Kim Sneppen

Kim Sneppen

Professor


  1. 2024
  2. Udgivet

    The dynamics of phage predation on a microcolony

    Eriksen, R. S., Larsen, Frej Andreas Nøhr, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2024, I: Biophysical Journal. 123, 2, s. 147-156 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    The counterintuitive implications of superspreading diseases

    Nielsen, B. F., Sneppen, Kim & Simonsen, L., 31 okt. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 3 s., 6954.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Epigenetic switching with asymmetric bridging interactions

    Skjegstad, L. E. J., Nickels, Jan Fabio, Sneppen, Kim & Kirkegaard, Julius Bier, 20 jun. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 12, s. 2421-2429 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Tradeoff between speed and reproductive number in pathogen evolution

    Eilersen, A. T., Nielsen, Bjarke Frost & Sneppen, Kim, 12 jun. 2023, I: Physical Review Research. 5, 2, 8 s., 023003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Sustainable diversity of phage-bacteria systems

    Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Host heterogeneity and epistasis explain punctuated evolution of SARS-CoV-2

    Nielsen, Bjarke Frost, Saad-roy, C. M., Li, Y., Sneppen, Kim, Simonsen, L., Viboud, C., Levin, S. A., Grenfell, B. T. & Morozov, A. V. (red.), 15 feb. 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 2, 24 s., e1010896.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Jag1-Notch cis-interaction determines cell fate segregation in pancreatic development

    sgk681, sgk681, Seymour, Philip Allan, Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Egeskov-Madsen, A. L. R., Jørgensen, Mette Christine, Jensen, Mogens Høgh & Serup, Palle, 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 348.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  10. 2022
  11. Udgivet

    Emerging diversity in a population of evolving intransitive dice

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 17 nov. 2022, I: Physical Review E. 106, 5, 6 s., 054409.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Lockdowns exert selection pressure on overdispersion of SARS-CoV-2 variants

    Nielsen, Bjarke Frost, Eilersen, A., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 2 sep. 2022, I: Epidemics. 40, 7 s., 100613.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  13. Udgivet

    From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems

    Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Pancreatic alpha and beta cells are globally phase-locked

    Ren, H., Li, Y., Han, C., Yu, Y., Shi, B., Peng, X., Wu, S., Yang, X., Sneppen, Kim, Chen, L., Tang, C. & Zhang, T., 28 jun. 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 16 s., 3721.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Protection of bacteriophage-sensitive Escherichia coli by lysogens

    Brown, Stanley, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2 apr. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 119, 4, e2106005119.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Spatial model of Ebola outbreaks contained by behavior change

    Halvorsen, G. S., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 14 mar. 2022, I: Plos One. 17, 3, 11 s., e0264425.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Emergence of networks of shared restriction-modification systems in phage-bacteria ecosystems

    Eriksen, R. S., Malhotra, N., Seshasayee, A. S. N., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2022, I: Journal of Biosciences. 47, 3, 19 s., 38.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  18. Udgivet

    The transcription factor Atf1 lowers the transition barrier for nucleosome-mediated establishment of heterochromatin

    Nickels, Jan Fabio, Della-Rosa, M. E., Miguelez Goyeneche, I., Charlton, Sebastian Jespersen, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2022, I: Cell Reports. 39, 7, 17 s., 110828.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  19. 2021
  20. Udgivet

    Superspreading quantified from bursty epidemic trajectories

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 16 dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 7 s., 24124.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Differences in social activity increase efficiency of contact tracing

    Nielsen, Bjarke Frost, Sneppen, Kim, Simonsen, L. & Mathiesen, Joachim, 2 okt. 2021, I: European Physical Journal B. 94, 10, 11 s., 209.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The COVID-19 pandemic: key considerations for the epidemic and its control

    Ørskov, S., Nielsen, Bjarke Frost, Føns, S., Sneppen, Kim & Simonsen, L., jul. 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 408-420 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Superspreading of airborne pathogens in a heterogeneous world

    Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 maj 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 9 s., 11191.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts

    Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Overdispersion in COVID-19 increases the effectiveness of limiting nonrepetitive contacts for transmission control

    Sneppen, Kim, Nielsen, Bjarke Frost, Taylor, R. J. & Simonsen, L., 6 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 14, 6 s., 2016623118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  26. Udgivet

    COVID-19 superspreading suggests mitigation by social network modulation

    Nielsen, Bjarke Frost, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 15 mar. 2021, I: Physical Review Letters. 126, 6 s., 118301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterfagfællebedømt

  27. Udgivet

    SARS-CoV-2 superspreading in cities vs the countryside

    Eilersen, A. T. & Sneppen, Kim, 23 feb. 2021, I: A P M I S. Acta Pathologica, Microbiologica et Immunologica Scandinavica. 129, 7, s. 401-407 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Social contagion in a world with asymmetric influence

    Halvorsen, G. S., Pedersen, B. N. & Sneppen, Kim, 3 feb. 2021, I: Physical Review E. 103, 2, 5 s., 022303.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Variability of Individual Infectiousness Derived from Aggregate Statistics of COVID-19

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 15 jan. 2021, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  30. 2020
  31. Udgivet

    On Phage Adsorption to Bacterial Chains

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Cost-benefit of limited isolation and testing in COVID-19 mitigation

    Eilersen, A. & Sneppen, Kim, 29 okt. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 7 s., 18543.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Airborne Pathogens in a Heterogeneous World: Superspreading & Mitigation

    Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 okt. 2020, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikel

  34. Udgivet

    Hitchhiking, collapse, and contingency in phage infections of migrating bacterial populations

    Ping, D., Wang, T., Fraebel, D. T., Maslov, S., Sneppen, Kim & Kuehn, S., 1 aug. 2020, I: ISME Journal. 14, 8, s. 2007-2018 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  35. Udgivet

    The uneasy coexistence of predators and pathogens

    Eilersen, A. T. & Sneppen, Kim, 2 jul. 2020, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 7, 7 s., 42.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Repression of the lysogenic PR promoter in bacteriophage TP901-1 through binding of a CI-MOR complex to a composite OM-OR operator

    Pedersen, M., Neergaard, J. T., Cassias, J., Rasmussen, K. K., Lo Leggio, Leila, Sneppen, Kim, Hammer, K. & Kilstrup, M., 26 maj 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 13 s., 8659.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Optimal Transport Flows for Distributed Production Networks

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 22 maj 2020, I: Physical Review Letters. 124, 20, 5 s., 208101.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Chaos in disease outbreaks among prey

    Eilersen, A. T., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 3 mar. 2020, I: Scientific Reports. 10, 7 s., 3907.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Modelling value bubbles in an attention based economy

    Toftdahl Olesen, C. & Sneppen, Kim, 2 mar. 2020, I: European Physical Journal B. 93, 3, 5 s., 36.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Model to Link Cell Shape and Polarity with Organogenesis

    Nielsen, Bjarke Frost, Nissen, Silas Boye, Sneppen, Kim, Mathiesen, Joachim & Trusina, Ala, 10 jan. 2020, I: iScience. 23, 2, s. 1-10 10 s., 100830.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Kronik: Risikobaseret genåbning af Danmark kan give færre alvorligt syge og en hurtigere genåbning

    Kirkeby, Carsten, Græsbøll, K., Halasa, T., Sneppen, Kim & Christiansen, L. E., 2020, I: Ingenøren.dk.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikel

  42. Udgivet

    Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  43. 2019
  44. Udgivet

    Regime Shifts in a Phage-Bacterium Ecosystem and Strategies for Its Control

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 nov. 2019, I: mSystems. 5, 4(6), e00470-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Self-assembly, buckling and density-invariant growth of three-dimensional vascular networks

    Kirkegaard, Julius Bier, Nielsen, Bjarke Frost, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 31 okt. 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 159, 8 s., 20190517.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent

    Sneppen, Kim & Ringrose, L., 13 maj 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Applying allometric scaling to predator-prey systems

    Eilersen, A. & Sneppen, Kim, 8 feb. 2019, I: Physical Review E. 99, 2, 8 s., 022405.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Exploring the contribution of exposure heterogeneity to the cessation of the 2014 Ebola epidemic

    Uekermann, F., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: PLoS ONE. 14, 2, 11 s., e0210638.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Multi stability and global bifurcations in epidemic model with distributed delay SIRnS-model

    Jensen, G. G., Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: European Physical Journal B. 92, 2, 28.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli

    Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  51. 2018
  52. Udgivet

    Theoretical tool bridging cell polarities with development of robust morphologies

    Nissen, Silas Boye, Rønhild, S., Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 27 nov. 2018, I: eLife. 7, 25 s., e38407.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  53. Udgivet

    Globalization in a nutshell

    Sneppen, Kim & Bornholdt, S., 29 okt. 2018, I: Physical Review E. 98, 4, 6 s., 022314.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Theory of invasion extinction dynamics in minimal food webs

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 12 feb. 2018, I: Physical Review E. 97, 2, 10 s., 022404.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Exploring the Link between Nucleosome Occupancy and DNA Methylation

    Lövkvist, Cecilia, Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 12 jan. 2018, I: Frontiers in Genetics. 8, 7 s., 232.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  56. Udgivet

    A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages

    Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  57. Udgivet

    Deconstructing the principles of ductal network formation in the pancreas

    Dahl-Jensen, Svend Bertel, Yennek, S., Flasse, L., Larsen, Hjalte List, Sever, D., Karremore, G., Novak, Ivana, Sneppen, Kim & Botton, A., 2018, I: PLOS Biology. 16, 7, 25 s., e2002842.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  58. 2017
  59. Udgivet

    Existence and construction of large stable food webs

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 sep. 2017, I: Physical Review E. 96, 3, 032406.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  60. Udgivet

    Severe population collapses and species extinctions in multihost epidemic dynamics

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 22 aug. 2017, I: Physical Review E. 96, 2, 022412.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  61. Udgivet

    Four simple rules that are sufficient to generate the mammalian blastocyst

    Nissen, Silas Boye, Perera Pérez, Marta, Martin Gonzalez, Javier, Morgani, S. M. C., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Brickman, Joshua Mark & Trusina, Ala, 12 jul. 2017, I: PLOS Biology. 15, 7, s. 1-30 e2000737.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  62. Udgivet

    Efficient chromosomal-scale DNA looping in Escherichia coli using multiple DNA-looping elements

    Hao, N., Sneppen, Kim, Shearwin, K. E. & Dodd, I. B., 19 maj 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 9, s. 5074-5085

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  63. Udgivet

    Models of life: epigenetics, diversity and cycles

    Sneppen, Kim, 1 apr. 2017, I: Reports on Progress in Physics. 80, 4, 042601.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  64. Udgivet

    Occlusion of the ribosome binding site connects the translational initiation frequency, mRNA stability and premature transcription termination

    Eriksen, M., Sneppen, Kim, Pedersen, Steen & Mitarai, Namiko, 14 mar. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 7 s., 362.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  65. Udgivet

    Population cycles and species diversity in dynamic Kill-the-Winner model of microbial ecosystems

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 4 jan. 2017, I: Scientific Reports. 7, 39642.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  66. 2016
  67. Udgivet

    Rapid Curtailing of the Stringent Response by Toxin-Antitoxin Encoded mRNases

    Tian, C., Roghanian, Mohammad, Jørgensen, M. G., Sneppen, Kim, Sørensen, Michael Askvad, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, jul. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 14, s. 1918-1926

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  68. Udgivet

    Nucleosome dynamics and maintenance of epigenetic states of CpG islands

    Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 28 jun. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 6, 062417.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  69. Udgivet

    DNA methylation in human epigenomes depends on local topology of CpG sites

    Lövkvist, Cecilia, Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 20 jun. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 11, s. 5123-5132

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  70. Udgivet

    Nanog, Oct4 and Tet1 interplay in establishing pluripotency

    Olariu, V., Lövkvist, Cecilia & Sneppen, Kim, 5 maj 2016, I: Scientific Reports. 6, 25438.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  71. Udgivet

    Diffusion retardation by binding of tobramycin in an alginate biofilm model

    Cao, B., Christophersen, L., Kolpen, Mette, Jensen, Peter Østrup, Sneppen, Kim, Høiby, Niels, Moser, Claus Ernst & Sams, T., 21 apr. 2016, I: P L o S One. 11, 4, 11 s., e0153616.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  72. Udgivet

    Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli

    Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  73. Udgivet

    Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions

    Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  74. Udgivet

    Short-range growth inhibitory signals from the epithelium can drive non-stereotypic branching in the pancreas

    Dahl-Jensen, Svend Bertel, Figueiredo-Larsen, E. M., Botton, A. & Sneppen, Kim, 23 feb. 2016, I: Physical Biology. 13, 1, 016007.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  75. Udgivet

    Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  76. Udgivet

    A cross-immunization model for the extinction of old influenza strains

    Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 2016, I: Scientific Reports. 6, 8 s., 25907.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  77. Udgivet

    Nucleation and spreading of a heterochromatic domain in fission yeast

    Obersriebnig, M. J., Pallesen, E. M. H., Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Thon, Genevieve, 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 11518.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  78. Udgivet

    Stabilization of epigenetic states of CpG islands by local cooperation

    Sormani, G., Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia & Sneppen, Kim, 2016, I: Molecular BioSystems. 12, 7, s. 2142-2146

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  79. 2015
  80. Udgivet

    Diversity Waves in Collapse-Driven Population Dynamics

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 sep. 2015, I: P L o S One. 11, 9, e1004440.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  81. Udgivet

    Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity

    Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  82. Udgivet

    Restriction modification systems as engines of diversity

    Sneppen, Kim, Semsey, S., Seshasayee, A. S. N. & Krishna, S., 2 jun. 2015, I: Frontiers in Microbiology. 6, 528.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  83. Udgivet

    Well-temperate phage: optimal bet-hedging against local environmental collapses

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2 jun. 2015, I: Scientific Reports. 5, 10523.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  84. Udgivet

    Cooperative stabilization of the SIR complex provides robust epigenetic memory in a model of SIR silencing in Saccharomyces cerevisiae

    Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 1 apr. 2015, I: Epigenetics. 10, 4, s. 293-302

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  85. 2014
  86. Udgivet

    Mismatch repair at stop codons is directed independent of GATC methylation on the Escherichia coli chromosome

    Sneppen, Kim & Semsey, S., 5 dec. 2014, I: Scientific Reports. 4, 7436.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  87. Udgivet

    Phage and bacteria support mutual diversity in a narrowing staircase of coexistence

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2014, I: I S M E Journal. 28, 11, s. 2317-2326

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  88. Udgivet

    Models of life: Dynamics and regulation in biological systems

    Sneppen, Kim, 5 okt. 2014, Cambridge University Press udg. Cambridge. 342 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogfagfællebedømt

  89. Udgivet

    Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space

    Mitarai, Namiko, Heinsalu, E. & Sneppen, Kim, 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  90. Udgivet

    Collaboration between CpG sites is needed for stable somatic inheritance of DNA methylation states

    Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia, Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 4, s. 2235-2244

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  91. Udgivet

    Effect of supercoiling on the λ switch

    Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 1 jan. 2014, I: Bacteriophage. 4, 2, s. 1-5 5 s., e27517.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  92. Udgivet

    Modeling rises and falls in money addicted social hierarchies

    Dybiec, B., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2014, I: Physica Scripta. 89, 8, 085002.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  93. 2013
  94. Udgivet

    DNA supercoiling enhances cooperativity and efficiency of an epigenetic switch

    Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 22 okt. 2013, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 110, 43, s. 17386-91 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  95. Udgivet

    Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy

    Cataudella, I., Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 1 aug. 2013, I: PLoS Computational Biology. 9, 8, e1003174.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  96. Udgivet

    Genetic Regulatory Networks that count to 3

    Lehmann, M. & Sneppen, Kim, 1 jul. 2013, I: Journal of Theoretical Biology. 329, s. 15-19 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  97. Udgivet

    Quality control system response to stochastic growth of amyloid fibrils

    Pigolotti, S., Lizana, L., Sneppen, Kim & Otzen, D., 2 maj 2013, I: F E B S Letters. 587, 9, s. 1405-1410 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  98. Udgivet

    Differentiation of developing olfactory neurons analysed in terms of coupled epigenetic landscapes

    Alsing, A. & Sneppen, Kim, 1 maj 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, 9, 4755-4764.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  99. Udgivet

    Labyrinthine clustering in a spatial rock-paper-scissors ecosystem

    Juul, J. S., Sneppen, Kim & Mathiesen, Joachim, 8 apr. 2013, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 87, 4, s. 042702 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  100. 2012
  101. Udgivet

    Specific contacts of the -35 region of the galP1 promoter by RNA polymerase inhibit GalR-mediated DNA looping repression

    Csiszovszki, Z., Lewis, D. E. A., Le, P., Sneppen, Kim & Semsey, S., 1 nov. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 20, s. 10064-10072 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  102. Udgivet

    Axelrod model: accepting or discussing

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 okt. 2012, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 85, 10, s. 357

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  103. Udgivet

    Spreading of multiple epidemics with cross immunization

    Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 13 sep. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 86, 3, Part 2, s. 036108 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  104. Udgivet

    Multistability with a Metastable Mixed State

    Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 5 sep. 2012, I: Physical Review Letters. 109, 10, s. 100602 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  105. Udgivet

    Spatial Structure and Lamarckian Adaptation Explain Extreme Genetic Diversity at CRISPR Locus

    Härter, Jan Olaf Mirko & Sneppen, Kim, 1 aug. 2012, I: mBio. 3, 4, s. e00126

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  106. Udgivet

    Coexistence of phage and bacteria on the boundary of self-organized refuges

    Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 31 jul. 2012, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 31, s. 12828-33 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  107. Udgivet

    Coexistence of phage and bacteria on the boundary of self-organized refuges

    Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 31 jul. 2012, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 109, 31, s. 12828-12833

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  108. Udgivet

    Emergence of diversity in a model ecosystem

    Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  109. Udgivet

    Clonal selection prevents tragedy of the commons when neighbors compete in a rock-paper-scissors game

    Juul, J. S., Sneppen, Kim & Mathiesen, Joachim, 26 jun. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 6, s. 061924 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  110. Udgivet

    Information spreading and development of cultural centers

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 18 maj 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 85, 5, s. 056116 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  111. Udgivet

    Conditional Cooperativity in Toxin-Antitoxin Regulation Prevents Random Toxin Activation and Promotes Fast Translational Recovery

    Cataudella, I., Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 11 apr. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6424-6434

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  112. Udgivet

    Correction to; Why Do Phage Play Dice? (vol 83, pg 11416, 2009)

    Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 1 mar. 2012, I: Journal of Virology. 86, 5, s. 22898-2898 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatfagfællebedømt

  113. Udgivet

    Protein Localization with Flexible DNA or RNA

    Bernhardsson, P. J. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 10 feb. 2012, I: PLoS.ONE.. 7, 2, s. e29218

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 10093