-resolution proteomics for data-driven systems biology

      Cox, J. & Mann, Matthias, 7 jul. 2011, I: Annual Review of Biochemistry. 80, s. 273-299 27 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    62. Udgivet

      A Proteome-wide, Quantitative Survey of In Vivo Ubiquitylation Sites Reveals Widespread Regulatory Roles

      Wagner, S. A., Beli, P., Weinert, B. T., Nielsen, Michael Lund, Cox, J., Mann, Matthias & Choudhary, Chunaram, 1 okt. 2011, I: Molecular and Cellular Proteomics. 10, 10, s. M111.013284

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    63. 2012

    64. 1D and 2D annotation enrichment: a statistical method integrating quantitative proteomics with complementary high-throughput data

      Cox, J. & Mann, Matthias, 2012, I: B M C Bioinformatics. 13 Suppl 16, s. S12

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    65. Udgivet

      Correction to Feasibility of Large-Scale Phosphoproteomics with Higher Energy Collisional Dissociation Fragmentation

      Nagaraj, N., D'Souza, R. C. J., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2012, I: Journal of Proteome Research.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    66. Udgivet

      Proteomic investigations reveal a role for RNA processing factor THRAP3 in the DNA damage response

      Beli, P., Lukashchuk, N., Wagner, S. A., Weinert, B. T., Olsen, Jesper Velgaard, Baskcomb, L., Mann, Matthias, Jackson, S. P. & Choudhary, Chunaram, 2012, I: Molecular Cell. 46, 2, s. 212-25 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    67. Extensive quantitative remodeling of the proteome between normal colon tissue and adenocarcinoma

      Wiśniewski, J. R., Ostasiewicz, P., Duś, K., Zielińska, D. F., Gnad, F. & Mann, Matthias, 1 jan. 2012, I: Molecular Systems Biology. 8, 611.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    68. Udgivet

      Proteomics for biomedicine: A half-completed journey

      Mann, Matthias, 1 feb. 2012, I: EMBO Molecular Medicine. 4, 2, s. 75-77 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    69. Udgivet

      Advancing cell biology through proteomics in space and time (PROSPECTS)

      Lamond, A. I., Uhlen, M., Horning, S., Makarov, A., Robinson, C. V., Serrano, L., Hartl, F. U., Baumeister, W., Werenskiold, A. K., Mann, Matthias, Andersen, J. S., Vorm, O., Linial, M. & Aebersold, R., 1 mar. 2012, I: Molecular & Cellular Proteomics. 11, 3, 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    70. 2013

    71. Proteomic approaches in circadian biology

      Robles, M. S. & Mann, Matthias, 2013, Handbook of experimental pharmacology: Circadian Clocks. s. 389-407 19 s. (Handbook of Experimental Pharmacology).

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Formidling

    72. Udgivet

      The SH2 domain interaction landscape

      Tinti, M., Kiemer, L., Costa, S., Miller, M. L., Sacco, F., Olsen, Jesper Velgaard, Carducci, M., Paoluzi, S., Langone, F., Workman, C., Blom, N., Machida, K., Thompson, C. M., Schutkowski, M., Brunak, Søren, Mann, Matthias, Mayer, B. J., Castagnoli, L. & Cesareni, G., 2013, I: Cell Reports. 3, 4, s. 1293-1305 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    73. The proteome of the calcified layer organic matrix of turkey (Meleagris gallopavo) eggshell

      Mann, K. & Mann, Matthias, 2013, I: Proteome Science. 11, 1, s. 40

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    74. Udgivet

      Quantification of the N-glycosylated secretome by super-SILAC during breast cancer progression and in human blood Samples

      Boersema, P. J., Geiger, T., Wiśniewski, J. R. & Mann, Matthias, 1 jan. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 1, s. 158-171 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    75. Udgivet

      Phosphorylation Variation during the Cell Cycle Scales with Structural Propensities of Proteins

      Tyanova, S., Frishman, D., Cox, J., Mann, Matthias & Olsen, Jesper Velgaard, 10 jan. 2013, I: P L o S Computational Biology (Online). 9, 1, s. e1002842 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    76. Proteomic and genetic analyses demonstrate that Plasmodium berghei blood stages export a large and diverse repertoire of proteins

      Pasini, E. M., Braks, J. A., Fonager, J., Klop, O., Aime, E., Spaccapelo, R., Otto, T. D., Berriman, M., Hiss, J. A., Thomas, A. W., Mann, Matthias, Janse, C. J., Kocken, C. H. M. & Franke-Fayard, B., feb. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 2, s. 426-48 23 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    77. A systematic mammalian genetic interaction map reveals pathways underlying ricin susceptibility

      Bassik, M. C., Kampmann, M., Lebbink, R. J., Wang, S., Hein, M. Y., Poser, I., Weibezahn, J., Horlbeck, M. A., Chen, S., Mann, Matthias, Hyman, A. A., Leproust, E. M., McManus, M. T. & Weissman, J. S., 14 feb. 2013, I: Cell. 152, 4, s. 909-22 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    78. Udgivet

      In Vivo SILAC-Based Proteomics Reveals Phosphoproteome Changes during Mouse Skin Carcinogenesis

      Zanivan, S., Meves, A., Behrendt, K., Schoof, E., Neilson, L. J., Cox, J., Tang, H. R., Kalna, G., van Ree, J. H., van Deursen, J. M., Trempus, C. S., Machesky, L. M., Linding, R., Wickström, S. A., Fässler, R. & Mann, Matthias, 21 feb. 2013, I: Cell Reports. 3, 2, s. 552-566 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    79. Udgivet

      The Coming Age of Complete, Accurate, and Ubiquitous Proteomes

      Mann, Matthias, Kulak, N. A., Nagaraj, N. & Cox, J., 21 feb. 2013, I: Molecular Cell. 49, 4, s. 583-590 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    80. Direct proteomic quantification of the secretome of activated immune cells

      Meissner, F., Scheltema, R. A., Mollenkopf, H. & Mann, Matthias, 26 apr. 2013, I: Science (New York, N.Y.). 340, 6131, s. 475-8 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    81. A SILAC-based approach identifies substrates of caspase-dependent cleavage upon TRAIL-induced apoptosis

      Stoehr, G., Schaab, C., Graumann, J. & Mann, Matthias, maj 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 5, s. 1436-50 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    82. Protein correlation profiles identify lipid droplet proteins with high confidence

      Krahmer, N., Hilger, M., Kory, N., Wilfling, F., Stoehr, G., Mann, Matthias, Farese, R. V. & Walther, T. C., maj 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 5, s. 1115-26 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    83. Stabilization of integrin-linked kinase by the Hsp90-CHIP axis impacts cellular force generation, migration and the fibrotic response

      Radovanac, K., Morgner, J., Schulz, J., Blumbach, K., Patterson, C., Geiger, T., Mann, Matthias, Krieg, T., Eckes, B., Fässler, R. & Wickström, S. A., 15 maj 2013, I: E M B O Journal. 32, 10, s. 1409-24 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    84. The chromodomain helicase Chd4 is required for Polycomb-mediated inhibition of astroglial differentiation

      Sparmann, A., Xie, Y., Verhoeven, E., Vermeulen, M., Lancini, C., Gargiulo, G., Hulsman, D., Mann, Matthias, Knoblich, J. A. & van Lohuizen, M., 29 maj 2013, I: E M B O Journal. 32, 11, s. 1598-612 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    85. A large synthetic peptide and phosphopeptide reference library for mass spectrometry-based proteomics

      Marx, H., Lemeer, S., Schliep, J. E., Matheron, L., Mohammed, S., Cox, J., Mann, Matthias, Heck, A. J. R. & Kuster, B., jun. 2013, I: Nature Biotechnology. 31, 6, s. 557-64 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    86. Initial quantitative proteomic map of 28 mouse tissues using the SILAC mouse

      Geiger, T., Velic, A., Macek, B., Lundberg, E., Kampf, C., Nagaraj, N., Uhlen, M., Cox, J. & Mann, Matthias, jun. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 6, s. 1709-22 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    87. Quantitative proteomic analysis reveals concurrent RNA-protein interactions and identifies new RNA-binding proteins in Saccharomyces cerevisiae

      Klass, D. M., Scheibe, M., Butter, F., Hogan, G. J., Mann, Matthias & Brown, P. O., jun. 2013, I: Genome Research. 23, 6, s. 1028-38 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    88. β1- and αv-class integrins cooperate to regulate myosin II during rigidity sensing of fibronectin-based microenvironments

      Schiller, H. B., Hermann, M., Polleux, J., Vignaud, T., Zanivan, S., Friedel, C. C., Sun, Z., Raducanu, A., Gottschalk, K., Théry, M., Mann, Matthias & Fässler, R., jun. 2013, I: Nature Cell Biology. 15, 6, s. 625-36 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

    89. High performance computational analysis of large-scale proteome data sets to assess incremental contribution to coverage of the human genome

      Neuhauser, N., Nagaraj, N., McHardy, P., Zanivan, S., Scheltema, R., Cox, J. & Mann, Matthias, 7 jun. 2013, I: Journal of Proteome Research. 12, 6, s. 2858-68 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    90. HOT1 is a mammalian direct telomere repeat-binding protein contributing to telomerase recruitment

      Kappei, D., Butter, F., Benda, C., Scheibe, M., Draškovič, I., Stevense, M., Novo, C. L., Basquin, C., Araki, M., Araki, K., Krastev, D. B., Kittler, R., Jessberger, R., Londoño-Vallejo, J. A., Mann, Matthias & Buchholz, F., 12 jun. 2013, I: E M B O Journal. 32, 12, s. 1681-701 21 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    91. Alleles of a polymorphic ETV6 binding site in DCDC2 confer risk of reading and language impairment

      Powers, N. R., Eicher, J. D., Butter, F., Kong, Y., Miller, L. L., Ring, S. M., Mann, Matthias & Gruen, J. R., 11 jul. 2013, I: American Journal of Human Genetics. 93, 1, s. 19-28 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    92. Interaction between AP-5 and the hereditary spastic paraplegia proteins SPG11 and SPG15

      Hirst, J., Borner, G. H. H., Edgar, J., Hein, M. Y., Mann, Matthias, Buchholz, F., Antrobus, R. & Robinson, M. S., aug. 2013, I: Molecular Biology of the Cell. 24, 16, s. 2558-69 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    93. SILAC-based proteomics of human primary endothelial cell morphogenesis unveils tumor angiogenic markers

      Zanivan, S., Maione, F., Hein, M. Y., Hernández-Fernaud, J. R., Ostasiewicz, P., Giraudo, E. & Mann, Matthias, 26 aug. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    94. DEAD box protein DDX1 regulates cytoplasmic localization of KSRP

      Chou, C., Lin, W., Lin, C., Luber, C. A., Godbout, R., Mann, Matthias & Chen, C., 4 sep. 2013, I: P L o S One. 8, 9, e73752.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

    95. Quantitative interaction screen of telomeric repeat-containing RNA reveals novel TERRA regulators

      Scheibe, M., Arnoult, N., Kappei, D., Buchholz, F., Decottignies, A., Butter, F. & Mann, Matthias, 22 okt. 2013, I: Genome Research.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    96. Quantitative interaction screen of telomeric repeat-containing RNA reveals novel TERRA regulators

      Scheibe, M., Arnoult, N., Kappei, D., Buchholz, F., Decottignies, A., Butter, F. & Mann, Matthias, 22 okt. 2013, I: Genome Research.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    97. A DNA-Centric Protein Interaction Map of Ultraconserved Elements Reveals Contribution of Transcription Factor Binding Hubs to Conservation

      Viturawong, T., Meissner, F., Butter, F. & Mann, Matthias, 31 okt. 2013, I: Plant Cell Reports. 5, 2, s. 531-45 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

    98. Udgivet

      Status of large-scale analysis of post-translational modifications by mass spectrometry

      Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 nov. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, s. 3444-52

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    99. N-linked glycosylation enrichment for in-depth cell surface proteomics of diffuse large B-cell lymphoma subtypes

      Deeb, S. J., Cox, J., Schmidt-Supprian, M. & Mann, Matthias, 4 nov. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    100. 2014
    101. Udgivet

      Specificity and commonality of the phosphoinositide-binding proteome analyzed by quantitative mass spectrometry

      Jungmichel, S., Sylvestersen, K. B., Choudhary, Chunaram, Nguyen, S., Mann, Matthias & Nielsen, Michael Lund, 13 feb. 2014, I: Cell Reports. 6, 3, s. 578-91 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    102. Udgivet

      Time-resolved dissection of early phosphoproteome and ensuing proteome changes in response to TGF-β

      J D'Souza, R. C., Knittle, A. M., Nagaraj, N., van Dinther, M., Choudhary, Chunaram, Ten Dijke, P., Mann, Matthias & Sharma, K., jul. 2014, I: Science Signaling. 7, 335, s. rs5 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    103. Udgivet

      The growing landscape of lysine acetylation links metabolism and cell signalling

      Choudhary, Chunaram, Weinert, B. T., Nishida, Y., Verdin, E. & Mann, Matthias, 23 jul. 2014, I: Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 15, 8, s. 536-50 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    104. Overexpression of Q-rich prion-like proteins suppresses polyQ cytotoxicity and alters the polyQ interactome

      Ripaud, L., Chumakova, V., Antonin, M., Hastie, A. R., Pinkert, S., Körner, R., Ruff, K. M., Pappu, R. V., Hornburg, D., Mann, Matthias, Hartl, F. U. & Hipp, M. S., 23 dec. 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 51, s. 18219-24 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    105. 2015
    106. Udgivet

      Proteomics reveals dynamic assembly of repair complexes during bypass of DNA cross-links

      Räschle, M., Smeenk, G., Hansen, R. K., Temu, T., Oka, Y., Hein, M. Y., Nagaraj, N., Long, D. T., Walter, J. C., Hofmann, K., Storchova, Z., Cox, J., Bekker-Jensen, Simon Holst, Mailand, Niels & Mann, Matthias, 2015, I: Science. 348, 6234, s. 539- 10 s., 1253671.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    107. Udgivet

      Mass Spectrometry of Human Leukocyte Antigen Class I Peptidomes Reveals Strong Effects of Protein Abundance and Turnover on Antigen Presentation

      Bassani-Sternberg, M., Pletscher-Frankild, S., Jensen, Lars Juhl & Mann, Matthias, mar. 2015, I: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 3, s. 658-73 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    108. Udgivet

      Single muscle fiber proteomics reveals unexpected mitochondrial specialization

      Murgia, M., Nagaraj, N., Deshmukh, Atul Shahaji, Zeiler, M., Cancellara, P., Moretti, I., Reggiani, C., Schiaffino, S. & Mann, Matthias, 1 mar. 2015, I: E M B O Reports. 16, 3, s. 387-95 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    109. Antisense-mediated exon skipping: a therapeutic strategy for titin-based dilated cardiomyopathy

      Gramlich, M., Pane, L. S., Zhou, Q., Chen, Z., Murgia, M., Schötterl, S., Goedel, A., Metzger, K., Brade, T., Parrotta, E., Schaller, M., Gerull, B., Thierfelder, L., Aartsma-Rus, A., Labeit, S., Atherton, J. J., McGaughran, J., Harvey, R. P., Sinnecker, D., Mann, M. & 3 flere, Laugwitz, K., Gawaz, M. P. & Moretti, A., 9 mar. 2015, I: EMBO Molecular Medicine. 7, 5, s. 562-576 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    110. Udgivet

      Deep proteomics of mouse skeletal muscle enables quantitation of protein isoforms, metabolic pathways and transcription factors

      Deshmukh, Atul Shahaji, Murgia, M., Nagaraja, N., Treebak, Jonas Thue, Cox, J. & Mann, Matthias, apr. 2015, I: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 4, s. 841-853

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    111. A double-barrel LC-MS/MS system to quantify 96 interactomes per day

      Hosp, F., Scheltema, R. A., Eberl, C., Kulak, N. A., Keilhauer, E. C., Mayr, K. & Mann, Matthias, 17 apr. 2015, I: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 7, s. 2030-41 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    112. Udgivet

      Systems Analyses Reveal Shared and Diverse Attributes of Oct4 Regulation in Pluripotent Cells

      Ding, L., Paszkowski-Rogacz, M., Winzi, M., Chakraborty, D., Theis, M., Singh, S., Ciotta, G., Poser, I., Roguev, A., Chu, W. K., Choudhary, Chunaram, Mann, Matthias, Stewart, A. F., Krogan, N. & Buchholz, F., 26 aug. 2015, I: Cell Systems. 1, 2, s. 141-151 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    113. Udgivet

      Secretome Analysis of Lipid-Induced Insulin Resistance in Skeletal Muscle Cells by a Combined Experimental and Bioinformatics Workflow

      Deshmukh, Atul Shahaji, Cox, J., Jensen, Lars Juhl, Meissner, F. & Mann, Matthias, 6 nov. 2015, I: Journal of Proteome Research. 14, 11, s. 4885-95 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    114. Udgivet

      Mitochondrial specialization revealed by single muscle fiber proteomics: focus on the Krebs cycle

      Schiaffino, S., Reggiani, C., Kostrominova, T. Y., Mann, Matthias & Murgia, M., dec. 2015, I: Scandinavian Journal of Medicine & Science in Sports. 25, Suppl 4, s. 41-8 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    115. 2016
    116. Udgivet

      Proteomic maps of breast cancer subtypes

      Tyanova, S., Albrechtsen, Reidar, Kronqvist, P., Cox, J., Mann, Matthias & Geiger, T., 4 jan. 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 10259.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    117. Udgivet

      TRAIP is a PCNA-binding ubiquitin ligase that protects genome stability after replication stress

      Hoffmann, Saskia, Smedegaard, S., Nakamura, K., Mortuza, G. B., Räschle, M., Ibañez de Opakua, A., Oka, Y., Feng, Y., Blanco, F. J., Mann, Matthias, Montoya, Guillermo, Groth, Anja, Bekker-Jensen, Simon Holst & Mailand, Niels, 4 jan. 2016, I: The Journal of Cell Biology. 212, 1, s. 63-75

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    118. Cytoplasmic protein aggregates interfere with nucleocytoplasmic transport of protein and RNA

      Woerner, A. C., Frottin, F., Hornburg, D., Feng, L. R., Meissner, F., Patra, M., Tatzelt, J., Mann, Matthias, Winklhofer, K. F., Hartl, F. U. & Hipp, M. S., 8 jan. 2016, I: Science (New York, N.Y.). 351, 6269, s. 173-6 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    Forrige 1 2 3 4 Næste

    ID: 5650809