Witold Piotr Kot
Tenure Track Adjunkt
Microbial Ecology and Biotechnology
Thorvaldsensvej 40
1871 Frederiksberg C
- 2024
- Udgivet
Insights into the circular: The cryptic plasmidome and its derived antibiotic resistome in the urban water systems
Yu, Z., He, Wanli, Klincke, F., Madsen, Jonas Stenløkke, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Dechesne, A., Smets, B., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Environment International. 183, 12 s., 108351.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
A novel Queuovirinae lineage of Pseudomonas aeruginosa phages encode dPreQ0 DNA modifications with a single GA motif that provide restriction and CRISPR Cas9 protection in vitro
Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Cui, L., Dedon, P., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 16, 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
CRISPR-Cas provides limited phage immunity to a prevalent gut bacterium in gnotobiotic mice
Rasmussen, Torben Sølbeck, Koefoed, A. K., Deng, Ling, Muhammed, Musemma Kedir, Rousseau, G. M., Kot, Witold, Sprotte, S., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, Axel Kornerup, Vogensen, Finn Kvist, Moineau, S. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: ISME Journal. 17, s. 432–442Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete Genome Sequences of Three Lactiplantibacillus plantarum Strains Isolated from Traditional Iranian Raw Milk Motal Cheese
Fatemizadeh, S. S., Krych, Lukasz, Castro-Mejía, J. L., Stefanova, Denitsa Vladimirova, Kot, Witold, Najafi, M. B. H. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: Microbiology Resource Announcements. 12, 1, 3 s., e0047922.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection of nucleotide modifications in bacteria and bacteriophages: Strengths and limitations of current technologies and software
Nielsen, Tue Kjærgaard, Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Moineau, S., Hansen, Lars Hestbjerg & Riber, Leise, 2023, I: Molecular Ecology. 32, 6, s. 1236-1247 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Four novel Curtobacterium phages isolated from environmental samples
Alanin, K. W. S., Olsen, Nikoline S., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Nielsen, Tue Kjærgaard, Rothgardt, M. M., Russel, A. M., Wagner, N., Lametsch, Rene, Bak, Frederik, Hennessy, Rosanna Catherine, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Archives of Virology. 168, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic rearrangements in Pseudomonas amygdali pathovar aesculi shape coronatine plasmids
Nielsen, Tue Kjærgaard, Winther-Have, Caroline Sophie W, Thomsen, Iben Margrete, Jackson, R. W., Rabiey, M., Hennessy, Rosanna Catherine, Bak, Frederik, Kot, Witold, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Carstens, Alexander Byth & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Infection, Genetics and Evolution. 113, 10 s., 105486.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The impact of storage buffer and storage conditions on fecal samples for bacteriophage infectivity and metavirome analyses
Zhai, Xichuan, Castro-Mejía, J. L., Gobbi, Alex, Aslampaloglou, A., Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris & Deng, Ling, 2023, I: Microbiome. 11, 12 s., 193.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Three novel Erwinia billingiae phages isolated from organic waste represent three new genera
Alanin, K. W. S., Olsen, Nikoline S., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Nielsen, Tue Kjærgaard, Wagner, N., Lametsch, Rene, Bak, Frederik, Hennessy, Rosanna Catherine, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Archives of Virology. 168, 7 s., 71.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Used Nasogastric Feeding Tubes from Neonates Contain Infant-Specific Bacterial Profiles
Meinich Juhl, S., Angeliki Krogfelt, K., Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris & Krych, Lukasz, 2023, I: Microorganisms. 11, 6, 11 s., 1365.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Widespread and largely unknown prophage activity, diversity, and function in two genera of wheat phyllosphere bacteria
Dougherty, Peter Erdmann, Nielsen, Tue Kjærgaard, Riber, Leise, Lading, H. H., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Raaijmakers, J. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: ISME Journal. 17, 12, s. 2415-2425Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
- Udgivet
Donor-dependent fecal microbiota transplantation efficacy against necrotizing enterocolitis in preterm pigs
Hui, Y., Vestergaard, G., Deng, Ling, Kot, Witold, Thymann, Thomas, Brunse, Anders & Nielsen, Dennis Sandris, 2022, I: npj Biofilms and Microbiomes. 8, 1, 12 s., 48.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fecal filtrate transplantation protects against necrotizing enterocolitis
Brunse, Anders, Deng, Ling, Pan, X., Hui, Y., Castro Mejia, J. L., Kot, Witold, Nguyen, Duc Ninh, Secher, Jan Bojsen-Møller, Nielsen, Dennis Sandris & Thymann, Thomas, 2022, I: The ISME Journal. 16, s. 686–694Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
From Alpha Diversity to Zzz: Interactions among sleep, the brain, and gut microbiota in the first year of life
Schoch, S. F., Castro-Mejía, J. L., Krych, Lukasz, Leng, B., Kot, Witold, Kohler, M., Huber, R., Rogler, G., Biedermann, L., Walser, J. C., Nielsen, Dennis Sandris & Kurth, S., 2022, I: Progress in Neurobiology. 209, 11 s., 102208.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Marked gut microbiota dysbiosis and increased imidazole propionate are associated with a NASH Göttingen Minipig model
Lützhøft, Ditte Olsen, Sinioja, T., Christoffersen, B., Jakobsen, Rasmus Riemer, Geng, Dawei, Ahmad, H. F. B., Straarup, E. M., Pedersen, K. M., Kot, Witold, Pedersen, H. D., Cirera, Susanna, Hyötyläinen, T., Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2022, I: BMC Microbiology. 22, 1, 287.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Maturation of sleep-gut microbiome dynamics in infancy and links to behavioral development
Kurth, S., Schoch, S., Castro-Mejia, J., Krych, Lukasz, Leng, B., Kot, Witold, Kohler, M., Huber, R., Rogler, G., Biedermann, L., Walser, J. & Nielsen, D., 2022, I: Journal of Sleep Research. 31, S1, s. 93-94 2 s., O194/P949.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Parasite-Probiotic Interactions in the Gut: Bacillus sp. and Enterococcus faecium Regulate Type-2 Inflammatory Responses and Modify the Gut Microbiota of Pigs During Helminth Infection
Myhill, L. J., Stolzenbach, S., Mejer, Helena, Krych, Lukasz, Jakobsen, S. R., Kot, Witold, Skovgaard, K., Canibe, N., Nejsum, P., Nielsen, Dennis Sandris, Thamsborg, Stig Milan & Williams, Andrew Richard, 2022, I: Frontiers in Immunology. 12, 793260.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Salmonella phage akira, infecting selected Salmonella enterica Enteritidis and Typhimurium strains, represents a new lineage of bacteriophages
Olsen, Nikoline S., Lametsch, Rene, Wagner, N., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2022, I: Archives of Virology. 167, s. 2049–2056Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The phytonutrient cinnamaldehyde limits intestinal inflammation and enteric parasite infection
Zhu, L., Andersen-Civil, A. I. S., Myhill, L. J., Thamsborg, Stig Milan, Kot, Witold, Krych, Lukasz, Nielsen, Dennis Sandris, Blanchard, A. & Williams, Andrew Richard, 2022, I: Journal of Nutritional Biochemistry. 100, 10 s., 108887.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Administration of bovine milk oligosaccharide to weaning gnotobiotic mice inoculated with a simplified infant type microbiota
Jakobsen, L. M. A., Sundekilde, U. K., Andersen, H. J., Kot, Witold, Mejia, J. L. C., Nielsen, Dennis Sandris, Hansen, Axel Kornerup & Bertram, H. C., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 1003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An Oligosaccharide Rich Diet Increases Akkermansia spp. Bacteria in the Equine Microbiota
Lindenberg, F. C., Lützhøft, Ditte Olsen, Krych, Lukasz, Fielden, J., Kot, Witold, Frøkiær, Hanne, van Galen, G., Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 666039.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms
Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enterococcus phage Nonaheksakonda infecting clinical isolates of Enterococcus faecalis represents a new lineage in the family Siphoviridae
Olsen, Nikoline S., Nielsen, K. J., Plöger, M., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Archives of Virology. 166, s. 593-599 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High throughput in vitro characterization of pectins for pig(let) nutrition
Wiese, M., Hui, Y., Holck, J., Sejberg, J. J. P., Daures, C., Maas, E., Kot, Witold, Borne, J. M., Khakimov, Bekzod, Thymann, Thomas & Nielsen, Dennis Sandris, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 15 s., 69.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 15105675
Flest downloads
-
3025
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
1776
downloads
Bacteriophages of Leuconostoc, Oenococcus, and Weissella
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1273
downloads
Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet