Yong Wang

Yong Wang

Adjunkt


Udgivelsesår:
Alle
1 - 39 ud af 39Pr. side: 100
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2023
  2. Udgivet

    The effect of linker conformation on performance and stability of a two-domain lytic polysaccharide monooxygenase

    Forsberg, Z., Stepnov, A. A., Tesei, Giulio, Wang, Yong, Buchinger, E., Kristiansen, S. K., Aachmann, F. L., Arleth, Lise, Eijsink, V. G. H., Lindorff-Larsen, Kresten & Courtade, G., 2023, I: Journal of Biological Chemistry. 299, 11, 17 s., 105262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. 2022
  4. Udgivet

    Cryo-EM reveals the conformational epitope of human monoclonal antibody PAM1.4 broadly reacting with polymorphic malarial protein VAR2CSA

    Raghavan, Sai Sundar Rajan, Dagil, Robert, Lopez-Perez, Mary, Conrad, J., Bassi, Maria Rosaria, Quintana Varon, Maria del Pilar, Choudhary, Swati, Gustavsson, Tobias, Wang, Yong, Gourdon, Pontus Emanuel, Ofori, M. F., Christensen, S. B., Minja, D. T. R., Schmiegelow, Christentze, Nielsen, Morten Agertoug, Barfod, Lea Klingenberg, Hviid, Lars, Salanti, Ali, Lavstsen, Thomas & Wang, Kaituo, 2022, I: PLoS Pathogens. 18, 11, e1010924.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Cryo-EM structure of the human NKCC1 transporter reveals mechanisms of ion coupling and specificity

    Neumann, C., Rosenbæk, L. L., Flygaard, R. K., Habeck, M., Karlsen, J. L., Wang, Yong, Lindorff-Larsen, Kresten, Gad, H. H., Hartmann, R., Lyons, J. A., Fenton, R. A. & Nissen, P., 2022, I: EMBO Journal. 41, 23, 15 s., e110169.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Identifying Heterozipper β-Sheet in Twisted Amyloid Aggregation

    Song, Y., Dai, B., Wang, Yong, Wang, Y., Liu, C., Gourdon, Pontus Emanuel, Liu, L., Wang, Kaituo & Dong, M., 2022, I: Nano Letters. 22, 9, s. 3707–3712

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Structures of Atm1 provide insight into [2Fe-2S] cluster export from mitochondria

    Li, P., Hendricks, A. L., Wang, Yong, Villones, R. L. E., Lindkvist-Petersson, K., Meloni, G., Cowan, J. A., Wang, Kaituo & Gourdon, Pontus Emanuel, 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 12 s., 4339.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    The covalent reactivity of functionalized 5-hydroxy-butyrolactams is the basis for targeting of fatty acid binding protein 5 (FABP5) by the neurotrophic agent MT-21

    Svenningsen, E. B., Ottosen, R. N., Jørgensen, K. H., Nisavic, M., Larsen, C. K., Hansen, B. K., Wang, Yong, Lindorff-Larsen, Kresten, Tørring, T., Hacker, S. M., Palmfeldt, J. & Poulsen, T. B., 2022, I: RSC Chemical Biology. 3, 10, s. 1216-1229 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. 2021
  10. Udgivet

    Architecture and assembly dynamics of the essential mitochondrial chaperone complex TIM9·10·12

    Weinhäupl, K., Wang, Yong, Hessel, A., Brennich, M., Lindorff-Larsen, Kresten & Schanda, P., 2021, I: Structure. 29, 9, s. 1065-1073.e4

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Charge Interactions in a Highly Charge-Depleted Protein

    Hervø-Hansen, S., Højgaard, C., Johansson, Kristoffer Enøe, Wang, Yong, Wahni, K., Young, D., Messens, J., Teilum, Kaare, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2021, I: Journal of the American Chemical Society. 143, 6, s. 2500-2508 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Cryo-EM reveals the architecture of placental malaria VAR2CSA and provides molecular insight into chondroitin sulfate binding

    Wang, Kaituo, Dagil, Robert, Lavstsen, Thomas, Misra, S. K., Spliid, C. B., Wang, Yong, Gustavsson, Tobias, Sandoval, D. R., Vidal-Calvo, E. E., Choudhary, Swati, Agerbæk, Mette Ørskov, Lindorff-Larsen, Kresten, Nielsen, Morten Agertoug, Theander, Thor Grundtvig, Sharp, J. S., Clausen, Thomas Mandel, Gourdon, Pontus Emanuel & Salanti, Ali, 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 10 s., 2956.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    DEER-PREdict: Software for efficient calculation of spin-labeling EPR and NMR data from conformational ensembles

    Tesei, Giulio, Martins, J. M., Kunze, M. B. A., Wang, Yong, Crehuet, R. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: PLOS Computational Biology. 17, 1, 18 s., e1008551.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Mapping the degradation pathway of a disease-linked aspartoacylase variant

    Andersen, Sarah Gersing, Wang, Yong, Grønbæk-Thygesen, Martin, Kampmeyer, Caroline, Bjørnkjær, Lene, Willemoës, Martin, Andréasson, C., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2021, I: PLOS Genetics. 17, 4, 28 s., e1009539.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Order and disorder - An integrative structure of the full-length human growth hormone receptor

    Kassem, N., Araya-Secchi, R., Bugge, K., Barclay, A., Steinocher, H., Khondker, A., Wang, Yong, Lenard, A. J., Bürck, J., Sahin, Cagla, Ulrich, A. S., Landreh, M., Pedersen, Martin Cramer, Rheinstädter, M. C., Pedersen, Per Amstrup, Lindorff-Larsen, Kresten, Arleth, Lise & Kragelund, Birthe Brandt, 2021, I: Science Advances. 7, 27, 20 s., eabh3805.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Properdin oligomers adopt rigid extended conformations supporting function

    Pedersen, D. V., Pedersen, M. N., Mazarakis, S. M. M., Wang, Yong, Lindorff-Larsen, Kresten, Arleth, Lise & Andersen, G. R., 2021, I: eLife. 10, 22 s., e63356.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Structural and functional variation of chitin-binding domains of a lytic polysaccharide monooxygenase from Cellvibrio japonicus

    Madland, E., Forsberg, Z., Wang, Yong, Lindorff-Larsen, Kresten, Niebisch, A., Modregger, J., Eijsink, V. G. H., Aachmann, F. L. & Courtade, G., 2021, I: Journal of Biological Chemistry. 297, 4, 17 s., 101084.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. 2020
  19. Udgivet

    Combining molecular dynamics simulations with small-angle X-ray and neutron scattering data to study multi-domain proteins in solution

    Nørgrd Larsen, Andreas, Wang, Yong, Bottaro, S., Grudinin, S., Arleth, Lise & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, I: P L o S Computational Biology. 16, 4, 29 s., e1007870.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Free Energy Profile and Kinetics of Coupled Folding and Binding of the Intrinsically Disordered Protein p53 with MDM2

    Zou, R., Zhou, Y., Wang, Yong, Kuang, G., Ågren, H., Wu, J. & Tu, Y., 2020, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 60, 3, s. 1551-1558 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Structural basis of client specificity in mitochondrial membrane-protein chaperones

    Sučec, I., Wang, Yong, Dakhlaoui, O., Weinhäupl, K., Jores, T., Costa, D., Hessel, A., Brennich, M., Rapaport, D., Lindorff-Larsen, Kresten, Bersch, B. & Schanda, P., 2020, I: Science Advances. 6, 51, 15 s., eabd0263.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. 2019
  23. Udgivet

    PSX, Protein-Solvent Exchange: software for calculation of deuterium-exchange effects in small-angle neutron scattering measurements from protein coordinates

    Pedersen, Martin Cramer, Wang, Yong, Tidemand, Frederik Grønbæk, Martel, A., Lindorff-Larsen, Kresten & Arleth, Lise, 2019, I: Journal of Applied Crystallography. 52, 6, s. 1427-1436 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    A Multi-State Coarse-Grained Simulation Model Captures Conformational Cycling in P-Type ATPases

    Wang, Yong, Saleh, N., Chu, X. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Biophysical Journal. 116, 3, suppl. 1, s. 300a 1484-Plat.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Allosteric modulation of the sarcoplasmic reticulum Ca2+ ATPase by thapsigargin via decoupling of functional motions

    Saleh, N., Wang, Yong, Nissen, P. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 21, 39, s. 21991-21995

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Structural Basis for Properdin Oligomerization and Convertase Stimulation in the Human Complement System

    Pedersen, D. V., Gadeberg, T. A. F., Thomas, C., Wang, Yong, Joram, N., Jensen, R. K., Mazarakis, S. M. M., Revel, M., El Sissy, C., Petersen, S. V., Lindorff-Larsen, Kresten, Thiel, S., Laursen, N. S., Fremeaux-Bacchi, V. & Andersen, G. R., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 19 s., 2007.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Substrate-induced conformational dynamics of the dopamine transporter

    Nielsen, A. K., Möller, I. R., Wang, Yong, Rasmussen, Søren Gøgsig Faarup, Lindorff-Larsen, Kresten, Rand, Kasper Dyrberg & Loland, Claus Juul, 2019, I: Nature Communications. 10, 14 s., 2714.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. 2018
  29. Udgivet

    Frequency adaptive metadynamics for the calculation of rare-event kinetics

    Wang, Yong, Valsson, O., Tiwary, P., Parrinello, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Journal of Chemical Physics. 149, 7, s. 1-7 072309.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Monte Carlo Sampling of Protein Folding by Combining an All-Atom Physics-Based Model with a Native State Bias

    Wang, Yong, Tian, P., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Journal of Physical Chemistry B. 122, 49, s. 11174-11185

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Role of protein dynamics in transmembrane receptor signalling

    Wang, Yong, Bugge, K. Ø., Kragelund, Birthe Brandt & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 74-82 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    Structural Basis of Membrane Protein Chaperoning through the Mitochondrial Intermembrane Space

    Weinhaupl, K., Lindau, C., Hessel, A., Wang, Yong, Schültze, C., Jores, T., Melchionda, L., Schönfisch, B., Kalbacher, H., Bersch, B., Rapaport, D., Brennich, M., Lindorff-Larsen, Kresten, Wiedemann, N. & Schanda, P., 2018, I: Cell. 175, 5, s. 1365-1379, e25

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. 2017
  34. Udgivet

    Biomolecular conformational changes and ligand binding: from kinetics to thermodynamics

    Wang, Yong, Martins, J. & Lindorff-Larsen, Kresten, sep. 2017, I: Chemical Science. 8, 9, s. 6466-6473 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. 2016
  36. Udgivet

    Hybrid Methods and Atomistic Models to Explore Free Energies, Rates and Pathways of Protein Shape Changes

    Wang, Yong, 2016, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

  37. Udgivet

    Mapping transiently formed and sparsely populated conformations on a complex energy landscape

    Wang, Yong, Papaleo, E. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2016, I: eLife. 5, 35 s., e17505.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. 2015
  39. Udgivet

    Structure of a functional amyloid protein subunit computed using sequence variation

    Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Yong, Otzen, D., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 22–25 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. 2014

  41. Dynamic Conformational Change Regulates the Protein-DNA Recognition: An Investigation on Binding of a Y-Family Polymerase to Its Target DNA

    Chu, X., Liu, F., Maxwell, B. A., Wang, Yong, Suo, Z., Wang, H., Han, W. & Wang, J., 2014, I: P L o S One. 10, 9, 15 s., e1003804.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. PolyUbiquitin Chain Linkage Topology Selects the Functions from the Underlying Binding Landscape

    Wang, Yong, Tang, C., Wang, E. & Wang, J., 2014, I: P L o S Computational Biology (Online). 10, 7, 14 s., e1003691.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Reply to Jensen and Blackledge: dual quantifications of intrinsically disordered proteins by NMR ensembles and molecular dynamics simulations

    Wang, Yong, Longhi, S., Roche, P. & Wang, J., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 16, s. E1559 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. 2013

  45. Exploring the Dynamic Functional Landscape of Adenylate Kinase Modulated by Substrates

    Wang, Yong, Gan, L., Wang, E. & Wang, J., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 1, s. 84-95 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Multiscaled exploration of coupled folding and binding of an intrinsically disordered molecular recognition element in measles virus nucleoprotein

    Wang, Yong, Chu, X., Longhi, S., Roche, P., Han, W., Wang, E. & Wang, J., 2013, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 40, s. E3743-E3752 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. 2012

  48. Exploration of Multi-State Conformational Dynamics and Underlying Global Functional Landscape of Maltose Binding Protein

    Wang, Yong, Tang, C., Wang, E. & Wang, J., 2012, I: P L o S Computational Biology (Online). 8, 4, 15 s., e1002471.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Importance of Electrostatic Interactions in the Association of Intrinsically Disordered Histone Chaperone Chz1 and Histone H2A.Z-H2B

    Chu, X., Wang, Yong, Gan, L., Bai, Y., Han, W., Wang, E. & Wang, J., 2012, I: P L o S Computational Biology (Online). 8, 7, 11 s., e1002608.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Multidomain Protein Solves the Folding Problem by Multifunnel Combined Landscape: Theoretical Investigation of a Y-Family DNA Polymerase

    Wang, Yong, Chu, X., Suo, Z., Wang, E. & Wang, J., 2012, I: Journal of the American Chemical Society. 134, 33, s. 13755-13764 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  51. 2011

  52. Multi-scaled explorations of binding-induced folding of intrinsically disordered protein inhibitor IA3 to its target enzyme

    Wang, J., Wang, Yong, Chu, X., Hagen, S. J., Han, W. & Wang, E., 2011, I: P L o S Computational Biology (Online). 7, 4, 12 s., e1001118.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

ID: 45779122