Nicolai Krogh

Nicolai Krogh

Adjunkt


  1. 2024
  2. Udgivet

    GPATCH4 regulates rRNA and snRNA 2′-O-methylation in both DHX15-dependent and DHX15-independent manners

    Kanwal, N., Krogh, Nicolai, Memet, I., Lemus-Diaz, N., Thomé, C. C., Welp, L. M., Mizi, A., Hackert, P., Papantonis, A., Urlaub, H., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2024, I: Nucleic Acids Research. 52, 4, s. 1953-1974 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    Loss of N-terminal acetyltransferase A activity induces thermally unstable ribosomal proteins and increases their turnover in Saccharomyces cerevisiae

    Hernández Guzmán, Ulises, Aksnes, H., Ree, R., Krogh, Nicolai, Jakobsson, M. E., Jensen, Lars Juhl, Arnesen, T. & Olsen, Jesper Velgaard, 2023, I: Nature Communications. 14, 4517.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  5. Udgivet
  6. 2021
  7. Udgivet

    Spatial-proteomics reveal in-vivo phospho-signaling dynamics at subcellular resolution

    Martinez Del Val, Ana, Bekker-Jensen, D. B., Steigerwald, S., Mehta, A., Tran, T., Sikorski, K., Torres Vega, Estefania, Kwasniewicz, E., Brynjólfsdóttir, S. H., Frankel, Lisa, Kjøbsted, Rasmus, Krogh, Nicolai, Lundby, Alicia, Bekker-Jensen, Simon Holst, Lund-Johansen, F. & Olsen, Jesper Velgaard, 2 feb. 2021, bioRxiv, s. 1-34, 34 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  8. Udgivet

    Impaired Vitamin D Signaling in T Cells From a Family With Hereditary Vitamin D Resistant Rickets

    Al-Jaberi, F. A. H., Kongsbak-Wismann, Martin, Aguayo-Orozco, A., Krogh, Nicolai, Buus, Terkild Brink, Lopez, D. V., Rode, A. K. O., Gravesen, E., Ølgaard, Klaus, Brunak, Søren, Woetmann, Anders , Ødum, Niels, Bonefeld, Charlotte Menne & Geisler, Carsten, 2021, I: Frontiers in Immunology. 12, 11 s., 684015.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  9. Udgivet

    RNA helicase-mediated regulation of snoRNP dynamics on pre-ribosomes and rRNA 2'-O-methylation

    Aquino, G. R. R., Krogh, Nicolai, Hackert, P., Martin, R., Gallesio, J. D., van Nues, R. W., Schneider, C., Watkins, N. J., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 7, s. 4066-4084 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Regulation of translation by site-specific ribosomal RNA methylation

    Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Altinel, Kübra, Tehler, D. E., Krogh, Nicolai, Jakobsen, Emil, Andersen, Jens Velde, Andersen, Kasper Langebjerg, Schoof, E., Ménard, Patrice, Nielsen, Henrik & Lund, Anders H., 2021, I: Nature Structural and Molecular Biology. 28, 11, s. 889-899

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Spatial-proteomics reveals phospho-signaling dynamics at subcellular resolution

    Martinez Del Val, Ana, Bekker-Jensen, D. B., Steigerwald, S., Koenig, Claire, Østergaard, Ole, Mehta, A., Tran, T., Sikorski, K., Torres Vega, Estefania, Kwasniewicz, E., Brynjólfsdóttir, S. H., Frankel, Lisa, Kjøbsted, Rasmus, Krogh, Nicolai, Lundby, Alicia, Bekker-Jensen, Simon Holst, Lund-Johansen, F. & Olsen, Jesper Velgaard, 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 17 s., 7113.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  12. Udgivet

    The Lariat Capping Ribozyme

    Nielsen, Henrik, Krogh, Nicolai, Masquida, B. & Johansen, S. D., 2021, Ribozymes: Principles, Methods, Applications. Müller, S., Masquida, B. & Winkler, W. (red.). Wiley, Bind 2. s. 117-142

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    The RNA helicase Dbp7 promotes domain V/VI compaction and stabilization of inter-domain interactions during early 60S assembly

    Aquino, G. R. R., Hackert, P., Krogh, Nicolai, Pan, K. T., Jaafar, M., Henras, A. K., Nielsen, Henrik, Urlaub, H., Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nature Communications. 12, 6152.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  14. Udgivet

    The small Cajal body-specific RNA 15 (SCARNA15) directs p53 and redox homeostasis via selective splicing in cancer cells

    Beneventi, G., Munita, R., Cao Thi Ngoc, P., Madej, M., Cieśla, M., Muthukumar, S., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Swaminathan, V. & Bellodi, C., 2021, I: NAR Cancer. 3, 3, zcab026.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Use of a Lariat Capping Ribozyme to Study Cap Function In Vivo

    Pietschmann, M., Tempel, G., Halladjian, Maral, Krogh, Nicolai & Nielsen, Henrik, 2021, Ribozymes: Methods and Protocols. Humana Press, Bind 2167. s. 271-285 15 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2167).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  16. 2020
  17. Udgivet

    Profiling of ribose methylations in ribosomal RNA from diffuse large B-cell lymphoma patients for evaluation of ribosomes as drug targets

    Krogh, Nicolai, Asmar, F., Côme, Christophe Roger Michel, Fibiger Munch-Petersen, H., Grønbæk, Kirsten & Nielsen, Henrik, 4 dec. 2020, I: NAR Cancer. 2, 4, 11 s., zcaa035.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  18. Udgivet

    The shift from early to late types of ribosomes in zebrafish development involves changes at a subset of rRNA 2'-O-Me sites

    Ramachandran, S., Krogh, Nicolai, Jørgensen, T. E., Johansen, S. D., Nielsen, Henrik & Babiak, I., dec. 2020, I: R N A. 26, 12, s. 1919-1934 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Developmental changes of rRNA ribose methylations in the mouse

    Hebras, J., Krogh, Nicolai, Marty, V., Nielsen, Henrik & Cavaillé, J., 2020, I: RNA Biology. 17, 1, s. 150-164 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  20. Udgivet

    RRP7A links primary microcephaly to dysfunction of ribosome biogenesis, resorption of primary cilia, and neurogenesis

    Farooq, M., Lindbæk, L., Krogh, N., Doganli, C., Keller, C., Mönnich, M., Gonçalves, A. B., Sakthivel, S., Mang, Y., Fatima, A., Andersen, V. S., Hussain, M. S., Eiberg, H., Hansen, L., Kjaer, K. W., Gopalakrishnan, J., Pedersen, L. B., Møllgård, K., Nielsen, H., Baig, S. M. & 3 flere, Tommerup, Niels, Christensen, Søren Tvorup & Larsen, Lars Allan, 2020, I: Nature Communications. 11, 16 s., 5816.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Re-assessment of the involvement of snord115 in the serotonin 2c receptor pathway in a genetically relevant mouse model

    Hebras, J., Marty, V., Personnaz, J., Mercier, P., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Aguirrebengoa, M., Seitz, H., Pradère, J., Guiard , B. P. & Cavaillé, J., 2020, I: eLife. 9, s. 1-34 34 s., e60862.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  22. Udgivet

    ZAKα Recognizes Stalled Ribosomes through Partially Redundant Sensor Domains

    Vind, Anna Constance, Snieckute, Goda, Blasius, Melanie, Tiedje, C., Krogh, Nicolai, Bekker-Jensen, D. B., Andersen, Kasper Langebjerg, Nordgaard, C., Tollenaere, M. A. X., Lund, Anders H., Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, Henrik & Bekker-Jensen, Simon Holst, 2020, I: Molecular Cell. 78, 4, s. 700-713.E7

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  23. 2019
  24. Udgivet

    Sequencing-based methods for detection and quantitation of ribose methylations in RNA

    Krogh, Nicolai & Nielsen, Henrik, 2019, I: Methods. 156, s. 5-15

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  25. 2018
  26. Udgivet

    SIRT7-Dependent Deacetylation of Fibrillarin Controls Histone H2A Methylation and rRNA Synthesis during the Cell Cycle

    Iyer-Bierhoff, A., Krogh, Nicolai, Tessarz, P., Ruppert, T., Nielsen, Henrik & Grummt, I., 2018, I: Cell Reports. 25, 11, s. 2946-2954

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  27. Udgivet

    The No-Go and Nonsense-Mediated RNA Decay Pathways Are Regulated by Inflammatory Cytokines in Insulin-Producing Cells and Human Islets and Determine β-Cell Insulin Biosynthesis and Survival

    Ghiasi, S. M., Krogh, Nicolai, Tyrberg, B. & Mandrup-Poulsen, Thomas, 2018, I: Diabetes. 67, 10, s. 2019-2037 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  28. 2017
  29. Udgivet

    RNA modifications contribute a new level of specialization to ribosomes and spliceosomes in yeast and human

    Krogh, Nicolai, 9 nov. 2017, Copenhagen University.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  30. Udgivet

    Lariat capping as a tool to manipulate the 5' end of individual yeast mRNA species in vivo

    Krogh, Nicolai, Pietschmann, M., Schmid, M., Jensen, T. H. & Nielsen, Henrik, 2017, I: R N A. 23, 5, s. 683-695 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  31. Udgivet

    RiboMeth-seq: Profiling of 2'-O-Me in RNA

    Krogh, Nicolai, Birkedal, U. & Nielsen, Henrik, 2017, RNA Methylation. Springer, Bind 1562. s. 189-209 21 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1562).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Substoichiometric ribose methylations in spliceosomal snRNAs

    Krogh, Nicolai, Kongsbak-Wismann, Martin, Geisler, Carsten & Nielsen, Henrik, 2017, I: Organic and Biomolecular Chemistry. 15, 42, s. 8872-8876 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  33. 2016
  34. Udgivet

    Profiling of 2'-O-Me in human rRNA reveals a subset of fractionally modified positions and provides evidence for ribosome heterogeneity

    Krogh, Nicolai, Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Tehler, D., Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Lund, Anders H. & Nielsen, Henrik, 19 sep. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 16, s. 7884-7895

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Methods for Determination of 2′-O-Me in RNA

    Birkedal, U., Krogh, Nicolai, Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 30 jul. 2016, Modified Nucleic Acids in Biology and Medicine. Jurga, S., Erdmann, V. A. & Barciszewski, J. (red.). switzerland: Springer Science+Business Media, s. 187-205 (RNA Technologies).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  36. 2015
  37. Udgivet

    Profiling of Ribose Methylations in RNA by High-Throughput Sequencing

    Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Krogh, Nicolai, Radhakrishnan, S., Gorodkin, Jan & Nielsen, Henrik, 7 jan. 2015, I: Angewandte Chemie (International ed. in English). 54, 2, s. 451-455 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

ID: 32060428