Mani Arumugam
- Udgivet
Compartmentalization of Immune Response and Microbial Translocation in Decompensated Cirrhosis
Alvarez Silva, Maria Camila, Schierwagen, R., Pohlmann, A., Magdaleno, F., Uschner, F. E., Ryan, P., Vehreschild, M. J. G. T., Claria, J., Latz, E., Lelouvier, B., Arumugam, Mani & Trebicka, J., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 11 s., 69.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Trans-ethnic gut microbiota signatures of type 2 diabetes in Denmark and India
Alvarez-Silva, C., Kashani, A., Hansen, T. H., Pinna, N. K., Anjana, R. M., Dutta, A., Saxena, S., Støy, J., Kampmann, U., Nielsen, T., Jørgensen, T., Gnanaprakash, V., Gnanavadivel, R., Sukumaran, A., Rani, C. S. S., Færch, K., Radha, V., Balasubramanyam, M., Nair, G. B., Das, B. & 6 flere, , 2021, I: Genome Medicine. 13, 37.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The role of the mycobiota in the gut-liver axis
Alvarez Silva, Maria Camila, Brach, Thorsten, Brejnrod, A. D. & Arumugam, Mani, 9 nov. 2018, The Human Gut-Liver-Axis in Health and Disease. Springer, s. 133-145 13 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Undervisning
- Udgivet
Insight into structure and assembly of the nuclear pore complex by utilizing the genome of a eukaryotic thermophile
Amlacher, S., Sarges, P., Flemming, D., van Noort, V., Kunze, R., Devos, D. P., Arumugam, Mani, Bork, P. & Hurt, E., 2011, I: Cell. 146, 2, s. 277-89 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SmashCommunity: A metagenomic annotation and analysis tool.
Arumugam, Mani, Harrington, E. D., Foerstner, K. U., Raes, J. & Bork, P., okt. 2010, I: Bioinformatics. 26, 23, s. 2977-2978 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pairagon+N-SCAN_EST: a model-based gene annotation pipeline
Arumugam, Mani, Wei, C., Brown, R. H. & Brent, M. R., 2006, I: Genome Biology (Online Edition). 7 Suppl 1, s. S5.1-10Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
EMPRR: A high-dimensional EM-based piecewise regression algorithm
Arumugam, Mani & Scott, S. D., 2004, Proceedings of the 2004 International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA '04. Kantardzic, M., Nasraoui, O. & Milanova, M. (red.). s. 264-271 8 s. (Proceedings of the 2004 International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA '04).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enterotypes of the human gut microbiome: [Plus]Corrigendum [Plus]Addendum
Arumugam, M., Raes, J., Pelletier, E., Le Paslier, D., Yamada, T., Mende, D. R., Fernandes, G. R., Tap, J., Bruls, T., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Borruel, N., Casellas, F., Fernandez, L., Gautier, L., Hansen, T., Hattori, M., Hayashi, T., Kleerebezem, M., Kurokawa, K. & 31 flere, , 2011, I: Nature. 473, 7346, s. 174-180 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An Improved Method for High Quality Metagenomics DNA Extraction from Human and Environmental Samples
Bag, S., Saha, B., Mehta, O., Anbumani, D., Kumar, N., Dayal, M., Pant, A., Kumar, P., Saxena, S., Allin, K. H., Hansen, T., Arumugam, M., Vestergaard, H., Pedersen, O., Pereira, V., Abraham, P., Tripathi, R., Wadhwa, N., Bhatnagar, S., Prakash, V. G. & 7 flere, , 2016, I: Scientific Reports. 6, 9 s., 26775.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2
Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, C. T., Callahan, B. J., Caraballo-Rodriguez, A. M., Chase, J., Cope, E. K. & 92 flere, , 2019, I: Nature Biotechnology. 37, 8, s. 852-857Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 (Nature Biotechnology, (2019), 37, 8, (852-857), 10.1038/s41587-019-0209-9)
Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N. A., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, C. T., Callahan, B. J., Caraballo-Rodríguez, A. M., Chase, J., Cope, E. K. & 92 flere, , 1 sep. 2019, I: Nature Biotechnology. 37, 9, s. 1091 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic analysis of blood molecular phenotypes reveals common properties in the regulatory networks affecting complex traits
Brown, A. A., Fernandez-Tajes, J. J., Hong, M. G., Brorsson, C. A., Koivula, R. W., Davtian, D., Dupuis, T., Sartori, A., Michalettou, T. D., Forgie, I. M., Adam, J., Allin, K. H., Caiazzo, R., Cederberg, H., De Masi, F., Elders, P. J. M., Giordano, G. N., Haid, M., Hansen, T., Hansen, T. H. & 134 flere, , 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 5062.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition
Costea, P. I., Hildebrand, F., Manimozhiyan, A., Bäckhed, F., Blaser, M. J., Bushman, F. D., De Vos, W. M., Ehrlich, S. D., Fraser, C. M., Hattori, M., Huttenhower, C., Jeffery, I. B., Knights, D., Lewis, J. D., Ley, R. E., Ochman, H., O'Toole, P. W., Quince, C., Relman, D. A., Shanahan, F. & 9 flere, , 2018, I: Nature Microbiology. 3, 1, s. 8-16 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The effect of gluten in adolescents and young adults with gastrointestinal symptoms: A blinded randomised cross-over trial
Crawley, C., Savino, N., Halby, C., Sander, S. D., Nybo Andersen, Anne-Marie, Arumugam, Mani, Murray, J., Christensen, R. & Husby, S., 2022, I: Alimentary Pharmacology and Therapeutics, Supplement. 55, 9, s. 1116-1127 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interplay between FGF21 and insulin action in the liver regulates metabolism
Emanuelli, Brice, Vienberg, S. G., Smyth, G., Cheng, C., Stanford, K. I., Arumugam, Mani, Michael, M. D., Adams, A. C., Kharitonenkov, A. & Kahn, C. R., 3 feb. 2014, I: The Journal of Clinical Investigation. 124, 2, s. 515-27 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interplay between FGF21 and insulin action in the liver regulates metabolism
Emanuelli, Brice, Vienberg, S. G., Smyth, G., Cheng, C., Stanford, K. I., Arumugam, Mani, Michael, M. D., Adams, A. C., Kharitonenkov, A. & Kahn, C. R., jan. 2015, I: The Journal of Clinical Investigation. 125, 1, s. 458Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gut microbiome development along the colorectal adenoma-carcinoma sequence
Feng, Q., Liang, S., Jia, H., Stadlmayr, A., Tang, L., Lan, Z., Zhang, D., Xia, H., Xu, X., Jie, Z., Su, L., Li, X., Li, X., Li, J., Xiao, L., Huber-Schönauer, U., Niederseer, D., Xu, X., Al-Aama, J. Y., Yang, H. & 6 flere, , 2015, I: Nature Communications. 6, 13 s., 6528.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Corrigendum: Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota
Forslund, K., Hildebrand, F., Nielsen, T., Falony, G., Le Chatelier, E., Sunagawa, S., Prifti, E., Vieira-Silva, S., Gudmundsdottir, V., Pedersen, H. K., Arumugam, M., Kristiansen, K., Voigt, A. Y., Vestergaard, H., Hercog, R., Costea, P. I., Kultima, J. R., Li, J., Jørgensen, T., Levenez, F. & 10 flere, , 3 maj 2017, I: Nature. 545, 116, 1 s., 22318.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning
- Udgivet
Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota
Forslund, K., Hildebrand, F., Nielsen, T., Falony, G., Le Chatelier, E., Sunagawa, S., Prifti, E., Vieira-Silva, S., Gudmundsdottir, V., Pedersen, H. K., Arumugam, M., Kristiansen, K., Yvonne Voigt, A., Vestergaard, H., Hercog, R., Igor Costea, P., Roat Kultima, J., Li, J., Jørgensen, T., Levenez, F. & 9 flere, , 2015, I: Nature. 528, 7581, s. 262-266 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Country-specific antibiotic use practices impact the human gut resistome
Forslund, K., Sunagawa, S., Kultima, J. R., Mende, D. R., Arumugam, Mani, Typas, A. & Bork, P., jul. 2013, I: Genome Research. 23, 7, s. 1163-9 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular properties of adult mouse gastric and intestinal epithelial progenitors in their niches
Giannakis, M., Stappenbeck, T. S., Mills, J. C., Leip, D. G., Lovett, M., Clifton, S. W., Ippolito, J. E., Glasscock, J. I., Arumugam, Mani, Brent, M. R. & Gordon, J. I., 2006, I: Journal of Biological Chemistry. 281, 16, s. 11292-300 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution
Gibbs, R. A., Weinstock, G. M., Metzker, M. L., Muzny, D. M., Sodergren, E. J., Scherer, S., Scott, G., Steffen, D., Worley, K. C., Burch, P. E., Okwuonu, G., Hines, S., Lewis, L., DeRamo, C., Delgado, O., Dugan-Rocha, S., Miner, G., Morgan, M., Hawes, A., Gill, R. & 31 flere, , 2004, I: Nature. 428, 6982, s. 493-521 29 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantitative differences in synthetic gut microbial inoculums do not affect the final stabilized in vitro community compositions
Gnanasekaran, Thiyagarajan, Sarathi, Arjun, Fang, Q., Azarm, A., Geraldo, Juliana Assis, Nigro, E. & Arumugam, Mani, 2023, I: mSystems. 8, 4, 16 s., e0124922.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of Novel Bioactive Metabolites Produced During the Cocultivation of Probiotic Strains and Clostridium Difficile in In Vitro Setup
Gnanasekaran, Thiyagarajan, Saenz, C., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2020, I: Journal of Clinical Gastroenterology. 54, Suppl. 1, s. S12 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
- Udgivet
Ecological adaptation and succession of human fecal microbial communities in an automated in vitro fermentation system
Gnanasekaran, Thiyagarajan, Geraldo, Juliana Assis, Ahrenkiel, D. W., Alvarez Silva, Maria Camila, Saenz, C., Khan, Adnan, Hanteer, O., Gunalan, V., Trost, K., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2021, I: mSystems. 6, 4, 18 s., e00232-21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 41056735
Flest downloads
-
1246
downloads
A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
639
downloads
Circulating microbiome in blood of different circulatory compartments
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
447
downloads
An Improved Method for High Quality Metagenomics DNA Extraction from Human and Environmental Samples
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet