Kristoffer Enøe Johansson
Akademisk medarbejder FU
Biomolecular Sciences
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- 2024
- Udgivet
A mutational atlas for Parkin proteostasis
Clausen, L., Voutsinos, Vasileios, Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Grønbæk-Thygesen, Martin, Nariya, S., Powell, R. L., Have, M. K. N., Østergaard, Vibe Hallundbæk, Stein, Amelie, Fowler, D. M., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 17 s., 1541.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conformational ensembles of the human intrinsically disordered proteome
Tesei, Giulio, Trolle, A. I., Jonsson, Nicolas, Betz, J., Knudsen, F. E., Pesce, Francesco, Johansson, Kristoffer Enøe & Lindorff-Larsen, Kresten, 2024, I: Nature. 626, s. 897-904 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Global analysis of multi-mutants to improve protein function
Johansson, Kristoffer Enøe, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 8, 15 s., 168034.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
HSP70-binding motifs function as protein quality control degrons
Abildgaard, A. B., Voutsinos, Vasileios, Petersen, S. D., Larsen, Fia Brunsgaard Valsted, Kampmeyer, Caroline, Johansson, Kristoffer Enøe, Stein, Amelie, Ravid, T., Andréasson, C., Jensen, M. K., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2023, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 80, 1, 17 s., 32.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of Quality-control Degradation Signals in Yeast Proteins
Johansson, Kristoffer Enøe, Mashahreh, B., Hartmann-Petersen, Rasmus, Ravid, T. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 2, 9 s., 167915.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid protein stability prediction using deep learning representations
Blaabjerg, Lasse Møller, Kassem, M. M., Good, L. L., Jonsson, Nicolas, Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Boomsma, Wouter, Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: eLife. 12, 19 s., e82593.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
14-fold increased prevalence of rare glucokinase gene variant carriers in unselected Danish patients with newly diagnosed type 2 diabetes
Gjesing, A. P., Engelbrechtsen, L., Cathrine B. Thuesen, A., Have, C. T., Hollensted, M., Grarup, N., Linneberg, A., Steen Nielsen, J., Christensen, L. B., Thomsen, R. W., Johansson, K. E., Cagiada, M., Gersing, S., Hartmann-Petersen, R., Lindorff-Larsen, K., Vaag, A., Sørensen, H. T., Brandslund, I., Beck-Nielsen, H., Pedersen, O. & 2 flere, , 2022, I: Diabetes Research and Clinical Practice. 194, 9 s., 110159.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conserved degronome features governing quality control associated proteolysis
Mashahreh, B., Armony, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Chappleboim, A., Friedman, N., Gardner, R. G., Hartmann-Petersen, Rasmus, Lindorff-Larsen, Kresten & Ravid, T., 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 13 s., 7588.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Increasing protein stability by inferring substitution effects from high-throughput experiments
Norrild, R. K., Johansson, Kristoffer Enøe, O'Shea, Charlotte, Morth, J. P., Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2022, I: Cell Reports Methods. 2, 11, 11 s., 100333.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Charge Interactions in a Highly Charge-Depleted Protein
Hervø-Hansen, S., Højgaard, C., Johansson, Kristoffer Enøe, Wang, Yong, Wahni, K., Young, D., Messens, J., Teilum, Kaare, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2021, I: Journal of the American Chemical Society. 143, 6, s. 2500-2508 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational and Experimental Assessment of Backbone Templates for Computational Redesign of the Thioredoxin Fold
Marin, Frederikke Isa, Johansson, Kristoffer Enøe, O'Shea, Charlotte, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2021, I: The Journal of Physical Chemistry B. 125, 40, s. 11141-11149Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Substitutional landscape of a split fluorescent protein fragment using high-density peptide microarrays
Antonescu, O. N., Rasmussen, A., Damm, N. A. M., Heidemann, Ditte Fogh, Popov, R., Nesterov-Mueller, A., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 2021, I: PLoS ONE. 16, 2, 17 s., e0241461.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Understanding the Origins of Loss of Protein Function by Analyzing the Effects of Thousands of Variants on Activity and Abundance
Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Valanciute, A., Nielsen, S. V., Hartmann-Petersen, Rasmus, Yang, J. J., Fowler, D. M., Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: Molecular Biology and Evolution. 38, 8, s. 3235-3246Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Global analysis of protein stability by temperature and chemical denaturation
Hamborg, L., Horsted, E. W., Johansson, Kristoffer Enøe, Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten & Teilum, Kaare, 2020, I: Analytical Biochemistry. 605, 7 s., 113863.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Improving folding properties of computationally designed proteins
Bjerre, B., Nissen, J., Madsen, M., Kamarauskaite, J., Norrild, R. K., Holm, Peter Christoffer, Nordentoft, M. K., O'Shea, Charlotte, Willemoës, Martin, Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 13 dec. 2019, I: Protein Engineering Design and Selection (Print). 32, 3, s. 145-151 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shining light on split fluorescent protein fitness landscapes using peptide array-based deep substitutional scanning
ANTONESCU, O., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 30 jun. 2019.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Comprehensive mapping of GFP structure-function relationship using high-density peptide arrays
Antonescu, O., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 10 jul. 2018.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterization of the hydrodynamics in a miniaturized dissolution apparatus
Johansson, Kristoffer Enøe, Plum, J., Mosleh, M., Madsen, C. M., Rades, Thomas & Mullertz, Anette , 2018, I: Journal of Pharmaceutical Sciences. 107, 4, s. 1095-1103 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein evolution: Hacking an enzyme
Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 2018, I: Nature Chemical Biology. 14, 3, s. 202-204 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural heterogeneity and dynamics in protein evolution and design
Johansson, Kristoffer Enøe & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 157-163 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Tracking dehydration mechanisms in crystalline hydrates with molecular dynamics simulations
Larsen, A. S., Ruggiero, M. T., Johansson, Kristoffer Enøe, Zeitler, J. A. & Rantanen, Jukka, okt. 2017, I: Crystal Growth & Design. 17, 10, s. 5017-5022 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational Dehydration of Crystalline Hydrates Using Molecular Dynamics Simulations
Larsen, A. S., Rantanen, Jukka & Johansson, Kristoffer Enøe, 2017, I: Journal of Pharmaceutical Sciences. 106, 1, s. 348-355 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Local structure in the disordered solid solution of cis- and trans-perinones
Teteruk, J. L., Glinnemann, J., Heyse, W., Johansson, Kristoffer Enøe, van de Streek, J. & Schmidt, M. U., jun. 2016, I: Acta Crystallographica. Section B: Structural Science. B72, s. 416-433 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Revision of the Crystal Structure of the First Molecular Polymorph in History
Johansson, Kristoffer Enøe & Van De Streek, J., 2 mar. 2016, I: Crystal Growth & Design. 16, 3, s. 1366-1370 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A soluble, folded protein without charged amino acid residues
Højgaard, C., Kofoed, C., Espersen, R., Johansson, Kristoffer Enøe, Villa, M., Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten, Teilum, Kaare & Winther, Jakob R., 2016, I: Biochemistry. 55, 28, s. 3949–3956 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template
Johansson, Kristoffer Enøe, Johansen, Nicolai Tidemand, Christensen, S., Horowitz, S., Bardwell, J. C. A., Olsen, Johan Gotthardt, Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, Thomas Wim & Winther, Jakob R., 2016, I: Journal of Molecular Biology. 428, 21, s. 4361-4377 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Distinguishing tautomerism in the crystal structure of (Z)-N-(5-ethyl-2,3-dihydro-1,3,4-thiadiazol-2-ylidene)-4-methylbenzenesulfonamide using DFT-D calculations and (13)C solid-state NMR
Li, X., Bond, A. D., Johansson, Kristoffer Enøe & Van de Streek, J., 15 aug. 2014, I: Acta Crystallographica. Section C: Crystal Structure Communications. C70, Pt 8, s. 784-9 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
A simple probabilistic model of multibody interactions in proteins
Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 81, 8, s. 1340-1350 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure
Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phaistos user manual
Boomsma, Wouter, Bottaro, S., Hamelryck, Thomas Wim, Frellsen, J., Andreetta, C., Borg, M., Harder, T., Johansson, Kristoffer Enøe, Stovgaard, K. & Tian, P., 2013, 90 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Undervisning
- 2012
- Udgivet
Computational Protein Design
Johansson, Kristoffer Enøe, 2012, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 151 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Subtle Monte Carlo updates in dense molecular systems
Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Johansson, Kristoffer Enøe, Andreetta, C., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2012, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 8, 2, s. 695-702 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
Efficient, non-disruptive local moves for Monte Carlo sampling of proteins
Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Johansson, Kristoffer Enøe, Andreetta, C., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2011, Next Generation Statistics in Biosciences: Proceedings of the 30th Leeds Annual Statistical Research (LASR) Workshop. Mardia, K. V., Gusnanto, A., Riley, A. D. & Voss, J. (red.). University of Leeds, s. 127 1 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
- 2010
- Udgivet
Beyond rotamers: a generative, probabilistic model of side chains in proteins
Harder, T., Boomsma, Wouter, Paluszewski, M., Frellsen, J., Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 306Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 11048943
Flest downloads
-
1010
downloads
Beyond rotamers: a generative, probabilistic model of side chains in proteins
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
263
downloads
A soluble, folded protein without charged amino acid residues
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
225
downloads
Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet