Tom Gilbert

Tom Gilbert

Professor


  1. 2019
  2. Udgivet

    Resolving a clinical tuberculosis outbreak using palaeogenomic genome reconstruction methodologies

    Jones, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Harris, L. G., Morgan, S., Temple, M., Ruddy, M. C., Williams, R., Perry, M. D., Hitchings, M., Wilkinson, T. S., Humphrey, T., Gilbert, M Thomas P & Davies, A. P., dec. 2019, I: Tuberculosis. 119, 5 s., 101865.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Promises and pitfalls of using high-throughput sequencing for diet analysis

    Alberdi, Antton, Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Bohmann, Kristine, Gopalakrishnan, Shyam, Lynggaard, Christina Islas, Nielsen, M. & Gilbert, M Thomas P, mar. 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 2, s. 327-348

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Ancient DNA reveals the timing and persistence of organellar genetic bottlenecks over 3,000 years of sunflower domestication and improvement

    Wales, N., Akman, M., Watson, R. H. B., Sánchez Barreiro, F., Smith, B. D., Gremillion, K. J., Gilbert, M Thomas P & Blackman, B. K., 1 jan. 2019, I: Evolutionary Applications. 12, 1, s. 38-53

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  5. Udgivet

    DNA extraction from keratin and chitin

    Campos, P. F. & Gilbert, M Thomas P, 1 jan. 2019, Methods in Molecular Biology. Humana Press, s. 57-63 7 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1963).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    31° South: Dietary niche of an arid‐zone endemic passerine

    Ribeiro, Â. M., Smit, B. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Environmental Engineering. 1, 2, s. 109-118

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  7. Udgivet

    31º South: The physiology of adaptation to arid conditions in a passerine bird

    Ribeiro, Â. M., Puetz, Lara Christine, Pattinson, N. B., Dalén, L., Deng, Y., KU, thw266, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smit, B. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Molecular Ecology. 28, 16, s. 3709-3721 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  8. Udgivet

    A 5700 year-old human genome and oral microbiome from chewed birch pitch

    Jensen, T. Z. T., Niemann, J., Iversen, K. H., Fotakis, A. K., Gopalakrishnan, S., Vågene, Å. J., Pedersen, M. W., Sinding, M-H. S., Ellegaard, M. R., Allentoft, M. E., Lanigan, L. T., Taurozzi, A. J., Nielsen, S. H., Dee, M. W., Mortensen, M. N., Christensen, M. C., Sørensen, S. A., Collins, M. J., Gilbert, M. T. P., Sikora, M. & 2 flere, Rasmussen, Simon & Schroeder, Hannes, 2019, I: Nature Communications. 10, 10 s., 5520.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  9. Udgivet

    A comparison of storage methods for gut microbiome studies in teleosts: insights from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

    Hildonen, M., Kodama, M., Puetz, Lara Christine, Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2019, I: Journal of Microbiological Methods. 160, s. 42-48

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  10. Udgivet

    A guide to the application of Hill numbers to DNA-based diversity analyses

    Alberdi, Antton & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 4, s. 804-817 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A simplified DNA extraction protocol for unsorted bulk arthropod samples that maintains exoskeletal integrity

    Nielsen, M., Gilbert, M Thomas P, Pape, Thomas & Bohmann, Kristine, 2019, I: Environmental DNA. 1, 2, s. 144-154

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Ancient RNA from Late Pleistocene permafrost and historical canids shows tissue-specific transcriptome survival

    Smith, O., Dunshea, G., Sinding, M. S., Fedorov, S., Germonpre, M., Bocherens, H. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: PLOS Biology. 17, 7, s. 1-28 e3000166.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Ancient pigs reveal a near-complete genomic turnover following their introduction to Europe

    Frantz, L. A. F., Haile, J., Lin, A. T., Scheu, A., Geoerg, C., Benecke, N., Alexander, M., Linderholm, A., Mullin, V. E., Daly, K. G., Battista, V. M., Price, M., Gron, K. J., Alexandri, P., Arbogast, R-M., Arbuckle, B., Balasescu, A., Barnett, R., Bartosiewicz, L., Baryshnikov, G. & 80 flere, Bonsall, C., Boric, D., Boroneant, A., Bulatovic, J., Cakirlar, C., Carretero, J., Chapman, J., Church, M., Crooijmans, R., De Cupere, B., Detry, C., Dimitrijevic, V., Dumitrascu, V., du Plessis, L., Edwards, C. J., Erek, C. M., Erim-Ozdogan, A., Ervynck, A., Fulgione, D., Gligor, M., Gotherstrom, A., Gourichon, L., Groenen, M. A. M., Helmer, D., Hongo, H., Horwitz, L. K., Irving-Pease, E. K., Lebrasseur, O., Lesur, J., Malone, C., Manaseryan, N., Marciniak, A., Martlew, H., Mashkour, M., Matthews, R., Matuzeviciute, G. M., Maziar, S., Meijaard, E., McGovern, T., Megens, H., Miller, R., Mohaseb, A. F., Orschiedt, J., Orton, D., Papathanasiou, A., Pearson, M. P., Pinhasi, R., Radmanovic, D., Ricaut, F., Richards, M., Sabin, R., Sarti, L., Schier, W., Sheikhi, S., Stephan, E., Stewart, J. R., Stoddart, S., Tagliacozzo, A., Tasic, N., Trantalidou, K., Tresset, A., Valdiosera, C., van den Hurk, Y., Van Poucke, S., Vigne, J., Yanevich, A., Zeeb-Lanz, A., Triantafyllidis, A., Gilbert, M Thomas P, Schibler, J., Rowley-Conwy, P., Zeder, M., Peters, J., Cucchi, T., Bradley, D. G., Dobney, K., Burger, J., Evin, A., Girdland-Flink, L. & Larson, G., 2019, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116, 35, s. 17231-17238

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Avian Binocularity and Adaptation to Nocturnal Environments: Genomic Insights from a Highly Derived Visual Phenotype

    Borges, R., Fonseca, J., Gomes, C., Johnson, W. E., O'Brien, S. J., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D. & Antunes, A., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 8, s. 2244-2255

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Biological adaptations in the Arctic cervid, the reindeer (Rangifer tarandus)

    Lin, Z., Chen, L., Chen, X., Zhong, Y., Yang, Y., Xia, W., Liu, C., Zhu, W., Wang, H., Yan, B., Yang, Y., Liu, X., Kvie, K. S., Røed, K. H., Wang, K., Xiao, W., Wei, H., Li, G., Heller, R., Gilbert, M. T. P. & 3 flere, Qiu, Q., Wang, W. & Li, Z., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1154-+ 7 s., eaav6312.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Contrasting dates of rainforest fragmentation in Africa inferred from trees with different dispersal abilities

    Pineiro, R., Hardy, O. J., Tovar, C., Gopalakrishnan, Shyam, Vieira, Filipe Garrett & Gilbert, M Thomas P, 2019, 19 s. (bioRxiv).

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  17. Udgivet

    DNA metabarcoding - need for robust experimental designs to draw sound ecological conclusions

    Zinger, L., Bonin, A., Alsos, I. G., Bálint, M., Bik, H., Boyer, F., Chariton, A. A., Creer, S., Coissac, E., Deagle, B. E., De Barba, M., Dickie, I. A., Dumbrell, A. J., Ficetola, G. F., Fierer, N., Fumagalli, L., Gilbert, M. T. P., Jarman, S., Jumpponen, A., Kauserud, H. & 7 flere, Orlando, L., Pansu, J., Pawlowski, J., Tedersoo, L., Thomsen, P. F., Willerslev, Eske & Taberlet, P., 2019, I: Molecular Ecology. 28, 8, s. 1857-1862 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Demographic reconstruction from ancient DNA supports rapid extinction of the great auk

    Thomas, J. E., Carvalho, G. R., Haile, J., Rawlence, N. J., Martin, M. D., Ho, S. Y. W., Sigfusson, A. P., Josefsson, V. A., Frederiksen, M., Linnebjerg, J. F., Castruita, J. A. S., Niemann, J., Sinding, M-H. S., Sandoval-Velasco, M., Soares, A. E. R., Lacy, R., Barilaro, C., Best, J., Brandis, D., Cavallo, C. & 17 flere, Elorza, M., Garrett, K. L., Groot, M., Johansson, F., Lifjeld, J. T., Nilson, G., Serjeanston, D., Sweet, P., Fuller, E., Hufthammer, A. K., Meldgaard, Morten, Fjeldså, Jon, Shapiro, B., Hofreiter, M., Stewart, J. R., Gilbert, M Thomas P & Knapp, M., 2019, I: eLife. 8, 35 s., e47509.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Diabetic cats have decreased gut microbial diversity and a lack of butyrate producing bacteria

    Kieler, Ida Nordang, Osto, M., Hugentobler, L., Puetz, Lara Christine, Gilbert, M Thomas P, Hansen, Torben, Pedersen, Oluf Borbye, Reusch, C. E., Zini, E., Lutz, T. A. & Bjørnvad, Charlotte Reinhard, 2019, I: Scientific Reports. 9, s. 1-13 13 s., 4822.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Early Pleistocene enamel proteome from Dmanisi resolves Stephanorhinus phylogeny

    Cappellini, E., Welker, F., Pandolfi, L., Ramos-Madrigal, J., Samodova, D., Rüther, P. L., Fotakis, A. K., Lyon, D., Moreno-Mayar, J. V., Bukhsianidze, M., Rakownikow Jersie-Christensen, R., Mackie, M., Ginolhac, A., Ferring, R., Tappen, M., Palkopoulou, E., Dickinson, M. R., Stafford, T. W., Chan, Y. L., Götherström, A. & 23 flere, Nathan, S. K. S. S., Heintzman, P. D., Kapp, J. D., Kirillova, I., Moodley, Y., Agusti, J., Kahlke, R. D., Kiladze, G., Martínez-Navarro, B., Liu, Shanlin, Sandoval-Velasco, Marcela, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kelstrup, C. D., Allentoft, Morten Erik, Orlando, L., Penkman, K., Shapiro, B., Rook, L., Dalén, L., Gilbert, M Thomas P, Olsen, Jesper Velgaard, Lordkipanidze, D. & Willerslev, Eske, 2019, I: Nature. 574, 7776, s. 103-107

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Genetic affinities of an eradicated European Plasmodium falciparum strain

    de-Dios, T., van Dorp, L., Gelabert, P., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2019, I: Microbial Genomics. 5, 9, 7 s., 289.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  22. Udgivet

    High-coverage genomes to elucidate the evolution of penguins

    Pan, H., Cole, T. L., Bi, X., Fang, M., Zhou, C., Yang, Z., Ksepka, D. T., Hart, T., Bouzat, J. L., Argilla, L. S., Bertelsen, M. F., Boersma, P. D., Bost, C. A., Cherel, Y., Dann, P., Fiddaman, S. R., Howard, P., Labuschagne, K., Mattern, T., Miller, G. & 26 flere, Parker, P., Phillips, R. A., Quillfeldt, P., Ryan, P. G., Taylor, H., Thompson, D. R., Young, M. J., Ellegaard, M. R., Gilbert, M Thomas P, Sinding, Mikkel Holger Strander, Antunes Pacheco, George, Shepherd, L. D., Tennyson, A. J. D., Grosser, S., Kay, E., Nupen, L. J., Ellenberg, U., Houston, D. M., Reeve, A. H., Johnson, K., Masello, J. F., Stracke, T., McKinlay, B., Borboroglu, P. G., Zhang, D. X. & KU, thw266, 2019, I: GigaScience. 8, 9, s. 1-17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Host-derived population genomics data provides insights into bacterial and diatom composition of the killer whale skin

    Hooper, R., Brealey, J. C., van der Valk, T., Alberdi, Antton, Durban, J. W., Fearnbach, H., Robertson, K. M., Baird, R. W., Bradley Hanson, M., Wade, P., Gilbert, M Thomas P, Morin, P. A., Wolf, J. B. W., Foote, A. D. & Guschanski, K., 2019, I: Molecular Ecology. 28, 2, s. 484-502 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Killer whale genomes reveal a complex history of recurrent admixture and vicariance

    Foote, A. D., Martin, M. D., Louis, M., Pacheco, G., Robertson, K. M., Sinding, M-H. S., Amaral, A. R., Baird, R. W., Baker, C. S., Ballance, L., Barlow, J., Brownlow, A., Collins, T., Constantine, R., Dabin, W., Dalla Rosa, L., Davison, N. J., Durban, J. W., Esteban, R., Ferguson, S. H. & 15 flere, Gerrodette, T., Guinet, C., Hanson, M. B., Hoggard, W., Matthews, C. J. D., Samarra, F. I. P., de Stephanis, R., Tavares, S. B., Tixier, P., Totterdell, J. A., Wade, P., Excoffier, L., Gilbert, M Thomas P, Wolf, J. B. W. & Morin, P. A., 2019, I: Molecular Ecology. 28, 14, s. 3427-3444 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits

    Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, Zhao, Y., Zhang, C., Wang, Z., Qin, Y., Liu, W., Wang, B., Ren, Y., Zhang, R., Zeng, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Wei, B., Li, R., Wan, W., Zhao, R., Zhu, W., Wang, Y., Duan, S., Gao, Y., Zhang, Y. E., Chen, C., Hvilsom, C., Epps, C. W., Chemnick, L. G., Doug, Y., Mirarab, S., Siegismund, Hans Redlef, Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Lewin, H. A., KU, thw266, Heller, Rasmus & Wang, W., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Mitogenomic evidence of close relationships between New Zealand's extinct giant raptors and small-sized Australian sister-taxa

    Knapp, M., Thomas, J. E., Haile, James Seymour, Prost, S., Ho, S. Y. W., Dussex, N., Cameron-Christie, S., Kardailsky, O., Barnett, R., Bunce, M., Gilbert, M Thomas P & Scofield, R. P., 2019, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 134, s. 122-128

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 12980