Witold Piotr Kot

Witold Piotr Kot

Tenure Track Adjunkt


  1. 2024
  2. Udgivet

    Insights into the circular: The cryptic plasmidome and its derived antibiotic resistome in the urban water systems

    Yu, Z., He, Wanli, Klincke, F., Madsen, Jonas Stenløkke, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Dechesne, A., Smets, B., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Environment International. 183, 12 s., 108351.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    A novel Queuovirinae lineage of Pseudomonas aeruginosa phages encode dPreQ0 DNA modifications with a single GA motif that provide restriction and CRISPR Cas9 protection in vitro

    Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Cui, L., Dedon, P., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 16, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    CRISPR-Cas provides limited phage immunity to a prevalent gut bacterium in gnotobiotic mice

    Rasmussen, Torben Sølbeck, Koefoed, A. K., Deng, Ling, Muhammed, Musemma Kedir, Rousseau, G. M., Kot, Witold, Sprotte, S., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, Axel Kornerup, Vogensen, Finn Kvist, Moineau, S. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: ISME Journal. 17, s. 432–442

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Complete Genome Sequences of Three Lactiplantibacillus plantarum Strains Isolated from Traditional Iranian Raw Milk Motal Cheese

    Fatemizadeh, S. S., Krych, Lukasz, Castro-Mejía, J. L., Stefanova, Denitsa Vladimirova, Kot, Witold, Najafi, M. B. H. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: Microbiology Resource Announcements. 12, 1, 3 s., e0047922.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Detection of nucleotide modifications in bacteria and bacteriophages: Strengths and limitations of current technologies and software

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Moineau, S., Hansen, Lars Hestbjerg & Riber, Leise, 2023, I: Molecular Ecology. 32, 6, s. 1236-1247 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Four novel Curtobacterium phages isolated from environmental samples

    Alanin, K. W. S., Olsen, Nikoline S., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Nielsen, Tue Kjærgaard, Rothgardt, M. M., Russel, A. M., Wagner, N., Lametsch, Rene, Bak, Frederik, Hennessy, Rosanna Catherine, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Archives of Virology. 168, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Genetic rearrangements in Pseudomonas amygdali pathovar aesculi shape coronatine plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Winther-Have, Caroline Sophie W, Thomsen, Iben Margrete, Jackson, R. W., Rabiey, M., Hennessy, Rosanna Catherine, Bak, Frederik, Kot, Witold, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Carstens, Alexander Byth & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Infection, Genetics and Evolution. 113, 10 s., 105486.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    The impact of storage buffer and storage conditions on fecal samples for bacteriophage infectivity and metavirome analyses

    Zhai, Xichuan, Castro-Mejía, J. L., Gobbi, Alex, Aslampaloglou, A., Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris & Deng, Ling, 2023, I: Microbiome. 11, 12 s., 193.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet
  12. Udgivet

    Used Nasogastric Feeding Tubes from Neonates Contain Infant-Specific Bacterial Profiles

    Meinich Juhl, S., Angeliki Krogfelt, K., Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris & Krych, Lukasz, 2023, I: Microorganisms. 11, 6, 11 s., 1365.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Widespread and largely unknown prophage activity, diversity, and function in two genera of wheat phyllosphere bacteria

    Dougherty, Peter Erdmann, Nielsen, Tue Kjærgaard, Riber, Leise, Lading, H. H., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Raaijmakers, J. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: ISME Journal. 17, 12, s. 2415-2425

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. 2022
  15. Udgivet

    Bacteriophages Roam the Wheat Phyllosphere

    Forero Junco, Laura Milena, Alanin, K. W. S., Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold, Gobbi, Alex & Hansen, Lars Hestbjerg, 2022, I: Viruses. 14, 2, 13 s., 244.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Donor-dependent fecal microbiota transplantation efficacy against necrotizing enterocolitis in preterm pigs

    Hui, Y., Vestergaard, G., Deng, Ling, Kot, Witold, Thymann, Thomas, Brunse, Anders & Nielsen, Dennis Sandris, 2022, I: npj Biofilms and Microbiomes. 8, 1, 12 s., 48.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Fecal filtrate transplantation protects against necrotizing enterocolitis

    Brunse, Anders, Deng, Ling, Pan, X., Hui, Y., Castro Mejia, J. L., Kot, Witold, Nguyen, Duc Ninh, Secher, Jan Bojsen-Møller, Nielsen, Dennis Sandris & Thymann, Thomas, 2022, I: The ISME Journal. 16, s. 686–694

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    From Alpha Diversity to Zzz: Interactions among sleep, the brain, and gut microbiota in the first year of life

    Schoch, S. F., Castro-Mejía, J. L., Krych, Lukasz, Leng, B., Kot, Witold, Kohler, M., Huber, R., Rogler, G., Biedermann, L., Walser, J. C., Nielsen, Dennis Sandris & Kurth, S., 2022, I: Progress in Neurobiology. 209, 11 s., 102208.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Marked gut microbiota dysbiosis and increased imidazole propionate are associated with a NASH Göttingen Minipig model

    Lützhøft, Ditte Olsen, Sinioja, T., Christoffersen, B., Jakobsen, Rasmus Riemer, Geng, Dawei, Ahmad, H. F. B., Straarup, E. M., Pedersen, K. M., Kot, Witold, Pedersen, H. D., Cirera, Susanna, Hyötyläinen, T., Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2022, I: BMC Microbiology. 22, 1, 287.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Maturation of sleep-gut microbiome dynamics in infancy and links to behavioral development

    Kurth, S., Schoch, S., Castro-Mejia, J., Krych, Lukasz, Leng, B., Kot, Witold, Kohler, M., Huber, R., Rogler, G., Biedermann, L., Walser, J. & Nielsen, D., 2022, I: Journal of Sleep Research. 31, S1, s. 93-94 2 s., O194/P949.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Parasite-Probiotic Interactions in the Gut: Bacillus sp. and Enterococcus faecium Regulate Type-2 Inflammatory Responses and Modify the Gut Microbiota of Pigs During Helminth Infection

    Myhill, L. J., Stolzenbach, S., Mejer, Helena, Krych, Lukasz, Jakobsen, S. R., Kot, Witold, Skovgaard, K., Canibe, N., Nejsum, P., Nielsen, Dennis Sandris, Thamsborg, Stig Milan & Williams, Andrew Richard, 2022, I: Frontiers in Immunology. 12, 793260.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Salmonella phage akira, infecting selected Salmonella enterica Enteritidis and Typhimurium strains, represents a new lineage of bacteriophages

    Olsen, Nikoline S., Lametsch, Rene, Wagner, N., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2022, I: Archives of Virology. 167, s. 2049–2056

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    The phytonutrient cinnamaldehyde limits intestinal inflammation and enteric parasite infection

    Zhu, L., Andersen-Civil, A. I. S., Myhill, L. J., Thamsborg, Stig Milan, Kot, Witold, Krych, Lukasz, Nielsen, Dennis Sandris, Blanchard, A. & Williams, Andrew Richard, 2022, I: Journal of Nutritional Biochemistry. 100, 10 s., 108887.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2021
  25. Udgivet

    Administration of bovine milk oligosaccharide to weaning gnotobiotic mice inoculated with a simplified infant type microbiota

    Jakobsen, L. M. A., Sundekilde, U. K., Andersen, H. J., Kot, Witold, Mejia, J. L. C., Nielsen, Dennis Sandris, Hansen, Axel Kornerup & Bertram, H. C., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 1003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    An Oligosaccharide Rich Diet Increases Akkermansia spp. Bacteria in the Equine Microbiota

    Lindenberg, F. C., Lützhøft, Ditte Olsen, Krych, Lukasz, Fielden, J., Kot, Witold, Frøkiær, Hanne, van Galen, G., Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 666039.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms

    Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Enterococcus phage Nonaheksakonda infecting clinical isolates of Enterococcus faecalis represents a new lineage in the family Siphoviridae

    Olsen, Nikoline S., Nielsen, K. J., Plöger, M., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Archives of Virology. 166, s. 593-599 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    High throughput in vitro characterization of pectins for pig(let) nutrition

    Wiese, M., Hui, Y., Holck, J., Sejberg, J. J. P., Daures, C., Maas, E., Kot, Witold, Borne, J. M., Khakimov, Bekzod, Thymann, Thomas & Nielsen, Dennis Sandris, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 15 s., 69.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 Næste

ID: 15105675