Jan Gorodkin
Professor
- 2015
- Udgivet
Optimizing RNA structures by sequence extensions using RNAcop
Hecker, N., Christensen-Dalsgaard, M., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Stadler, P. F., Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8135-8145 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quality Assessment of Domesticated Animal Genome Assemblies
Seemann, Ernst Stefan, Anthon, Christian, Palasca, Oana & Gorodkin, Jan, 2015, I: Bioinformatics and Biology Insights. 9, Suppl 4, s. 49-58 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RNA 3D modules in genome-wide predictions of RNA 2D structure
Theis, C., Zirbel, C. L., Zu Siederdissen, C. H., Anthon, Christian, Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: PLOS ONE. 10, 10, 13 s., e0139900.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptomic landscape of lncRNAs in inflammatory bowel disease
Mirza, A. H., Bang-Berthelsen, C. H., Seemann, Ernst Stefan, Pan, X., Frederiksen, K. S., Vilien, M., Gorodkin, Jan & Pociot, Flemming, 2015, I: Genome Medicine. 7, 22 s., 39.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Spatially conserved regulatory elements identified within human and mouse Cd247 gene using high-throughput sequencing data from the ENCODE project.
Pundhir, Sachin, Hannibal, T. D., Bang-Berthelsen, C. H., Wegener, A. K., Pociot, Flemming, Holmberg, D. I. & Gorodkin, Jan, 2 maj 2014, I: Gene. 545, 1, s. 80-87 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
De Novo Discovery of Structured ncRNA Motifs in Genomic Sequences
Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2014, RNA Sequence, Structure, and Function: Computational and Bioinformatic Methods. Gorodkin, J. & Ruzzo, W. L. (red.). Bind 1097. s. 303-18 16 s. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational approaches for predicting mutation effects on RNA Sstructure
Radhakrishnan, S. & Gorodkin, Jan, 2014, Bioinformatics. Persson, B. (red.). Elsevier, s. 111-121 11 s. (Comprehensive biomedical physics, Bind 6).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Concepts and introduction to RNA bioinformatics
Gorodkin, Jan, Hofacker, I. L. & Ruzzo, W. L., 2014, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1097, s. 1-31 31 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein-driven inference of miRNA-disease associations
Mørk, S., Pletscher-Frankild, S., Palleja, A., Gorodkin, Jan & Jensen, Lars Juhl, 2014, I: Bioinformatics (Oxford, England). 30, 3, s. 392-397 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RNA Structural Alignments, Part I: Sankoff-Based Approaches for Structural Alignments
Havgaard, Jakob Hull & Gorodkin, Jan, 2014, RNA Sequence, Structure, and Function: Computational and Bioinformatic Methods. Gorodkin, J. & Ruzzo, W. L. (red.). s. 275-90 16 s. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4356276
Flest downloads
-
2862
downloads
Porcine transcriptome analysis based on 97 non-normalized cDNA libraries and assembly of 1,021,891 expressed sequence tags
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1375
downloads
454 pyrosequencing based transcriptome analysis of Zygaena filipendulae with focus on genes involved in biosynthesis of cyanogenic glucosides
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1305
downloads
Transcriptome-wide analysis of UTRs in non-small cell lung cancer reveals cancer-related genes with SNV-induced changes on RNA secondary structure and miRNA target sites
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet