Sebastian Marquardt

Sebastian Marquardt

Lektor - forfremmelsesprogrammet


  1. 2023
  2. Udgivet

    A ribose world: current status and future challenges of plant RNA biology

    Marquardt, Sebastian & Manavella, P. A., 2023, I: Journal of Experimental Botany. 74, 7, s. 2203-2207 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Cotranscriptional RNA processing and modification in plants

    Marquardt, Sebastian, Petrillo, E. & Manavella, P. A., 2023, I: The Plant Cell. 35, 6, s. 1654-1670

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Functional Variation in the Non-Coding Genome: Molecular Implications for Food Security

    Gullotta, Giorgio, Korte, A. & Marquardt, Sebastian, 2023, I: Journal of Experimental Botany. 74, 7, s. 2338–2351 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    LncRNA FLAIL affects alternative splicing and represses flowering in Arabidopsis

    Jin, Yu, Ivanov, M., Dittrich, A. N., Nelson, A. D. L. & Marquardt, Sebastian, 2023, I: EMBO Journal. 42, 11, 21 s., e110921.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. 2022
  7. Udgivet

    Histone chaperone ASF1 mediates H3.3-H4 deposition in Arabidopsis

    Zhong, Z., Wang, Y., Wang, M., Yang, F., Thomas, Quentin, Xue, Y., Zhang, Y., Liu, W., Jami-Alahmadi, Y., Xu, L., Feng, S., Marquardt, Sebastian, Wohlschlegel, J. A., Ausin, I. & Jacobsen, S. E., 2022, I: Nature Communications. 13, 15 s., 6970.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    R-loops at microRNA encoding loci promote co-transcriptional processing of pri-miRNAs in plants

    Gonzalo, L., Tossolini, I., Gulanicz, T., Cambiagno, D. A., Kasprowicz-Maluski, A., Smolinski, D. J., Mammarella, M. F., Ariel, F. D., Marquardt, Sebastian, Szweykowska-Kulinska, Z., Jarmolowski, A. & Manavella, P. A., 2022, I: Nature Plants. 8, 4, s. 402-418 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. 2021
  10. Udgivet

    From Single Cells to Flowers – Biological Complexity Driving Plant Reproductive Development

    Schwarz, Isabel Aimèe, Neumann, M., Vega, R., Xu, X., Cornaro, L., Colombo, L., Vernoux, T., Xu, J., Marquardt, Sebastian & Kaufmann, K., 2021, Preprints.org.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  11. Udgivet

    Light-Dependent Translation Change of Arabidopsis psbA Correlates with RNA Structure Alterations at the Translation Initiation Region

    Gawroński, P., Enroth, Christel Hougård, Kindgren, P., Marquardt, Sebastian, Karpiński, S., Leister, D., Jensen, Poul Erik, Vinther, Jeppe & Scharff, L. B., 2021, I: Cells. 10, 2, 22 s., 322.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    The Hda1 histone deacetylase limits divergent non-coding transcription and restricts transcription initiation frequency

    Gowthaman, U., Ivanov, M., Schwarz, Isabel Aimèe, Patel, H. P., Müller, N. A., Garcia Pichardo, Desire, Lenstra, T. L. & Marquardt, Sebastian, 2021, I: EMBO Journal. 40, 23, 16 s., 108903.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    TrancriptomeReconstructoR: data-driven annotation of complex transcriptomes

    Ivanov, M., Sandelin, Albin Gustav & Marquardt, Sebastian, 2021, I: BMC Bioinformatics. 22, 15 s., 290.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Winter fields antisense RNAs to kick off flowering

    Jin, Yu & Marquardt, Sebastian, 2021, I: Genes and Development. 38, 11-12, s. 785-786 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. 2020
  16. Udgivet

    A G(enomic)P(ositioning)S(ystem) for Plant RNAPII Transcription

    Leng, Xueyuan, Thomas, Quentin, Rasmussen, S. H. & Marquardt, Sebastian, 2020, I: Trends in Plant Science. 25, 8, s. 744-764

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    DNA Processing in the Context of Noncoding Transcription

    Gowthaman, U., Garcia Pichardo, Desire, Jin, Yu, Schwarz, Isabel Aimèe & Marquardt, Sebastian, 2020, I: Trends in Biochemical Sciences. 45, 12, s. 1009-1021

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Dual sgRNA-based Targeted Deletion of Large Genomic Regions and Isolation of Heritable Cas9-free Mutants in Arabidopsis

    Jin, Yu & Marquardt, Sebastian, 2020, I: Bio-protocol. 10, 20, 17 s., 3796.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Native elongation transcript sequencing reveals temperature dependent dynamics of nascent RNAPII transcription in Arabidopsis

    Kindgren, P., Ivanov, M. & Marquardt, Sebastian, 2020, I: Nucleic Acids Symposium Series. 48, 5, s. 2332-2347 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Organismal benefits of transcription speed control at gene boundaries

    Leng, Xueyuan, Ivanov, M., Kindgren, P., Malik, I., Thieffry, A., Brodersen, Peter, Sandelin, Albin Gustav, Kaplan, C. D. & Marquardt, Sebastian, 2020, I: EMBO Reports. 21, 4, 16 s., e49315.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Transcript isoform sequencing reveals widespread promoter-proximal transcriptional termination in Arabidopsis

    Thomas, Quentin, Ard, R., Liu, J., Li, B., Wang, J., Pelechano, V. & Marquardt, Sebastian, 2020, I: Nature Communications. 11, 1, s. 1-15

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. 2019
  23. Udgivet

    Transcription-driven chromatin repression of Intragenic transcription start sites

    Nielsen, M., Ard, R., Leng, Xueyuan, Ivanov, M., Kindgren, P. R., Pelechano, V. & Marquardt, Sebastian, 1 feb. 2019, I: PLOS Genetics. 15, 2, s. 1-33 e1007969.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2018
  25. Udgivet

    Efficient termination of nuclear lncRNA transcription promotes mitochondrial genome maintenance

    du Mee, D. J. M., Ivanov, M., Parker, J. P., Buratowski, S. & Marquardt, Sebastian, 5 mar. 2018, I: eLife. 7, e31989.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Transcriptional read-through of the long non-coding RNA SVALKA governs plant cold acclimation

    Kindgren, P. R., Ard, R., Ivanov, M. & Marquardt, Sebastian, 2018, I: Nature Communications. 9, s. 1-11 4561.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. 2017
  28. Udgivet

    Emerging properties and functional consequences of noncoding transcription

    Ard, R., Allshire, R. C. & Marquardt, Sebastian, 2017, I: Genetics (Print). 207, 2, s. 357-367 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. 2014
  30. A chromatin-based mechanism for limiting divergent noncoding transcription

    Marquardt, Sebastian, Escalante-Chong, R., Pho, N., Wang, J., Churchman, L. S., Springer, M. & Buratowski, S., 2014, I: Cell. 157, 7, s. 1712-23 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Functional consequences of splicing of the antisense transcript COOLAIR on FLC transcription

    Marquardt, Sebastian, Raitskin, O., Wu, Z., Liu, F., Sun, Q. & Dean, C., 2014, I: Molecular Cell. 54, 1, s. 156-165 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. 2013
  33. Kinetic competition between RNA Polymerase II and Sen1-dependent transcription termination

    Hazelbaker, D. Z., Marquardt, Sebastian, Wlotzka, W. & Buratowski, S., 2013, I: Molecular Cell. 49, 1, s. 55-66 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. 2011
  35. Distinct RNA degradation pathways and 3' extensions of yeast non-coding RNA species

    Marquardt, Sebastian, Hazelbaker, D. Z. & Buratowski, S., maj 2011, I: Transcription. 2, 3, s. 145-154 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. 2010
  37. Cullin 4-ring finger-ligase plays a key role in the control of endoreplication cycles in Arabidopsis trichomes

    Roodbarkelari, F., Bramsiepe, J., Weinl, C., Marquardt, Sebastian, Novák, B., Jakoby, M. J., Lechner, E., Genschik, P. & Schnittger, A., 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 34, s. 15275-15280 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Targeted 3' processing of antisense transcripts triggers Arabidopsis FLC chromatin silencing

    Liu, F., Marquardt, Sebastian, Lister, C., Swiezewski, S. & Dean, C., 2010, I: Science (New York, N.Y.). 327, 5961, s. 94-7 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. 2009
  40. Altered interactions within FY/AtCPSF complexes required for Arabidopsis FCA-mediated chromatin silencing

    Manzano, D., Marquardt, Sebastian, Jones, A. M. E., Bäurle, I., Liu, F. & Dean, C., 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 21, s. 8772-7 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. 2006
  42. Additional targets of the Arabidopsis autonomous pathway members, FCA and FY

    Marquardt, Sebastian, Boss, P. K., Hadfield, J. & Dean, C., 2006, I: Journal of Experimental Botany. Flowering Newsletter. 57, 13, s. 3379-86 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  43. 2005
  44. Udgivet

    Novel functions of plant cyclin-dependent kinase inhibitors, ICK1/KRP1, can act non-cell-autonomously and inhibit entry into mitosis

    Weinl, C., Marquardt, Sebastian, Kuijt, S. J. H., Nowack, M. K., Jakoby, M. J., Hülskamp, M. & Schnittger, A., jun. 2005, I: Plant Cell. 17, 6, s. 1704-22 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. 2004
  46. Udgivet

    Partial loss-of-function alleles reveal a role for GNOM in auxin transport-related, post-embryonic development of Arabidopsis

    Geldner, N., Richter, S., Vieten, A., Marquardt, Sebastian, Torres-Ruiz, R. A., Mayer, U. & Jürgens, G., jan. 2004, I: Development (Cambridge, England). 131, 2, s. 389-400 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 122741632