Ole Winther

Ole Winther

Professor MSO, Gæsteprofessor


  1. 2023
  2. Udgivet

    Molecular Representations in Machine-Learning-Based Prediction of PK Parameters for Insulin Analogs

    Einarson, K. A., Bendtsen, K. M., Li, K., Thomsen, M., Kristensen, N. R., Winther, Ole, Fulle, S., Clemmensen, L. & Refsgaard, H. H. F., 2023, I: ACS Omega. 8, 26, s. 23566-23578 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    RNA trafficking and subcellular localization—a review of mechanisms, experimental and predictive methodologies

    Wang, Jun, Horlacher, M., Cheng, L. & Winther, Ole, 2023, I: Briefings in Bioinformatics. 24, 5, 14 s., bbad249.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Towards in silico CLIP-seq: predicting protein-RNA interaction via sequence-to-signal learning

    Horlacher, M., Wagner, N., Moyon, L., Kuret, K., Goedert, N., Salvatore, Marco, Ule, J., Gagneur, J., Winther, Ole & Marsico, A., 2023, I: Genome Biology. 24, 1, 37 s., 180.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Transfer learning identifies sequence determinants of cell-type specific regulatory element accessibility

    Salvatore, Marco, Horlacher, M., Marsico, A., Winther, Ole & Andersson, Robin, 2023, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 5, 2, 10 s., 026.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Uncertainty-aware and explainable machine learning for early prediction of battery degradation trajectory

    Rieger, L. H., Flores, E., Nielsen, K. F., Norby, P., Ayerbe, E., Winther, Ole, Vegge, T. & Bhowmik, A., 2023, I: Digital Discovery. 2, 1, s. 112-122 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Variational Open-Domain Question Answering

    Liévin, V., Motzfeldt, A. G., Jensen, I. R. & Winther, Ole, 2023, I: Proceedings of Machine Learning Research. 202, s. 20950-20977 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  8. 2022
  9. Udgivet

    Calibrated uncertainty for molecular property prediction using ensembles of message passing neural networks

    Busk, J., Jørgensen, P. B., Bhowmik, A., Schmidt, M. N., Winther, Ole & Vegge, T., 2022, I: Machine Learning: Science and Technology. 3, 1, 12 s., 015012.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models

    Thumuluri, V., Almagro Armenteros, J. J., Johansen, A. R., Nielsen, H. & Winther, Ole, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W228-W234

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Interpretable autoencoders trained on single cell sequencing data can transfer directly to data from unseen tissues

    Walbech, J. S., Kinalis, S., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: Cells. 11, 12 s., 85.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    NetSurfP-3.0: accurate and fast prediction of protein structural features by protein language models and deep learning

    Høie, M. H., Kiehl, E. N., Petersen, Bent, Nielsen, M., Winther, Ole, Nielsen, H., Hallgren, J. & Marcatili, P., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W510-W515 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 171145930