Sune Darkner

Sune Darkner

Lektor


  1. 2021
  2. Udgivet

    A framework for voxel-based assessment of biological effect after proton radiotherapy in pediatric brain cancer patients using multi-modal imaging

    Skaarup, Mikkel, Lundemann, M. J., Darkner, Sune, Jorgensen, M., Marner, Lisbeth, Mirkovic, D., Grosshans, D., Peeler, C., Mohan, R., Vogelius, I. R. & Appelt, A., 10 jun. 2021, I: Medical Physics. 48, 7, 12 s., 4110-4121.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    U-Sleep: resilient high-frequency sleep staging

    Perslev, Mathias, Darkner, Sune, Kempfner, L., Nikolic, M., Jennum, Poul & Igel, Christian, 15 apr. 2021, I: npj Digital Medicine. 4, 1, 12 s., 72.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A multi-patient analysis of the center of rotation trajectories using finite element models of the human mandible

    Gholamalizadeh, Torkan, Darkner, Sune, Søndergaard, P. L. & Erleben, Kenny, 2021, I: PLoS ONE. 16, 11 November, 16 s., e0259794.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Bundle Geodesic Convolutional Neural Network for DWI Segmentation from Single Scan Learning

    Liu, Renfei, Lauze, Francois Bernard, Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2021, Computational Diffusion MRI - 12th International Workshop, CDMRI 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Proceedings. Cetin-Karayumak, S., Christiaens, D., Figini, M., Guevara, P., Gyori, N., Nath, V. & Pieciak, T. (red.). Springer, s. 121-132 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 13006 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Cine-MRI Simulation to Evaluate Tumor Tracking

    Tascon Vidarte, Jose David, Wahlstedt, I., Jomier, J., Erleben, Kenny, Vogelius, I. R. & Darkner, Sune, 2021, Simulation and Synthesis in Medical Imaging - 6th International Workshop, SASHIMI 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Proceedings. Svoboda, D., Burgos, N., Wolterink, J. M. & Zhao, C. (red.). Springer, s. 131-141 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12965 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Contact modeling from images using cut finite element solvers

    Claus, S., Kerfriden, P., Moshfeghifar, F., Darkner, Sune, Erleben, Kenny & Wong, Christian, 2021, I: Advanced Modeling and Simulation in Engineering Sciences. 8, 1, s. 1-23 13.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    First Order Locally Orderless Registration

    Darkner, Sune, Tascon Vidarte, Jose David & Lauze, Francois Bernard, 2021, Scale Space and Variational Methods in Computer Vision - 8th International Conference, SSVM 2021, Proceedings. Elmoataz, A., Fadili, J., Quéau, Y., Rabin, J. & Simon, L. (red.). Springer, s. 177-188 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12679 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Global Position Prediction for Interactive Motion Capture

    Schreiner, Paul, Perepichka, M., Lewis, H., Darkner, Sune, Kry, P. G., Erleben, Kenny & Zordan, V. B., 2021, I: Proceedings of the ACM on Computer Graphics and Interactive Techniques. 4, 3, s. 1-16 3479985.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Accepteret/In press

    Information-Theoretic Registration with Explicit Reorientation of Diffusion-Weighted Images

    Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard & Darkner, Sune, 2021, (Accepteret/In press) I: Journal of Mathematical Imaging and Vision.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    OpenJaw Dataset

    Gholamalizadeh, Torkan, Darkner, Sune, Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2021

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstformDatasætForskning

  12. 2020
  13. Udgivet

    A Highly Accurate Model Based Registration Method for FIB-SEM Images of Neurons

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, 8 s. (arXiv.org).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  14. Udgivet

    Mandibular Teeth Movement Variations in Tipping Scenario: A Finite Element Study on Several Patients

    Gholamalizadeh, Torkan, Darkner, Sune, Cattaneo, P. M., Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2020. 10 s.

    Publikation: KonferencebidragPaperForskning

  15. Udgivet

    Restoring drifted electron microscope volumes using synaptic vesicles at sub-pixel accuracy

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, I: Communications Biology. 3, 1, 7 s., ´81.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. 2019
  17. Udgivet

    U-Time: A Fully Convolutional Network for Time Series Segmentation Applied to Sleep Staging

    Perslev, Mathias, Hejselbak Jensen, M., Darkner, Sune, Jørgen Jennum, P. & Igel, Christian, 1 okt. 2019, Advances in Neural Information Processing Systems 32 (NIPS 2019). NIPS Proceedings, Bind 32. s. 4415-4426

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Drift Corrector Software

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 20 aug. 2019

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstformSoftwareprogramForskning

  19. Udgivet

    Data Driven Inverse Kinematics of Soft Robots using Local Models

    Holsten, F., Engell-norregard, M. P., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2019, 2019 International Conference on Robotics and Automation (ICRA). IEEE, s. 6251-6257

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Deterministic Group Tractography with Local Uncertainty Quantification

    Holm, Andreas Nugaard, Feragen, Aasa, Dela Haije, Tom & Darkner, Sune, 2019, Computational Diffusion: International MICCAI Workshop, Granada,. Bonet-Carne, E., Grussu, F., Ning, L., Sepehrband, F. & Tax, C. M. W. (red.). 226249 udg. Springer, s. 377-386 (Mathematics and Visualization).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    TopAwaRe: Topology-Aware Registration

    Nielsen, R. K., Darkner, Sune & Feragen, Aasa, 2019, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2019 - 22nd International Conference, Proceedings. Shen, D., Yap, P-T., Liu, T., Peters, T. M., Khan, A., Staib, L. H., Essert, C. & Zhou, S. (red.). Springer VS, s. 364-372 9 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11765 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  22. 2018
  23. Udgivet

    Safety and Efficacy of Mesenchymal Stem Cells for Radiation-Induced Xerostomia: A Randomized, Placebo-Controlled Phase 1/2 Trial (MESRIX)

    Grønhøj, C., Jensen, D. H., Vester-Glowinski, P., Jensen, S. B., Bardow, A., Oliveri, R. S., Fog, L. M., Specht, Lena, Thomsen, Carsten, Darkner, Sune, Jensen, M., Müller, V., Kiss, K., Agander, T., Andersen, E., Fischer-Nielsen, Anne & von Buchwald, Christian, 1 jul. 2018, I: International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics. 101, 3, s. 581-592 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Brain Segmentation in Rodent MR-Images Using Convolutional Neural Networks

    Sigurdsson, Björn, Darkner, Sune, Sommer, Stefan Horst, Mortensen, Kristian Nygaard, Sanggaard, S., Kostrikov, S. & Nedergaard, Maiken, 2018.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Collocation for diffeomorphic deformations in medical image registration

    Darkner, Sune, Pai, A. S. U., Liptrot, M. G. & Sporring, Jon, 2018, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 40, 7, s. 1570-1583

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2017
  27. Udgivet

    Hippocampal texture predicts rate of cognitive decline in mild cognitive impairment

    Pai, A. S. U., Pillai, J. A., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sommer, Stefan Horst & Nielsen, Mads, jul. 2017, I: Alzheimer's & Dementia. 13, 7, supplement, s. P1356 1 s., P4-225.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  28. Udgivet

    Density-based non-rigid registration of diffusion-weighted images

    Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard, Nielsen, Mads & Darkner, Sune, apr. 2017.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Streamlet Tractography

    Liptrot, M. G., Darkner, Sune, Feragen, Aasa & Lauze, Francois Bernard, apr. 2017.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    3D analysis of synaptic vesicle density and distribution after acute foot-shock stress by using serial section transmission electron microscopy

    Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    A statistical model for simultaneous template estimation, bias correction, and registration of 3D brain images

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Raket, L. L., Kühnel, L., Darkner, Sune, Sørensen, L. & Nielsen, Mads, 2017, Medical Computer Vision and Bayesian and Graphical Models for Biomedical Imaging: MICCAI 2016 International Workshops, MCV and BAMBI, Athens, Greece, October 21, 2016, Revised Selected Papers. Müller, H., Kelm, B. M., Arbel, T., Cai, W., Cardoso, M. J., Langs, G., Menze, B., Metaxas, D., Montillo, A., Wells, W. M., Zhang, S., Chung, A. C. S., Jenkinson, M. & Ribbens, A. (red.). Springer, s. 151-159 9 s. (Lecture notes in computer science, Bind 10081).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    First-in-man mesenchymal stem cells for radiation-induced xerostomia (MESRIX): study protocol for a randomized controlled trial.

    Grønhøj, C., Jensen, D. H., Glovinski, P. V., mpw981, M., Jensen, A. B., Oliveri, R. S., Specht, Lena, Thomsen, Carsten, Darkner, Sune, Kiss, K., Fischer-Nielsen, Anne & von Buchwald, Christian, 2017, I: Trials. 18, 1, 10 s., 108.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. 2016
  34. Udgivet

    The minimal energetic requirement of sustained awareness after brain injury

    Stender, Johan, Mortensen, Kristian Nygaard, Thibaut, A., Darkner, Sune, Laureys, S., Gjedde, Albert & Kupers, Ron, 6 jun. 2016, I: Current Biology. 26, 11, s. 1494-1499 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Combining the boundary shift integral and tensor-based morphometry for brain atrophy estimation

    Michalkiewicz, M. D., Pai, A. S. U., Leung, K. K., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, Medical imaging 2016: Image processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 978406. (Progress in Biomedical Optics and Imaging).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Deformation-based atrophy computation by surface propagation and its application to Alzheimer’s disease

    Pai, A. S. U., Sporring, Jon, Darkner, Sune, Dam, Erik Bjørnager, Lillholm, Martin, Jørgensen, D., Oh, J., Chen, G., Suhy, J., Sørensen, L. & Nielsen, Mads, 2016, I: SPIE Journal of Medical Imaging. 3, 1, 11 s., 014005.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Finding significantly connected voxels based on histograms of connection strengths

    Kasenburg, N., Pedersen, M. V. & Darkner, Sune, 2016, Medical Imaging 2016: Image Processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. 978431. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 39, Bind 17).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Kernel bundle diffeomorphic image registration using stationary velocity fields and Wendland basis functions

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, I: IEEE transactions on medical imaging. 35, 6, s. 1369-1380 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Structural parcellation of the thalamus using shortest-path tractography

    Kasenburg, N., Darkner, Sune, Hahn, U., Liptrot, M. G. & Feragen, Aasa, 2016, 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 559-563 5 s. 7493330

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  40. 2015
  41. Udgivet

    Adaptive time-stepping in dieomorphic image registration with bounded inverse consistency error

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015) . INRIA, s. 35-47

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Adaptive time-stepping in diffeomorphic image registration with bounded inverse consistency error

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L. E. B. L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, The 18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention: proceedings. Technische Universität München , s. 35-47 13 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Automatic correction of dental artifacts in PET/MRI

    Ladefoged, C. N., Andersen, F. L., Keller, S., Beyer, T., Law, I., Højgaard, Liselotte, Darkner, Sune & Lauze, Francois Bernard, 2015, I: SPIE Journal of Medical Imaging. 2, 2, 13 s., 024009.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Comparison of several computational pipelines for atrophy computation in longitudinal Alzheimers studies

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L. E. B. L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Diffeomorphic image registration with automatic time-step adjustment

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, 2015 IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 1085-1088 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Image registration using stationary velocity fields parameterized by norm-minimizing Wendland kernel

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Medical Imaging 2015: Image Processing. SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. (Proceedings of S P I E - International Society for Optical Engineering, Bind 9413).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Locally orderless registration for diffusion weighted images

    Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard, Nielsen, Mads & Darkner, Sune, 2015, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2015: 18th international conference, Munich, Germany, October 5-9, 2015, Proceedings, Part II. Navab, N., Hornegger, J., Wells, W. M. & Frangi, A. F. (red.). Springer, s. 305-312 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 9350).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Multimodal brain extraction from structural MRI using co-registered FDG-PET

    Jensen, H. G., Federspiel, F. V. K., Ptito, Maurice, Nielsen, Mads, Gjedde, Albert, Keller, S. H., Law, Ian, Kupers, Ron & Darkner, Sune, 2015. 12 s.

    Publikation: KonferencebidragPaperForskning

  49. 2014
  50. Udgivet

    Automatic FDG-PET-based tumor and metastatic lymph node segmentation in cervical cancer

    Rodríguez Arbonès, D., Jensen, H. G., Loft, A., af Rosenschöld, P. M., Hansen, Anders Elias, Igel, Christian & Darkner, Sune, 2014, Medical Imaging 2014: Image Processing. Ourselin, S. & Styner, M. A. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 8 s. 903441. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 35, Bind 15).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Conforming contact manifolds for multibody simulations

    Visseq, V., Bonde, U., Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2014. 2 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  52. Udgivet

    Estimating the thickness of ultra thin sections for electron microscopy by image statistics

    Sporring, Jon, Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R. & Jensen, E. B. V., 2014, 2014 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. IEEE, s. 157-160 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    Stepwise inverse consistent Euler’s scheme for diffeomorphic image registration

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2014, Biomedical Image Registration: 6th International Workshop, WBIR 2014, London, UK, July 7-8, 2014. Proceedings. Ourselin, S. & Modat, M. (red.). Springer, s. 223-230 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8545).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P75-P76 2 s., IC-P-131.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P414 1 s., P1-285.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  56. 2013
  57. Udgivet

    3D estimation of synaptic vesicle distributions in serial section transmission electron microscopy

    Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R. & Sporring, Jon, 8 jun. 2013. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    Automatic measurement of wrist synovitis from contrast-enhanced MRI: a registration-centered approach

    Mysling, P., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Dam, E. & Lillholm, Martin, 2013, Medical Imaging 2013: Image Processing. Ourselin, S. & Haynor, D. R. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 86692U. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 36, Bind 14).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    Cube propagation for focal brain atrophy estimation

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Mysling, P., Jørgensen, D. R., Dam, E. B., Lillholm, Martin, Oh, J., Chen, G., Suhy, J., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, 2013 IEEE 10th International Symposium on Biomedical Imaging. IEEE, s. 402-405 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 18038443