Ole Winther

Ole Winther

Professor MSO, Gæsteprofessor


  1. Udgivet

    A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data

    Gabrielaite, M., Torp, M. H., Rasmussen, Malthe Sebro, Andreu-Sánchez, S., Vieira, Filipe Garrett, Pedersen, C. B., Kinalis, S., Madsen, M. B., Kodama, M., Demircan, G. S., Simonyan, A., Yde, C. W., Olsen, L. R., Marvig, R. L., Østrup, O., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2021, I: Cancers. 13, 24, 6283.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data

    Gabrielaite, M., Torp, M., Rasmussen, M., Andreu-Sánchez, S., Vieira, Filipe Garrett, Pedersen, C., Kinalis, S., Madsen, M., Yde, C., Rønn, O. L., Marvig, R., Østrup, O., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2021, bioRxiv, 29 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  3. Udgivet

    A computational method for identification of vaccine targets from protein regions of conserved human leukocyte antigen binding

    Olsen, L. R., Simon, C., Kudahl, U. J., Bagger, F. O., Winther, Ole, Reinherz, E. L., Zhang, G. L. & Brusic, V., 2015, I: B M C Medical Genomics. 8, Suppl 4, 6 s., 5.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A perspective on inverse design of battery interphases using multi-scale modelling, experiments and generative deep learning

    Bhowmik, A., Castelli, I. E., Garcia-Lastra, J. M., Bjørn-Jørgensen, P., Winther, Ole & Vegge, T., 2019, I: Energy Storage Materials. 21, s. 446-456

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Airway inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps and asthma: the united airways concept further supported

    Håkansson, K., Bachert, C., Konge, Lars, Thomsen, Simon Francis, Pedersen, Anders Elm, Poulsen, Steen Seier, Martin-Bertelsen, T., Winther, Ole, Backer, Vibeke & von Buchwald, Christian, 2015, I: PloS one. 10, 7, 11 s., e0127228.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    An introduction to deep learning on biological sequence data: examples and solutions

    Jurtz, V. I., Johansen, A. R., Nielsen, M., Almagro Armenteros, J. J., Nielsen, H., Sønderby, C. K., Winther, Ole & Sønderby, S. K., 15 nov. 2017, I: Bioinformatics. 33, 22, s. 3685-3690 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Angiotensinogen and HLA class II predict bevacizumab response in recurrent glioblastoma patients

    Urup, T., Michaelsen, Signe Regner, Olsen, L. R., Toft, A., Christensen, I. J., Grunnet, K., Winther, Ole, Broholm, H., Kosteljanetz, M., Issazadeh-Navikas, Shohreh, Poulsen, H. S. & Lassen, Ulrik Niels, okt. 2016, I: Molecular Oncology. 10, 8, s. 1160-1168

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Autoencoding beyond pixels using a learned similarity metric

    Larsen, A. B. L., Sønderby, S. K., Larochelle, H. & Winther, Ole, 2016, Proceedings of The 33rd International Conference on Machine Learning. Balcan, M. F. & Weinberger, K. Q. (red.). s. 1558–1566 9 s. (JMLR: Workshop and Conference Proceedings, Bind 48).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    BayesMD: Flexible Biological Modeling for Motif Discovery

    Tang, M. E., Krogh, Anders & Winther, Ole, 2008, I: Journal of Computational Biology. 15, 10, s. 1347-63 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Binning microbial genomes using deep learning

    Nissen, J. N., Sønderby, C. K., Armenteros, J. J. A., Grønbech, Christopher Heje, Nielsen, H. B., Petersen, T. N., Winther, Ole & Rasmussen, Simon, 2018, (bioRxiv).

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  11. Udgivet

    Bioinformatics for cancer immunotherapy target discovery

    Olsen, L. R., Campos, B., Stein Barnkob, M., Winther, Ole, Brusic, V. & Andersen, M. H., 2014, I: Cancer Immunology, Immunotherapy. 63, 12, s. 1235-1249 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    BloodSpot: a database of gene expression profiles and transcriptional programs for healthy and malignant haematopoiesis

    Bagger, F. O., Sasivarevic, D., Hadi Sohi, S., Laursen, L. G., Pundhir, Sachin, Sønderby, C. K., Winther, Ole, Rapin, N. & Porse, Bo Torben, 4 jan. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, D1, s. D917-24 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Bone signaling in middle ear development: a genome-wide differential expression analysis

    Nielsen, M. C., Martin-Bertelsen, T., Friis, M., Winther, Ole, Friis-Hansen, Lennart Jan, Cayé-Thomasen, Per & Sørensen, Mads Sølvsten, 2014, I: Anatomical Record. 297, 12, s. 2349-2355 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Calibrated uncertainty for molecular property prediction using ensembles of message passing neural networks

    Busk, J., Jørgensen, P. B., Bhowmik, A., Schmidt, M. N., Winther, Ole & Vegge, T., 2022, I: Machine Learning: Science and Technology. 3, 1, 12 s., 015012.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Can large language models reason about medical questions?

    Liévin, V., Hother, C. E., Motzfeldt, A. G. & Winther, Ole, 2024, I: Patterns. 5, 3, 12 s., 100943.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Cancers of unknown primary origin (CUP) are characterized by chromosomal instability (CIN) compared to metastasis of know origin

    Vikeså, J., Møller, A. K. H., Kaczkowski, B., Helweg-Larsen, R. B., Winther, Ole, Henao Giraldo, R., Krogh, Anders, Perell, K., Jensen, F., Daugaard, G. & Nielsen, Finn Cilius, 2015, I: B M C Cancer. 15, 14 s., 151.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Cellular origin of prognostic chromosomal aberrations in AML patients

    Mora-Jensen, H., Jendholm, L. J., Rapin, N. P. J., Andersen, M. K., Roug, A. S., Bagger, F. O., Bullinger, L., Winther, Ole, Borregaard, N., Porse, Bo Torben & Theilgaard-Mønch, Kim, 11 feb. 2015, I: Leukemia. 29, s. 1785-1789 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Comparing cancer vs normal gene expression profiles identifies new disease entities and common transcriptional programs in AML patients

    Rapin, N. P. J., Bagger, F. O., Jendholm, L. J., Mora-Jensen, H., Krogh, Anders, Kohlmann, A., Thiede, C., Borregaard, N., Bullinger, L., Winther, Ole, Theilgaard-Mønch, Kim & Porse, Bo Torben, 6 feb. 2014, I: Blood (online). 123, 6, s. 894-904 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Competence classification of cumulus and granulosa cell transcriptome in embryos matched by morphology and female age

    Borup, R., Thuesen, L. L., tcg964, tcg964, Andersen, A. N., Ziebe, S., Winther, Ole & Grøndahl, M. L., 2016, I: P L o S One. 11, 4, s. 1-19 19 s., e0153562.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Convolutional LSTM networks for subcellular localization of proteins

    Sønderby, S. K., Sønderby, C. K., Nielsen, H. & Winther, Ole, 2015, Algorithms for Computational Biology. Dediu, A-H., Hernández-Quiroz, F., Martín-Vide, C. & Rosenblueth, D. A. (red.). Springer, s. 68-80 13 s. (Lecture notes in computer science, Bind 9199).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Daily estimates of clinical severity of symptoms in bipolar disorder from smartphone-based self-assessments

    Busk, J., Faurholt-Jepsen, M., Frost, M., Bardram, J. E., Kessing, Lars Vedel & Winther, Ole, 2020, I: Translational Psychiatry. 10, 12 s., 194.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Deconvolution of autoencoders to learn biological regulatory modules from single cell mRNA sequencing data

    Kinalis, S., Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2019, I: BMC Bioinformatics. 20, 9 s., 379.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Deep Learning for Diagnostic Binary Classification of Multiple-Lesion Skin Diseases

    Thomsen, K., Christensen, A. L., Iversen, L., Lomholt, H. B. & Winther, Ole, 2020, I: Frontiers in Medicine. 7, 7 s., 574329.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Deep integrative models for large-scale human genomics

    Sigurdsson, Arnór Ingi, Louloudis, Ioannis, Banasik, Karina, Westergaard, David, Winther, Ole, Lund, O., Ostrowski, Sisse Rye, Erikstrup, C., Pedersen, Ole Birger Vesterager, Nyegaard, Mette, Brunak, Søren, Vilhjálmsson, B. & Rasmussen, Simon, 2023, I: Nucleic Acids Symposium Series. 51, 12, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    DeepLoc: prediction of protein subcellular localization using deep learning

    Almagro Armenteros, J. J., Sønderby, C. K., Sønderby, S. K., Nielsen, H. & Winther, Ole, 1 nov. 2017, I: Bioinformatics. 33, 21, s. 3387-3395 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 Næste

ID: 171145930