Ludovic Antoine Alexandre Orlando
Ludovic Antoine Alexandre Orlando

Professor

  • Section for Geogenetics

    Øster Voldgade 5-7, 1350 København K

    Telefon: +45 35 32 12 31Mobil: +33 61 82 79 510

  1. 2020
  2. Udgivet

    Ancient Genomes Reveal Unexpected Horse Domestication and Management Dynamics

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2020, I : BioEssays. 42, 1, s. 1-8 1900164.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  3. 2019
  4. Udgivet

    Origin and Evolution of Deleterious Mutations in Horses

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Librado, P., sep. 2019, I : Genes. 10, 16 s., 649.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Paleogenomics: Reconstruction of plant evolutionary trajectories from modern and ancient DNA

    Pont, C., Wagner, S., Kremer, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Plomion, C. & Salse, J., 11 feb. 2019, I : Genome Biology. 20, 1, 17 s., 29.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Sexing Viking Age horses from burial and non-burial sites in Iceland using ancient DNA

    Nistelberger, H. M., Pálsdóttir, A. H., Star, B., Leifsson, R., Gondek, A. T., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Barrett, J. H., Hallsson, J. H. & Boessenkool, S., 1 jan. 2019, I : Journal of Archaeological Science. 101, s. 115-122

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Authentication and assessment of contamination in ancient DNA

    Renaud, Gabriel, Schubert, M., Sawyer, S. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2019, Ancient DNA: Methods and Protocols. Shapiro, B., Barlow, A., Heintzman, P. D., Hofreiter, M., Paijmans, J. L. A. & Soares, A. E. R. (red.). 2. ed. udg. Humana Press, s. 163-194 32 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1963).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    DNA metabarcoding - need for robust experimental designs to draw sound ecological conclusions

    Zinger, L., Bonin, A., Alsos, I. G., Bálint, M., Bik, H., Boyer, F., Chariton, A. A., Creer, S., Coissac, E., Deagle, B. E., De Barba, M., Dickie, I. A., Dumbrell, A. J., Ficetola, G. F., Fierer, N., Fumagalli, L., Gilbert, M Thomas P, Jarman, S., Jumpponen, A., Kauserud, H., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Pansu, J., Pawlowski, J., Tedersoo, L., Thomsen, P. F., Willerslev, Eske & Taberlet, P., 2019, I : Molecular Ecology. 28, 8, s. 1857-1862 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    DamMet: ancient methylome mapping accounting for errors, true variants, and post-mortem DNA damage

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, Renaud, Gabriel, Albrechtsen, Anders & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2019, I : GigaScience. 8, 4, 6 s., giz025.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Early Pleistocene enamel proteome from Dmanisi resolves Stephanorhinus phylogeny

    Cappellini, Enrico, Welker, Frido, Pandolfi, L., Ramos Madrigal, Jazmin, Samodova, Diana, Rüther, Patrick, Fotaki, Anna Katerina, Lyon, D., Moreno Mayar, José Victor, Bukhsianidze, M., Rakownikow Jersie-Christensen, R., Mackie, Meaghan, Ginolhac, A., Ferring, R., Tappen, M., Palkopoulou, E., Dickinson, M. R., Stafford, T. W., Chan, Y. L., Götherström, A., Nathan, S. K. S. S., Heintzman, P. D., Kapp, J. D., Kirillova, I., Moodley, Y., Agusti, J., Kahlke, R. D., Kiladze, G., Martínez-Navarro, B., Liu, S., Sandoval-Velasco, Marcela, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kelstrup, C. D., Allentoft, Morten Erik, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Penkman, K., Shapiro, B., Rook, L., Dalén, L., Gilbert, M Thomas P, Olsen, Jesper Velgaard, Lordkipanidze, D. & Willerslev, Eske, 2019, I : Nature. 574, 7776, s. 103-107 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  11. Investigating ancient animal economies and exchange in Kyrgyzstan's Alay Valley

    Taylor, W. T. T., Shnaider, S., Spengler, R., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Abdykanova, A. & Krivoshapkin, A., 2019, I : Antiquity. 93, 367, 5 s., e2.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Joint Estimates of Heterozygosity and Runs of Homozygosity for Modern and Ancient Samples

    Renaud, Gabriel, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Korneliussen, Thorfinn Sand, Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2019, I : Genetics. 212, 3, s. 587-614 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Tracking Five Millennia of Horse Management with Extensive Ancient Genome Time Series

    Fages, A., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Khan, N., Gaunitz, Charleen, Seguin-Orlando, A., Leonardi, M., McCrory Constantz, C., Gamba, C., Al-Rasheid, K. A. S., Albizuri, S., Alfarhan, A. H., Allentoft, Morten Erik, Alquraishi, S., Anthony, D., Baimukhanov, N., Barrett, J. H., Bayarsaikhan, J., Benecke, N., Bernáldez-Sánchez, E., Berrocal-Rangel, L., Biglari, F., Boessenkool, S., Boldgiv, B., Brem, G., Brown, D., Burger, J., Crubézy, E., Daugnora, L., Davoudi, H., Damgaard, P. D. B., de los Ángeles de Chorro y de Villa-Ceballos, M., Deschler-Erb, S., Detry, C., Dill, N., do Mar Oom, M., Dohr, A., Ellingvåg, S., Erdenebaatar, D., Fathi, H., Felkel, S., Fernández-Rodríguez, C., García-Viñas, E., Germonpré, M., Granado, J. D., Hallsson, J. H., Hemmer, H., Hofreiter, M., Kasparov, A., Khasanov, M., Khazaeli, R., Kosintsev, P., Kristiansen, K., Kubatbek, T., Kuderna, L., Kuznetsov, P., Laleh, H., Leonard, J. A., Lhuillier, J., Liesau von Lettow-Vorbeck, C., Logvin, A., Lõugas, L., Ludwig, A., Luis, C., Arruda, A. M., Marques-Bonet, T., Matoso Silva, R., Merz, V., Mijiddorj, E., Miller, B. K., Monchalov, O., Mohaseb, F. A., Morales, A., Nieto-Espinet, A., Nistelberger, H., Onar, V., Pálsdóttir, A. H., Pitulko, V., Pitskhelauri, K., Pruvost, M., Rajic Sikanjic, P., Rapan Papeša, A., Roslyakova, N., Sardari, A., Sauer, E., Schafberg, R., Scheu, A., Schibler, J., Schlumbaum, A., Serrand, N., Serres-Armero, A., Shapiro, B., Sheikhi Seno, S., Shevnina, I., Shidrang, S., Southon, J., Star, B., Sykes, N., Taheri, K., Taylor, W., Teegen, W. R., Trbojević Vukičević, T., Trixl, S., Tumen, D., Undrakhbold, S., Usmanova, E., Vahdati, A., Valenzuela-Lamas, S., Viegas, C., Wallner, B., Weinstock, J., Zaibert, V., Clavel, B., Lepetz, S., Mashkour, M., Helgason, A., Stefánsson, K., Barrey, E., Willerslev, Eske, Outram, A. K., Librado, P. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2019, I : Cell. 177, 6, s. 1419-1435, e1-e31

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. 2018
  15. Udgivet

    Convergent genomic signatures of domestication in sheep and goats

    Alberto, F. J., Boyer, F., Orozco-terwengel, P., Streeter, I., Servin, B., De Villemereuil, P., Benjelloun, B., Librado, P., Biscarini, F., Colli, L., Barbato, M., Zamani, W., Alberti, A., Engelen, S., Stella, A., Joost, S., Ajmone-marsan, P., Negrini, R., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Rezaei, H. R., Naderi, S., Clarke, L., Flicek, P., Wincker, P., Coissac, E., Kijas, J., Tosser-klopp, G., Chikhi, A., Bruford, M. W., Taberlet, P. & Pompanon, F., 1 dec. 2018, I : Nature Communications. 9, 1, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Horse Y chromosome assembly displays unique evolutionary features and putative stallion fertility genes

    Janečka, J. E., Davis, B. W., Ghosh, S., Paria, N., Das, P. J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Schubert, M., Nielsen, M. K., Stout, T. A. E., Brashear, W., Li, G., Johnson, C. D., Metz, R. P., Zadjali, A. M. A., Love, C. C., Varner, D. D., Bellott, D. W., Murphy, W. J., Chowdhary, B. P. & Raudsepp, T., 1 dec. 2018, I : Nature Communications. 9, 1, 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Late Bronze Age cultural origins of dairy pastoralism in Mongolia

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 27 nov. 2018, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 48, s. 12083-12085

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Early pastoral economies along the Ancient Silk Road: Biomolecular evidence from the Alay Valley, Kyrgyzstan

    Taylor, W., Shnaider, S., Abdykanova, A., Fages, A., Welker, Frido, Irmer, F., Seguin-orlando, A., Khan, N., Douka, K., Kolobova, K., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Krivoshapkin, A., Boivin, N. & Hardy, K. (red.), sep. 2018, I : PLOS ONE. 13, 10, 19 s., e0205646.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    The prehistoric peopling of Southeast Asia

    McColl, Hugh, Racimo, Fernando, Vinner, Lasse, Demeter, Fabrice, Gakuhari, T., Moreno Mayar, José Victor, van Driem, G., Gram Wilken, U., Seguin-Orlando, A., de la Fuente Castro, C. P., Wasef, S., Shoocongdej, R., Souksavatdy, V., Sayavongkhamdy, T., Saidin, M. M., Allentoft, Morten Erik, Sato, T., Malaspinas, A., Aghakhanian, F. A., Korneliussen, Thorfinn Sand, Prohaska, A., Margaryan, Ashot, Damgaard, P. D. B., Kaewsutthi, S., Lertrit, P., Nguyen, T. M. H., Hung, H., Minh Tran, T., Nghia Truong, H., Nguyen, G. H., Shahidan, S., Wiradnyana, K., Matsumae, H., Shigehara, N., Yoneda, M., Ishida, H., Masuyama, T., Yamada, Y., Tajima, A., Shibata, H., Toyoda, A., Hanihara, T., Nakagome, S., Deviese, T., Bacon, A., Duringer, P., Ponche, J., Shackelford, L., Patole-Edoumba, E., Nguyen, A. T., Bellina-Pryce, B., Galipaud, J., Kinaston, R., Buckley, H., Pottier, C., Rasmussen, Simon, Higham, T., Foley, R. A., Lahr, M. M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Sikora, Martin, Phipps, M. E., Oota, H., Higham, C., Lambert, D. M. & Willerslev, Eske, 6 jul. 2018, I : Science (New York, N.Y.). 361, 6397, s. 88-92 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes

    Damgaard, P. D. B., Marchi, N., Rasmussen, Simon, Peyrot, M., Renaud, Gabriel, Korneliussen, Thorfinn Sand, Moreno Mayar, José Victor, Pedersen, Mikkel Winther, Goldberg, A., Usmanova, E., Baimukhanov, N., Loman, V., Hedeager, L., Pedersen, A. G., Nielsen, K., Afanasievl, G., Akmatov, K., Aldashev, A., Alpaslan, A., Baimbetov, G., Bazaliiskii, V. I., Beisenov, A., Boldbaatar, B., Boldgiv, B., Dorzhu, C., Ellingvag, S., Erdenebaatar, D., Dajani, R., Dmitriev, E., Evdokimov, V., Frei, K. M., Gromov, A., Goryachev, A., Hakonarson, H., Hegay, T., Khachatryan, Z., Khaskhanov, R., Kitov', E., Kolbina, A., Kubatbek, T., Kukushkin, A., Kukushkin, I., Lau, N., Margaryan, Ashot, Merkyte, I., Mertz, I. V., Mertz, V. K., Mijiddorj, E., Moiyesev, V., Mukhtarova, G., Nurmukhanbetov, B., Orozbekova, Z., Panyushkina, I., Pieta, K., Smrčka, V., Shevnina, I., Logvin, A., Sjögren, K., Štolcová, T., Tashbaeva, K., Tkachev, A., Tulegenov, T., Voyakin, D., Yepiskoposyan, L., Undrakhbold, S., Varfolomeev, V., Weber, A., Kradin, N., Allentoft, Morten Erik, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Nielsen, Rasmus, Sikora, Martin, Heyer, E., Kristiansen, K. & Willerslev, Eske, 2018, I : Nature. 557, 7705, s. 369-374 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Vibrio tapetis Displays an Original Type IV Secretion System in Strains Pathogenic for Bivalve Molluscs

    Dias, G. M., Bidault, A., Le Chevalier, P., Choquet, G., Sarkissian, C. D., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Medigue, C., Barbe, V., Mangenot, S., Thompson, C. C., Thompson, F. L., Jacq, A., Pichereau, V. & Paillard, C., 2018, I : Frontiers in Microbiology. 9, 14 s., 227.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    A southern African origin and cryptic structure in the highly mobile plains zebra

    Pedersen, C. T., Albrechtsen, Anders, Etter, P. D., Johnson, E. A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Chikhi, L., Siegismund, Hans Redlef & Heller, Rasmus, 2018, I : Nature Ecology & Evolution. 2, 3, s. 491-498 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Ancient genomes revisit the ancestry of domestic and Przewalski's horses

    Gaunitz, Charleen, Fages, A. A., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Albrechtsen, Anders, Khan, N., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Owens, I. J., Felkel, S., Bignon-Lau, O., Damgaard, P. D. B., Mittnik, A., Mohaseb, A. F., Davoudi, H., Alquraishi, S., Alfarhan, A. H., Al-Rasheid, K. A. S., Crubézy, E., Benecke, N., Olsen, S., Brown, D., Anthony, D., Massy, K., Pitulko, V., Kasparov, A., Brem, G., Hofreiter, M., Mukhtarova, G., Baimukhanov, N., Lõugas, L., Onar, V., Stockhammer, P. W., Krause, J., Boldgiv, B., Undrakhbold, S., Erdenebaatar, D., Lepetz, S., Mashkour, M., Ludwig, A., Wallner, B., Merz, V., Merz, I., Zaibert, V., Willerslev, Eske, Sanz, P. L., Outram, A. K. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2018, I : Science. 360, 6384, s. 111-114 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Ancient hepatitis B viruses from the Bronze Age to the Medieval period

    Mühlemann, B., Jones, T. C., Damgaard, P. D. B., Allentoft, Morten Erik, Shevnina, I., Logvin, A., Usmanova, E., Panyushkina, I. P., Boldgiv, B., Bazartseren, T., Tashbaeva, K., Merz, V., Lau, N., Smrcka, V., Voyakin, D., Kitov, E., Epimakhov, A., Pokutta, D., Vicze, M., Price, T. D., Moiseyev, V., Hansen, Anders Johannes, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Rasmussen, Simon, Sikora, Martin, Vinner, Lasse, Osterhaus, A. D. M. E., Smith, D. J., Glebe, D., Fouchier, R. A. M., Drosten, C., Sjögren, K., Kristiansen, K. & Willerslev, Eske, 2018, I : Nature. 557, 7705, s. 418-423 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Decline of genetic diversity in ancient domestic stallions in Europe

    Wutke, S., Sandoval-Castellanos, E., Benecke, N., Döhle, H., Friederich, S., Gonzalez, J., Hofreiter, M., Lõugas, L., Magnell, O., Malaspinas, A., Morales-Muñiz, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Reissmann, M., Trinks, A. & Ludwig, A., 2018, I : Science Advances. 4, 4, 8 s., eaap9691.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Detecting signatures of positive selection along defined branches of a population tree using LSD

    Librado, P. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2018, I : MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 35, 6, s. 1520-1535 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    High-Throughput DNA sequencing of ancient wood

    Wagner, S., Lagane, F., Seguin-Orlando, A., Schubert, M., Leroy, T., Guichoux, E., Chancerel, E., Bech-Hebelstrup, I., Bernard, V., Billard, C., Billaud, Y., Bolliger, M., Croutsch, C., Cufar, K., Eynaud, F., Heussner, K. U., Koeninger, J., Langenegger, F., Leroy, F., Lima, C., Martinelli, N., Momber, G., Billamboz, A., Nelle, O., Palomo, A., Pique, R., Ramstein, M., Schweichel, R., Staeuble, H., Tegel, W., Terradas, X., Verdin, F., Plomion, C., Kremer, A. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2018, I : Molecular Ecology. 27, 5, s. 1138-1154 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Improved de novo genomic assembly for the domestic donkey

    Renaud, Gabriel, Petersen, Bent, Seguin-orlando, A., Bertelsen, Mads Frost, Waller, A., Newton, R., Paillot, R., Bryant, N., Vaudin, M., Librado, P. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2018, I : Science Advances. 4, 4, eaaq0392.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Improved reference genome for the domestic horse increases assembly contiguity and composition

    Kalbfleisch, T. S., Rice, E. S., DePriest, M. S. ,. J., Walenz, B. P., Hestand, M. S., Vermeesch, J. R., O'Connell, B. L., Fiddes, I. T., Vershinina, A. O., Saremi, N. F., Petersen, J. L., Finno, C. J., Bellone, R. R., McCue, M. E., Brooks, S. A., Bailey, E., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Greene, R. E., Miller, D. C., Antczak, D. F. & MacLeod, J. N., 2018, I : Communications Biology. 1, 8 s., 197.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Late Quaternary horses in Eurasia in the face of climate and vegetation change

    Leonardi, M., Boschin, F., Giampoudakis, K., Beyer, R. M., Krapp, M., Bendrey, R., Sommer, R., Boscato, P., Manica, A., Nogues, David Bravo & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2018, I : Science Advances. 4, 7, 12 s., eaar5589.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Oral health status in historic population: Macroscopic and metagenomic evidence

    Willmann, C., Mata, X., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Tonasso, L., Tisseyre, L., Jeziorski, C., Cabot, E., Chevet, P., Crubézy, E., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Esclassan, R., Thèves, C. & Caramelli, D., 2018, I : PLOS ONE. 13, 5, 18 s., e0196482.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Terminal Pleistocene Alaskan genome reveals first founding population of Native Americans

    Moreno Mayar, José Victor, Potter, B. A., Vinner, Lasse, Steinrucken, M., Rasmussen, Simon, Terhorst, J., Kamm, J. A., Albrechtsen, Anders, Malaspinas, A., Sikora, Martin, Reuther, J. D., Irish, J. D., Malhi, R. S., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Song, Y. S., Nielsen, Rasmus, Meltzer, D. J. & Willerslev, Eske, 2018, I : Nature Genetics. 553, 7687, s. 203-207 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia

    Damgaard, P. D. B., Martiniano, R., Kamm, J., Moreno Mayar, José Victor, Kroonen, Guus, Peyrot, M., Barjamovic, G., Rasmussen, Simon, Zacho, Claus Grønlund, Baimukhanov, N., Zaibert, V., Merz, V., Biddanda, A., Merz, I., Loman, V., Evdokimov, V., Usmanova, E., Hemphill, B., Seguin-Orlando, A., Yediay, Fulya Eylem, Ullah, I., Sjögren, K., Iversen, K. H., Choin, J., jxb425, jxb425, Ilardo, M., Schroeder, Hannes, Moiseyev, V., Gromov, A., Polyakov, A., Omura, S., Senyurt, S. Y., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Ahmad, H., McKenzie, C., Margaryan, Ashot, Hameed, A., Samad, A., Gul, N., Khokhar, M. H., Goriunova, O. I., Bazaliiskii, V. I., Novembre, J., Weber, A. W., Allentoft, Morten Erik, Nielsen, R., Kristiansen, K., Sikora, Martin, Outram, A. K., Durbin, R. & Willerslev, Eske, 2018, I : Science. 360, 6396, 11 s., 1422.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. 2017
  35. Udgivet

    Evaluating the impact of domestication and captivity on the horse gut microbiome

    Metcalf, J. L., Song, S. J., Morton, J. T., Weiss, S., Seguin-Orlando, A., Joly, F., Feh, C., Taberlet, P., Coissac, E., Amir, A., Willerslev, Eske, Knight, R., McKenzie, V. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 14 nov. 2017, I : Scientific Reports. 7, 9 s., 15497.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Survival and divergence in a small group: the extraordinary genomic history of the endangered Apennine brown bear stragglers

    Benazzo, A., Trucchi, E., Cahill, J. A., Delser, P. M., Mona, S., Fumagalli, M., Bunnefeld, L., Cornetti, L., Ghirotto, S., Girardi, M., Ometto, L., Panziera, A., Rota-Stabelli, O., Zanetti, E., Karamanlidis, A., Groff, C., Paule, L., Gentile, L., Vilà, C., Vicario, S., Boitani, L., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Fuselli, S., Vernesi, C., Shapiro, B., Ciucci, P. & Bertorelle, G., 7 nov. 2017, I : Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 114, 45, s. E9589-E9597 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Ancient genomes show social and reproductive behavior of early Upper Paleolithic foragers

    Sikora, Martin, Seguin-Orlando, A., Sousa, V. C., Albrechtsen, Anders, Korneliussen, Thorfinn Sand, Ko, A., Rasmussen, Simon, Dupanloup, I., Nigst, P. R., Bosch, M. D., Renaud, Gabriel, Allentoft, Morten Erik, Margaryan, Ashot, Vasilyev, S. V., Veselovskaya, E. V., Borutskaya, S. B., Deviese, T., Comeskey, D., Higham, T., Manica, A., Foley, R., Meltzer, D. J., Nielsen, Rasmus, Excoffler, L., Lahr, M. M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Willerslev, Eske, 3 nov. 2017, I : Science. 358, 6363, s. 659-662 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Genome-wide ancestry and demographic history of African-descendant Maroon communities from French Guiana and Suriname

    Fortes-Lima, C., Gessain, A., Ruiz-Linares, A., Bortolini, M., Migot-Nabias, F., Bellis, G., Moreno Mayar, José Victor, Restrepo, B. N., Rojas, W., Avendaño-Tamayo, E., Bedoya, G., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Salas, A., Helgason, A., Gilbert, M Thomas P, Sikora, Martin, Schroeder, Hannes & Dugoujon, J., 2 nov. 2017, I : American Journal of Human Genetics. 101, 5, s. 725-736 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    The effects of captivity on the mammalian gut microbiome

    McKenzie, V. J., Song, S. J., Delsuc, F., Prest, T. L., Oliverio, A. M., Korpita, T. M., Alexiev, A., Amato, K. R., Metcalf, J. L., Kowalewski, M., Avenant, N. L., Link, A., Di Fiore, A., Seguin-Orlando, A., Feh, C., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Mendelson, J. R., Sanders, J. & Knight, R., okt. 2017, I : Integrative and Comparative Biology. 57, 4, s. 690-704 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Ancient DNA analysis identifies marine mollusc shells as new metagenomic archives of the past

    Der Sarkissian, C., Pichereau, V., Dupont, C., Ilsøe, P. C., Perrigault, M., Butler, P., Chauvaud, L., Eiríksson, J., Scourse, J., Paillard, C. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, sep. 2017, I : Molecular Ecology Resources. 17, 5, s. 835-853 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Developing a 670k genotyping array to tag ~2M SNPs across 24 horse breeds

    Schaefer, R. J., Schubert, M., Bailey, E., Bannasch, D. L., Barrey, E., Bar-Gal, G. K., Brem, G., Brooks, S. A., Distl, O., Fries, R., Finno, C. J., Gerber, V., Haase, B., Jagannathan, V., Kalbfleisch, T., Leeb, T., Lindgren, G., Lopes, M. S., Mach, N., Machado, A. D. C., MacLeod, J. N., McCoy, A., Metzger, J., Penedo, C., Polani, S., Rieder, S., Tammen, I., Tetens, J., Thaller, G., Verini-Supplizi, A., Wade, C., Wallner, B., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Mickelson, J. R. & McCue, M. E., 27 jul. 2017, I : BMC Genomics. 18, 18 s., 565.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Combining bleach and mild predigestion improves ancient DNA recovery from bones

    Boessenkool, S., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Nistelberger, H. M., Der Sarkissian, C., Gondek, A. T., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Barrett, J. H. & Star, B., jul. 2017, I : Molecular Ecology Resources. 17, 4, s. 742–751 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Planktonic foraminifera-derived environmental DNA extracted from abyssal sediments preserves patterns of plankton macroecology

    Morard, R., Lejzerowicz, F., Darling, K. F., Lecroq-Bennet, B., Pedersen, Mikkel Winther, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Pawlowski, J., Mulitza, S., de Vargas, C. & Kucera, M., 6 jun. 2017, I : Biogeosciences. 14, 11, s. 2741-2754 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Less effective selection leads to larger genomes

    Lefébure, T., Morvan, C., Malard, F., François, C., Konecny-Dupré, L., Guéguen, L., Weiss-Gayet, M., Seguin-Orlando, A., Ermini, L., Der Sarkissian, C., Charrier, N. P., Eme, D., Mermillod-Blondin, F., Duret, L., Vieira, C., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Douady, C. J., jun. 2017, I : Genome Research. 27, 6, s. 1016-1028 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Experimental conditions improving in-solution target enrichment for ancient DNA

    Cruz-Dávalos, D. I., Llamas, B., Gaunitz, Charleen, Fages, A. A., Gamba, C., Soubrier, J., Sanz, P. L., Seguin-Orlando, A., Pruvost, M., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Scheu, A., Beneke, N., Ludwig, A., Cooper, A., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, maj 2017, I : Molecular Ecology Resources. 17, 3, s. 508-522 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Ancient genomic changes associated with domestication of the horse

    Sanz, P. L., Gamba, C., Gaunitz, Charleen, Der Sarkissian, C., Pruvost, M., Albrechtsen, Anders, Fages, A. A., Khan, N., Schubert, M., Jagannathan, V., Serres-Armero, A., Kuderna, L. F. K., Povolotskaya, I. S., Seguin-Orlando, A., Lepetz, S., Neuditschko, M., Thèves, C., Alquraishi, S., Alfarhan, A. H., AL-Rasheid, K., Rieder, S., Samashev, Z., Francfort, H., Benecke, N., Hofreiter, M., Ludwig, A., Keyser, C., Marques-Bonet, T., Ludes, B., Crubézy, E., Leeb, T., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 28 apr. 2017, I : Science. 356, 6336, s. 442-445 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Detecting taxonomic and phylogenetic signals in equid cheek teeth: towards new palaeontological and archaeological proxies

    Cucchi, T., Mohaseb, A., Peigné, S., Debue, K., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Mashkour, M., apr. 2017, I : Royal Society Open Science. 4, 4, 14 s., 160997.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Mitogenomic phylogeny, diversification, and biogeography of South American spiny rats

    Fabre, P., Upham, N. S., Emmons, L. H., Justy, F., Leite, Y. L. R., Loss, A. C., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Tilak, M., Patterson, B. D. & Douzery, E. J. P., mar. 2017, I : Molecular Biology and Evolution. 34, 3, s. 613-633 21 s., msw261.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Human evolution: a tale from ancient genomes

    Llamas, B., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 5 feb. 2017, I : Royal Society of London. Philosophical Transactions B. Biological Sciences. 372, 1713, 11 s., 20150484.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Taming the past: ancient DNA and the study of animal domestication

    MacHugh, D. E., Larson, G. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, feb. 2017, I : Annual Review of Animal Biosciences. 5, s. 329-351 23 s., 6.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Zonkey: a simple, accurate and sensitive pipeline to genetically identify equine Fl-hybrids in archaeological assemblages

    Schubert, M., Mashkour, M., Gaunitz, Charleen, Fages, A. A., Seguin-Orlando, A., Sheikhi, S., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Chuang, R., Ermini, L., Gamba, C., Weinstock, J., Vedat, O. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, feb. 2017, I : Journal of Archaeological Science. 78, s. 147-157 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    A communal catalogue reveals Earth's multiscale microbial diversity

    Earth Microbiome Project Consortium, E. M. P. C., 2017, I : Nature. 551, 7681, s. 457-463 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    A new genus of horse from Pleistocene North America

    Heintzman, P. D., Zazula, G. D., MacPhee, R. D. E., Scott, E., Cahill, J. A., McHorse, B. K., Kapp, J. D., Stiller, M., Wooller, M. J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Southon, J., Froese, D. G. & Shapiro, B., 2017, I : eLife. 6, 43 s., e29944.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Covariation in life history, body and brain size, and molecular substitution rate across the diverse radiation of extant and extinct (megafaunal) lemurs

    Perry, G., Kistler, L., Schwartz, G. T., Godfrey, L. R. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2017, I : American Journal of Physical Anthropology. 162, Supplement S64, s. 314 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  55. Udgivet

    Evolutionary patterns and processes: lessons from ancient DNA

    Leonardi, M., Sanz, P. L., Der Sarkissian, C., Schubert, M., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Gamba, C., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2017, I : Systematic Biology. 66, 1, s. e1-e29 29 s., syw059.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics

    Gopalakrishnan, Shyam, Samaniego Castruita, J. A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Räikkönen, J., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Larson, G., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes, Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2017, I : BMC Genomics. 18, 11 s., 495.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    gargammel: a sequence simulator for ancient DNA

    Renaud, Gabriel, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2017, I : Bioinformatics. 33, 4, s. 577-579 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  58. 2016
  59. Udgivet

    Spotted phenotypes in horses lost attractiveness in the Middle Ages

    Wutke, S., Benecke, N., Sandoval-Castellanos, E., Döhle, H., Friederich, S., Gonzalez, J., Hallsson, J. H., Hofreiter, M., Lõugas, L., Magnell, O., Morales-Muniz, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Pálsdóttir, A. H., Reissmann, M., Ruttkay, M., Trinks, A. & Ludwig, A., 7 dec. 2016, I : Scientific Reports. 6, 9 s., 38548.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  60. Udgivet

    Population characteristics of a large whale shark aggregation inferred from seawater environmental DNA

    Sigsgaard, E. E., Nielsen, Ida Broman, Bach, S. S., Lorenzen, Eline, Robinson, D. P., Knudsen, Steen Wilhelm, Pedersen, Mikkel Winther, Al Jaidah, M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Willerslev, Eske, Møller, Peter Rask & Thomsen, P. F., 21 nov. 2016, I : Nature Ecology & Evolution. 1, 1, 4 s., 0004.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  61. Udgivet

    metaBIT, an integrative and automated metagenomic pipeline for analysing microbial profiles from high-throughput sequencing shotgun data

    Louvel, G., Der Sarkissian, C., Hanghøj, Kristian Ebbesen & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, nov. 2016, I : Molecular Ecology Resources. 16, 6, s. 1415-1427 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  62. Udgivet

    The evolutionary origin and genetic makeup of domestic horses

    Sanz, P. L., Fages, A. A., Gaunitz, Charleen, Leonardi, M., Wagner, S., Khan, N., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Alquraishi, S. A., Alfarhan, A. H., Al-Rasheid, K. A., Der Sarkissian, C., Schubert, M. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, okt. 2016, I : Genetics. 204, 2, s. 423-434 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  63. Udgivet

    The origin of ambling horses

    Wutke, S., Andersson, L., Benecke, N., Sandoval-Castellanos, E., Gonzalez, J., Hallsson, J. H., Lõugas, L., Magnell, O., Morales-Muniz, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Pálsdóttir, A. H., Reissmann, M., Muñoz-Rodríguez, M. B., Ruttkay, M., Trinks, A., Hofreiter, M. & Ludwig, A., 8 aug. 2016, I : Current Biology. 26, 15, s. R697-R699 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  64. Udgivet

    Synergistic roles of climate warming and human occupation in Patagonian megafaunal extinctions during the Last Deglaciation

    Metcalf, J. L., Turney, C., Barnett, R., Martin, F., Bray, S. C., Mouatt, J. T. V., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Salas-Gismondi, R., Loponte, D., Medina, M., De Nigris, M., Civalero, T., Fernández, P. M., Gasco, A., Duran, V., Seymour, K. L., Otaola, C., Gil, A., Paunero, R., Prevosti, F. J., Bradshaw, C. J. A., Wheeler, J. C., Borrero, L., Austin, J. J. & Cooper, A., jun. 2016, I : Science Advances. 2, 6, s. e1501682 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  65. Udgivet

    A genomewide catalogue of single nucleotide polymorphisms in white-beaked and Atlantic white-sided dolphins

    Fernandez Garcia, R., Schubert, M., Vargas-Velazquez, A. M., Brownlow, A., Vikingsson, G. A., Siebert, U., Jensen, L. F., Øien, N., Wall, D., Rogan, E., Mikkelsen, B., Dabin, W., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Guillot, G. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2016, I : Molecular Ecology Resources. 16, 1, s. 266-276 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  66. Udgivet

    Accurate continuous geographic assignment from low- to high-density SNP data

    Guillot, G., Jónsson, H., Hinge, A., Manchih, N. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2016, I : Bioinformatics. 32, 7, s. 1106-1108 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  67. Udgivet

    AdapterRemoval v2: rapid adapter trimming, identification, and read merging

    Schubert, M., Lindgreen, Stinus & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2016, I : BMC Research Notes. 9, 7 s., 88.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  68. Udgivet

    Back to the roots and routes of dromedary domestication

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2016, I : National Academy of Sciences. Proceedings. 113, 24, s. 6588-6590 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  69. Udgivet

    Comparing the performance of three ancient DNA extraction methods for high-throughput sequencing

    Gamba, C., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Gaunitz, Charleen, Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Bradley, D. G. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2016, I : Molecular Ecology Resources. 16, 2, s. 459-469 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  70. Udgivet

    Early cave art and ancient DNA record the origin of European bison

    Soubrier, J., Gower, G., Chen, K., Richards, S. M., Llamas, B., Mitchell, K. J., Ho, S. Y. W., Kosintsev, P., Lee, M. S. Y., Baryshnikov, G., Bollongino, R., Bover, P., Burger, J., Chivall, D., Crégut-Bonnoure, E., Decker, J. E., Doronichev, V. B., Douka, K., Fordham, D. A., Fontana, F., Fritz, C., Glimmerveen, J., Golovanova, L. V., Groves, C., Guerreschi, A., Haak, W., Higham, T., Hofman-Kamińska, E., Immel, A., Julien, M., Krause, J., Krotova, O., Langbein, F., Larson, G., Rohrlach, A., Scheu, A., Schnabel, R. D., Taylor, J. F., Tokarska, M., Tosello, G., van der Plicht, J., van Loenen, A., Vigne, J., Wooley, O., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Kowalczyk, R., Shapiro, B. & Cooper, A., 2016, I : Nature Communications. 7, s. 13158 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  71. Udgivet

    Fast, accurate and automatic ancient nucleosome and methylation maps with epiPALEOMIX

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, Seguin-Orlando, A., Schubert, M., Madsen, T., Pedersen, J. S., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2016, I : Molecular Biology and Evolution. 33, 12, s. 3284-3298 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  72. Udgivet

    Positive selection in the SLC11A1 gene in the family Equidae

    Bayerova, Z., Janova, E., Matiasovic, J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Horin, P., 2016, I : Immunogenetics. 68, 5, s. 353-364 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  73. Udgivet

    Postglacial viability and colonization in North America’s ice-free corridor

    Pedersen, Mikkel Winther, Ruter, Anthony Henry, Schweger, C., Friebe, H., Staff, R. A., Kjeldsen, Kristian Kjellerup, Zepeda Mendoza, M. L., Beaudoin, A. B., Zutter, C., Larsen, Nicolaj Krog, Potter, B. A., Nielsen, Rasmus, Rainville, R. A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Meltzer, D. J., Kjær, Kurt H. & Willerslev, Eske, 2016, I : Nature. 537, 7618, s. 45–49 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  74. Udgivet

    Regulatory mutations in TBX3 disrupt asymmetric hair pigmentation that underlies Dun camouflage color in horses

    Imsland, F., McGowan, K., Rubin, C., Henegar, C., Sundström, E., Berglund, J., Schwochow, D., Gustafson, U., Imsland, P., Lindblad-Toh, K., Lindgren, G., Mikko, S., Millon, L., Wade, C., Schubert, M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Penedo, M. C. T., Barsh, G. S. & Andersson, L., 2016, I : Nature Genetics. 48, 2, s. 152-158 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  75. Udgivet

    The traveling optical scanner – case study on 3D shape models of ancient Brazilian skulls

    Trinderup, C. H., Dahl, V. A., Gregersen, K., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Dahl, A. B., 2016, Image and Signal Processing: 7th International Conference, ICISP 2016, Trois-Rivières, QC, Canada, May 30 - June 1, 2016, Proceedings. Mansouri, A., Nouboud, F., Chalifour, A., Mammass, D., Meunier, J. & Elmoataz, A. (red.). Springer, s. 398-405 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 9680).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  76. 2015
  77. Udgivet

    Ancient proteins resolve the evolutionary history of Darwin's South American ungulates

    Welker, Frido, Collins, Matthew James, Thomas, J. A., Wadsley, M., Brace, S., Cappellini, Enrico, Turvey, S. T., Reguero, M., Gelfo, J. N., Kramarz, A., Burger, J., Thomas-Oates, J., Ashford, D. A., Ashton, P. D., Rowsell, K., Porter, D. M., Kessler, B., Fischer, R., Baessmann, C., Kaspar, S., Olsen, Jesper Velgaard, Kiley, P., Elliott, J. A., Kelstrup, C. D., Mullin, V., Hofreiter, M., Willerslev, Eske, Hublin, J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Barnes, I. & MacPhee, R. D. E., 4 jun. 2015, I : Nature. 522, 7554, s. 81–84 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  78. Udgivet

    Amplification of TruSeq ancient DNA libraries with AccuPrime Pfx: consequences on nucleotide misincorporation and methylation patterns

    Seguin-Orlando, A., Hoover, C. A., Vasiliev, S. K., Ovodov, N. D., Shapiro, B., Cooper, A., Rubin, E. M., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 31 mar. 2015, I : Science and Technology of Archaeological Research. 1, 1, s. 1-9 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  79. Udgivet

    Major transitions in human evolution revisited: A tribute to ancient DNA

    Ermini, L., Dersarkissian, C. S. I., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, feb. 2015, I : Journal of Human Evolution. 79, s. 4-20 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  80. Udgivet

    Population demography and genetic diversity in the pleistocene cave lion

    Ersmark, E., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Sandoval-Castellanos, E., Barnes, I., Barnett, R., Stuart, A., Lister, A. & Dalén, L., 1 jan. 2015, I : Open Quaternary. 1, 4.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  81. Udgivet

    Ancient DNA and human evolution

    Perry, G. H. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Journal of Human Evolution. 79, s. 1-3 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  82. Udgivet

    Ancient and modern environmental DNA

    Pedersen, Mikkel Winther, Overballe-Petersen, S., Ermini, L., Der Sarkissian, C., Haile, James Seymour, Hellström, A. M., Spens, J., Thomsen, P. F., Bohmann, Kristine, Cappellini, Enrico, Schnell, I. B., Wales, N., Carøe, Christian, Campos, P., Schmidt, A. M. Z., Gilbert, M Thomas P, Hansen, Anders Johannes, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Willerslev, Eske, 2015, I : Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 11 s., 20130383.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  83. Udgivet

    Ancient genomics

    Der Sarkissian, C., Allentoft, Morten Erik, Avila Arcos, M. D. C., Barnett, R., Campos, P. F., Cappellini, Enrico, Ermini, L., Fernandez Garcia, R., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ginolhac, A., Hansen, Anders Johannes, Jónsson, H., Korneliussen, Thorfinn Sand, Margaryan, Ashot, Martin, M. D., Moreno Mayar, José Victor, Raghavan, M., Rasmussen, M., Sandoval-Velasco, Marcela, Schroeder, Hannes, Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Wales, N., Gilbert, M Thomas P, Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 12 s., 20130387.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  84. Udgivet

    Annotation of the protein coding regions of the equine genome

    Hestand, M. S., Kalbfleisch, T. S., Coleman, S. J., Zeng, Z., Liu, J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & MacLeod, J. N., 2015, I : PLOS ONE. 10, 6, 13 s., e0124375.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  85. Udgivet

    Comparison of the equine reference sequence with its Sanger source data and new Illumina reads

    Rebolledo-Mendez, J., Hestand, M. S., Coleman, S. J., Zeng, Z., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, MacLeod, J. N. & Kalbfleisch, T., 2015, I : PLoS ONE. 10, 6, 13 s., e0126852.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  86. Udgivet

    Early divergent strains of Yersinia pestis in Eurasia 5,000 years ago

    Rasmussen, Simon, Allentoft, Morten Erik, Nielsen, K., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Sikora, Martin, Sjögren, K., Pedersen, A. G., Schubert, M., Van Dam, A., Kapel, Christian, Nielsen, H. B., Brunak, Søren, Avetisyan, P., Epimakhov, A., Khalyapin, M. V., Gnuni, A., Kriiska, A., Lasak, I., Metspalu, M., Moiseyev, V., Gromov, A., Pokutta, D., Saag, L., Varul, L., Yepiskoposyan, L., Sicheritz-Ponten, T., Foley, R. A., Lahr, M. M., Nielsen, R., Kristiansen, K. & Willerslev, Eske, 2015, I : Cell. 163, 3, s. 571-582 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  87. Udgivet

    Equids

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Current Biology. 25, 20, s. R973-R978 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  88. Udgivet

    Evolutionary genomics and conservation of the endangered Przewalski's horse

    Der Sarkissian, C., Ermini, L., Schubert, M., Yang, M. A., Sanz, P. L., Fumagalli, M., Jónsson, H., Bar-Gal, G. K., Albrechtsen, Anders, Vieira, Filipe Garrett, Petersen, Bent, Ginolhac, A., Seguin-Orlando, A., Magnussen, K., Fages, A. A., Gamba, C., Lorente-Galdos, B., Polani, S., Steiner, C., Neuditschko, M., Jagannathan, V., Feh, C., Greenblatt, C. L., Ludwig, A., Abramson, N. I., Zimmermann, W., Schafberg, R., Tikhonov, A., Sicheritz-Ponten, T., Willerslev, Eske, Marques-Bonet, T., Ryder, O. A., McCue, M., Rieder, S., Leeb, T., Slatkin, M. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Current Biology. 25, 19, s. 2577-2583 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  89. Udgivet

    Genome-wide ancestry of 17th-century enslaved Africans from the Caribbean

    Schroeder, Hannes, Avila Arcos, M. D. C., Malaspinas, A. S., Poznik, G. D., Sandoval-Velasco, Marcela, Carpenter, M. L., Moreno Mayar, José Victor, Sikora, Martin, Johnson, P. L. F., Allentoft, Morten Erik, Samaniego Castruita, J. A., Haviser, J. B., Dee, M. W., Stafford, T. W., Salas, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Willerslev, Eske, Bustamente, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I : Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 112, 12, s. 3669–3673 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  90. Udgivet

    Improving access to endogenous DNA in ancient bones and teeth

    Damgaard, P. D. B., Margaryan, Ashot, Schroeder, Hannes, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Willerslev, Eske & Allentoft, Morten Erik, 2015, I : Scientific Reports. 5, 12 s., 11184.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  91. Udgivet

    Mitochondrial genetic diversity of Eurasian red squirrels (Sciurus vulgaris) from Denmark

    Madsen, Corrie, Mouatt, J. T. V., Fernandez Garcia, R., Marchi, N., Håkansson, B., Krog, M., Asferg, T., Baagøe, Hans J. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Journal of Heredity. 106, 6, s. 719-727 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  92. Udgivet

    Mitochondrial genomes reveal the extinct Hippidion as an outgroup to all living equids

    Der Sarkissian, C., Mouatt, J. T. V., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Eme, D., Weinstock, J., Teresa Alberdi, M., Martin, F., Lopez, P. M., Prado, J. L., Prieto, A., Douady, C. J., Stafford jr., T., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Biology Letters. 11, 3, 5 s., 20141058.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  93. Udgivet

    New insights on single-stranded versus double-stranded DNA library preparation for ancient DNA

    Wales, N., Carøe, Christian, Sandoval-Velasco, Marcela, Gamba, C., Barnett, R., Samaniego Castruita, J. A., Ramos Madrigal, Jazmin, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Gilbert, M Thomas P, 2015, I : BioTechniques. 59, 6, s. 368-371 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  94. Udgivet

    Planning tiger recovery: understanding intraspecific variation for effective conservation

    Wilting, A., Courtiol, A., Christiansen, P., Niedballa, J., Scharf, A. K., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Balkenhol, N., Hofer, H., Kramer-Schadt, S., Fickel, J. & Kitchener, A. C., 2015, I : Science Advances. 1, 5, s. e1400175 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  95. Udgivet

    Population genomics of bronze age Eurasia

    Allentoft, Morten Erik, Sikora, Martin, Sjogren, K., Rasmussen, S., Rasmussen, M., Stenderup, J., Damgaard, P. D. B., Schroeder, Hannes, Ahlstrom, T., Vinner, Lasse, Malaspinas, A. S., Margaryan, Ashot, Higham, T., Chivall, D., Lynnerup, Niels, Harvig, L. L., Baron, J., Della Casa, P., Dabrowski, P., Duffy, P. R., Ebel, A. V., Epimakhov, A., Frei, K., Furmanek, M., Gralak, T., Gromov, A., Gronkiewicz, S., Grupe, G., Hajdu, T., Jarysz, R., Khartanovich, V., Khokhlov, A., Kiss, V., Kolar, J., Kriiska, A., Lasak, I., Longhi, C., McGlynn, G., Merkevicius, A., Merkyte, I., Metspalu, M., Mkrtchyan, R., Moiseyev, V., Paja, L., Palfi, G., Pokutta, D., Pospieszny, L., Price, T. D., Saag, L., Sablin, M., Shishlina, N., Smrcka, V., Soenov, V. I., Szeverenyi, V., Toth, G., Trifanova, S. V., Varul, L., Vicze, M., Yepiskoposyan, L., Zhitenev, V., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Sicheritz-Ponten, T., Brunak, Søren, Nielsen, Rasmus, Kristiansen, K. & Willerslev, Eske, 2015, I : Nature Genetics. 522, 7555, s. 167-172 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  96. Udgivet

    Pros and cons of methylation-based enrichment methods for ancient DNA

    Seguin-Orlando, A., Gamba, C., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Louvel, G., Boulygina, E., Sokolov, A., Nedoluzhko, A., Lorenzen, Eline, Lopez, P., McDonald, H. G., Scott, E., Tikhonov, A., Stafford jr., T., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Shapiro, B., Willerslev, Eske, Prokhortchouk, E. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Scientific Reports. 5, 15 s., 11826.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  97. Udgivet

    Reconstructing ancient genomes and epigenomes

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2015, I : Nature Reviews. Genetics. 16, 7, s. 395-408 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  98. Udgivet

    The ancestry and affiliations of Kennewick Man

    Rasmussen, M., Sikora, Martin, Albrechtsen, Anders, Korneliussen, Thorfinn Sand, Moreno Mayar, José Victor, Poznik, G. D., Zollikofer, C. P. E., Ponce de León, M. S., Allentoft, Morten Erik, Moltke, Ida, Jónsson, H., Valdiosera Morales, C. E., Malhi, R. S., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Bustamante, C. D., Stafford jr., T., Meltzer, D. J., Nielsen, Rasmus & Willerslev, Eske, 2015, I : Nature. 523, 7561, s. 455-458 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  99. Udgivet

    The first aurochs genome reveals the breeding history of British and European cattle

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Genome Biology. 16, 3 s., 225.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  100. Udgivet

    Tracking the origins of Yakutian horses and the genetic basis for their fast adaptation to subarctic environments

    Sanz, P. L., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Schubert, M., Jónsson, H., Albrechtsen, Anders, Fumagalli, M., Yang, M. A., Gamba, C., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C. D., Petersen, Bent, Hoover, C. A., Lorente-Galdos, B., Nedoluzhko, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Neuditschko, M., Jagannathan, V., Theves, C., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Sicheritz-Pontén, T., Popov, R., Grigoriev, S., Alekseev, A. N., Rubin, E. M., McCue, M., Rieder, S., Leeb, T., Tikhonov, A., Crubézy, E., Slatkin, M., Marques-Bonet, T., Nielsen, R., Willerslev, Eske, Kantanen, J., Prokhortchouk, E. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2015, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 50, s. E6889-E6897 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  101. 2014
  102. Udgivet

    Using Ancient DNA to Understand Evolutionary and Ecological Processes

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Cooper, A., 6 okt. 2014, I : Annual Review of Ecology, Evolution and Systematics. 45, s. 573-598 26 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  103. Udgivet

    Rodents of the Caribbean: origin and diversification of hutias unravelled by next-generation museomics

    Fabre, P., Mouatt, J. T. V., Raghavan, M., Der Sarkissian, C., Willerslev, Eske, Douzery, E. J. P. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, jul. 2014, I : Biology Letters. 10, 7, 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  104. Udgivet
  105. Udgivet

    Characterization of ancient and modern genomes by SNP detection and phylogenomic and metagenomic analysis using PALEOMIX

    Schubert, M., Ermini, L., Der Sarkissian, C., Jónsson, H., Ginolhac, A., Schaefer, R., Martin, M. D., Fernandez Garcia, R., Kircher, M., McCue, M., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2014, I : Nature Protocols. 9, 5, s. 1056-82 27 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  106. Udgivet

    Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation

    Zhang, Guojie, Li, C., Li, Q., Li, B., Larkin, D. M., Lee, C., Storz, J. F., Antunes, A., Greenwold, M. J., Meredith, R. W., Ödeen, A., Cui, J., Zhou, Q., Xu, L., Pan, H., Wang, Z., Jin, L., Zhang, P., Hu, H., Yang, W., Hu, J., Xiao, J., Yang, Z., Liu, Y., Xie, Q., Yu, H., Lian, J., Wen, P., Zhang, F., Li, H., Zeng, Y., Xiong, Z., Liu, S., Zhou, L., Huang, Z., An, N., Wang, J., Zheng, Q., Xiong, Y., Wang, G., Wang, B., Wang, J., Fan, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro Nuñez, L. A., Schubert, M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Mourier, T., Howard, J. T., Ganapathy, G., Pfenning, A., Whitney, O., Rivas, M. V., Hara, E., Smith, J., Farré, M., Narayan, J., Slavov, G., Romanov, M. N., Borges, R., MacHado, J. P., Khan, I., Springer, M. S., Gatesy, J., Hoffmann, F. G., Opazo, J. C., Håstad, O., Sawyer, R. H., Kim, H., Kim, K. W., Kim, H. J., Cho, S., Li, N., Huang, Y., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Bertelsen, Mads Frost, Derryberry, E., Warren, W., Wilson, R. K., Li, S., Ray, D. A., Green, R. E., O'Brien, S. J., Griffin, D., Johnson, W. E., Haussler, D., Ryder, O. A., Willerslev, Eske, Graves, G. R., Alström, P., Fjeldså, Jon, Mindell, D. P., Edwards, S. V., Braun, E. L., Rahbek, Carsten, Burt, D. W., Houde, P., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Wang, Jun, 2014, I : Science. 346, 6215, s. 1311-1320 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  107. Udgivet

    Evolution: an epigenetic window into the past?

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Willerslev, Eske, 2014, I : Science. 345, 6196, s. 511-512 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  108. Udgivet

    Fifty thousand years of Arctic vegetation and megafaunal diet

    Willerslev, Eske, Davison, J., Moora, M., Zobel, M., Coissac, E., Edwards, M. E., Lorenzen, Eline, Vestergård, M., Gussarova, G., Haile, James Seymour, Craine, J., Gielly, L., Boessenkool, S., Epp, L. S., Pearman, P. B., Cheddadi, R., Murray, D., Bråthen, K. A., Yoccoz, N., Binney, H., Cruaud, C., Wincker, P., Goslar, T., Alsos, I. G., Bellemain, E., Brysting, A. K., Elven, R., Sønstebø, J. H., Murton, J., Sher, A., Rasmussen, M., Rønn, Regin, Mourier, T., Cooper, A., Austin, J., Möller, P., Froese, D., Zazula, G., Pompanon, F., Rioux, D., Niderkorn, V., Tikhonov, A., Savvinov, G., Roberts, R. G., MacPhee, R. D. E., Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Brochmann, C. & Taberlet, P., 2014, I : Nature. 506, 7486, s. 47-51 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  109. Udgivet

    Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome

    Pedersen, J. S., Valen, E., Velazquez, A. M. V., Parker, B. J., Rasmussen, M., Lindgreen, Stinus, Lilje, B., Tobin, D. J., Kelly, T. K., Vang, S., Andersson, Robin, Jones, P. A., Hoover, C. A., Tikhonov, A., Prokhortchouk, E., Rubin, E. M., Sandelin, Albin Gustav, Gilbert, M Thomas P, Krogh, Anders, Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2014, I : Genome Research. 24, 3, s. 454-466 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  110. Udgivet

    Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years

    Seguin-Orlando, A., Korneliussen, Thorfinn Sand, Sikora, Martin, Malaspinas, A. S., Manica, A., Moltke, Ida, Albrechtsen, Anders, Ko, A., Margaryan, Ashot, Moiseyev, V., Goebel, T., Westaway, M., Lambert, D., Khartanovich, V., Wall, J. D., Nigst, P. R., Foley, R. A., Lahr, M. M., Nielsen, R., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Willerslev, Eske, 2014, I : Science. 346, 6213, s. 1113-1118 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  111. Udgivet

    Population genomics reveal recent speciation and rapid evolutionary adaptation in polar bears

    Liu, S., Lorenzen, Eline, Fumagalli, M., Li, B., Harris, K., Xiong, Z., Zhou, L., Korneliussen, Thorfinn Sand, Somel, M., Babbitt, C., Wray, G., Li, J., He, W., Wang, Z., Fu, W., Xiang, X., Morgan, C. C., Doherty, A., O'Connell, M. J., McInerney, J. O., Born, E. W., Dalén, L., Dietz, R., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Sonne, C., Zhang, Guojie, Nielsen, Rasmus, Willerslev, Eske & Wang, Jun, 2014, I : Cell. 157, 4, s. 785-794 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  112. Udgivet

    Prehistoric genomes reveal the genetic foundation and cost of horse domestication

    Schubert, M., Jónsson, H., Chang, D., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Ginolhac, A., Albrechtsen, Anders, Dupanloup, I., Foucal, A., Petersen, Bent, Fumagalli, M., Raghavan, M., Seguin-Orlando, A., Korneliussen, Thorfinn Sand, Velazquez, A. M. V., Stenderup, J., Hoover, C. A., Rubin, C., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., MacHugh, D. E., Kalbfleisch, T., MacLeod, J. N., Rubin, E. M., Sicheritz-Ponten, T., Andersson, L., Hofreiter, M., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, R., Excoffier, L., Willerslev, Eske, Shapiro, B. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2014, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. E5661–E5669 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  113. Udgivet

    Shotgun microbial profiling of fossil remains.

    Der Sarkissian, C., Ermini, L., Jónsson, H., Alekseev, A. N., Crubézy, E., Shapiro, B. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2014, I : Molecular Ecology. 23, 7, s. 1780-1798 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  114. Udgivet

    Speciation with gene flow in equids despite extensive chromosomal plasticity

    Jónsson, H., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Ginolhac, A., Petersen, L., Fumagalli, M., Albrechtsen, Anders, Petersen, Bent, Korneliussen, Thorfinn Sand, Mouatt, J. T. V., Lear, T., Myka, J. L., Lundquist, J., Miller, D. C., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Stagegaard, J., Strauss, G., Bertelsen, Mads Frost, Sicheritz-Ponten, T., Antczak, D. F., Bailey, E., Nielsen, R., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2014, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. 18655–18660 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  115. Udgivet

    The genetic prehistory of the New World Arctic

    Raghavan, M., DeGiorgio, M., Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida, Skoglund, P., Korneliussen, Thorfinn Sand, Grønnow, B., Appelt, M., Gulløv, H. C., Friesen, T. M., Fitzhugh, W., Malmström, H. S., Rasmussen, Simon, Olsen, J., Melchior, L. C., Fuller, B. T., Fahrni, S. M., Stafford jr., T., Grimes, V., Renouf, M. A. P., Cybulski, J., Lynnerup, Niels, Lahr, M. M., Britton, K., Knecht, R., Arneborg, J., Metspalu, M., Cornejo, O. E., Malaspinas, A. S., Wang, Y., Rasmussen, M., Raghavan, V., Hansen, T. V. O., Khusnutdinova, E., Pierre, T. L., Dneprovsky, K., Andreasen, C., Lange, H., Hayes, M. G., Coltrain, J., Spitsyn, V. A., Götherström, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Kivisild, T., Villems, R., Crawford, M. H., Nielsen, Finn Cilius, Dissing, J., Heinemeier, J., Meldgaard, Morten, Bustamante, C., O'Rourke, D. H., Jakobsson, M., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, R. & Willerslev, Eske, 2014, I : Science. 345, 6200, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  116. Udgivet

    The genome of a Late Pleistocene human from a Clovis burial site in western Montana

    Rasmussen, M., Anzick, S. L., Waters, M. R., Skoglund, P., DeGiorgio, M., Stafford jr., T., Rasmussen, Simon, Moltke, Ida, Albrechtsen, Anders, Doyle, S. M., Poznik, G. D., Gudmundsdottir, V., Yadav, R., Malaspinas, A. S., White, S. S., Allentoft, Morten Erik, Cornejo, O. E., Tambets, K., Eriksson, A., Heintzman, P. D., Karmin, M., Korneliussen, Thorfinn Sand, Meltzer, D. J., Pierre, T. L., Stenderup, J., Saag, L., Warmuth, V. M., Lopes, M. C., Malhi, R. S., Brunak, S., Sicheritz-Pontén, T., Barnes, I., Collins, M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Balloux, F., Manica, A., Gupta, R., Metspalu, M., Bustamante, C. D., Jakobsson, M., Nielsen, R. & Willerslev, Eske, 2014, I : Nature. 506, 7487, s. 225-229 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  117. Udgivet

    Two ancient human genomes reveal Polynesian ancestry among the indigenous Botocudos of Brazil

    Malaspinas, A. S., Lao, O., Schroeder, Hannes, Rasmussen, M., Raghavan, M., Moltke, Ida, Campos, P., Sagredo, F. S., Rasmussen, Simon, Gonçalves, V. F., Albrechtsen, Anders, Allentoft, Morten Erik, Johnson, P. L. F., Li, M., Reis, S., Bernardo, D. V., DeGiorgio, M., Duggan, A. T., Bastos, M., Wang, Y., Stenderup, J., Moreno Mayar, José Victor, Brunak, S., Sicheritz-Ponten, T., Hodges, E., Hannon, G. J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Price, T. D., Jensen, J. D., Nielsen, Rasmus, Heinemeier, J., Olsen, J., Rodrigues-Carvalho, C., Lahr, M. M., Neves, W. A., Kayser, M., Higham, T., Stoneking, M., Pena, S. D. J. & Willerslev, Eske, 2014, I : Current biology : CB. 24, 21, s. R1035-R1037 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  118. Udgivet

    Upper palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans

    Raghavan, M., Skoglund, P., Graf, K. E., Metspalu, M., Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida, Rasmussen, Simon, Stafford jr., T., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Metspalu, E., Karmin, M., Tambets, K., Rootsi, S., Mägi, R., Campos, P., Balanovska, E., Balanovsky, O., Khusnutdinova, E., Litvinov, S., Osipova, L. P., Fedorova, S. A., Voevoda, M. I., Degiorgio, M., Sicheritz-Ponten, T., Brunak, S., Demeshchenko, S., Kivisild, T., Villems, R., Nielsen, R., Jakobsson, M. & Willerslev, Eske, 2014, I : Nature. 505, 7481, s. 87-91 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  119. Udgivet

    Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds

    Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G., Boussau, B., Bayzid, M. S., Zavidovych, V., Subramanian, S., Gabaldón, T., Capella-Gutiérrez, S., Huerta-Cepas, J., Rekepalli, B., Terkelsen, K. M., Schierup, M. H., Lindow, Bent Erik Kramer, Warren, W. C., Ray, D., Green, R. E., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Li, S., Li, N., Huang, Y., Derryberry, E. P., Bertelsen, Mads Frost, Sheldon, F. H., Brumfield, R. T., Mello, C. V., Lovell, P. V., Wirthlin, M., Schneider, M. P. C., Prosdocimi, F., Samaniego Castruita, J. A., Velazquez, A. M. V., Alfaro Nuñez, L. A., Campos, P., Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Pas, A., Bailey, T., Scofield, P., Bunce, M., Lambert, D. M., Zhou, Q., Perelman, P., Driskell, A. C., Shapiro, B., Xiong, Z., Zeng, Y., Liu, S., Li, Z., Liu, B., Wu, K., Xiao, J., Yinqi, X., Zheng, Q., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Smeds, L., Rheindt, F. E., Braun, M., Fjeldså, Jon, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Barker, F. K., Jønsson, Knud Andreas, Johnson, W., Koepfli, K. P., O'Brien, S., Haussler, D., Ryder, O. A., Rahbek, Carsten, Willerslev, Eske, Graves, G. R., Glenn, T. C., McCormack, J., Burt, D., Ellegren, H., Alström, P., Edwards, S. V., Stamatakis, A., Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, Jun, Gilbert, M Thomas P & Zhang, Guojie, 2014, I : Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  120. 2013
  121. Udgivet

    Bacterial natural transformation by highly fragmented and damaged DNA

    Overballe-Petersen, S., Harms, K., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Moreno Mayar, José Victor, Rasmussen, Simon, Dahl, Tais W., Rosing, Minik Thorleif, Poole, A. M., Sicheritz-Ponten, T., Brunak, S., Inselmann, S., de Vries, J., Wackernagel, W., Pybus, O. G., Nielsen, Rasmus, Johnsen, P. J., Nielsen, K. M. & Willerslev, Eske, 3 dec. 2013, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 49, s. 19860–19865 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  122. Udgivet

    Décrypter les génomes du passé

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, dec. 2013, I : Biofutur. 32, 349, s. 28-31 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  123. Udgivet

    First evidence of Equus asinus L. in the Chalcolithic disputes the Phoenicians as the first to introduce donkeys into the Iberian Peninsula

    Cardoso, J. L., Mouatt, J. T. V., Eisenmann, V. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, dec. 2013, I : Journal of Archaeological Science. 40, 12, s. 4483-4490 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  124. Udgivet

    Morphological and genetic evidence for early Holocene cattle management in northeastern China

    Zhang, H., Paijmans, J. L. A., Chang, F., Wu, X., Chen, G., Lei, C., Yang, X., Wei, Z., Bradley, D. G., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, O'Connor, T. & Hofreiter, M., 8 nov. 2013, I : Nature Communications. 4, 7 s., 2755.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  125. Udgivet

    Ligation bias in Illumina next-generation DNA libraries: implications for sequencing ancient genomes

    Seguin-Orlando, A., Schubert, M., Clary, J., Stagegaard, J., Alberdi, M. T., Prado, J. L., Prieto, A., Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 29 okt. 2013, I : PLoS ONE. 8, 10, 11 s., e78575.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  126. Udgivet

    A comparative study of ancient environmental DNA to pollen and macrofossils from lake sediments reveals taxonomic overlap and additional plant taxa

    Pedersen, Mikkel Winther, Ginolhac, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Olsen, J., Andersen, K., Holm, J. M., Funder, Svend Visby, Willerslev, Eske & Kjær, Kurt H., 1 sep. 2013, I : Quaternary Science Reviews. 75, s. 161-168 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  127. Udgivet

    Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen

    Martin, M. D., Cappellini, Enrico, Samaniego Castruita, J. A., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Seguin-Orlando, A., Wales, N., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Ho, S. Y. W., Dietrich, F. S., Mieczkowski, P. A., Heitman, J., Willerslev, Eske, Krogh, Anders, Ristaino, J. B. & Gilbert, M Thomas P, 18 jul. 2013, I : Nature Communications. 4, 7 s., 2172.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  128. Udgivet

    Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Ginolhac, A., Zhang, G., Froese, D., Albrechtsen, Anders, Stiller, M., Schubert, M., Cappellini, Enrico, Petersen, Bent, Moltke, Ida, Johnson, P. L. F., Fumagalli, M., Mouatt, J. T. V., Raghavan, M., Korneliussen, Thorfinn Sand, Malaspinas, A. S., Vogt, J., Szklarczyk, D. M., Kelstrup, C., Vinther, J., Dolocan, A., Stenderup, J., Velazquez, A. M. V., Cahill, J., Rasmussen, M., Wang, X., Min, J., Zazula, G. D., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C., Magnussen, K., Thompson, J. F., Weinstock, J., Gregersen, K., Røed, K. H., Eisenmann, V., Rubin, C. J., Miller, D. C., Antczak, D. F., Bertelsen, M. F., Brunak, S., Al-Rasheid, K. A. S., Ryder, O., Andersson, L., Mundy, J., Krogh, Anders, Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Sicheritz-Pontén, T., Jensen, Lars Juhl, Olsen, Jesper Velgaard, Hofreiter, M., Nielsen, R., Shapiro, B., Wang, Jun & Willerslev, Eske, 4 jul. 2013, I : Nature. 499, 7456, s. 74-78 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  129. Udgivet

    mapDamage2.0: fast approximate Bayesian estimates of ancient DNA damage parameters

    Jónsson, H., Ginolhac, A., Schubert, M., Johnson, P. L. F. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 1 jul. 2013, I : Bioinformatics. 29, 13, s. 1682-1684 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  130. Udgivet

    Mitochondrial phylogenomics of modern and ancient equids

    Mouatt, J. T. V., Seguin-Orlando, A., Stiller, M., Ginolhac, A., Raghavan, M., Nielsen, S. C. A., Weinstock, J., Froese, D., Vasiliev, S. K., Ovodov, N. D., Clary, J., Helgen, K. M., Fleischer, R. C., Cooper, A., Shapiro, B. & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 20 feb. 2013, I : PLoS ONE. 8, 2, s. e55950 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  131. 2012
  132. Udgivet

    Variola virus in a 300-year-old Siberian mummy

    Biagini, P., Thèves, C., Balaresque, P., Géraut, A., Cannet, C., Keyser, C., Nikolaeva, D., Gérard, P., Duchesne, S., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Willerslev, Eske, Alekseev, A. N., de Micco, P., Ludes, B. & Crubézy, E., 22 nov. 2012, I : The New England Journal of Medicine. 367, 21, s. 2057-2059 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  133. Udgivet

    Investigating the potential use of environmental DNA (eDNA) for genetic monitoring of marine mammals

    Foote, A. D., Thomsen, P. F., Sveegaard, S., Wahlberg, M., Kielgast, Jos, Kyhn, L. A., Salling, A. B., Galatius, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Gilbert, M Thomas P, 29 aug. 2012, I : PLoS ONE. 7, 8, 6 s., e41781.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  134. Udgivet

    DNA from soil mirrors plant taxonomic and growth form diversity

    Yoccoz, N. G., Bråthen, K. A., Gielly, L., Haile, James Seymour, Edwards, M. E., Goslar, T., von Stedingk, H., Brysting, A. K., Coissac, E., Pompanon, F., Sønstebo, J. H., Miquel, C., Valentini, A., de Bello, F., Chave, J., Thuiller, W., Wincker, P., Cruaud, C., Gavory, F., Rasmussen, M., Gilbert, M Thomas P, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Brochmann, C., Willerslev, Eske & Taberlet, P., 1 aug. 2012, I : Molecular Ecology. 21, 15, s. 3647-3655 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  135. Udgivet

    Improving the performance of true single molecule sequencing for ancient DNA

    Ginolhac, A., Mouatt, J. T. V., Stenderup, J., Rasmussen, M., Stiller, M., Shapiro, B., Zazula, G., Froese, D., Steinmann, K. E., Thompson, J. F., Al-Rasheid, K. A. S., Gilbert, M Thomas P, Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 10 maj 2012, I : BMC Genomics. 13, 14 s., 177.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  136. Udgivet

    Statistical guidelines for detecting past population shifts using ancient DNA

    Mourier, T., Ho, S. Y. W., Gilbert, M Thomas P, Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 16 mar. 2012, I : Molecular Biology and Evolution. 29, 9, s. 2241-2251 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  137. Udgivet

    Glacial survival of boreal trees in northern Scandinavia

    Parducci, L., Jørgensen, T., Tollefsrud, M. M., Elverland, E., Alm, T., Fontana, S. L., Bennett, K. D., Haile, James Seymour, Matetovici, I., Suyama, Y., Edwards, M. E., Andersen, K., Rasmussen, M., Boessenkool, S., Coissac, E., Brochmann, C., Taberlet, P., Houmark-Nielsen, Michael, Larsen, Nicolaj Krog, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Alsos, I. G. & Willerslev, Eske, 2 mar. 2012, I : Science. 335, 6072, s. 1083-1086 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  138. Udgivet

    A comparative study of ancient sedimentary DNA, pollen and macrofossils from permafrost sediments of northern Siberia reveals long-term vegetational stability

    Jørgensen, T., Haile, James Seymour, Möller, P., Andreev, A., Boessenkool, S., Rasmussen, M., Kienast, F., Coissac, E., Taberlet, P., Brochmann, C., Bigelow, N. H., Andersen, K., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2012, I : Molecular Ecology. 21, 8, s. 1989-2003 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  139. Udgivet

    Genomic affinities of two 7,000-year-old Iberian hunter-gatherers

    Sánchez-Quinto, F., Schroeder, Hannes, Ramirez, O., Avila Arcos, M. D. C., Pybus, M., Olalde, I., Velazquez, A. M. V., Marcos, M., Encinas, J., Bertranpetit, J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2012, I : Current Biology. 22, 16, s. 1494-1499 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  140. Udgivet

    Improving ancient DNA read mapping against modern reference genomes

    Schubert, M., Ginolhac, A., Lindgreen, Stinus, Thompson, J. F., Al-Rasheid, K. A. S., Willerslev, Eske, Krogh, Anders & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 2012, I : BMC Genomics. 13, 15 s., 178.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  141. Udgivet

    Islands in the ice: detecting past vegetation on Greenlandic nunataks using historical records and sedimentary ancient DNA Meta-barcoding

    Jørgensen, T., Kjær, Kurt H., Haile, James Seymour, Rasmussen, M., Boessenkool, S., Andersen, K., Coissac, E., Taberlet, P., Brochmann, C., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2012, I : Molecular Ecology. 21, 8, s. 1980-1988 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  142. Udgivet

    Meta-barcoding of 'dirt' DNA from soil reflects vertebrate biodiversity

    Andersen, K., Bird, K. L., Rasmussen, M., Haile, James Seymour, Breuning-Madsen, H., Kjær, Kurt H., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2012, I : Molecular Ecology. 21, 8, s. 1966-1979 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  143. Udgivet

    Mitogenome sequencing reveals shallow evolutionary histories and recent divergence time between morphologically and ecologically distinct European whitefish (Coregonus spp.)

    Jacobsen, L. M. W., Hansen, M. M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Bekkevold, D., Bernatchez, L., Willerslev, Eske & Gilbert, M Thomas P, 2012, I : Molecular Ecology. 21, 11, s. 2727-2742 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  144. Udgivet

    Monitoring endangered freshwater biodiversity using environmental DNA

    Thomsen, P. F., Kielgast, Jos, Iversen, Lars Lønsmann, Wiuf, C. H., Rasmussen, M., Gilbert, M Thomas P, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Willerslev, Eske, 2012, I : Molecular Ecology. 21, 11, s. 2565-2573 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  145. Udgivet

    Next-generation sequencing offers new insights into DNA degradation

    Overballe-Petersen, S., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Willerslev, Eske, 2012, I : Trends in Biotechnology. 30, 7, s. 364-368 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  146. Udgivet

    Partial genetic turnover in Neandertals: continuity in the East and population replacement in the West

    Dalén, L., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Shapiro, B., Brandström-Durling, M., Quam, R., Gilbert, M Thomas P, Díez Fernández-Lomana, J. C., Willerslev, Eske, Arsuaga, J. L. & Götherström, A., 2012, I : Molecular Biology and Evolution. 29, 8, s. 1893-1897 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  147. Udgivet

    Proteomic analysis of a pleistocene mammoth femur reveals more than one hundred ancient bone proteins

    Cappellini, Enrico, Jensen, Lars Juhl, Szklarczyk, D. M., Ginolhac, A., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Stafford jr., T., Holen, S. R., Collins, M. J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P & Olsen, Jesper Velgaard, 2012, I : Journal of Proteome Research. 11, 2, s. 917-926 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  148. 2011
  149. Udgivet

    mapDamage: testing for damage patterns in ancient DNA sequences

    Ginolhac, A., Rasmussen, M., Gilbert, M Thomas P, Willerslev, Eske & Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, 1 aug. 2011, I : Bioinformatics. 27, 15, s. 2153-2155 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  150. Udgivet

    Mitogenomic phylogenetic analyses of the Delphinidae with an emphasis on the Globicephalinae

    Mouatt, J. T. V., Ho, S. Y. W., Foote, A. D., Morin, P. A., Kreb, D., Krützen, M., Parra, G. J., Robertson, K. M., de Stephanis, R., Verborgh, P., Willerslev, Eske, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Gilbert, M Thomas P, 1 jan. 2011, I : BMC Evolutionary Biology. 11, 10 s., 65.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  151. Udgivet

    An Aboriginal Australian genome reveals separate human dispersals into Asia

    Rasmussen, M., Guo, X., Wang, Y., Lohmueller, K. E., Rasmussen, Simon, Albrechtsen, Anders, Skotte, L., Lindgreen, Stinus, Metspalu, M., Jombart, T., Kivisild, T., Zhai, W., Eriksson, A., Manica, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, De La Vega, F. M., Tridico, S., Metspalu, E., Nielsen, K., Avila Arcos, M. D. C., Moreno Mayar, José Victor, Muller, C., Dortch, J., Gilbert, M Thomas P, Lund, O., Wesolowska, A., Karmin, M., Weinert, L. A., Wang, B., Li, J., Tai, S., Xiao, F., Hanihara, T., van Driem, G., Jha, A. R., Ricaut, F., de Knijff, P., Migliano, A. B., Gallego Romero, I., Kristiansen, Karsten, Lambert, D. M., Brunak, Søren, Forster, P., Brinkmann, B., Nehlich, O., Bunce, M., Richards, M., Gupta, R., Bustamante, C. D., Krogh, Anders, Foley, R. A., Lahr, M. M., Balloux, F., Sicheritz-Pontén, T., Villems, R., Nielsen, Rasmus, Wang, Jun & Willerslev, Eske, 2011, I : Science. 334, 6052, s. 94-98 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  152. Udgivet

    Out of the Pacific and back again: insights into the matrilineal history of Pacific Killer whale ecotypes

    Foote, A. D., Morin, P. A., Durban, J. W., Willerslev, Eske, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Gilbert, M Thomas P, 2011, I : PLoS ONE. 6, 9, 7 s., e24980.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  153. Udgivet

    Species-specific responses of Late Quaternary megafauna to climate and humans

    Lorenzen, Eline, Nogues, David Bravo, Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Weinstock Arenovitz, J., Binladen, J. K. M. A., Marske, K. A., Ugan, A., Borregaard, Michael Krabbe, Gilbert, M Thomas P, Nielsen, Rasmus, Ho, S. Y. W., Goebel, T., Graf, K. E., Byers, D., Stenderup, J., Rasmussen, M., Campos, P., Leonard, J. A., Koepfli, K., Froese, D., Zazula, G., Stafford jr., T., Aaris-Sørensen, Kim, Batra, P., Haywood, A. M., Singarayer, J. S., Valdes, P. J., Boeskorov, G., Burns, J. A., Davydov, S. P., Haile, James Seymour, Jenkins, D. L., Kosintsev, P., Kuznetsova, T., Lai, X., Martin, L. D., McDonald, H. G., Mol, D., Meldgaard, Morten, Munch, K., Stephan, E., Sablin, M., Sommer, R. S., Sipko, T., Scott, E., Suchard, M. A., Tikhonov, A., Willerslev, R., Wayne, R. K., Cooper, A., Hofreiter, M., Sher, A., Shapiro, B., Rahbek, Carsten & Willerslev, Eske, 2011, I : Nature. 479, 7373, s. 359-364 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  154. Udgivet

    True single-molecule DNA sequencing of a pleistocene horse bone

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Ginolhac, A., Raghavan, M., Mouatt, J. T. V., Rasmussen, M., Magnussen, K., Steinmann, K. E., Kapranov, P., Thompson, J. F., Zazula, G., Froese, D., Moltke, Ida, Shapiro, B., Hofreiter, M., Al-Rasheid, K. A. S., Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2011, I : Genome Research. 21, 10, s. 1705-1719 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  155. Udgivet

    Twelve years of Neandertal genetic discoveries: state-of-the-art and future challenges

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Hänni, C., 2011, Continuity and Discontinuity in the Peopling of Europe - One Hundred Fifty Years of Neanderthal Study: proceedings of the international congress to commemorate “150 years of Neanderthal discoveries, 1856-2006”. Condemi, S. & Weniger, G-C. (red.). Springer, s. 223-238 16 s. (Vertebrate Paleobiology and Paleoanthropology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  156. 2010
  157. Udgivet

    Ancient DNA analyses exclude humans as the driving force behind late Pleistocene musk ox (Ovibos moschatus) population dynamics

    Campos, P., Willerslev, Eske, Sher, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Axelsson, E. G., Tikhonov, A., Aaris-Sørensen, Kim, Greenwood, A. D., Kahlke, R., Kosintsev, P., Krakhmalnaya, T., Kuznetsova, T., Lemey, P., MacPhee, R., Norris, C. A., Shepherd, K., Suchard, M. A., Zazula, G. D., Shapiro, B. & Gilbert, M Thomas P, 23 mar. 2010, I : National Academy of Sciences. Proceedings. 107, 12, s. 5675-5680 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  158. Udgivet

    Ancient human genome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo

    Rasmussen, M., Li, Y., Lindgreen, Stinus, Pedersen, J. S., Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida, Metspalu, M., Metspalu, E., Kivisild, T., Gupta, R., Bertalan, M., Nielsen, K., Gilbert, M Thomas P, Wang, Y., Raghavan, M., Campos, P., Kamp, Hanne Louise Munkholm, Wilson, A. S., Gledhill, A., Tridico, S., Bunce, M., Lorenzen, Eline, Binladen, J. K. M. A., Guo, X., Zhao, J., Zhang, X., Zhang, H., Li, Z., Chen, M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Kristiansen, Karsten, Bak, Mads, Tommerup, Niels, Bendixen, C., Pierre, T. L., Grønnow, B., Meldgaard, Morten, Andreasen, C., Fedorova, S. A., Osipova, L. P., Higham, T. F. G., Ramsey, C. B., Hansen, T. V. O., Nielsen, Finn Cilius, Crawford, M. H., Brunak, Søren, Sicheritz-Pontén, T., Villems, R., Nielsen, Rasmus, Krogh, Anders, Wang, Jun & Willerslev, Eske, 11 feb. 2010, I : Nature. 463, 7282, s. 757-762 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  159. Udgivet

    Ancient DNA sequences point to a large loss of mitochondrial genetic diversity in the saiga antelope (Saiga tatarica) since the Pleistocene

    Campos, P., Kristensen, T., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Sher, A., Kholodova, M. V., Götherström, A., Hofreiter, M., Drucker, D. G., Kosintsev, P., Tikhonov, A., Baryshnikov, G. F., Willerslev, Eske & Gilbert, M Thomas P, 2010, I : Molecular Ecology. 19, 22, s. 4863-4875 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  160. The microcephalin ancestral allele in a Neanderthal individual

    Lari, M., Rizzi, E., Milani, L., Corti, G., Balsamo, C., Vai, S., Catalano, G., Pilli, E., Longo, L., Condemi, S., Giunti, P., Hänni, C., De Bellis, G., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Barbujani, G. & Caramelli, D., 2010, I : P L o S One. 5, 5, 6 s., e10648.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  161. 2009
  162. Revising the recent evolutionary history of equids using ancient DNA

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Metcalf, J. L., Alberdi, M. T., Telles-Antunes, M., Bonjean, D., Otte, M., Martin, F., Eisenmann, V., Mashkour, M., Morello, F., Prado, J. L., Salas-Gismondi, R., Shockey, B. J., Wrinn, P. J., Vasil'ev, S. K., Ovodov, N. D., Cherry, M. I., Hopwood, B., Male, D., Austin, J. J., Hänni, C. & Cooper, A., 2009, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 51, s. 21754-21759 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  163. Using Classical Population Genetics Tools with Heterochroneous Data: Time Matters!

    Depaulis, F., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Hänni, C., 2009, I : PLoS ONE. 4, 5, 16 s., e5541.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  164. 2008
  165. Ancient DNA Clarifies the Evolutionary History of American Late Pleistocene Equids

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Male, D., Alberdi, M. T., Prado, J. L., Prieto, A., Cooper, A. & Hänni, C., 2008, I : Journal of Molecular Evolution. 66, 5, s. 533-538 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  166. DNA from extinct giant lemurs links archaeolemurids to extant indriids

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Calvignac, S., Schnebelen, C., Douady, C. J., Godfrey, L. R. & Hänni, C., 2008, I : BMC Evolutionary Biology. 8, 9 s., 121.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  167. Surprising migration and population size dynamics in ancient Iberian brown bears (Ursus arctos)

    Valdiosera, C. E., García-Garitagoitia, J. L., Garcia, N., Doadrio, I., Thomas, M. G., Hänni, C., Arsuaga, J., Barnes, I., Hofreiter, M., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Götherström, A., 2008, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 13, s. 5123-5128 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  168. 2007
  169. Conceptual bases for quantifying the role of the environment on gene evolution: the participation of positive selection and neutral evolution

    Levasseur, A., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Bailly, X., Milinkovitch, M. C., Danchin, E. G. J. & Pontarotti, P., 2007, I : Biological Reviews. 82, 4, s. 551-572 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  170. Does the 43 bp sequence from an 800 000 year old Cretan dwarf elephantid really rewrite the textbook on mammoths?

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Pagés, M., Calvignac, S., Hughes, S. & Hänni, C., 2007, I : Biology Letters. 3, 1, s. 57-59 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  171. Mammoth and elephant phylogenetic relationships: Mammut americanum, the missing outgroup

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Hänni, C. & Douady, C. J., 2007, I : Evolutionary Bioinformatics. 3, s. 45-51 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  172. Neanderthals in central Asia and Siberia

    Krause, J., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Serre, D., Viola, B., Prüfer, K., Richards, M. P., Hublin, J., Hänni, C., Derevianko, A. P. & Pääbo, S., 2007, I : Nature. 449, 7164, s. 902-904 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  173. The Derived FOXP2 Variant of Modern Humans Was Shared with Neandertals

    Krause, J., Lalueza-Fox, C., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Enard, W., Green, R. E., Burbano, H. A., Hublin, J., Hänni, C., Fortea, J., De La Rasilla, M., Bertranpetit, J., Rosas, A. & Pääbo, S., 2007, I : Current Biology. 17, 21, s. 1908-1912 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  174. 2006
  175. Geographic distribution of an extinct equid (Equus hydruntinus: Mammalia, Equidae) revealed by morphological and genetical analyses of fossils

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Mashkour, M., Burke, A., Douady, C. J., Eisenmann, V. & Hänni, C., 2006, I : Molecular Ecology. 15, 8, s. 2083-2093 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  176. Revisiting Neandertal diversity with a 100,000 year old mtDNA sequence

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Darlu, P., Toussaint, M., Bonjean, D., Otte, M. & Hänni, C., 2006, I : Current Biology. 16, 11, s. R400-R402

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  177. 2003
  178. Ancient DNA analysis reveals woolly rhino evolutionary relationships

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Leonard, J. A., Thenot, A., Laudet, V., Guerin, C. & Hänni, C., 2003, I : Molecular Phylogenetics and Evolution. 28, 3, s. 485-499 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  179. Morphological Convergence in Hippidion and Equus (Amerhippus) South American Equids Elucidated by Ancient DNA Analysis

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Eisenmann, V., Reynier, F., Sondaar, P. & Hänni, C., 2003, I : Journal of Molecular Evolution. 57, SUPPL. 1, s. S29-S40

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  180. Napoleon Bonaparte and the fate of an Amazonian rat: new data on the taxonomy of Mesomys hispidus (Rodentia: Echimyidae)

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Mauffrey, J. F., Cuisin, J., Patton, J. L., Hänni, C. & Catzeflis, F., 2003, I : Molecular Phylogenetics and Evolution. 27, 1, s. 113-120 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  181. 2002
  182. Ancient DNA and the population genetics of cave bears (Ursus spelaeus) through space and time

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Bonjean, D., Bocherens, H., Thenot, A., Argant, A., Otte, M. & Hänni, C., 2002, I : Molecular Biology and Evolution. 19, 11, s. 1920-1933 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  183. 2001
  184. Ancient DNA analysis reveals divergence of the cave bear, Ursus spelaeus, and brown bear, Ursus arctos, lineages

    Loreille, O., Orlando, Ludovic Antoine Alexandre, Patou-Mathis, M., Philippe, M., Taberlet, P. & Hänni, C., 2001, I : Current Biology. 11, 3, s. 200-203 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  185. 2000
  186. Du nouveau pour I'ADN ancien

    Orlando, Ludovic Antoine Alexandre & Hanni, C., 2000, I : Medecine/Sciences. 16, 8-9, s. i-xvi 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

ID: 20893272