Ole Winther

Ole Winther

Professor MSO, Gæsteprofessor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0002-1966-3205

    Udgivelsesår:
    Alle
    26 - 50 ud af 84Pr. side: 25
    Sortering: Titel
    1. Udgivet

      DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models

      Thumuluri, V., Almagro Armenteros, J. J., Johansen, A. R., Nielsen, H. & Winther, Ole, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W228-W234

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    2. Udgivet

      DeepLocRNA: an interpretable deep learning model for predicting RNA subcellular localization with domain-specific transfer-learning

      Wang, Jun, Horlacher, M., Cheng, L. & Winther, Ole, 2024, I: Bioinformatics. 40, 2, 10 s., btae065.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. Udgivet

      DeepPeptide predicts cleaved peptides in proteins using conditional random fields

      Teufel, Felix Georg, Refsgaard, J. C., Madsen, C. T., Stahlhut, C., Grønborg, M., Winther, Ole & Madsen, D., 2023, I: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 10, 6 s., btad616.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    4. Udgivet

      Deorphanizing Peptides Using Structure Prediction

      Teufel, Felix Georg, Refsgaard, J. C., Kasimova, M. A., Deibler, K., Madsen, C. T., Stahlhut, C., Grønborg, M., Winther, Ole & Madsen, D., 2023, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 63, 9, 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      DermX: An end-to-end framework for explainable automated dermatological diagnosis

      Jalaboi, R., Faye, F., Orbes-Arteaga, M., Jørgensen, D., Winther, Ole & Galimzianova, A., 2023, I: Medical Image Analysis. 83, 12 s., 102647.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      Detecting sequence signals in targeting peptides using deep learning

      Almagro Armenteros, J. J., Salvatore, Marco, Emanuelsson, O., Winther, Ole, von Heijne, G., Elofsson, A. & Nielsen, H., 2019, I: Life Science Alliance. 2, 5, 14 s., 201900429.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      Differential gene expression in the otic capsule and the middle ear-an annotation of bone-related signaling genes

      Nielsen, M. C., Martin-Bertelsen, T., Friis, M., Winther, Ole, Friis-Hansen, Lennart Jan, Rye-Jørgensen, N., Bloch, S. & Sørensen, Mads Sølvsten, 2015, I: Otology & Neurotology. 36, 4, s. 727-732 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    8. Udgivet

      DiscoTope-3.0: improved B-cell epitope prediction using inverse folding latent representations

      Høie, M. H., Gade, F. S., Johansen, J., Würtzen, C., Winther, Ole, Nielsen, M. & Marcatili, P., 2024, I: Frontiers in Immunology. 15, 12 s., 1322712.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      Discovery of regulatory elements is improved by a discriminatory approach

      Valen, E., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Krogh, Anders, 2009, I: PLoS Computational Biology. 5, 11, s. e1000562

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      Down-regulation of microRNAs controlling tumourigenic factors in follicular thyroid carcinoma

      Rossing, M., Helweg-Larsen, R. B., Henao Giraldo, R., Winther, Ole, Vikeså, J., Niazi, O., Godballe, C., Krogdahl, A., Glud, M., Sørensen, C. H., Kiss, K., Bennedbæk, F. N. & Nielsen, Finn Cilius, 2012, I: Journal of Molecular Endocrinology. 48, 1, s. 11-23 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. Udgivet

      Enterococcus faecalis infection causes inflammation, intracellular oxphos-independent ROS production, and DNA damage in human gastric cancer cells

      Strickertsson, J. A. B., Desler, Claus, Martin-Bertelsen, T., Machado, A. M. D., Wadstrøm, T., Winther, Ole, Rasmussen, Lene Juel & Friis-Hansen, Lennart Jan, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, s. 1-13 13 s., e63147.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    12. Udgivet

      Explainable Image Quality Assessments in Teledermatological Photography

      Jalaboi, R., Winther, Ole & Galimzianova, A., 2023, I: Telemedicine and e-Health. 29, 9, s. 1342-1348 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. Udgivet

      Forecasting Mood in Bipolar Disorder From Smartphone Self-assessments: Hierarchical Bayesian Approach

      Busk, J., Faurholt-Jepsen, M., Frost, M., Bardram, J. E., Kessing, Lars Vedel & Winther, Ole, 1 apr. 2020, I: JMIR mHealth and uHealth. 8, 4, 14 s., e15028.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      Gene expression of the endolymphatic sac

      Friis, M., Martin-Bertelsen, T., Friis-Hansen, Lennart Jan, Winther, Ole, Henao Giraldo, R., Sørensen, Mads Sølvsten & Qvortrup, Klaus, 2011, I: Acta Oto-Laryngologica. 131, 12, s. 1257-63 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    15. Udgivet

      Genome-wide detection and analysis of hippocampus core promoters using DeepCAGE

      Valen, E., Pascarella, G., Chalk, A., Maeda, N., Kojima, M., Kawazu, C., Murata, M., Nishiyori, H., Lazarevic, D., Motti, D., Marstrand, T. T., Tang, M-H. E., Zhao, X., Krogh, A., Winther, O., Arakawa, T., Kawai, J., Wells, C., Daub, C., Harbers, M. & 4 flere, Hayashizaki, Y., Gustincich, S., Sandelin, Albin Gustav & Carninci, P., 2009, I: Genome Research. 19, 2, s. 255-65 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    16. Udgivet

      Graph neural network interatomic potential ensembles with calibrated aleatoric and epistemic uncertainty on energy and forces

      Busk, J., Schmidt, M. N., Winther, Ole, Vegge, T. & Jørgensen, P. B., 2023, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 25, s. 25828-25837 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. Udgivet

      GraphPart: homology partitioning for biological sequence analysis

      Teufel, Felix Georg, Gíslason, M. H., Almagro Armenteros, J. J., Johansen, A. R., Winther, Ole & Nielsen, H., 2023, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 5, 4, 9 s., lqad088.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      Growth-rate regulated genes have profound impact on interpretation of transcriptome profiling in Saccharomyces cerevisiae

      Regenberg, Birgitte, Grotkjaer, T., Winther, Ole, Fausbøll, A., Akesson, M., Bro, C., Hansen, L. K., Brunak, Søren & Nielsen, Jens Bo, 2006, I: Genome Biology (Online Edition). 7, 11, s. R107

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      HemaExplorer: a database of mRNA expression profiles in normal and malignant haematopoiesis

      Bagger, F. O., Rapin, N. P. J., Theilgaard-Mønch, Kim, Kaczkowski, B., Thorén, L. A. M., Jendholm, L. J., Winther, Ole & Porse, Bo Torben, 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, Database issue, s. D1034-D1039 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. Udgivet

      Identification and validation of 174 COVID-19 vaccine candidate epitopes reveals low performance of common epitope prediction tools

      Prachar, Marek, Justesen, S., Steen-Jensen, D. B., Thorgrimsen, S., Jurgons, E., Winther, Ole & Bagger, F. O., 2020, I: Scientific Reports. 10, 8 s., 20465.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    21. Udgivet

      Improved metagenome binning and assembly using deep variational autoencoders

      Nissen, J. N., Johansen, Joachim, Allesoe, R. L., Sonderby, C. K., Armenteros, J. J. A., Grønbech, Christopher Heje, Jensen, Lars Juhl, Nielsen, H. B., Petersen, T. N., Winther, Ole & Rasmussen, Simon, 2021, I: Nature Biotechnology. 39, s. 555-560

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    22. Udgivet

      Improving The Analysis Of Gene Expression Profiles By Comparing AML Blasts With Their Nearest Normal Counterparts

      Rapin, N., Bagger, F. O., Jendholm, J., Mora-Jensen, H. I., Krogh, Anders, Kohlmann, A., Thiede, C., Borregaard, N., Bullinger, L., Winther, Ole, Theilgaard-Mønch, Kim & Porse, Bo Torben, 2013, I: Blood. 122, 21

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

    23. Udgivet

      Integrative analyses reveal novel strategies in HPV11,-16 and -45 early infection

      Kaczkowski, B., Rossing, M., Andersen, D. K., Dreher, A., Morevati, M., Visser, M. A., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Norrild, B., 2012, I: Scientific Reports. 2, s. 515

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. Udgivet

      Interpretable autoencoders trained on single cell sequencing data can transfer directly to data from unseen tissues

      Walbech, J. S., Kinalis, S., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: Cells. 11, 12 s., 85.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    25. Udgivet

      JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update.

      Bryne, J. C., Valen, E., Tang, M. E., Marstrand, T., Winther, Ole, da Piedade, I., Krogh, Anders, Lenhard, B. & Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Database issue, s. D102-6

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    Forrige 1 2 3 4 Næste

    ID: 171145930