Kristian Ebbesen Hanghøj

Kristian Ebbesen Hanghøj

Gæsteforsker


  1. 2024
  2. Udgivet

    African bushpigs exhibit porous species boundaries and appeared in Madagascar concurrently with human arrival

    Balboa, R. F., Bertola, L. D., Brüniche-Olsen, A., Rasmussen, M. S., Liu, X., Besnard, G., Salmona, J., Santander, C. G., He, S., Zinner, D., Pedrono, M., Muwanika, V., Masembe, C., Schubert, M., Kuja, J., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Stæger, F. F., Rakotoarivony, R., Henrique, M. & 14 flere, Lin, Long, Wang, X., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Sinding, Mikkel Holger Strander, Atickem, A., Chikhi, L., Roos, C., Gaubert, P., Siegismund, Hans Redlef, Moltke, Ida, Albrechtsen, Anders & Heller, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 15 s., 172.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Giraffe lineages are shaped by major ancient admixture events

    Bertola, L. D., Quinn, L., Hanghøj, K., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Balboa, R. F., Meisner, J., Bøggild, T., Wang, X., Lin, L., Nursyifa, C., Liu, X., Li, Z., Chege, M., Moodley, Y., Brüniche-Olsen, A., Kuja, J., Schubert, M., Agaba, M., Santander, C. G. & 7 flere, Sinding, Mikkel Holger Strander, Muwanika, V., Masembe, C., Siegismund, Hans Redlef, Moltke, Ida, Albrechtsen, Anders & Heller, Rasmus, 2024, I: Current Biology. 34, 7, s. 1576-1586.e5 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Introgression and disruption of migration routes have shaped the genetic integrity of wildebeest populations

    Liu, X., Lin, L., Sinding, M. H. S., Bertola, L. D., Hanghøj, K., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Schubert, M., Pečnerová, P., Balboa, R. F., Li, Z., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Pinto, R. R., Wang, X., Kuja, J., Brüniche-Olsen, A., Meisner, J., Santander, C. G. & 8 flere, Ogutu, J. O., Masembe, C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Muwanika, V., Siegismund, Hans Redlef, Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida & Heller, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 2921.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Population genomics of the muskox' resilience in the near absence of genetic variation

    Pečnerová, P., Lord, E., Garcia-Erill, G., Hanghøj, K., Rasmussen, M. S., Meisner, J., Liu, X., van der Valk, T., Santander, C. G., Quinn, L., Lin, L., Liu, S., Carøe, C., Dalerum, F., Götherström, A., Måsviken, J., Vartanyan, S., Raundrup, K., Al-Chaer, A., Rasmussen, L. & 11 flere, Hvilsom, C., Heide-Jørgensen, M. P., Sinding, Mikkel Holger Strander, Aastrup, P., Van Coeverden de Groot, P. J., Schmidt, N. M., Albrechtsen, Anders, Dalén, L., Heller, Rasmus, Moltke, Ida & Siegismund, Hans Redlef, 2024, I: Molecular Ecology. 33, 2, 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. 2023
  7. Udgivet
  8. Udgivet

    Estimating admixture pedigrees of recent hybrids without a contiguous reference genome

    Garcia Erill, Genís, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Heller, Rasmus, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2023, I: Molecular Ecology Resources. 23, 7, s. 1604-1619 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. 2022
  10. Udgivet

    An LDLR missense variant poses high risk of familial hypercholesterolemia in 30% of Greenlanders and offers potential of early cardiovascular disease intervention

    Jørsboe, E., Andersen, M. K., Skotte, L., Stæger, F. F., Færgeman, N. J., Hanghøj, K., Santander, C. G., Senftleber, N. K., Diaz, L. J., Overvad, M., Waples, R. K., Geller, F., Bjerregaard, P., Melbye, M., Larsen, C. V. L., Feenstra, B., Anders Koch, K., Jørgensen, M. E., Grarup, N., Moltke, I. & 2 flere, Albrechtsen, Anders & Hansen, Torben, 2022, I: Human Genetics and Genomics Advances. 3, 4, 10 s., 100118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Loss of sucrase-isomaltase function increases acetate levels and improves metabolic health in Greenlandic cohorts

    Andersen, M. K., Skotte, L., Jørsboe, E., Polito, R., Stæger, F. F., Aldiss, P., Hanghøj, K., Waples, R. K., Santander, C. G., Grarup, N., Dahl-Petersen, I. K., Diaz, L. J., Overvad, M., Senftleber, N. K., Søborg, B., Larsen, C. V. L., Lemoine, C., Pedersen, O., Feenstra, B., Bjerregaard, P. & 9 flere, Melbye, M., Jørgensen, M. E., Færgeman, N. J., Koch, A., Moritz, Thomas, Gillum, M. P., Moltke, Ida, Hansen, Torben & Albrechtsen, Anders, 2022, I: Gastroenterology. 162, 4, s. 1171-1182.e3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. 2021
  13. Udgivet

    Detecting selection in low-coverage high-throughput sequencing data using principal component analysis

    Meisner, Jonas, Albrechtsen, Anders & Hanghøj, Kristian Ebbesen, 2021, I: BMC Bioinformatics. 22, 13 s., 470.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet
  15. Udgivet

    NGSremix: A software tool for estimating pairwise relatedness between admixed individuals from next-generation sequencing data

    Nøhr, A. K., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Garcia Erill, Genís, Li, Zilong, Moltke, Ida & Albrechtsen, Anders, 2021, I: G3: Genes, Genomes, Genetics. 11, 8, 8 s., jkab174.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. 2020
  17. Udgivet

    Targeted conservation genetics of the endangered chimpanzee

    Frandsen, P., Fontsere, C., Nielsen, S. V., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Castejon-Fernandez, N., Lizano, E., Hughes, D., Hernandez-Rodriguez, J., Korneliussen, Thorfinn Sand, Carlsen, F., Siegismund, Hans Redlef, Mailund, T., Marques-Bonet, T. & Hvilsom, C., 2020, I: Heredity. 125, 1-2, s. 15-27 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    The derived allele of a novel intergenic variant at chromosome 11 associates with lower body mass index and a favorable metabolic phenotype in Greenlanders

    Andersen, M. K., Jørsboe, E., Skotte, L., Hanghøj, K., Sandholt, C. H., Moltke, I., Grarup, N., Kern, T., Mahendran, Y., Søborg, B., Bjerregaard, P., Larsen, C. V. L., Dahl-Petersen, I. K., Tiwari, H. K., Feenstra, B., Koch, A., Wiener, H. W., Hopkins, S. E., Pedersen, O., Melbye, M. & 4 flere, Boyer, B. B., Jørgensen, M. E., Albrechtsen, Anders & Hansen, Torben, 2020, I: PLOS Genetics. 16, 1, 17 s., e1008544.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. 2019
  20. Udgivet

    Fast and accurate relatedness estimation from high-throughput sequencing data in the presence of inbreeding

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, Moltke, Ida, Andersen, P. A., Manica, A. & Korneliussen, Thorfinn Sand, maj 2019, I: GigaScience. 8, 5, 9 s., giz034.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    DamMet: ancient methylome mapping accounting for errors, true variants, and post-mortem DNA damage

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, Renaud, Gabriel, Albrechtsen, Anders & Orlando, L., 2019, I: GigaScience. 8, 4, 6 s., giz025.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Joint Estimates of Heterozygosity and Runs of Homozygosity for Modern and Ancient Samples

    Renaud, Gabriel, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Korneliussen, Thorfinn Sand, Willerslev, Eske & Orlando, L., 2019, I: Genetics (Print). 212, 3, s. 587-614 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Tracking Five Millennia of Horse Management with Extensive Ancient Genome Time Series

    Fages, A., Hanghøj, K., Khan, N., Gaunitz, C., Seguin-Orlando, A., Leonardi, M., McCrory Constantz, C., Gamba, C., Al-Rasheid, K. A. S., Albizuri, S., Alfarhan, A. H., Allentoft, M., Alquraishi, S., Anthony, D., Baimukhanov, N., Barrett, J. H., Bayarsaikhan, J., Benecke, N., Bernáldez-Sánchez, E., Berrocal-Rangel, L. & 101 flere, Biglari, F., Boessenkool, S., Boldgiv, B., Brem, G., Brown, D., Burger, J., Crubézy, E., Daugnora, L., Davoudi, H., Damgaard, P. D. B., de los Ángeles de Chorro y de Villa-Ceballos, M., Deschler-Erb, S., Detry, C., Dill, N., do Mar Oom, M., Dohr, A., Ellingvåg, S., Erdenebaatar, D., Fathi, H., Felkel, S., Fernández-Rodríguez, C., García-Viñas, E., Germonpré, M., Granado, J. D., Hallsson, J. H., Hemmer, H., Hofreiter, M., Kasparov, A., Khasanov, M., Khazaeli, R., Kosintsev, P., Kristiansen, K., Kubatbek, T., Kuderna, L., Kuznetsov, P., Laleh, H., Leonard, J. A., Lhuillier, J., Liesau von Lettow-Vorbeck, C., Logvin, A., Lõugas, L., Ludwig, A., Luis, C., Arruda, A. M., Marques-Bonet, T., Matoso Silva, R., Merz, V., Mijiddorj, E., Miller, B. K., Monchalov, O., Mohaseb, F. A., Morales, A., Nieto-Espinet, A., Nistelberger, H., Onar, V., Pálsdóttir, A. H., Pitulko, V., Pitskhelauri, K., Pruvost, M., Rajic Sikanjic, P., Rapan Papeša, A., Roslyakova, N., Sardari, A., Sauer, E., Schafberg, R., Scheu, A., Schibler, J., Schlumbaum, A., Serrand, N., Serres-Armero, A., Shapiro, B., Sheikhi Seno, S., Shevnina, I., Shidrang, S., Southon, J., Star, B., Sykes, N., Taheri, K., Taylor, W., Teegen, W. R., Trbojević Vukičević, T., Trixl, S., Tumen, D., Undrakhbold, S., Usmanova, E., Vahdati, A., Valenzuela-Lamas, S., Viegas, C., Wallner, B., Weinstock, J., Zaibert, V., Clavel, B., Lepetz, S., Mashkour, M., Helgason, A., Stefánsson, K., Barrey, E., Willerslev, Eske, Outram, A. K., Librado, P. & Orlando, L., 2019, I: Cell. 177, 6, s. 1419-1435, e1-e31

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2018
  25. Udgivet

    Ancient genomes revisit the ancestry of domestic and Przewalski's horses

    Gaunitz, C., Fages, A. A., Hanghøj, K. E., Albrechtsen, A., Khan, N., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Owens, I. J., Felkel, S., Bignon-Lau, O., Damgaard, P. D. B., Mittnik, A., Mohaseb, A. F., Davoudi, H., Alquraishi, S., Alfarhan, A. H., Al-Rasheid, K. A. S., Crubézy, E., Benecke, N., Olsen, S. & 27 flere, Brown, D., Anthony, D., Massy, K., Pitulko, V., Kasparov, A., Brem, G., Hofreiter, M., Mukhtarova, G., Baimukhanov, N., Lõugas, L., Onar, V., Stockhammer, P. W., Krause, J., Boldgiv, B., Undrakhbold, S., Erdenebaatar, D., Lepetz, S., Mashkour, M., Ludwig, A., Wallner, B., Merz, V., Merz, I., Zaibert, V., Willerslev, Eske, Sanz, P. L., Outram, A. K. & Orlando, L. A. A., 2018, I: Science. 360, 6384, s. 111-114 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Genomic investigations of horse domestication using ancient DNA and a novel statistical method for epigenomic inference from ancient DNA sequencing data

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, 2018, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  27. Udgivet

    Oral health status in historic population: Macroscopic and metagenomic evidence

    Willmann, C., Mata, X., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Tonasso, L., Tisseyre, L., Jeziorski, C., Cabot, E., Chevet, P., Crubézy, E., Orlando, L., Esclassan, R., Thèves, C. & Caramelli, D., 2018, I: PLOS ONE. 13, 5, 18 s., e0196482.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. 2017
  29. Udgivet

    fastNGSadmix: admixture proportions and principal component analysis of a single NGS sample

    Jørsboe, E., Hanghøj, Kristian Ebbesen & Albrechtsen, Anders, 1 okt. 2017, I: Bioinformatics. 33, 19, s. 3148-3150 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Combining bleach and mild predigestion improves ancient DNA recovery from bones

    Boessenkool, S., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Nistelberger, H. M., Der Sarkissian, C., Gondek, A. T., Orlando, L. A. A., Barrett, J. H. & Star, B., jul. 2017, I: Molecular Ecology Resources. 17, 4, s. 742–751 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    gargammel: a sequence simulator for ancient DNA

    Renaud, Gabriel, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Willerslev, Eske & Orlando, L. A. A., 2017, I: Bioinformatics. 33, 4, s. 577-579 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. 2016
  33. Udgivet

    metaBIT, an integrative and automated metagenomic pipeline for analysing microbial profiles from high-throughput sequencing shotgun data

    Louvel, G., Der Sarkissian, C., Hanghøj, Kristian Ebbesen & Orlando, L. A. A., nov. 2016, I: Molecular Ecology Resources. 16, 6, s. 1415-1427 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    The evolutionary origin and genetic makeup of domestic horses

    Sanz, P. L., Fages, A. A., Gaunitz, Charleen, Leonardi, M., Wagner, S., Khan, N., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Alquraishi, S. A., Alfarhan, A. H., Al-Rasheid, K. A., Der Sarkissian, C., Schubert, Mikkel & Orlando, L. A. A., okt. 2016, I: Genetics. 204, 2, s. 423-434 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Clonal yeast biofilms can reap competitive advantages through cell differentiation without being obligatorily multicellular

    Regenberg, Birgitte, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Andersen, K. S. & Boomsma, Jacobus J., 2016, I: Royal Society of London. Proceedings B. Biological Sciences. 283, 1842, 8 s., 20161303.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Comparing the performance of three ancient DNA extraction methods for high-throughput sequencing

    Gamba, C., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Gaunitz, Charleen, Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Bradley, D. G. & Orlando, L. A. A., 2016, I: Molecular Ecology Resources. 16, 2, s. 459-469 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Fast, accurate and automatic ancient nucleosome and methylation maps with epiPALEOMIX

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, Seguin-Orlando, A., Schubert, Mikkel, Madsen, T., Pedersen, J. S., Willerslev, Eske & Orlando, L. A. A., 2016, I: Molecular Biology and Evolution. 33, 12, s. 3284-3298 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 146844414