Lili Niu

Lili Niu

Postdoc

Medlem af:


    1. 2024
    2. Udgivet

      Full Mass Range ΦSDM Orbitrap Mass Spectrometry for DIA Proteome Analysis

      Steigerwald, S., Sinha, A., Fort, K. L., Zeng, W., Niu, Lili, Wichmann, C., Kreutzmann, A., Mourad, D., Aizikov, K., Grinfeld, D., Makarov, A., Mann, Matthias & Meier, F., 2024, I: Molecular and Cellular Proteomics. 12 s., 100713.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. 2023
    4. Udgivet

      Discovery of drug-omics associations in type 2 diabetes with generative deep-learning models: [with Author Correction]

      Allesøe, R. L., Lundgaard, A. T., Hernández Medina, R., Aguayo-Orozco, A., Johansen, J., Nissen, J. N., Brorsson, C., Mazzoni, G., Niu, L., Biel, J. H., Brasas, V., Webel, H., Benros, M. E., Pedersen, A. G., Chmura, P. J., Jacobsen, U. P., Mari, A., Koivula, R., Mahajan, A., Vinuela, A. & 31 flere, Tajes, J. F., Sharma, S., Haid, M., Hong, M., Musholt, P. B., De Masi, F., Vogt, J., Pedersen, H. K., Gudmundsdottir, V., Jones, A., Kennedy, G., Bell, J., Thomas, E. L., Frost, G., Thomsen, Henrik S., Hansen, E., Hansen, T. H., drb459, drb459, Muilwijk, M., Blom, M. T., 't Hart, L. M., Pattou, F., Raverdy, V., Brage, S., Ridderstråle, M., Pedersen, Oluf Borbye, Hansen, Torben, Banasik, Karina, Rasmussen, Simon, Brunak, Søren & IMI-DIRECT consortium, I. C., 2023, I: Nature Biotechnology. 41, 3, s. 399–408 18 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. 2022
    6. Udgivet

      A knowledge graph to interpret clinical proteomics data

      Santos, A., Colaço, A. R., Nielsen, A. B., Niu, Lili, Strauss, Maximilian, Geyer, P. E., Coscia, F., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Mundt, F., Jensen, Lars Juhl & Mann, Matthias, 2022, I: Nature Biotechnology. 40, s. 692–702

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Dynamic human liver proteome atlas reveals functional insights into disease pathways

      Niu, Lili, Geyer, P. E., Gupta, R., Santos, A., Meier, F., Doll, S., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Klein, S., Ortiz, C., Uschner, F. E., Schierwagen, R., Trebicka, J. & Mann, Matthias, 2022, I: Molecular Systems Biology. 18, 5, 24 s., e10947.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Integrated Liver and Plasma Proteomics in Obese Mice Reveals Complex Metabolic Regulation

      Stocks, Ben Nicholas, Gonzalez-Franquesa, A., Borg, M. L., Björnholm, M., Niu, Lili, Zierath, Juleen R & Deshmukh, Atul Shahaji, 2022, I: Molecular and Cellular Proteomics. 21, 3, 19 s., 100207.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Noninvasive proteomic biomarkers for alcohol-related liver disease

      Niu, Lili, Thiele, M., Geyer, P. E., Rasmussen, D. N., Webel, Henry, Santos, A., Gupta, R., Meier, F., Strauss, Maximilian, Kjaergaard, M., Lindvig, K., Jacobsen, S., Rasmussen, Simon, Hansen, Torben, Krag, A. & Mann, Matthias, 2022, I: Nature Medicine. 28, 6, s. 1277-1287 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. 2021
    11. Udgivet

      Defining NASH from a multi-omics systems biology perspective

      Niu, Lili, Sulek, K., Vasilopoulou, C. G., Santos, A., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Rasmussen, Simon, Meier, F. & Mann, Matthias, 2021, I: Journal of Clinical Medicine. 10, 20, 22 s., 4673.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Hepatocyte-specific perturbation of NAD+ biosynthetic pathways in mice induces reversible nonalcoholic steatohepatitis-like phenotypes

      Dall, M., Hassing, Anna Skab, Niu, Lili, Nielsen, Thomas Svava, Ingerslev, L. R., Sulek, K., Trammell, Sam, Gillum, M. P., Barrès, Romain, Larsen, Steen, Poulsen, Steen Seier, Mann, Matthias, Ørskov, Cathrine & Treebak, Jonas Thue, 2021, I: Journal of Biological Chemistry. 297, 6, 26 s., 101388.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. 2020
    14. Udgivet

      Plasma proteome profiles treatment efficacy of incretin dual agonism in diet-induced obese female and male mice

      Sachs, S., Niu, Lili, Geyer, P., Jall, S., Kleinert, Maximilian, Feuchtinger, A., Stemmer, K., Brielmeier, M., Finan, B., DiMarchi, R. D., Tschop, M. H., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Mann, Matthias, Mueller, T. D. & Hofmann, S. M., 2020, I: Diabetes, Obesity and Metabolism. 23, 1, s. 195-207 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin

      Dyring-Andersen, Beatrice, Løvendorf, M. B., Coscia, F., Santos, A., Møller, L. B. P., Colaço, A. R., Niu, Lili, Bzorek, M., Doll, S., Andersen, J. L., Clark, R. A., Skov, Lone, Teunissen, M. B. M. & Mann, Matthias, 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 5587.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. 2019
    17. Udgivet

      Plasma proteome profiling discovers potential biomarkers of non-alcoholic fatty liver disease

      Niu, Lili, Gupta, R., Geyer, P. E., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Gluud, Lise Lotte, Santos, A., Doll, S., Holst, Jens Juul, Knop, Filip Krag, Vilsbøll, Tina, Junker, A., Sachs, S., Stemmer, K., Mueller, T. D., Tschoep, M. H., Hofmann, S. M. & Mann, Matthias, aug. 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S71 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

    18. Udgivet

      A spatially resolved proteomic atlas of human skin and its associated immune system

      Dyring-Andersen, Beatrice, Coscia, F., Santos, A., Løvendorf, M. B., Sørensen, L. B. P., Niu, Lili, Andersen, J. L., Clark, R., Skov, L., Teunissen, M. B. & Mann, Matthias, 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S259 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

    19. Udgivet

      A spatially resolved proteomic atlas of psoriatic skin

      Dyring-Andersen, Beatrice, Lovendorf, M. B., Santos, A., Coscia, F., Sørensen, L. B. P., Niu, Lili, Andersen, J. L., Teunissen, M. B., Skov, L. & Mann, Matthias, 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S260 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

    20. Udgivet

      Plasma Proteome Profiling to detect and avoid sample-related biases in biomarker studies

      Geyer, P. E., Voytik, E., Treit, P. V., Doll, S., Kleinhempel, A., Niu, Lili, Müller, J. B., Buchholtz, M., Bader, J. M., Teupser, D., Holdt, L. M. & Mann, Matthias, 2019, I: EMBO Molecular Medicine. 11, 11, e10427.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. Udgivet

      Plasma proteome profiling discovers novel proteins associated with non-alcoholic fatty liver disease

      Niu, Lili, Geyer, P. E., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Gluud, Lise Lotte, Santos, A., Doll, S., Treit, P. V., Holst, Jens Juul, Knop, Filip Krag, Vilsbøll, Tina, Junker, A., Sachs, S., Stemmer, K., Müller, T. D., Tschöp, M. H., Hofmann, S. M. & Mann, Matthias, 2019, I: Molecular Systems Biology. 15, 16 s., e8793.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      Quick and clean: Cracking sentences encoded in E. coli by LC-MS/MS, de novo sequencing, and dictionary search

      Niu, Lili & Mann, Matthias, 2019, I: EuPA Open Proteomics. 22-23, s. 30-35 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. 2018
    24. Udgivet

      Constructing a cell-type resolved human liver proteome atlas: THU-034

      Niu, Lili, Geyer, P. & Mann, Matthias, 2018, I: Journal of Hepatology. 68, s. S138-S139

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      Plasma Proteome Profiling Reveals Dynamics of Inflammatory and Lipid Homeostasis Markers after Roux-En-Y Gastric Bypass Surgery

      Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Geyer, P. E., Doll, S., Treit, P. V., Bojsen-Møller, K. N., Martinussen, C., Jørgensen, N. B., Torekov, Signe Sørensen, Meier, F., Niu, Lili, Santos, A., Keilhauer, E. C., Holst, Jens Juul, Madsbad, Sten & Mann, Matthias, 2018, I: Cell Systems. 7, 6, s. 601-612

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      Proteomics in the Study of Liver Diseases

      Niu, Lili, Geyer, P. E. & Mann, Matthias, 2018, The Human Gut-Liver-Axis in Health and Disease. Krag, A. & Hansen, T. (red.). Springer, s. 165-193

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

    ID: 165028052