Simon Rasmussen
Lektor, gruppeleder, Professor
Rasmussen Group
Blegdamsvej 3B, Bygning: 06-2-24
2200 København N
Rasmussen Group
- 2016
Metagenomic analysis of rapid gravity sand filter microbial communities suggests novel physiology of Nitrospira spp
Palomo, A., Jane Fowler, S., Gülay, A., Rasmussen, Simon, Sicheritz-Ponten, T. & Smets, B. F., nov. 2016, I: I S M E Journal. 10, 11, s. 2569-2581 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole genome sequencing as a tool for phylogenetic analysis of clinical strains of Mitis group streptococci
Rasmussen, L. H., Dargis, R., Højholt, K., Christensen, J. J., Skovgaard, O., Justesen, U. S., Rosenvinge, F. S., Moser, Claus Ernst, Lukjancenko, O., Rasmussen, Simon & Nielsen, X. C., okt. 2016, I: European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 35, 10, s. 1615-1625Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Alpha proteobacterial ancestry of the [Fe-Fe]-hydrogenases in anaerobic eukaryotes
Degli Esposti, M., Cortez, D., Lozano, L., Rasmussen, Simon, Nielsen, H. B. & Martinez Romero, E., 30 jul. 2016, I: Biology Direct. 11, s. 34Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A genomic history of aboriginal Australia
Malaspinas, A. S., Westaway, M. C., Muller, C. E., Sousa, V. C., Lao, O., Alves, I., Bergström, A., Athanasiadis, G., Cheng, J. Y., Crawford, J. E., Heupink, T. H., Macholdt, E., Peischl, S., Rasmussen, S., Schiffels, S., Subramanian, S., Wright, J. L., Albrechtsen, A., Barbieri, C., Dupanloup, I. & 55 flere, , 2016, I: Nature. 538, 7624, s. 207-214 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dhurrin metabolism in the developing grain of Sorghum bicolor (L.) Moench investigated by metabolite profiling and novel clustering analyses of time-resolved transcriptomic data
Nielsen, L. J., Stuart, P., Picmanova, M., Rasmussen, Simon, Olsen, C. E., Harholt, J., Møller, Birger Lindberg & Bjarnholt, Nanna, 2016, I: BMC Genomics. 17, 24 s., 1021.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
Reads2Type: a web application for rapid microbial taxonomy identification
Saputra, D., Rasmussen, Simon, Larsen, M. V., Haddad, N., Sperotto, M. M., Aarestrup, F. M., Lund, O. & Sicheritz-Pontén, T., 25 nov. 2015, I: BMC Bioinformatics. 16, 398.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Meta-genomic analysis of toilet waste from long distance flights; a step towards global surveillance of infectious diseases and antimicrobial resistance
Nordahl Petersen, T., Rasmussen, Simon, Hasman, H., Carøe, C., Bælum, J., Schultz, A. C., Bergmark, L., Svendsen, C. A., Lund, O., Sicheritz-Pontén, T. & Aarestrup, F. M., 10 jul. 2015, I: Scientific Reports. 5, s. 11444Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Discovery, genotyping and characterization of structural variation and novel sequence at single nucleotide resolution from de novo genome assemblies on a population scale
Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Belling, K. G. & Rasmussen, Simon, 2015, I: GigaScience. 4, 13 s., 64.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Early divergent strains of Yersinia pestis in Eurasia 5,000 years ago
Rasmussen, S., Allentoft, M. E., Nielsen, K., Orlando, L. A. A., Sikora, M., Sjögren, K-G., Pedersen, A. G., Schubert, M., Van Dam, A., Kapel, C. M. O., Nielsen, H. B., Brunak, S., Avetisyan, P., Epimakhov, A., Khalyapin, M. V., Gnuni, A., Kriiska, A., Lasak, I., Metspalu, M., Moiseyev, V. & 11 flere, , 2015, I: Cell. 163, 3, s. 571-582 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans
Raghavan, M., Steinrücken, M., Harris, K., Schiffels, S., Rasmussen, S., DeGiorgio, M., Albrechtsen, A., Valdiosera Morales, C. E., Avila Arcos, M. D. C., Malaspinas, A. S., Eriksson, A., Moltke, I., Metspalu, M., Homburger, J. R., Wall, J., Cornejo, O. E., Moreno Mayar, J. V., Korneliussen, T. S., Pierre, T. L., Rasmussen, M. & 81 flere, , 2015, I: Science (New York, N.Y.). 349, 6250, 6250.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 204201681
Flest downloads
-
1360
downloads
Genome-scale cold stress response regulatory networks in ten Arabidopsis thaliana ecotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
605
downloads
Bifidobacterium bifidum actively changes the gene expression profile induced by Lactobacillus acidophilus in murine dendritic cells
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
429
downloads
Discovery, genotyping and characterization of structural variation and novel sequence at single nucleotide resolution from de novo genome assemblies on a population scale
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet