Tom Gilbert

Tom Gilbert

Professor

Medlem af:


    1. 2017
    2. Udgivet

      Characterizing restriction enzyme-associated loci in historic ragweed (Ambrosia artemisiifolia) voucher specimens using custom-designed RNA probes

      Sanchez Barreiro, F., Vieira, Filipe Garrett, Martin, M. D., Haile, James Seymour, Gilbert, M Thomas P & Wales, N., 2017, I: Molecular Ecology Resources. 17, 2, s. 209-220 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Draft genome of the fungus-growing termite pathogenic fungus Ophiocordyceps bispora (Ophiocordycipitaceae, Hypocreales, Ascomycota)

      Conlon, B. H., Mitchell, J., de Beer, Z. W., Carøe, C., Gilbert, M Thomas P, Eilenberg, Jørgen, Poulsen, Michael & de Fine Licht, Henrik Hjarvard, 2017, I: Data in Brief. 11, s. 537-542 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Leeches as a source of mammalian viral DNA and RNA - a study in medicinal leeches

      Kampmann, Marie-Louise, Schnell, I. B., Jensen, R. H., Axtner, J., Sander, Adam F. , Hansen, Anders Johannes, Bertelsen, Mads Frost, Greenwood, A. D., Gilbert, M Thomas P & Wilting, A., 2017, I: European Journal of Wildlife Research. 63, 6 s., 36.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Relative performance of two DNA extraction and library preparation methods on archaeological human teeth samples

      Sandoval-Velasco, Marcela, Lundstrom, I. K. C., Wales, N., Ávila-Arcos, M. C., Schroeder, Hannes & Gilbert, M Thomas P, 2017, I: Science and Technology of Archaeological Research. 3, 1, s. 80-88 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics

      Gopalakrishnan, Shyam, Samaniego Castruita, J. A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Räikkönen, J., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Larson, G., Orlando, L. A. A., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes, Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2017, I: BMC Genomics. 18, 11 s., 495.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. 2016
    8. Udgivet

      The potential and pitfalls of de-extinction

      Richmond, D. J., Sinding, Mikkel Holger Strander & Gilbert, M Thomas P, okt. 2016, I: Zoologica Scripta. 45, S1, s. 22-36 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Do vertebrate gut metagenomes confer rapid ecological adaptation?

      Alberdi, Antton, Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Bohmann, Kristine, Zepeda Mendoza, M. L. & Gilbert, M Thomas P, sep. 2016, I: Trends in Ecology & Evolution. 31, 9, s. 689-699 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      The limits and potential of paleogenomic techniques for reconstructing grapevine domestication

      Wales, N., Ramos Madrigal, J., Cappellini, E., Baez, A. C., Samaniego Castruita, J. A., Romero-Navarro, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Peñaloza, F., Moreno Mayar, J. V., Gasparyan, B., Zardaryan, D., Bagoyan, T., Smith, A., Pinhasi, R., Bosi, G., Fiorentino, G., Grasso, A. M., Celant, A., Bar-Oz, G. & 7 flere, Tepper, Y., Hall, A., Scalabrin, S., Miculan, M., Morgante, M., Di Gaspero, G. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2016, I: Journal of Archaeological Science. 72, s. 57-70 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      Further evidence of Chelonid herpesvirus 5 (ChHV5) latency: high levels of ChHV5 DNA detected in clinically healthy marine turtles

      Alfaro Nuñez, L. A., Bojesen, Anders Miki, Bertelsen, Mads Frost, Wales, N., Balazs, G. H. & Gilbert, M Thomas P, 27 jul. 2016, I: PeerJ. 4, 16 s., e2274.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Redefining the taxonomy of the all-black and pied boubous (Laniarius spp.) in coastal Kenya and Somalia

      Finch, B. W., Hunter, N. D., Winkelmann, I. E. H., Manzano Vargas, K., Njoroge, P., Fjeldså, Jon & Gilbert, M Thomas P, jun. 2016, I: Bulletin of the British Ornithologists' Club. 136, 2, s. 74-85 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      The population genomic basis of geographic differentiation in North American common ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.)

      Martin, M. D., Olsen, Morten Tange, Samaniego Castruita, J. A., Zimmer, E. A. & Gilbert, M Thomas P, jun. 2016, I: Ecology and Evolution. 6, 11, s. 3760-3771 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      Genome-culture coevolution promotes rapid divergence of killer whale ecotypes

      Foote, A. D., Vijay, N., Avila Arcos, M. D. C., Baird, R. W., Durban, J. W., Fumagalli, M., Gibbs, R. A., Hanson, M. B., Korneliussen, Thorfinn Sand, Martin, M. D., Robertson, K. M., Sousa, V. C., Vieira, Filipe Garrett, Vinař, T., Wade, P., Worley, K. C., Excoffier, L., Morin, P. A., Gilbert, M Thomas P & Wolf, J. B. W., maj 2016, I: Nature Communications. 7, 12 s., 11693.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Bone-associated gene evolution and the origin of flight in birds

      Machado, J. P., Johnson, W. E., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J. & Antunes, A., 2016, I: BMC Genomics. 17, 15 s., 371.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Complete mitochondrial genomes of living and extinct pigeons revise the timing of the columbiform radiation

      Soares, A. E. R., Novak, B. J., Haile, James Seymour, Heupink, T. H., Fjeldså, Jon, Gilbert, M Thomas P, Poinar, H., Church, G. M. & Shapiro, B., 2016, I: BMC Evolutionary Biology. 16, 9 s., 230.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      DAMe: a toolkit for the initial processing of datasets with PCR replicates of double-tagged amplicons for DNA metabarcoding analyses

      Zepeda Mendoza, M. L., Bohmann, Kristine, Baez, A. C. & Gilbert, M Thomas P, 2016, I: BMC Research Notes. 9, 13 s., 255.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      Genome sequence of a 5,310-year-old maize cob provides insights into the early stages of maize domestication

      Ramos Madrigal, Jazmin, Smith, B. D., Moreno Mayar, J. Víctor, Gopalakrishnan, Shyam, Ross-Ibarra, J., Gilbert, M Thomas P & Wales, N., 2016, I: Current Biology. 26, 23, s. 3195-3201 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Genomic characterization of a South American Phytophthora hybrid mandates reassessment of the geographic origins of Phytophthora infestans

      Martin, M. D., Vieira, Filipe Garrett, Ho, S. Y. W., Wales, N., Schubert, Mikkel, Seguin-Orlando, A., Ristaino, J. B. & Gilbert, M Thomas P, 2016, I: Molecular Biology and Evolution. 33, 2, s. 478-491 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Genomic population structure of freshwater-resident and anadromous ide (Leuciscus idus) in north-western Europe

      Skovrind, Mikkel, Olsen, Morten Tange, Vieira, Filipe Garrett, Antunes Pacheco, George, Carl, Henrik, Gilbert, M Thomas P & Møller, Peter Rask, 2016, I: Ecology and Evolution. 6, 4, s. 1064-1074 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. Udgivet

      Mitochondrial DNA from the eradicated European Plasmodium vivax and P. falciparum from 70-year-old slides from the Ebro Delta in Spain

      Gelabert, P., Sandoval-Velasco, Marcela, Olalde, I., Fregel, R., Rieux, A., Escosa, R., Aranda, C., Paaijmans, K., Mueller, I., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2016, I: National Academy of Sciences. Proceedings. 113, 41, s. 11495-11500 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      The Draft Genome of Extinct European Aurochs and its Implications for De-Extinction

      Gilbert, M Thomas P & Sinding, Mikkel Holger Strander, 2016, I: Open Quaternary. 2, 9 s., 7.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      Whole genome identification, phylogeny and evolution of the cytochrome P450 family 2 (CYP2) sub-families in birds

      Almeida, D., Maldonado, E., Khan, I., Silva, L., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J., Johnson, W. E. & Antunes, A., 2016, I: Genome Biology and Evolution. 8, 4, s. 1115-1131 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. 2015
    25. Udgivet

      A common genetic origin for early farmers from Mediterranean Cardial and Central European LBK cultures

      Olalde, I., Schroeder, Hannes, Sandoval-Velasco, Marcela, Vinner, Lasse, Lobón, I., Ramirez, O., Civit, S., Borja, P. G., Salazar-García, D. C., Talamo, S., Fullola, J. M., Oms, F. X., Pedro, M., Martínez, P., Sanz, M., Daura, J., Zilhão, J., Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2015, I: Molecular Biology and Evolution. 32, 12, s. 3132-3142 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      A refined model of the genomic basis for phenotypic variation in vertebrate hemostasis

      Ribeiro, Â. M., Zepeda Mendoza, M. L., Bertelsen, Mads Frost, Kristensen, Annemarie T., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2015, I: B M C Evolutionary Biology. 15, 8 s., 124.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      Ancient DNA unravels the truth behind the controversial GUS Greenlandic Norse fur samples: the bison was a horse, and the muskox and bears were goats

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Arneborg, J., Nyegaard, G. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Journal of Archaeological Science. 53, s. 297-303 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    28. Udgivet

      Ancient and modern environmental DNA

      Pedersen, Mikkel Winther, Overballe-Petersen, S., Ermini, L., Der Sarkissian, C., Haile, James Seymour, Hellström, A. M., Spens, J., Thomsen, P. F., Bohmann, Kristine, Cappellini, Enrico, Schnell, I. B., Wales, N., Carøe, C., Campos, P., Schmidt, A. M. Z., Gilbert, M Thomas P, Hansen, Anders Johannes, Orlando, L. A. A. & Willerslev, Eske, 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 11 s., 20130383.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    29. Udgivet

      Ancient genomics

      Der Sarkissian, C., Allentoft, M. E., Avila Arcos, M. D. C., Barnett, R., Campos, P. F., Cappellini, E., Ermini, L., Fernandez Garcia, R., Rodrigues da Fonseca, R. A., Ginolhac, A., Hansen, A. J., Jónsson, H., Korneliussen, T. S., Margaryan, A., Martin, M. D., Moreno Mayar, J. V., Raghavan, M., Rasmussen, M., Sandoval Velasco, M., Schroeder, H. & 6 flere, Schubert, Mikkel, Seguin-Orlando, A., Wales, N., Gilbert, M Thomas P, Willerslev, Eske & Orlando, L. A. A., 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 12 s., 20130387.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    30. Udgivet

      Ancient mitochondrial DNA from the northern fringe of the Neolithic farming expansion in Europe sheds light on the dispersion process

      Malmström, H., Linderholm, A., Skoglund, P., Storå, J., Sjödin, P., Gilbert, M Thomas P, Holmlund, G., Willerslev, Eske, Jakobsson, M., Lidén, K. & Götherström, A., 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 10 s., 20130373.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    31. Udgivet

      Avianbase: a community resource for bird genomics

      Eöry, L., Gilbert, M Thomas P, Li, C., Li, B., Archibald, A., Aken, B. L., KU, thw266, Jarvis, E., Flicek, P. & Burt, D. W., 2015, I: Genome Biology (Online Edition). 16, 4 s., 21.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    32. Udgivet

      Bird sequencing project takes off

      KU, thw266, Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature. 522, 7554, s. 34 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    33. Udgivet

      Comparative performance of two whole-genome capture methodologies on ancient DNA Illumina libraries

      Avila Arcos, M. D. C., Sandoval-Velasco, Marcela, Schroeder, Hannes, Carpenter, M. L., Malaspinas, A. S., Wales, N., Peñaloza, F., Bustamante, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Methods in Ecology and Evolution. 6, 6, s. 725-734 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    34. Udgivet

      Contrasting population-level responses to Pleistocene climatic oscillations in an alpine bat revealed by complete mitochondrial genomes and evolutionary history inference

      Alberdi, A., Gilbert, M Thomas P, Razgour, O., Aizpurua, O., Aihartza, J. & Garin, I., 2015, I: Journal of Biogeography. 42, 9, s. 1689-1700 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    35. Udgivet

      Convergent evolution of the genomes of marine mammals

      Foote, A. D., Liu, Y., Thomas, G. W. C., Vinař, T., Alföldi, J., Deng, J., Dugan, S., van Elk, C. E., Hunter, M. E., Joshi, V., Khan, Z., Kovar, C., Lee, S. L., Lindblad-Toh, K., Mancia, A., Nielsen, R., Qin, X., Qu, J., Raney, B. J., Vijay, N. & 6 flere, Wolf, J. B. W., Hahn, M. W., Muzny, D. M., Worley, K. C., Gilbert, M Thomas P & Gibbs, R. A., 2015, I: Nature Genetics. 47, 3, s. 272-275 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    36. Udgivet

      Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus

      Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Christensen, R. J., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Mackie, M., Canci, A., Bouwman, A., Ruhli, F. & 2 flere, Gilbert, M Thomas P & Collins, M. J., 2015, I: American Journal of Physical Anthropology. 156, Suppl. 60, s. 319 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    37. Udgivet

      Environmental genes and genomes: understanding the differences and challenges in the approaches and software for their analyses

      Zepeda Mendoza, M. L., Sicheritz-Pontén, T. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Briefings in Bioinformatics. 16, 5, s. 745-758 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    38. Udgivet

      Gene loss, adaptive evolution and the co-evolution of plumage coloration genes with opsins in birds

      Borges, R., Khan, I., Johnson, W. E., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J. & Antunes, A., 2015, I: B M C Genomics. 16, 13 s., 751 .

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    39. Udgivet

      Genome-wide ancestry of 17th-century enslaved Africans from the Caribbean

      Schroeder, Hannes, Avila Arcos, M. D. C., Malaspinas, A. S., Poznik, G. D., Sandoval-Velasco, Marcela, Carpenter, M. L., Moreno Mayar, J. Víctor, Sikora, Martin, Johnson, P. L. F., Allentoft, Morten Erik, Samaniego Castruita, J. A., Haviser, J. B., Dee, M. W., Stafford, T. W., Salas, A., Orlando, L. A. A., Willerslev, Eske, Bustamente, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 112, 12, s. 3669–3673 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    40. Udgivet

      Geographic and temporal dynamics of a global radiation and diversification in the killer whale

      Morin, P. A., Parsons, K. M., Archer, F. I., Avila Arcos, M. D. C., Barrett-Lennard, L. G., Dalla Rosa, L., Duchêne, S., Durban, J. W., Ellis, G. M., Ferguson, S. H., Ford, J. K., Ford, M. J., Garilao, C., Gilbert, M. T. P., Kaschner, K., Matkin, C. O., Petersen, S. D., Robertson, K. M., Visser, I. N., Wade, P. R. & 2 flere, Ho, S. Y. W. & Foote, A. D., 2015, I: Molecular Ecology. 24, 15, s. 3964-3979 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    41. Udgivet

      New insights on single-stranded versus double-stranded DNA library preparation for ancient DNA

      Wales, N., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Gamba, C., Barnett, R., Samaniego Castruita, J. A., Ramos Madrigal, Jazmin, Orlando, L. A. A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: BioTechniques. 59, 6, s. 368-371 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    42. Udgivet

      Odintifier - A computational method for identifying insertions of organellar origin from modern and ancient high-throughput sequencing data based on haplotype phasing

      Samaniego Castruita, J. A., Zepeda Mendoza, M. L., Barnett, R., Wales, N. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: BMC Bioinformatics. 16, 13 s., 232.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    43. Udgivet

      Olfactory receptor subgenomes linked with broad ecological adaptations in sauropsida

      Khan, I., Yang, Z., Maldonado, E., Li, C., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J., Johnson, W. E. & Antunes, A., 2015, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 32, 11, s. 2832-2843 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    44. Udgivet

      Penile density and globally used chemicals in Canadian and Greenland polar bears

      Sonne, C., Dyck, M., Rigét, F. F., Jensen, J. B., Hyldstrup, L., Letcher, R. J., Gustavson, K., Gilbert, M Thomas P & Dietz, R., 2015, I: Environmental Research. 137, s. 287-291 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    45. Udgivet

      Phylogenomic analyses data of the avian phylogenomics project

      Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Alfaro Nuñez, L. A., Narula, N., Liu, L., Burt, D., Ellegren, H., Edwards, S. V., Stamatakis, A. & 7 flere, Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, J., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2015, I: GigaScience. 4, 9 s., 4.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    46. Udgivet

      Reconstructing ancient genomes and epigenomes

      Orlando, L. A. A., Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2015, I: Nature Reviews. Genetics. 16, 7, s. 395-408 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    47. Udgivet

      Response to Comment on “Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds”

      Cracraft, J., Houde, P., Ho, S. Y. W., Mindell, D. P., Fjeldså, Jon, Lindow, Bent Erik Kramer, Edwards, S. V., Rahbek, Carsten, Mirarab, S., Warnow, T., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Braun, E. L. & Jarvis, E. D., 2015, I: Science. 349, 6255, s. 1460b 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    48. Udgivet

      Tag jumps illuminated - reducing sequence-to-sample misidentifications in metabarcoding studies

      Schnell, I. B., Bohmann, Kristine & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Molecular Ecology Resources. 15, 6, s. 1289-1303 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    49. Udgivet

      The Genome 10K Project: a way forward

      Koepfli, K-P., Paten, B., O'Brien, S. J., Antunes, A., Belov, K., Bustamante, C., Castoe, T. A., Clawson, H., Crawford, A. J., Diekhans, M., Distel, D., Durbin, R., Earl, D., Fujita, M. K., Gamble, T., Georges, A., Gemmell, N., Gilbert, M. T. P., Graves, J. M., Green, R. E. & 25 flere, Hickey, G., Jarvis, E. D., Johnson, W., Komissarov, A., Korf, I., Kuhn, R., Larkin, D. M., Lewin, H., Lopez, J. V., Ma, J., Marques-Bonet, T., Miller, W., Murphy, R., Pevzner, P., Shapiro, B., Steiner, C., Tamazian, G., Venkatesh, B., Wang, J., Wayne, R., Wiley, E., Yang, H., KU, thw266, Haussler, D. & Ryder, O., 2015, I: Annual Review of Animal Biosciences. 3, s. 57-111 55 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    50. Udgivet

      The origin and evolution of maize in the Southwestern United States: [+ erratum]

      Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smith, B. D., Wales, N., Cappellini, Enrico, Skoglund, P., Fumagalli, M., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Hufnagel, D. E., Korneliussen, Thorfinn Sand, Vieira, Filipe Garrett, Jakobsson, M., Arriaza, B., Willerslev, Eske, Nielsen, Rasmus, Hufford, M. B., Albrechtsen, Anders, Ross-Ibarra, J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature Plants. 1, 5 s., 14003.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    51. Udgivet

      Viral meningitis epidemics and a single, recent, recombinant and anthroponotic origin of swine vesicular disease virus

      Bruhn, C. A. W., Nielsen, S. C. A., Samaniego Castruita, J. A., Wadsworth, J., Knowles, N. J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Evolution, Medicine, and Public Health. 2015, 1, s. 289-303 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    52. Udgivet

      iDNA from terrestrial haematophagous leeches as a wildlife surveying and monitoring tool - prospects, pitfalls and avenues to be developed

      Schnell, I. B., Sollmann, R., Calvignac-Spencer, S., Siddall, M. E., Yu, D. W., Wilting, A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Frontiers in Zoology. 12, 14 s., 24.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    53. 2014
    54. Udgivet

      The lectotype for the Asian elephant, Elephas maximus Linnaeus, 1758 (Mammalia, Proboscidea) and comments on `primary, secondary and tertiary syntypes' and `virtual lectotype designation'

      Gentry, A., Lister, A. M., Roos, A., Gilbert, M Thomas P & Cappellini, Enrico, 1 sep. 2014, I: Bulletin of Zoological Nomenclature. 71, 3, 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

    55. Udgivet

      Validation of a sensitive PCR assay for the detection of Chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus in latent turtle infections

      Alfaro Nuñez, L. A. & Gilbert, M Thomas P, sep. 2014, I: Journal of Virological Methods. 206, s. 38-41 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    56. Udgivet

      Yersinia pestis: one pandemic, two pandemics, three pandemics, more?

      Gilbert, M Thomas P, apr. 2014, I: The Lancet Infectious Diseases. 14, 4, s. 264-265 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

    57. Udgivet

      A flock of Genomes

      KU, thw266, Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1308-1309 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

    58. Udgivet

      Biochemistry. Unlocking ancient protein palimpsests

      Cappellini, Enrico, Collins, M. J. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: Science. 343, 6177, s. 1320-1322 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    59. Udgivet

      Comparative Performance of Two Whole Genome Capture Methodologies on Ancient DNA Illumina Libraries

      Ávila-Arcos, M. C., Sandoval-Velasco, Marcela, Schroeder, Hannes, Carpenter, M. L., Malaspinas, A., Wales, N., Peñaloza, F., Bustamante, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2014, 6 udg., bioRxiv, 37 s.

      Publikation: Working paperPreprintForskning

    60. Udgivet

      Comparative genomic data of the Avian Phylogenomics Project

      KU, thw266, Li, B., Li, C., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Wang, J. & Avian Genome Consortium, A. G. C., 2014, I: GigaScience. 3, 8 s., 26.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    61. Udgivet

      Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation

      Zhang, G., Li, C., Li, Q., Li, B., Larkin, D. M., Lee, C., Storz, J. F., Antunes, A., Greenwold, M. J., Meredith, R. W., Ödeen, A., Cui, J., Zhou, Q., Xu, L., Pan, H., Wang, Z., Jin, L., Zhang, P., Hu, H., Yang, W. & 85 flere, Hu, J., Xiao, J., Yang, Z., Liu, Y., Xie, Q., Yu, H., Lian, J., Wen, P., Zhang, F., Li, H., Zeng, Y., Xiong, Z., Liu, S., Zhou, L., Huang, Z., An, N., Wang, J., Zheng, Q., Xiong, Y., Wang, G., Wang, B., Wang, J., Fan, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro Nuñez, L. A., Schubert, Mikkel, Orlando, L. A. A., Mourier, T., Howard, J. T., Ganapathy, G., Pfenning, A., Whitney, O., Rivas, M. V., Hara, E., Smith, J., Farré, M., Narayan, J., Slavov, G., Romanov, M. N., Borges, R., MacHado, J. P., Khan, I., Springer, M. S., Gatesy, J., Hoffmann, F. G., Opazo, J. C., Håstad, O., Sawyer, R. H., Kim, H., Kim, K. W., Kim, H. J., Cho, S., Li, N., Huang, Y., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Bertelsen, Mads Frost, Derryberry, E., Warren, W., Wilson, R. K., Li, S., Ray, D. A., Green, R. E., O'Brien, S. J., Griffin, D., Johnson, W. E., Haussler, D., Ryder, O. A., Willerslev, Eske, Graves, G. R., Alström, P., Fjeldså, Jon, Mindell, D. P., Edwards, S. V., Braun, E. L., Rahbek, Carsten, Burt, D. W., Houde, P., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Wang, J., 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1311-1320 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    62. Udgivet

      Complex evolutionary trajectories of sex chromosomes across bird taxa

      Zhou, Q., Zhang, J., Bachtrog, D., An, N., Huang, Q., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, 8 s., 1246338.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    63. Udgivet

      Convergent transcriptional specializations in the brains of humans and song-learning birds

      Pfenning, A. R., Hara, E., Whitney, O., Rivas, M. V., Wang, R., Roulhac, P. L., Howard, J. T., Wirthlin, M., Lovell, P. V., Ganapathy, G., Mouncastle, J., Moseley, M. A., Thompson, J. W., Soderblom, E. J., Iriki, A., Kato, M., Gilbert, M. T. P., Zhang, G., Bakken, T., Bongaarts, A. & 5 flere, Bernard, A., Lein, E., Mello, C. V., Hartemink, A. J. & Jarvis, E. D., 2014, I: Science. 346, 6215, 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    64. Udgivet

      Current perspectives and the future of domestication studies

      Larson, G., Piperno, D. R., Allaby, R. G., Purugganan, M. D., Andersson, L., Arroyo-Kalin, M., Barton, L., Vigueira, C. C., Denham, T., Dobney, K., Doust, A. N., Gepts, P., Gilbert, M. T. P., Gremillion, K. J., Lucas, L., Lukens, L., Marshall, F. B., Olsen, K. M., Pires, J. C., Richerson, P. J. & 4 flere, Rubio de Casas, R., Sanjur, O. I., Thomas, M. G. & Fuller, D. Q., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 17, s. 6139-6146 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    65. Udgivet

      Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus

      Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O. E., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Jersie-Christensen, R. R., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Charlton, S., Mackie, M. E., Canci, A., Bouwman, A. & 3 flere, Rühli, F., Gilbert, M Thomas P & Collins, M. J., 2014, I: Scientific Reports. 4, 6 s., 7104.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    66. Udgivet

      Dynamic evolution of the alpha (α) and beta (β) keratins has accompanied integument diversification and the adaptation of birds into novel lifestyles

      Greenwold, M. J., Bao, W., Jarvis, E. D., Hu, H., Li, C., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Sawyer, R. H., 2014, I: B M C Evolutionary Biology. 14, 16 s., 249.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    67. Udgivet

      Environmental DNA for wildlife biology and biodiversity monitoring

      Bohmann, Kristine, Evans, A., Gilbert, M Thomas P, Carvalho, G. R., Creer, S., Knapp, M., Yu, D. W. & de Bruyn, M., 2014, I: Trends in Ecology & Evolution. 29, 6, s. 358-367 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    68. Udgivet

      Evaluating the Y chromosomal timescale in human demographic and lineage dating

      Wang, C., Gilbert, M Thomas P, Jin, L. & Li, H., 2014, I: Investigative Genetics. 5, 7 s., 12.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    69. Udgivet

      Evidence for a single loss of mineralized teeth in the common avian ancestor

      Meredith, R. W., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D. & Springer, M. S., 2014, I: Science. 346, 6215, 6 s., 1254390.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    70. Udgivet

      Evolutionary genomics and adaptive evolution of the hedgehog gene family (Shh, Ihh and Dhh) in vertebrates

      Pereira, J., Johnson, W. E., O'Brien, S. J., Jarvis, E. D., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Vasconcelos, V. & Antunes, A., 2014, I: PloS one. 9, 12, 35 s., e74132.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    71. Udgivet

      Extinct New Zealand megafauna were not in decline before human colonization

      Allentoft, Morten Erik, Heller, Rasmus, Oskam, C. L., Lorenzen, Eline, Hale, M. L., Gilbert, M Thomas P, Jacomb, C., Holdaway, R. N. & Bunce, M., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 111, 13, s. 4922-4927 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    72. Udgivet

      Fifty thousand years of Arctic vegetation and megafaunal diet

      Willerslev, E., Davison, J., Moora, M., Zobel, M., Coissac, E., Edwards, M. E., Lorenzen, E., Vestergård, M., Gussarova, G., Haile, J. S., Craine, J., Gielly, L., Boessenkool, S., Epp, L. S., Pearman, P. B., Cheddadi, R., Murray, D., Bråthen, K. A., Yoccoz, N., Binney, H. & 30 flere, Cruaud, C., Wincker, P., Goslar, T., Alsos, I. G., Bellemain, E., Brysting, A. K., Elven, R., Sønstebø, J. H., Murton, J., Sher, A., Rasmussen, M., Rønn, Regin, Mourier, T., Cooper, A., Austin, J., Möller, P., Froese, D., Zazula, G., Pompanon, F., Rioux, D., Niderkorn, V., Tikhonov, A., Savvinov, G., Roberts, R. G., MacPhee, R. D. E., Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Orlando, L. A. A., Brochmann, C. & Taberlet, P., 2014, I: Nature. 506, 7486, s. 47-51 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    73. Udgivet

      Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome

      Pedersen, J. S., Valen, E., Velazquez, A. M. V., Parker, B. J., Rasmussen, M., Lindgreen, S., Lilje, B., Tobin, D. J., Kelly, T. K., Vang, S., Andersson, R., Jones, P. A., Hoover, C. A., Tikhonov, A., Prokhortchouk, E., Rubin, E. M., Sandelin, A. G., Gilbert, M. T. P., Krogh, A., Willerslev, E. & 1 flere, Orlando, L. A. A., 2014, I: Genome Research. 24, 3, s. 454-466 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    74. Udgivet

      Genomic signatures of near-extinction and rebirth of the crested ibis and other endangered bird species

      Li, S., Li, B., Cheng, C., Xiong, Z., Liu, Q., Lai, J., Carey, H. V., Zhang, Q., Zheng, H., Wei, S., Zhang, H., Chang, L., Liu, S., Zhang, S., Yu, B., Zeng, X., Hou, Y., Nie, W., Guo, Y., Chen, T. & 13 flere, Han, J., Wang, J., Wang, J., Chen, C., Liu, J., Stambrook, P. J., Xu, M., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Yang, H., Jarvis, E. D., Yu, J. & Yan, J., 2014, I: Genome Biology (Online Edition). 15, 16 s., 557.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    75. Udgivet

      Global distribution of Chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus among clinically healthy sea turtles

      Alfaro Nuñez, L. A., Bertelsen, Mads Frost, Bojesen, Anders Miki, Rasmussen, I., Zepeda Mendoza, M. L., Olsen, Morten Tange & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: B M C Evolutionary Biology. 14, 11 s., 206.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    76. Udgivet

      Herbarium specimens reveal a historical shift in phylogeographic structure of common ragweed during native range disturbance

      Martin, M. D., Zimmer, E. A., Olsen, Morten Tange, Foote, A. D., Gilbert, M Thomas P & Brush, G. S., 2014, I: Molecular Ecology. 23, 7, s. 1701-1716 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    77. Udgivet

      Hybridization capture using short PCR products enriches small genomes by Capturing Flanking Sequences (CapFlank)

      Tsangaras, K., Wales, N., Sicheritz-Pontén, T., Rasmussen, Simon, Michaux, J., Ishida, Y., Morand, S., Kampmann, Marie-Louise, Gilbert, M Thomas P & Greenwood, A. D., 2014, I: PLoS ONE. 9, 10, 10 s., e109101.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    78. Udgivet

      Low frequency of paleoviral infiltration across the avian phylogeny

      Cui, J., Zhao, W., Huang, Z., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P, Walker, P. J., Holmes, E. C. & KU, thw266, 2014, I: Genome Biology (Online Edition). 15, 12, 13 s., 539.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    79. Udgivet

      Near-complete genome sequencing of swine vesicular disease virus using the Roche GS FLX sequencing platform

      Nielsen, S. C. A., Bruhn, C. A. W., Samaniego Castruita, J. A., Wadsworth, J., Knowles, N. J. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: PLOS ONE. 9, 5, 7 s., e97180.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    80. Udgivet

      Optimization of DNA recovery and amplification from non-carbonized archaeobotanical remains

      Wales, N., Andersen, K., Cappellini, Enrico, Avila Arcos, M. D. C. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: PLOS ONE. 9, 1, 14 s., e86827.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    81. Udgivet

      Pathogens and host immunity in the ancient human oral cavity

      Warinner, C., Rodrigues, J. F. M., Vyas, R., Trachsel, C., Shved, N., Grossmann, J., Radini, A., Hancock, Y., Tito, R. Y., Fiddyment, S., Speller, C., Hendy, J., Charlton, S., Luder, H. U., Salazar-García, D. C., Eppler, E., Seiler, R., Hansen, L. H., Samaniego Castruita, J. A., Barkow-Oesterreicher, S. & 12 flere, Teoh, K. Y., Kelstrup, C., Olsen, Jesper Velgaard, Nanni, P., Kawai, T., Willerslev, Eske, von Mering, C., Lewis, C. M., Collins, M. J., Gilbert, M Thomas P, Rühli, F. & Cappellini, Enrico, 2014, I: Nature Genetics. 46, s. 336-344 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    82. Udgivet

      Persistence of the mitochondrial lineage responsible for the Irish potato famine in extant New World Phytophthora infestans

      Martin, M. D., Ho, S. Y. W., Wales, N., Ristaino, J. B. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: Molecular Biology and Evolution. 31, 6, s. 1414-1420 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    83. Udgivet

      Prehistoric genomes reveal the genetic foundation and cost of horse domestication

      Schubert, M., Jónsson, H., Chang, D., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Ginolhac, A., Albrechtsen, A., Dupanloup, I., Foucal, A., Petersen, B., Fumagalli, M., Raghavan, M., Seguin-Orlando, A., Korneliussen, T. S., Velazquez, A. M. V., Stenderup, J., Hoover, C. A., Rubin, C-J., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A. & 15 flere, Al-Rasheid, K. A. S., MacHugh, D. E., Kalbfleisch, T., MacLeod, J. N., Rubin, E. M., Sicheritz-Ponten, T., Andersson, L., Hofreiter, M., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, R., Excoffier, L., Willerslev, Eske, Shapiro, B. & Orlando, L. A. A., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. E5661–E5669 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    84. Udgivet

      Resolution of the type material of the Asian elephant, Elephas maximus Linnaeus, 1758 (Proboscidea, Elephantidae)

      Cappellini, Enrico, Gentry, A., Palkopoulou, E., Ishida, Y., Cram, D., Roos, A., Watson, M., Johansson, U. S., Fernholm, B., Agnelli, P., Barbagli, F., Littlewood, D. T. J., Kelstrup, C., Olsen, Jesper Velgaard, Lister, A. M., Roca, A. L., Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 170, 1, s. 222-232 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    85. Udgivet

      Second generation sequencing and morphological faecal analysis reveal unexpected foraging behaviour by Myotis nattereri (Chiroptera, Vespertilionidae) in winter

      Hope, P. R., Bohmann, Kristine, Gilbert, M Thomas P, Zepeda Mendoza, M. L., Razgour, O. & Jones, G., 2014, I: Frontiers in Zoology. 11, 15 s., 39.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    86. Udgivet

      Speciation and demographic history of Atlantic eels (Anguilla anguilla and A. rostrata) revealed by mitogenome sequencing

      Jacobsen, M. W., Pujolar, J. M., Gilbert, M Thomas P, Moreno Mayar, J. Víctor, Bernatchez, L., Als, T. D., Lobon-Cervia, J. & Hansen, M. M., 2014, I: Heredity. 113, s. 432-442 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    87. Udgivet

      Storytelling and story testing in domestication

      Gerbault, P., Allaby, R. G., Boivin, N., Rudzinski, A., Grimaldi, I. M., Pires, J. C., Climer Vigueira, C., Dobney, K., Gremillion, K. J., Barton, L., Arroyo-Kalin, M., Purugganan, M. D., Rubio de Casas, R., Bollongino, R., Burger, J., Fuller, D. Q., Bradley, D. G., Balding, D. J., Richerson, P. J., Gilbert, M. T. P. & 2 flere, Larson, G. & Thomas, M. G., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 17, s. 6159-6164 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    88. Udgivet

      The genetic prehistory of the New World Arctic

      Raghavan, M., DeGiorgio, M., Albrechtsen, A., Moltke, I., Skoglund, P., Korneliussen, T. S., Grønnow, B., Appelt, M., Gulløv, H. C., Friesen, T. M., Fitzhugh, W., Malmström, H. S., Rasmussen, S., Olsen, J., Melchior, L. C., Fuller, B. T., Fahrni, S. M., Stafford jr., T., Grimes, V., Renouf, M. A. P. & 36 flere, Cybulski, J., Lynnerup, Niels, Lahr, M. M., Britton, K., Knecht, R., Arneborg, J., Metspalu, M., Cornejo, O. E., Malaspinas, A. S., Wang, Y., Rasmussen, M., Raghavan, V., Hansen, Thomas van Overeem, Khusnutdinova, E., Pierre, T. L., Dneprovsky, K., Andreasen, C., Lange, H., Hayes, M. G., Coltrain, J., Spitsyn, V. A., Götherström, A., Orlando, L. A. A., Kivisild, T., Villems, R., Crawford, M. H., Nielsen, Finn Cilius, Dissing, J., Heinemeier, J., Meldgaard, Morten, Bustamante, C., O'Rourke, D. H., Jakobsson, M., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, R. & Willerslev, Eske, 2014, I: Science. 345, 6200, 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    89. Udgivet

      The microbiome of New World vultures

      Roggenbuck, M., Schnell, I. B., Blom, N., Bælum, J., Bertelsen, M. F., Sicheritz-Pontén, T., Sørensen, Søren Johannes, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R. & Hansen, L. H., 2014, I: Nature Communications. 5, 7 s., 5498.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    90. Udgivet

      The origin and emergence of an HIV-1 epidemic: from introduction to endemicity

      Bruhn, C. A. W., Audelin, A. M., Helleberg, Marie, Bjorn-Mortensen, K., Obel, Niels, Gerstoft, Jan, Nielsen, C., Melbye, M., Medstrand, P., Gilbert, M Thomas P & Esbjörnsson, J., 2014, I: AIDS (London, England). 28, 7, s. 1031-1040 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    91. Udgivet

      Two Antarctic penguin genomes reveal insights into their evolutionary history and molecular changes related to the Antarctic environment

      Li, C., Zhang, Y., Li, J., Kong, L., Hu, H., Pan, H., Xu, L., Deng, Y., Li, Q., Jin, L., Yu, H., Chen, Y., Liu, B., Yang, L., Liu, S., Zhang, Y., Lang, Y., Xia, J., He, W., Shi, Q. & 21 flere, Subramanian, S., Millar, C. D., Meader, S., Rands, C. M., Fujita, M. K., Greenwold, M. J., Castoe, T. A., Pollock, D. D., Gu, W., Nam, K., Ellegren, H., Ho, S. Y., Burt, D. W., Ponting, C. P., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P, Yang, H., Wang, J., Lambert, D. M., Wang, J. & KU, thw266, 2014, I: GigaScience. 3, 27, 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    92. Udgivet

      Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds

      Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, Boussau, B., Bayzid, M. S., Zavidovych, V., Subramanian, S., Gabaldón, T., Capella-Gutiérrez, S., Huerta-Cepas, J., Rekepalli, B., Terkelsen, K. M., Schierup, M. H., Lindow, Bent Erik Kramer, Warren, W. C., Ray, D., Green, R. E., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Li, S., Li, N., Huang, Y., Derryberry, E. P., Bertelsen, Mads Frost, Sheldon, F. H., Brumfield, R. T., Mello, C. V., Lovell, P. V., Wirthlin, M., Schneider, M. P. C., Prosdocimi, F., Samaniego Castruita, J. A., Velazquez, A. M. V., Alfaro Nuñez, L. A., Campos, P., Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Pas, A., Bailey, T., Scofield, P., Bunce, M., Lambert, D. M., Zhou, Q., Perelman, P., Driskell, A. C., Shapiro, B., Xiong, Z., Zeng, Y., Liu, S., Li, Z., Liu, B., Wu, K., Xiao, J., Yinqi, X., Zheng, Q., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Smeds, L., Rheindt, F. E., Braun, M., Fjeldså, Jon, Orlando, L. A. A., Barker, F. K., Jønsson, Knud Andreas, Johnson, W., Koepfli, K. P., O'Brien, S., Haussler, D., Ryder, O. A., Rahbek, Carsten, Willerslev, Eske, Graves, G. R., Glenn, T. C., McCormack, J., Burt, D., Ellegren, H., Alström, P., Edwards, S. V., Stamatakis, A., Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, J., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    93. 2013
    94. Udgivet

      Pulling out the 1%: whole-genome capture for the targeted enrichment of ancient DNA sequencing libraries

      Carpenter, M. L., Buenrostro, J. D., Valdiosera Morales, C., Schroeder, H., Allentoft, M. E., Sikora, M., Rasmussen, M., Gravel, S., Guillén, S., Nekhrizov, G., Leshtakov, K., Dimitrova, D., Theodossiev, N., Pettener, D., Luiselli, D., Sandoval, K., Moreno-Estrada, A., Li, Y., Wang, J., Gilbert, T. & 3 flere, Willerslev, Eske, Greenleaf, W. J. & Bustamante, C. D., 7 nov. 2013, I: American Journal of Human Genetics. 93, 5, s. 852-864 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    95. Udgivet

      An invertebrate stomach's view on vertebrate ecology: certain invertebrates could be used as "vertebrate samplers'' and deliver DNA-based information on many aspects of vertebrate ecology

      Calvignac-Spencer, S., Leendertz, F. H., Gilbert, M Thomas P & Schubert, G., 1 nov. 2013, I: BioEssays. 35, 11, s. 1004-1013 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    96. Udgivet

      Mitogenomic analyses from ancient DNA

      Paijmans, J. L. A., Gilbert, M Thomas P & Hofreiter, M., nov. 2013, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 69, 2, s. 404-416 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    97. Udgivet

      Recent diversification of a marine genus (Tursiops spp.) Tracks habitat preference and environmental change

      Moura, A. E., Nielsen, S. C. A., Mouatt, J. T. V., Moreno Mayar, J. Víctor, Gilbert, M Thomas P, Gray, H. W. I., Natoli, A., Möller, L. & Hoelzel, A. R., nov. 2013, I: Systematic Biology. 62, 6, s. 865-77 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    98. Udgivet

      Tracking niche variation over millennial timescales in sympatric killer whale lineages

      Foote, A. D., Newton, J., Avila Arcos, M. D. C., Kampmann, Marie-Louise, Samaniego Castruita, J. A., Post, K., Rosing-Asvid, A., Sinding, Mikkel Holger Strander & Gilbert, M Thomas P, 7 okt. 2013, I: Proceedings of the Royal Society B.. 280, 1768, 9 s., 20131481.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    99. Udgivet

      Mitogenomic insights into a recently described and rarely observed killer whale morphotype

      Foote, A. D., Morin, P., Pitman, R. L., Avila Arcos, M. D. C., Durban, J. W., Helden, A. V., Sinding, Mikkel Holger Strander & Gilbert, M Thomas P, okt. 2013, I: Polar Biology. 36, 10, s. 1519-1523 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    100. Udgivet

      Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen

      Martin, M. D., Cappellini, Enrico, Samaniego Castruita, J. A., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Seguin-Orlando, A., Wales, N., Orlando, L. A. A., Ho, S. Y. W., Dietrich, F. S., Mieczkowski, P. A., Heitman, J., Willerslev, Eske, Krogh, Anders, Ristaino, J. B. & Gilbert, M Thomas P, 18 jul. 2013, I: Nature Communications. 4, 7 s., 2172.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    101. Udgivet

      Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse

      Orlando, L. A. A., Ginolhac, A., Zhang, G., Froese, D., Albrechtsen, A., Stiller, M., Schubert, M., Cappellini, E., Petersen, B., Moltke, I., Johnson, P. L. F., Fumagalli, M., Mouatt, J. T. V., Raghavan, M., Korneliussen, T. S., Malaspinas, A. S., Vogt, J., Szklarczyk, D. M., Kelstrup, C., Vinther, J. & 36 flere, Dolocan, A., Stenderup, Jesper Tandberg, Velazquez, A. M. V., Cahill, J., Rasmussen, M., Wang, X., Min, J., Zazula, G. D., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C., Magnussen, K., Thompson, J. F., Weinstock, J., Gregersen, K., Røed, K. H., Eisenmann, V., Rubin, C. J., Miller, D. C., Antczak, D. F., Bertelsen, M. F., Brunak, S., Al-Rasheid, K. A. S., Ryder, O., Andersson, L., Mundy, J., Krogh, Anders, Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Sicheritz-Pontén, T., Jensen, Lars Juhl, Olsen, Jesper Velgaard, Hofreiter, M., Nielsen, R., Shapiro, B., Wang, J. & Willerslev, Eske, 4 jul. 2013, I: Nature. 499, 7456, s. 74-78 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    102. Udgivet

      Mitochondrial genome diversity and population structure of the giant squid Architeuthis: genetics sheds new light on one of the most enigmatic marine species

      Winkelmann, I. E. H., Campos, P., Strugnell, J., Cherel, Y., Smith, P. J., Kubodera, T., Allcock, L., Kampmann, Marie-Louise, Schroeder, Hannes, Guerra, A., Norman, M., Finn, J., Ingrao, D., Clarke, M. & Gilbert, M Thomas P, 22 maj 2013, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 280, 1759, 9 s., 20130273.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    103. Udgivet

      Long-term RNA persistence in postmortem contexts

      Fordyce, S. L., Kampmann, Marie-Louise, van Doorn, N. L. & Gilbert, M Thomas P, 23 apr. 2013, I: Investigative Genetics. 4, 1, 7 s., 7.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    104. Udgivet

      Ancient DNA reveals that bowhead whale lineages survived Late Pleistocene climate change and habitat shifts

      Foote, A. D., Kaschner, K., Schultze, S. E., Garilao, C., Ho, S. Y. W., Post, K., Higham, T. F. G., Stokowska, C., van der Es, H., Embling, C. B., Gregersen, K., Johansson, F., Willerslev, Eske & Gilbert, M Thomas P, 9 apr. 2013, I: Nature Communications. 4, 7 s., 1677.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    105. Udgivet

      Genomic diversity and evolution of the head crest in the rock pigeon

      Shapiro, M. D., Kronenberg, Z., Li, C., Domyan, E. T., Pan, H., Campbell, M., Tan, H., Huff, C. D., Hu, H., Vickrey, A. I., Nielsen, S. C. A., Stringham, S. A., Hu, H., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P, Yandell, M., Zhang, G. & Wang, J., 1 mar. 2013, I: Science. 339, 6123, s. 1063-1067 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 12980