Tom Gilbert
Professor
- 2024
- Udgivet
Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes
Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G., Gao, R. & 32 flere, , 1 apr. 2024, I: Nature.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the microbial diversity of novel misos with metagenomics
Kothe, C. I., Rasmussen, Jacob Agerbo, Mak, Sarah Siu Tze, Gilbert, M Thomas P & Evans, J., 2024, I: Food Microbiology. 117, 9 s., 104372.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- E-pub ahead of print
Field and laboratory guidelines for reliable bioinformatic and statistical analysis of bacterial shotgun metagenomic data
Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Dunn, Rob, Hansen, Lars Hestbjerg, Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2024, (E-pub ahead of print) I: Critical Reviews in Biotechnology.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Host-gut microbiota interactions shape parasite infections in farmed Atlantic salmon
Brealey, Jaelle, Kodama, M., Rasmussen, Jacob Agerbo, Hansen, Søren Blikdal, Santos-Bay, Luisa, Lecaudey, L. A., Hansen, M., Fjære, E., Myrmel, L. S., Madsen, L., Bernhard, A., Sveier, H., Kristiansen, Karsten, Gilbert, M Thomas P, Martin, M. D. & Limborg, Morten Tønsberg, 2024, I: mSystems. 9, 2, 29 s., e01043-23.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
A pangenome graph reference of 30 chicken genomes allows genotyping of large and complex structural variants
Rice, E. S., Alberdi, A., Alfieri, J., Athrey, G., Balacco, J. R., Bardou, P., Blackmon, H., Charles, M., Cheng, H. H., Fedrigo, O., Fiddaman, S. R., Formenti, G., Frantz, L. A. F., Gilbert, M. T. P., Hearn, C. J., Jarvis, E. D., Klopp, C., Marcos, S., Mason, A. S., Velez-Irizarry, D. & 2 flere, , 2023, I: BMC Biology. 21, 17 s., 267.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A simplified protocol for DNA extraction from FTA cards for faecal microbiome studies
Botnen, A. B., Bjørnsen, Mads Bjørn, Alberdi, Antton, Gilbert, M Thomas P & Aizpurua Arrieta, Ostaizka, 2023, I: Heliyon. 9, 1, 10 s., e12861.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient DNA from a lost Negev Highlands desert grape reveals a Late Antiquity wine lineage
Cohen, P., Bacilieri, R., Ramos Madrigal, Jazmin, Privman, E., Boaretto, E., Weber, A., Fuks, D., Weiss, E., Erickson-Gini, T., Bucking, S., Tepper, Y., Cvikel, D., Schmidt, J., Gilbert, M Thomas P, Wales, N., Bar-Oz, G. & Meiri, M., 2023, I: PNAS. 120, 17, 8 s., e2213563120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient DNA reveals genetic admixture in China during tiger evolution
Sun, X., Liu, Y. C., Tiunov, M. P., Gimranov, D. O., Zhuang, Y., Han, Y., Driscoll, C. A., Pang, Y., Li, C., Pan, Y., Velasco, M. S., Gopalakrishnan, S., Yang, R. Z., Li, B. G., Jin, K., Xu, X., Uphyrkina, O., Huang, Y., Wu, X. H., Gilbert, M. T. P. & 3 flere, , 2023, I: Nature Ecology and Evolution. 7, 11, s. 1914-1929 29 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Assessing the genetic composition of cotton-top tamarins (Saguinus oedipus) before sweeping anthropogenic impact
Rasmussen, Linett, Fontsere, Claudia, Soto-Calderón, I. D., Guillen, R., Savage, A., Hansen, Anders Johannes, Hvilsom, C. & Gilbert, M Thomas P, 2023, I: Molecular Ecology. 32, 20, s. 5514-5527 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Changes in the functional diversity of modern bird species over the last million years
Germain, Ryan Ross, Feng, S., Buffan, L., Carmona, C. P., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, Zhang, G. & Nogues, David Bravo, 2023, I: PNAS. 120, 7, 9 s., e2201945119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Co-diversification of an intestinal Mycoplasma and its salmonid host
Rasmussen, Jacob Agerbo, Kiilerich, P., Madhun, A. S., Waagbø, R., Lock, E. J. R., Madsen, L., Gilbert, M Thomas P, Kristiansen, Karsten & Limborg, Morten Tønsberg, 2023, I: ISME Journal. 17, 5, s. 682-692 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conservation implications of elucidating the Korean wolf taxonomic ambiguity through whole-genome sequencing
Hernández-Alonso, G., Ramos-Madrigal, J., Sun, X., Scharff-Olsen, C. H., Sinding, M. H. S., Martins, N. F., Ciucani, M. M., Mak, S. S. T., Lanigan, L. T., Clausen, C. G., Bhak, J., Jeon, S., Kim, C., Eo, K. Y., Cho, S. H., Boldgiv, B., Gantulga, G., Unudbayasgalan, Z., Kosintsev, P. A., Stenøien, H. K. & 2 flere, , 2023, I: Ecology and Evolution. 13, 8, 15 s., e10404.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolution of the germline mutation rate across vertebrates
Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Zheng, J., Li, P., Bertelsen, Mads Frost, Quintard, B., Hoffman, J. I., Li, Z., Leger, J. S., Shao, C., Stiller, Josefin, Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2023, I: Nature. 615, s. 285-291Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Future-proofing environmental DNA and trait-based predictions of food webs
Pereira, Catia Lucio, Ersoy, Z., Gilbert, M Thomas P, Gravel, D., Araújo, M. B. & Matias, M. G., 2023, I: BioScience. 73, 12, s. 862-878 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic diversity and differentiation between island and mainland populations of white-tailed eagles (Haliaeetus albicilla)
Hansen, C. C. R., Láruson, Á. J., Rasmussen, Jacob Agerbo, Ballesteros, J. A. C., Sinding, Mikkel Holger Strander, Hallgrimsson, G. T., von Schmalensee, M., Stefansson, R. A., Skarphédinsson, K. H., Labansen, A. L., Leivits, M., Sonne, C., Dietz, R., Skelmose, K., Boertmann, D., Eulaers, I., Martin, M. D., Helgason, A. S., Gilbert, M Thomas P & Pálsson, S., 2023, I: Molecular Ecology. 32, 8, s. 1925-1942 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomics of adaptive evolution in the woolly mammoth
Díez-del-Molino, D., Dehasque, M., Chacón-Duque, J. C., Chrzanová Pecnerová, Patrícia, Tikhonov, A., Protopopov, A., Plotnikov, V., Kanellidou, F., Nikolskiy, P., Mortensen, P., Danilov, G. K., Vartanyan, S., Gilbert, M Thomas P, Lister, A. M., Heintzman, P. D., van der Valk, T. & Dalén, L., 2023, I: Current Biology. 33, 9, 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros
Sánchez-Barreiro, F., Westbury, Binia De Cahsan, Westbury, Michael Vincent, Sun, Xin, Margaryan, Ashot, Fontsere, Claudia, Bruford, M. W., Russo, I. M., Kalthoff, D. C., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Dalén, L., KU, thw266, Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Moodley, Y., 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, 19 s., msad180.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Intestinal epigenotype of Atlantic salmon (Salmo salar) associates with tenacibaculosis and gut microbiota composition
Hansen, Søren Blikdal, Bozzi, D., Mak, Sarah Siu Tze, Clausen, C. G., Nielsen, Tue Kjærgaard, Kodama, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2023, I: Genomics. 115, 3, 9 s., 110629.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mammal mitogenomics from invertebrate-derived DNA
Danabalan, R., Merkel, K., Schnell, I. B., Arandjelovic, M., Boesch, C., Brazzola, G., Dieguez, P., Dupain, J., Kambale-Vyalengerera, M., Kühl, H. S., Hoffmann, C., Lapuente, J., Thinh, V. N., Zimmermann, F., Leendertz, F. H., Gilbert, M Thomas P, Roos, C., Mazzoni, C., Gogarten, J. F. & Calvignac-Spencer, S., 2023, I: Environmental DNA. 5, 5, s. 1004-1015 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On the origin and evolution of RNA editing in metazoans
Zhang, P., Zhu, Y., Guo, Q., Li, J., Zhan, X., Yu, H., Xie, N., Tan, H., Lundholm, Nina, Garcia-Cuetos, L., Martin, M. D., Subirats, M. A., Su, Y., Ruiz-Trillo, I., Martindale, M. Q., Yu, J., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Li, Q., 2023, I: Cell Reports. 42, 2, 22 s., 112112.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Palaeogenomics of Extinct and Archaic Hominins
Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2023, Handbook of Archaeological Sciences. Pollard, M., Armitage, R. A. & Makarewicz, C. A. (red.). 2 udg. Wiley-Interscience, Bind 1. s. 647-656 10 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Redefining the Evolutionary History of the Rock Dove, Columba livia, Using Whole Genome Sequences
Hernández Alonso, Germán, Ramos Madrigal, Jazmin, van Grouw, H., Ciucani, Marta Maria, Cavill, Emily Louisa, Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishnan, Shyam, Antunes Pacheco, George & Gilbert, M Thomas P, 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 11, 17 s., msad243.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change
Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2023, I: Nature Ecology and Evolution. 7, 6, s. 862-872 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The ancestry and geographical origins of St Helena's liberated Africans
Sandoval-Velasco, Marcela, Jagadeesan, A., Ramos Madrigal, Jazmin, Ávila-Arcos, M. C., Fortes-Lima, C. A., Watson, J., Johannesdóttir, E., Cruz-Dávalos, D. I., Gopalakrishnan, Shyam, Moreno Mayar, J. Víctor, Niemann, Jonas, Renaud, G., Brown, K. A. R., Bennett, H., Pearson, A., Helgason, A., Gilbert, M Thomas P & Schroeder, Hannes, 2023, I: American Journal of Human Genetics. 110, 9, s. 1590-1599 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The extinct Sicilian wolf shows a complex history of isolation and admixture with ancient dogs
Ciucani, M. M., Ramos-Madrigal, J., Hernández-Alonso, G., Carmagnini, A., Aninta, S. G., Sun, X., Scharff-Olsen, C. H., Lanigan, L. T., Fracasso, I., Clausen, C. G., Aspi, J., Kojola, I., Baltrūnaitė, L., Balčiauskas, L., Moore, J., Åkesson, M., Saarma, U., Hindrikson, M., Hulva, P., Bolfíková, B. Č. & 19 flere, , 2023, I: iScience. 26, 8, 22 s., 107307.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genetic history of Scandinavia from the Roman Iron Age to the present
Rodríguez-Varela, R., Moore, K. H. S., Ebenesersdóttir, S. S., Kilinc, G. M., Kjellström, A., Papmehl-Dufay, L., Alfsdotter, C., Berglund, B., Alrawi, L., Kashuba, N., Sobrado, V., Lagerholm, V. K., Gilbert, E., Cavalleri, G. L., Hovig, E., Kockum, I., Olsson, T., Alfredsson, L., Hansen, T. F., Werge, T. & 24 flere, , 2023, I: Cell. 186, 1, s. 32-46.e19Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uncovering neutral and adaptive genomic differentiation among European perch with brackish water and freshwater origin in the western Baltic Sea region
Skovrind, Mikkel, Antunes Pacheco, George, Christensen, E. A. F., Gopalakrishnan, Shyam, Fietz, K., Holm-Hansen, T. H., Vieira, Filipe Garrett, Krag, M. A., Carl, Henrik, Gilbert, M Thomas P, Olsen, Morten Tange & Møller, Peter Rask, 2023, I: Fisheries Research. 268, 11 s., 106846.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- 2022
- Udgivet
A multi-omics approach unravels metagenomic and metabolic alterations of a probiotic and synbiotic additive in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
Rasmussen, Jacob Agerbo, Villumsen, Kasper Rømer, Ernst, M., Hansen, M., Forberg, T., Gopalakrishnan, Shyam, Gilbert, M Thomas P, Bojesen, Anders Miki, Kristiansen, Karsten & Limborg, Morten Tønsberg, 2022, I: Microbiome. 10, 19 s., 21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient and historical DNA in conservation policy
Jensen, E. L., Díez-del-Molino, D., Gilbert, M Thomas P, Bertola, Laura, Borges, F., Cubric-Curik, V., de Navascués, M., Frandsen, P., Heuertz, M., Hvilsom, C., Jiménez-Mena, B., Miettinen, A., Moest, M., Chrzanová Pecnerová, Patrícia, Barnes, I. & Vernesi, C., 2022, I: Trends in Ecology and Evolution. 37, 5, s. 420-429 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient proteins resolve controversy over the identity of Genyornis eggshell
Demarchi, B., Stiller, Josefin, Grealy, A., Mackie, Meaghan, Deng, Y., Gilbert, M Thomas P, Clarke, J., Legendre, L. J., Boano, R., Sicheritz-Pontén, Thomas, Magee, J., KU, thw266, Bunce, M., Collins, Matthew James & Miller, G., 2022, I: PNAS. 119, 43, 9 s., e2109326119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic
Patrono, L. V., Vrancken, B., Budt, M., Düx, A., Lequime, S., Boral, S., Gilbert, M. T. P., Gogarten, J. F., Hoffmann, L., Horst, D., Merkel, K., Morens, D., Prepoint, B., Schlotterbeck, J., Schuenemann, V. J., Suchard, M. A., Taubenberger, J. K., Tenkhoff, L., Urban, C., Widulin, N. & 6 flere, , 2022, I: Nature Communications. 13, 9 s., 2314.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conservation genomics of the endangered Seychelles Magpie-Robin (Copsychus sechellarum): a unique insight into the history of a precious endemic bird
Cavill, Emily Louisa, Gopalakrishnan, Shyam, Puetz, Lara Christine, Ribeiro, Â. M., Mak, Sarah Siu Tze, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Antunes Pacheco, George, Dunlop, B., Accouche, W., Shah, N., Zora, A., Calabrese, L., Genner, M., Jones, G., Guo, C., KU, thw266 & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Ibis. 164, 2, s. 396-410 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differential expression profiling of heat stressed tardigrades reveals major shift in the transcriptome
Neves, R. C., Møbjerg, A., Kodama, M., Ramos Madrigal, Jazmin, Gilbert, M Thomas P & Møbjerg, Nadja, 2022, I: Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular & Integrative Physiology. 267, 7 s., 111169.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Enriching captivity conditions with natural elements does not prevent the loss of wild-like gut microbiota but shapes its compositional variation in two small mammals
Koziol, Adam Leslie, Larrañaga, Iñaki Odriozola, Jessen, Lasse Nyholm, Leonard, Aoife Mary, San Jose, C., Pauperio, J., Ferreira, C., Hansen, Anders Johannes, Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2022, I: MicrobiologyOpen. 11, 5, 19 s., e1318.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extreme freeze-tolerance in cryophilic tardigrades relies on controlled ice formation but does not involve significant change in transcription: [Corrigendum]
Møbjerg, A., Kodama, M., Ramos Madrigal, Jazmin, Neves, R. C., Jørgensen, Aslak, Schiøtt, M., Gilbert, M Thomas P & Møbjerg, Nadja, 2022, I: Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular & Integrative Physiology. 271, 8 s., 111245.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic load and adaptive potential of a recovered avian species that narrowly avoided extinction
Femerling Romero, Maria Georgette, Oosterhout, C. V., Feng, S., Bristol, R. M., KU, thw266, Groombridge, J., Gilbert, M Thomas P & Morales Villegas, Hernan Eduardo, 2022, bioRxiv, 23 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Genome-wide re-sequencing reveals the adaptive potential of European ash (Fraxinus excelsior)
Doonan, J., Budde, K. B., Lobo, A., Kosawang, C., Verbylaite, R., Pliura, A., Ulaszewski, B., Thomas, K., Konrad, H., Jørgensen, H. J. L., Seegmüller, S., Liziniewicz, M., Cleary, M., Nemesio-Gorriz, M., Fussi, B., Kirisits, T., Gilbert, M. T. P., Martin, M., Heuertz, M., Kjær, E. D. & 1 flere, , 2022, 7th IUFRO International Workshop on the Genetics of Tree-Parasite Interactions in Forestry: Book of abstracts: GTPI 2022. IUFRO, s. 49 1 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
- Udgivet
Genomic evidence refutes the hypothesis that the Bornean banteng is a distinct species
Sun, Xin, Ciucani, M. M., Rasmussen, Jacob Agerbo, Gilbert, M Thomas P & Sinding, Mikkel Holger Strander, 2022, I: BMC Ecology and Evolution. 22, 4 s., 110.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic insights into the secondary aquatic transition of penguins
Cole, T. L., Zhou, C., Fang, M., Pan, H., Ksepka, D. T., Fiddaman, S. R., Emerling, C. A., Thomas, D. B., Bi, X., Fang, Q., Ellegaard, M. R., Feng, S., Smith, A. L., Heath, T. A., Tennyson, A. J. D., Borboroglu, P. G., Wood, J. R., Hadden, P. W., Grosser, S., Bost, C. A. & 20 flere, , 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3912.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Grey wolf genomic history reveals a dual ancestry of dogs
Bergström, A., Stanton, D. W. G., Taron, U. H., Frantz, L., Sinding, M. H. S., Ersmark, E., Pfrengle, S., Cassatt-Johnstone, M., Lebrasseur, O., Girdland-Flink, L., Fernandes, D. M., Ollivier, M., Speidel, L., Gopalakrishnan, S., Westbury, M. V., Ramos-Madrigal, J., Feuerborn, T. R., Reiter, E., Gretzinger, J., Münzel, S. C. & 61 flere, , 2022, I: Nature. 607, 7918, s. 313-320Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel strategies to improve chicken performance and welfare by unveiling host-microbiota interactions through hologenomics
Tous, N., Marcos, S., Goodarzi Boroojeni, F., Pérez de Rozas, A., Zentek, J., Estonba, A., Sandvang, D., Gilbert, M Thomas P, Esteve-Garcia, E., Finn, R., Alberdi, Antton & Tarradas, J., 2022, I: Frontiers in Physiology. 13, 14 s., 884925.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomics of the world's otters
de Ferran, V., Figueiró, H. V., Trindade, F. D. J., Smith, O., Sinding, Mikkel Holger Strander, Trinca, C. S., Lazzari, G. Z., Veron, G., Vianna, J. A., Barbanera, F., Kliver, S., Serdyukova, N., Bulyonkova, T., Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Koepfli, K. & Eizirik, E., 2022, I: Current Biology. 32, 16, s. 3650-3658.e4 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Probing the genomic limits of de-extinction in the Christmas Island rat
Lin, J., Duchene, David, Carøe, C., Smith, O., Ciucani, M. M., Niemann, Jonas, Richmond, D., Greenwood, A. D., MacPhee, R., KU, thw266, Gopalakrishnan, Shyam & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 7, s. 1650-1656.e3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rhizosphere bacterial communities differ among traditional maize landraces
Lund, M., Rasmussen, Jacob Agerbo, Ramos Madrigal, Jazmin, Sawers, R., Gilbert, M Thomas P & Barnes, Christopher James, 2022, I: Environmental DNA. 4, 6, s. 1241-1249 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change
Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2022, bioRxiv, 24 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
The Australian dingo is an early offshoot of modern breed dogs
Field, M. A., Yadav, S., Dudchenko, O., Esvaran, M., Rosen, B. D., Skvortsova, K., Edwards, R. J., Keilwagen, J., Cochran, B. J., Manandhar, B., Bustamante, S., Rasmussen, J. A., Melvin, R. G., Chernoff, B., Omer, A., Colaric, Z., Chan, E. K. F., Minoche, A. E., Smith, T. P. L., Gilbert, M. T. P. & 5 flere, , 2022, I: Science Advances. 8, 16, 14 s., eabm5944.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Earth BioGenome Project 2020: Starting the clock
Lewin, H. A., Richards, S., Aiden, E. L., Allende, M. L., Archibald, J. M., Bálint, M., Barker, K. B., Baumgartner, B., Belov, K., Bertorelle, G., Blaxter, M. L., Cai, J., Caperello, N. D., Carlson, K., Castilla-Rubio, J. C., Chaw, S. M., Chen, L., Childers, A. K., Coddington, J. A., Conde, D. A. & 65 flere, , 2022, I: PNAS. 119, 4, 7 s., e2115635118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The era of reference genomes in conservation genomics
Formenti, G., Theissinger, K., Fernandes, C., Bista, I., Bombarely, A., Bleidorn, C., Ciofi, C., Crottini, A., Godoy, J. A., Höglund, J., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R. A., Paez, S., Palsbøll, P. J., Pampoulie, C., Ruiz-López, M. J., Svardal, H., Theofanopoulou, C., de Vries, J. & 8 flere, , 2022, I: Trends in Ecology and Evolution. 37, 3, s. 197-202 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin’s giant daisies
Cerca, J., Petersen, B., Lazaro-Guevara, J. M., Rivera-Colón, A., Birkeland, S., Vizueta, J., Li, S., Li, Q., Loureiro, J., Kosawang, C., Díaz, P. J., Rivas-Torres, G., Fernández-Mazuecos, M., Vargas, P., McCauley, R. A., Petersen, G., Santos-Bay, L., Wales, N., Catchen, J. M., Machado, D. & 9 flere, , 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3729.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The population genomic legacy of the second plague pandemic
Gopalakrishnan, S., Ebenesersdóttir, S. S., Lundstrøm, I. K. C., Turner-Walker, G., Moore, K. H. S., Luisi, P., Margaryan, A., Martin, M. D., Ellegaard, M. R., Magnússon, Ó., Sigurðsson, Á., Snorradóttir, S., Magnúsdóttir, D. N., Laffoon, J. E., van Dorp, L., Liu, X., Moltke, I., Ávila-Arcos, M. C., Schraiber, J. G., Rasmussen, S. & 40 flere, , 2022, I: Current Biology. 32, 21, s. 4743-4751.e6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The potential of aquatic bloodfeeding and nonbloodfeeding leeches as a tool for iDNA characterisation
Lynggaard, Christina Islas, Oceguera-Figueroa, A., Kvist, S., Gilbert, M Thomas P & Bohmann, Kristine, 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 2, s. 539-553 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
To bee, or not to bee? One leg is the question
Cavill, Emily Louisa, Liu, S., Zhou, X. & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 5, s. 1868-1874 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Travel Tales of a Worldwide Weed: Genomic Signatures of Plantago major L. Reveal Distinct Genotypic Groups With Links to Colonial Trade Routes
Iwanycki Ahlstrand, N., Gopalakrishnan, S., Vieira, F. G., Bieker, V. C., Meudt, H. M., Dunbar-Co, S., Rothfels, C. J., Martinez-Swatson, K. A., Maldonado, C., Hassemer, G., Shipunov, A., Bowers, M. D., Gardner, E., Xu, M., Ghorbani, A., Amano, M., Grace, O. M., Pringle, J. S., Bishop, M., Manzanilla, V. & 18 flere, , 2022, I: Frontiers in Plant Science. 13, 16 s., 838166.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uncovering the genomic basis of an extraordinary plant invasion
Bieker, V. C., Battlay, P., Petersen, B., Sun, X., Wilson, J., Brealey, J. C., Bretagnolle, F., Nurkowski, K., Lee, C., Barreiro, F. S., Owens, G. L., Lee, J. Y., Kellner, F. L., van Boheeman, L., Gopalakrishnan, S., Gaudeul, M., Mueller-Schaerer, H., Lommen, S., Karrer, G., Chauvel, B. & 8 flere, , 2022, I: Science Advances. 8, 34, 18 s., eabo5115.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
- Udgivet
A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 2; peer review: 2 approved]
Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 16 s., 25.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 1; peer review: 2 approved]
Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 15 s., 25.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A towering genome: Experimentally validated adaptations to high blood pressure and extreme stature in the giraffe
Liu, C., Gao, J., Cui, X., Li, Z., Chen, L., Yuan, Y., Zhang, Y., Mei, L., Zhao, L., Cai, D., Hu, M., Zhou, B., Li, Z., Qin, T., Si, H., Li, G., Lin, Z., Xu, Y., Zhu, C., Yin, Y. & 9 flere, , 2021, I: Science Advances. 7, 12, 13 s., eabe9459.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An integrated morphological-molecular approach reveals new insights on the systematics of the octocoral Telestula humilis (Thomson, 1927) (Octocorallia: Alcyonacea : Clavulariidae)
Poliseno, A., Altuna, A., Puetz, Lara Christine, Mak, Sarah Siu Tze, Rios, P., Petroni, E., McFadden, C. S., Sørensen, Martin Vinther & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Invertebrate Systematics. 35, 3, s. 261-281 21 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient and modern genomes unravel the evolutionary history of the rhinoceros family
Liu, S., Westbury, M. V., Dussex, N., Mitchell, K. J., Sinding, M. H. S., Heintzman, P. D., Duchêne, D. A., Kapp, J. D., von Seth, J., Heiniger, H., Sánchez-Barreiro, F., Margaryan, A., André-Olsen, R., De Cahsan, B., Meng, G., Yang, C., Chen, L., van der Valk, T., Moodley, Y., Rookmaaker, K. & 19 flere, , 2021, I: Cell. 184, 19, s. 4874-4885.e16Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient and modern stickleback genomes reveal the demographic constraints on adaptation
Kirch, M., Romundset, A., Gilbert, M Thomas P, Jones, F. C. & Foote, A. D., 2021, I: Current Biology. 31, 9, s. 2027-2036.e8 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient microRNA profiles of 14,300-yr-old canid samples confirm taxonomic origin and provide glimpses into tissue-specific gene regulation from the Pleistocene
Fromm, B., Tarbier, M., Smith, O., Marmol-Sanchez, E., Dalen, L., Gilbert, M Thomas P & Friedlander, M. R., 2021, I: RNA. 27, 3, s. 324-334 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Contrasting genetic signal of recolonization after rainforest fragmentation in African trees with different dispersal abilities
Piñeiro, R., Hardy, O. J., Tovar, C., Gopalakrishnan, Shyam, Vieira, Filipe Garrett & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 27, 9 s., e2013979118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dire wolves were the last of an ancient New World canid lineage
Perri, A. R., Mitchell, K. J., Mouton, A., Alvarez-Carretero, S., Hulme-Beaman, A., Haile, J., Jamieson, A., Meachen, J., Lin, A. T., Schubert, B. W., Ameen, C., Antipina, E. E., Bover, P., Brace, S., Carmagnini, A., Carøe, C., Samaniego Castruita, J. A., Chatters, J. C., Dobney, K., dos Reis, M. & 29 flere, , 2021, I: Nature. 591, s. 87-91Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary history of the extinct Sardinian dhole
Ciucani, M. M., Jensen, J. K., Sinding, M. S., Smith, O., Lucenti, S. B., Rosengren, E., Rook, L., Tuveri, C., Arca, M., Cappellini, Enrico, Galaverni, M., Randi, E., Guo, C., KU, thw266, Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Gilbert, M Thomas P & Gopalakrishnan, Shyam, 2021, I: Current Biology. 31, 24, s. 5571-5579.e6 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extended survival of Pleistocene Siberian wolves into the early 20th century on the island of Honshu
Niemann, Jonas, Gopalakrishnan, Shyam, Yamaguchi, N., Ramos Madrigal, Jazmin, Wales, N., Gilbert, M Thomas P & Sinding, M. S., 2021, I: iScience. 24, 25 s., 101904.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Feasibility of applying shotgun metagenomic analyses to grapevine leaf, rhizosphere and soil microbiome characterisation
Azevedo-Silva, D., Rasmussen, Jacob Agerbo, Carneiro, M., Gilbert, M Thomas P & Azevedo, H., 2021, I: Australian Journal of Grape and Wine Research. 27, 4, s. 519-526 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fine-tuning biodiversity assessments: A framework to pair eDNA metabarcoding and morphological approaches
Pereira, Catia Lucio, Gilbert, M Thomas P, Araújo, M. B. & Matias, M. G., 2021, I: Methods in Ecology and Evolution. 12, 12, s. 2397-2409 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome-resolved metagenomics suggests a mutualistic relationship between Mycoplasma and salmonid hosts
Rasmussen, Jacob Agerbo, Villumsen, Kasper Rømer, Duchene, David, Puetz, Lara Christine, Delmont, T. O., Sveier, H., Jørgensen, Louise von Gersdorff, Præbel, K., Martin, M. D., Bojesen, Anders Miki, Gilbert, M Thomas P, Kristiansen, Karsten & Limborg, Morten Tønsberg, 2021, I: Communications Biology. 4, 10 s., 579.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic insights into the conservation status of the world's last remaining Sumatran rhinoceros populations
von Seth, J., Dussex, N., Diez-del-Molino, D., van der Valk, T., Kutschera, V. E., Kierczak, M., Steiner, C. C., Liu, S., Gilbert, M. T. P., Sinding, M-H. S., Prost, S., Guschanski, K., Nathan, S. K. S. S., Brace, S., Chan, Y. L., Wheat, C. W., Skoglund, P., Ryder, O. A., Goossens, B., Gotherstrom, A. & 1 flere, , 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 11 s., 2393.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gut Microbiota Linked with Reduced Fear of Humans in Red Junglefowl Has Implications for Early Domestication
Puetz, Lara Christine, Delmont, T. O., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Guo, C., KU, thw266, Katajamaa, R., Jensen, P. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Advanced Genetics. 2, 4, 12 s., 2100018.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Historical population declines prompted significant genomic erosion in the northern and southern white rhinoceros (Ceratotherium simum)
Sánchez-Barreiro, F., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Westbury, Michael Vincent, de Manuel, M., Margaryan, Ashot, Ciucani, M. M., Vieira, Filipe Garrett, Patramanis, Ioannis, Kalthoff, D. C., Timmons, Z., Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Ryder, O. A., KU, thw266, Marques-Bonet, T., Moodley, Y. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6355-6369 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of African swine fever virus transcription within peripheral blood mononuclear cells of acutely infected pigs
Olesen, A. S., Kodama, M., Lohse, L., Accensi, F., Rasmussen, T. B., Lazov, Christina Marie, Limborg, Morten Tønsberg, Gilbert, M Thomas P, Bøtner, A. & Belsham, Graham John, 2021, I: Viruses. 13, 11, 2333.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Kouprey (Bos sauveli) genomes unveil polytomic origin of wild Asian Bos
Sinding, M. S., Ciucani, M. M., Ramos Madrigal, Jazmin, Carmagnini, A., Rasmussen, Jacob Agerbo, Feng, S., Chen, G., Vieira, Filipe Garrett, Mattiangeli, V., Ganjoo, R. K., Larson, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Frantz, L., Gilbert, M Thomas P & Bradley, D. G., 2021, I: iScience. 24, 11, 18 s., 103226.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Leech blood-meal invertebrate-derived DNA reveals differences in Bornean mammal diversity across habitats
Drinkwater, R., Jucker, T., Potter, J. H. T., Swinfield, T., Coomes, D. A., Slade, E. M., Gilbert, M Thomas P, Lewis, O. T., Bernard, H., Struebig, M. J., Clare, E. L. & Rossiter, S. J., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 13, s. 3299-3312 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mitochondrial genomes of Danish vertebrate species generated for the national DNA reference database, DNAmark
Margaryan, Ashot, Noer, Christina, Richter, S. R., Restrup, M. E., Bülow‐hansen, J. L., Leerhøi, Frederik, Arfaoui, Emilia Marie Rolander, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Gilbert, M Thomas P & Bohmann, Kristine, 2021, I: Environmental DNA. 3, 2, s. 472-480Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modern Siberian dog ancestry was shaped by several thousand years of Eurasian-wide trade and human dispersal
Feuerborn, T. R., Carmagnini, A., Losey, R. J., Nomokonova, T., Askeyev, A., Askeyev, I., Askeyev, O., Antipina, E. E., Appelt, M., Bachura, O. P., Beglane, F., Bradley, D. G., Daly, K. G., Gopalakrishnan, S., Gregersen, K. M., Guo, C., Gusev, A. V., Jones, C., Kosintsev, P. A., Kuzmin, Y. V. & 17 flere, , 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 39, e2100338118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular parallelisms between pigmentation in the avian iris and the integument of ectothermic vertebrates
Andrade, P., Gazda, M. A., Araújo, P. M., Afonso, S., Rasmussen, Jacob Agerbo, Marques, C. I., Lopes, R. J., Gilbert, M Thomas P & Carneiro, M., 2021, I: PLOS Genetics. 17, 2, 16 s., 1009404.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Non-invasive surveys of mammalian viruses using environmental DNA
Alfano, N., Dayaram, A., Axtner, J., Tsangaras, K., Kampmann, Marie-Louise, Mohamed, A., Wong, S. T., Gilbert, M Thomas P, Wilting, A. & Greenwood, A. D., 2021, I: Methods in Ecology and Evolution. 12, 10, s. 1941-1952Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning
Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reconsidering domestication from a process archaeology perspective
Bogaard, A., Allaby, R., Arbuckle, B. S., Bendrey, R., Crowley, S., Cucchi, T., Denham, T., Frantz, L., Fuller, D., Gilbert, M Thomas P, Karlsson, E., Manin, A., Marshall, F., Mueller, N., Peters, J., Stépanoff, C., Weide, A. & Larson, G., 2021, I: World Archaeology. 53, 1, s. 56-77 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Runs of homozygosity in killer whale genomes provide a global record of demographic histories
Foote, A. D., Hooper, R., Alexander, A., Baird, R. W., Baker, C. S., Ballance, L., Barlow, J., Brownlow, A., Collins, T., Constantine, R., Dalla Rosa, L., Davison, N. J., Durban, J. W., Esteban, R., Excoffier, L., Martin, S. L. F., Forney, K. A., Gerrodette, T., Gilbert, M. T. P., Guinet, C. & 14 flere, , 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6162-6177 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Salmon gut microbiota correlates with disease infection status: potential for monitoring health in farmed animals
Bozzi, D., Rasmussen, Jacob Agerbo, Carøe, C., Sveier, H., Nordøy, K., Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 1, 17 s., 30.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genetic impact of an Ebola outbreak on a wild gorilla population
Fontsere, C., Frandsen, P., Hernandez-Rodriguez, J., Niemann, Jonas, Scharff-Olsen, Camilla Hjorth, Vallet, D., Le Gouar, P., Ménard, N., Navarro, A., Siegismund, Hans Redlef, Hvilsom, C., Gilbert, M Thomas P, Kuhlwilm, M., Hughes, D. & Marques-Bonet, T., 2021, I: BMC Genomics. 22, 12 s., 735.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genome sequence of the grey wolf, Canis lupus Linnaeus 1758
Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishnan, Shyam, Raundrup, K., Dalén, L., Threlfall, J., Gilbert, M Thomas P, Darwin Tree of Life Barcoding collective, D. T. O. L. B. C., Wellcome Sanger Institute Tree of Life programme, W. S. I. T. O. L. P., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: DNA Pipelines collective, W. S. I. S. O. D. P. C. & Tree of Life Core Informatics collective, Darwin Tree of Life Consortium, T. O. L. C. I. C. D. T. O. L. C., 2021, I: Wellcome Open Research. 6, 12 s., 310.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The germline mutational process in rhesus macaque and its implications for phylogenetic dating
Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Bakker, J., Zheng, J., Li, P., Antunes Pacheco, George, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kamilari, M., Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 5, 14 s., giab029.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The role of the gut microbiota in the dietary niche expansion of fishing bats
Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Jessen, Lasse Nyholm, Morris, E., Chaverri, G., Montalvo, L. G. H., Flores-Martinez, J. J., Lin, A., Razgour, O., Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 14 s., 76.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species
Rhie, A., McCarthy, S. A., Fedrigo, O., Damas, J., Formenti, G., Koren, S., Uliano-Silva, M., Chow, W., Fungtammasan, A., Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Chaisson, M., Gedman, G. L., Cantin, L. J., Thibaud-Nissen, F., Haggerty, L., Bista, I., Smith, M., Haase, B. & 107 flere, , 2021, I: Nature. 592, 7856, s. 737-746 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
eDNA‐based biomonitoring at an experimental German vineyard to characterize how management regimes shape ecosystem diversity
Rasmussen, Jacob Agerbo, Nielsen, M., Mak, Sarah Siu Tze, Döring, J., Klincke, F., Gopalakrishnan, Shyam, Dunn, Rob, Kauer, R. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Environmental DNA. 3, 1, s. 70-82 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Using paleo-archives to safeguard biodiversity under climate change
Fordham, D. A., Jackson, S. T., Brown, S. C., Huntley, B., Dahl-Jensen, Dorthe, Gilbert, M Thomas P, Otto-Bliesner, B., Svensson, Anders, Theodoridis, S., Wilmshurst, J. M., Buettel, J. C., Canteri, Elisabetta, McDowell, M., Orlando, L. A. A., Pilowsky, Julia Aaron, Rahbek, Carsten & Nogues, David Bravo, 28 aug. 2020, I: Science. 369, 6507, s. 1072-1083 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux
da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, , 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss
Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient DNA suggests modern wolves trace their origin to a Late Pleistocene expansion from Beringia
Loog, L., Thalmann, O., Sinding, M. H. S., Schuenemann, V. J., Perri, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Witt, K. E., Samaniego Castruita, J. A., Velasco, M. S., Lundstrøm, I. K. C., Wales, N., Sonet, G., Frantz, L., Schroeder, H., Budd, J., Jimenez, E. L., Fedorov, S., Gasparyan, B., Kandel, A. W. & 16 flere, , 2020, I: Molecular Ecology. 29, 9, s. 1596-1610 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition
Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, , 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification
Bohmann, Kristine, Mirarab, S., Bafna, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Molecular Ecology. 29, 14, s. 2521-2534Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bone biodeterioration - The effect of marine and terrestrial depositional environments on early diagenesis and bone bacterial community
Eriksen, A. M. H., Nielsen, Tue Kjærgaard, Matthiesen, H., Carøe, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Gregory, D. J., Turner-Walker, G., Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: PLoS ONE. 15, 10 October, 24 s., e0240512.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA metabarcoding and spatial modelling link diet diversification with distribution homogeneity in European bats
Alberdi, Antton, Razgour, O., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Novella-Fernandez, R., Aihartza, J., Budinski, I., Garin, I., Ibanez, C., Izagirre, E., Rebelo, H., Russo, D., Vlaschenko, A., Zhelyazkova, V., Zrncic, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Nature Communications. 11, 8 s., 1154.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA-Based Arthropod Diversity Assessment in Amazonian Iron Mine Lands Show Ecological Succession Towards Undisturbed Reference Sites
Lynggaard, Christina Islas, Yu, D. W., Oliveira, G., Caldeira, C. F., Ramos, S. J., Ellegaard, M. R., Gilbert, M Thomas P, Gastauer, M. & Bohmann, Kristine, 2020, I: Frontiers in Ecology and Evolution. 8, 15 s., 590976.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 12980
Flest downloads
-
6185
downloads
Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5636
downloads
Deep sequencing of RNA from ancient maize kernels
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5247
downloads
True single-molecule DNA sequencing of a pleistocene horse bone
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet