Tom Gilbert

Tom Gilbert

Professor

Medlem af:


    1. Udgivet

      Contrasting population-level responses to Pleistocene climatic oscillations in an alpine bat revealed by complete mitochondrial genomes and evolutionary history inference

      Alberdi, A., Gilbert, M Thomas P, Razgour, O., Aizpurua, O., Aihartza, J. & Garin, I., 2015, I: Journal of Biogeography. 42, 9, s. 1689-1700 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    2. Udgivet

      Comparative performance of two whole-genome capture methodologies on ancient DNA Illumina libraries

      Avila Arcos, M. D. C., Sandoval-Velasco, Marcela, Schroeder, Hannes, Carpenter, M. L., Malaspinas, A. S., Wales, N., Peñaloza, F., Bustamante, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Methods in Ecology and Evolution. 6, 6, s. 725-734 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Gene loss, adaptive evolution and the co-evolution of plumage coloration genes with opsins in birds

      Borges, R., Khan, I., Johnson, W. E., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J. & Antunes, A., 2015, I: B M C Genomics. 16, 13 s., 751 .

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Viral meningitis epidemics and a single, recent, recombinant and anthroponotic origin of swine vesicular disease virus

      Bruhn, C. A. W., Nielsen, S. C. A., Samaniego Castruita, J. A., Wadsworth, J., Knowles, N. J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Evolution, Medicine, and Public Health. 2015, 1, s. 289-303 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Response to Comment on “Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds”

      Cracraft, J., Houde, P., Ho, S. Y. W., Mindell, D. P., Fjeldså, Jon, Lindow, Bent Erik Kramer, Edwards, S. V., Rahbek, Carsten, Mirarab, S., Warnow, T., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Braun, E. L. & Jarvis, E. D., 2015, I: Science. 349, 6255, s. 1460b 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Ancient genomics

      Der Sarkissian, C., Allentoft, M. E., Avila Arcos, M. D. C., Barnett, R., Campos, P. F., Cappellini, E., Ermini, L., Fernandez Garcia, R., Rodrigues da Fonseca, R. A., Ginolhac, A., Hansen, A. J., Jónsson, H., Korneliussen, T. S., Margaryan, A., Martin, M. D., Moreno Mayar, J. V., Raghavan, M., Rasmussen, M., Sandoval Velasco, M., Schroeder, H. & 6 flere, Schubert, Mikkel, Seguin-Orlando, A., Wales, N., Gilbert, M Thomas P, Willerslev, Eske & Orlando, L. A. A., 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 12 s., 20130387.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Avianbase: a community resource for bird genomics

      Eöry, L., Gilbert, M Thomas P, Li, C., Li, B., Archibald, A., Aken, B. L., KU, thw266, Jarvis, E., Flicek, P. & Burt, D. W., 2015, I: Genome Biology (Online Edition). 16, 4 s., 21.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Convergent evolution of the genomes of marine mammals

      Foote, A. D., Liu, Y., Thomas, G. W. C., Vinař, T., Alföldi, J., Deng, J., Dugan, S., van Elk, C. E., Hunter, M. E., Joshi, V., Khan, Z., Kovar, C., Lee, S. L., Lindblad-Toh, K., Mancia, A., Nielsen, R., Qin, X., Qu, J., Raney, B. J., Vijay, N. & 6 flere, Wolf, J. B. W., Hahn, M. W., Muzny, D. M., Worley, K. C., Gilbert, M Thomas P & Gibbs, R. A., 2015, I: Nature Genetics. 47, 3, s. 272-275 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Phylogenomic analyses data of the avian phylogenomics project

      Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Alfaro Nuñez, L. A., Narula, N., Liu, L., Burt, D., Ellegren, H., Edwards, S. V., Stamatakis, A. & 7 flere, Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, J., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2015, I: GigaScience. 4, 9 s., 4.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Olfactory receptor subgenomes linked with broad ecological adaptations in sauropsida

      Khan, I., Yang, Z., Maldonado, E., Li, C., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J., Johnson, W. E. & Antunes, A., 2015, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 32, 11, s. 2832-2843 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      The Genome 10K Project: a way forward

      Koepfli, K-P., Paten, B., O'Brien, S. J., Antunes, A., Belov, K., Bustamante, C., Castoe, T. A., Clawson, H., Crawford, A. J., Diekhans, M., Distel, D., Durbin, R., Earl, D., Fujita, M. K., Gamble, T., Georges, A., Gemmell, N., Gilbert, M. T. P., Graves, J. M., Green, R. E. & 25 flere, Hickey, G., Jarvis, E. D., Johnson, W., Komissarov, A., Korf, I., Kuhn, R., Larkin, D. M., Lewin, H., Lopez, J. V., Ma, J., Marques-Bonet, T., Miller, W., Murphy, R., Pevzner, P., Shapiro, B., Steiner, C., Tamazian, G., Venkatesh, B., Wang, J., Wayne, R., Wiley, E., Yang, H., KU, thw266, Haussler, D. & Ryder, O., 2015, I: Annual Review of Animal Biosciences. 3, s. 57-111 55 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Ancient mitochondrial DNA from the northern fringe of the Neolithic farming expansion in Europe sheds light on the dispersion process

      Malmström, H., Linderholm, A., Skoglund, P., Storå, J., Sjödin, P., Gilbert, M Thomas P, Holmlund, G., Willerslev, Eske, Jakobsson, M., Lidén, K. & Götherström, A., 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 10 s., 20130373.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      Geographic and temporal dynamics of a global radiation and diversification in the killer whale

      Morin, P. A., Parsons, K. M., Archer, F. I., Avila Arcos, M. D. C., Barrett-Lennard, L. G., Dalla Rosa, L., Duchêne, S., Durban, J. W., Ellis, G. M., Ferguson, S. H., Ford, J. K., Ford, M. J., Garilao, C., Gilbert, M. T. P., Kaschner, K., Matkin, C. O., Petersen, S. D., Robertson, K. M., Visser, I. N., Wade, P. R. & 2 flere, Ho, S. Y. W. & Foote, A. D., 2015, I: Molecular Ecology. 24, 15, s. 3964-3979 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      A common genetic origin for early farmers from Mediterranean Cardial and Central European LBK cultures

      Olalde, I., Schroeder, Hannes, Sandoval-Velasco, Marcela, Vinner, Lasse, Lobón, I., Ramirez, O., Civit, S., Borja, P. G., Salazar-García, D. C., Talamo, S., Fullola, J. M., Oms, F. X., Pedro, M., Martínez, P., Sanz, M., Daura, J., Zilhão, J., Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2015, I: Molecular Biology and Evolution. 32, 12, s. 3132-3142 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Reconstructing ancient genomes and epigenomes

      Orlando, L. A. A., Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2015, I: Nature Reviews. Genetics. 16, 7, s. 395-408 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Ancient and modern environmental DNA

      Pedersen, Mikkel Winther, Overballe-Petersen, S., Ermini, L., Der Sarkissian, C., Haile, James Seymour, Hellström, A. M., Spens, J., Thomsen, P. F., Bohmann, Kristine, Cappellini, Enrico, Schnell, I. B., Wales, N., Carøe, C., Campos, P., Schmidt, A. M. Z., Gilbert, M Thomas P, Hansen, Anders Johannes, Orlando, L. A. A. & Willerslev, Eske, 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 11 s., 20130383.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      A refined model of the genomic basis for phenotypic variation in vertebrate hemostasis

      Ribeiro, Â. M., Zepeda Mendoza, M. L., Bertelsen, Mads Frost, Kristensen, Annemarie T., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2015, I: B M C Evolutionary Biology. 15, 8 s., 124.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      The origin and evolution of maize in the Southwestern United States: [+ erratum]

      Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smith, B. D., Wales, N., Cappellini, Enrico, Skoglund, P., Fumagalli, M., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Hufnagel, D. E., Korneliussen, Thorfinn Sand, Vieira, Filipe Garrett, Jakobsson, M., Arriaza, B., Willerslev, Eske, Nielsen, Rasmus, Hufford, M. B., Albrechtsen, Anders, Ross-Ibarra, J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature Plants. 1, 5 s., 14003.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Odintifier - A computational method for identifying insertions of organellar origin from modern and ancient high-throughput sequencing data based on haplotype phasing

      Samaniego Castruita, J. A., Zepeda Mendoza, M. L., Barnett, R., Wales, N. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: BMC Bioinformatics. 16, 13 s., 232.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Tag jumps illuminated - reducing sequence-to-sample misidentifications in metabarcoding studies

      Schnell, I. B., Bohmann, Kristine & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Molecular Ecology Resources. 15, 6, s. 1289-1303 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. Udgivet

      iDNA from terrestrial haematophagous leeches as a wildlife surveying and monitoring tool - prospects, pitfalls and avenues to be developed

      Schnell, I. B., Sollmann, R., Calvignac-Spencer, S., Siddall, M. E., Yu, D. W., Wilting, A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Frontiers in Zoology. 12, 14 s., 24.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      Genome-wide ancestry of 17th-century enslaved Africans from the Caribbean

      Schroeder, Hannes, Avila Arcos, M. D. C., Malaspinas, A. S., Poznik, G. D., Sandoval-Velasco, Marcela, Carpenter, M. L., Moreno Mayar, J. Víctor, Sikora, Martin, Johnson, P. L. F., Allentoft, Morten Erik, Samaniego Castruita, J. A., Haviser, J. B., Dee, M. W., Stafford, T. W., Salas, A., Orlando, L. A. A., Willerslev, Eske, Bustamente, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 112, 12, s. 3669–3673 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      Ancient DNA unravels the truth behind the controversial GUS Greenlandic Norse fur samples: the bison was a horse, and the muskox and bears were goats

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Arneborg, J., Nyegaard, G. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Journal of Archaeological Science. 53, s. 297-303 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      Penile density and globally used chemicals in Canadian and Greenland polar bears

      Sonne, C., Dyck, M., Rigét, F. F., Jensen, J. B., Hyldstrup, L., Letcher, R. J., Gustavson, K., Gilbert, M Thomas P & Dietz, R., 2015, I: Environmental Research. 137, s. 287-291 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      New insights on single-stranded versus double-stranded DNA library preparation for ancient DNA

      Wales, N., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Gamba, C., Barnett, R., Samaniego Castruita, J. A., Ramos Madrigal, Jazmin, Orlando, L. A. A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: BioTechniques. 59, 6, s. 368-371 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus

      Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Christensen, R. J., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Mackie, M., Canci, A., Bouwman, A., Ruhli, F. & 2 flere, Gilbert, M Thomas P & Collins, M. J., 2015, I: American Journal of Physical Anthropology. 156, Suppl. 60, s. 319 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      Environmental genes and genomes: understanding the differences and challenges in the approaches and software for their analyses

      Zepeda Mendoza, M. L., Sicheritz-Pontén, T. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Briefings in Bioinformatics. 16, 5, s. 745-758 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    28. Udgivet

      Bird sequencing project takes off

      KU, thw266, Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature. 522, 7554, s. 34 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    ID: 12980