Jon Sporring

Jon Sporring

Professor


  1. 2024
  2. Udgivet

    A semi-automatic method for extracting mitochondrial cristae characteristics from 3D focused ion beam scanning electron microscopy data

    Wang, Chenhao, Østergaard, L., Hasselholt, S. & Sporring, Jon, 2024, I: Communications Biology . 7, 1, 377.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. E-pub ahead of print

    Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain

    Vieira, R., Mariani, J. N., Huynh, N. P. T., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Solly, R., Tate, A., Schanz, S., Cotrupi, N., Mousaei, M., Sporring, Jon, Benraiss, A. & Goldman, Steven Alan, 2024, (E-pub ahead of print) I: Nature Biotechnology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. 2023
  5. Udgivet

    Parametric Volumetric Registration

    Yushkevich, P. A., Zhang, M. & Sporring, Jon, 29 sep. 2023, Medical Image Analysis. Frangi, A., Prince, J. & Sonka, M. (red.). Academic Press, s. 331-354 24 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    A Practical Approach to Estimating the Effect of Synchrotron Radiation on Sperm Motility and Viability

    Lindhøj, M. B., Bonnin, A., Almstrup, K., Dyrby, T., Mokso, R. & Sporring, Jon, 2023, bioRxiv, 18 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  7. Udgivet

    Astrocytic engagement of the corticostriatal synaptic cleft is disrupted in a mouse model of Huntington’s disease

    Villanueva, C. B., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Mokso, R., Benraiss, A., Sporring, Jon & Goldman, Steven Alan, 2023, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 120, 24, 11 s., e2210719120.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Morphology on Categorical Distributions

    Ørting, S. N., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg & Sporring, Jon, 2023, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 65, s. 861–873

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Multi-scale and Multi-resolution

    Sporring, Jon, 2023, Medical Image Analysis. Frangi, A., Prince, J. & Sonka, M. (red.). Elsevier, 33 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Multiscale and multiresolution analysis

    Sporring, Jon, 2023, Medical Image Analysis. Academic Press, s. 177-197

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  11. 2022
  12. Udgivet

    Extracting Mitochondrial Cristae Characteristics from 3D Focused Ion Beam Scanning Electron Microscopy Data

    Wang, Chenhao, Østergård, L., Hasselholt, S. & Sporring, Jon, 9 nov. 2022, bioRxiv. 20 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  13. Udgivet

    Reconstructing Binary Signals from Local Histograms

    Sporring, Jon & Darkner, Sune, 21 mar. 2022, I: Entropy. 24, 3, s. 1-11 433.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    An algebra for local histograms

    Sporring, Jon & Darkner, Sune, 2022, I: Frontiers in Computer Science. 4, s. 1-9 939563.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Layer III pyramidal cells in the prefrontal cortex reveal morphological changes in subjects with depression, schizophrenia, and suicide

    Larsen, N. Y., Vihrs, N., Møller, J., Sporring, Jon, Tan, X., Li, X., Ji, G., Rajkowska, G., Sun, F. & Nyengaard, J. R., 2022, I: Translational Psychiatry. 12, 1, s. 363 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. 2021
  17. Udgivet

    Cellular 3D-reconstruction and analysis in the human cerebral cortex using automatic serial sections

    Larsen, N. Y., Li, X., Tan, X., Ji, G., Lin, J., Rajkowska, G., Møller, J., Vihrs, N., Sporring, Jon, Sun, F. & Nyengaard, J. R., dec. 2021, I: Communications Biology . 4, 1, 15 s., 1030.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Currents and K-functions for Fiber Point Processes

    Hansen, P. E. H., Waagepetersen, R. P., Svane, A. M., Sporring, Jon, Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Hasselholt, S. & Sommer, Stefan Horst, 2021, arXiv preprint. 12 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  19. Udgivet

    Currents and K-functions for Fiber Point Processes

    Hansen, P. E. H., Waagepetersen, R. P., Svane, A. M., Sporring, Jon, Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Hasselholt, S. & Sommer, Stefan Horst, 2021, Geometric Science of Information: 5th International Conference, GSI 2021, Paris, France, July 21–23, 2021, Proceedings. Nielsen, F. & Barbaresco, F. (red.). Springer, s. 127-134 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 12829).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    How Few Annotations are Needed for Segmentation Using a Multi-planar U-Net?

    Laprade, W. M., Perslev, Mathias & Sporring, Jon, 2021, Deep Generative Models, and Data Augmentation, Labelling, and Imperfections - First Workshop, DGM4MICCAI 2021, and First Workshop, DALI 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Proceedings. Engelhardt, S., Oksuz, I., Zhu, D., Yuan, Y., Mukhopadhyay, A., Heller, N., Huang, S. X., Nguyen, H., Sznitman, R. & Xue, Y. (red.). Springer, s. 209-216 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 13003 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Measuring Shape Relations Using r-Parallel Sets

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Svane, A. M., Villanueva, C. B., Goldman, Steven Alan & Sporring, Jon, 2021, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 63, s. 1069–1083 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. 2020
  23. Udgivet

    Morphology on categorical distributions

    Ørting, S. N., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg & Sporring, Jon, 14 dec. 2020, arXiv.org.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  24. Udgivet

    A Highly Accurate Model Based Registration Method for FIB-SEM Images of Neurons

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, 8 s. (arXiv.org).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  25. Udgivet

    A Novel Approach to Tongue Standardization and Feature Extraction

    Wang, Chenhao, Cattaneo, C., Liu, J., Bredie, Wender, Pagliarini, E. & Sporring, Jon, 2020, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2020: 23rd International Conference, Proceedings. Martel, A. L., Abolmaesumi, P., Stoyanov, D., Mateus, D., Zuluaga, M. A., Zhou, S. K., Racoceanu, D. & Joskowicz, L. (red.). Springer, s. 36-45 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 12265 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Comparison of manual and machine learning image processing approaches to determine fungiform papillae on the tongue

    Cattaneo, C., Liu, J., Wang, Chenhao, Pagliarini, E., Sporring, Jon & Bredie, Wender, 2020, bioRxiv, 18 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  27. Udgivet

    Comparison of manual and machine learning image processing approaches to determine fungiform papillae on the tongue

    Cattaneo, C., Liu, J., Wang, Chenhao, Pagliarini, E., Sporring, Jon & Bredie, Wender, 2020, I: Scientific Reports. 10, 15 s., 18694.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Restoring drifted electron microscope volumes using synaptic vesicles at sub-pixel accuracy

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, I: Communications Biology. 3, 1, 7 s., ´81.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. 2019
  30. Udgivet

    Drift Corrector Software

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 20 aug. 2019

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstformSoftwareprogramForskning

  31. Udgivet

    Using a high-level parallel programming language for GPU-accelerated tomographic reconstruction

    Lindhøj, M. B., Henriksen, Troels, Pedersen, L. & Sporring, Jon, 15 jul. 2019, The 2019 International Conference on High Performance Computing & Simulation: HPCS 2019. IEEE, s. 27-32 6 s. 3

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Generalizations of Ripley’s K-function with Application to Space Curves

    Sporring, Jon, Waagepetersen, R. P. & Sommer, Stefan Horst, jun. 2019, Information Processing in Medical Imaging - 26th International Conference, IPMI 2019, Hong Kong, China, 2019, Proceedings: 26th International Conference, IPMI 2019, Hong Kong, China, June 2–7, 2019, Proceedings. Springer, s. 731-742 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 11492).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Experimental cerebral malaria is associated with profound loss of both glycan and protein components of the endothelial glycocalyx

    Hempel, C., Sporring, Jon & Kurtzhals, Jørgen, 2019, I: F A S E B Journal. 33, 2, s. 2058-2071

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Muscle fibre morphology and microarchitecture in cerebral palsy patients obtained by 3D synchrotron X-ray computed tomography

    Borg, L., Sporring, Jon, Dam, Erik Bjørnager, Dahl, V. A., Dyrby, T. B., Feidenhans'l, Robert Krarup, Dahl, A. B. & Pingel, Jessica, 2019, I: Computers in Biology and Medicine. 107, s. 265-269 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. 2018
  36. Udgivet

    Collocation for diffeomorphic deformations in medical image registration

    Darkner, Sune, Pai, A. S. U., Liptrot, M. G. & Sporring, Jon, 2018, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 40, 7, s. 1570-1583

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Estimating the continuous entropy of a discrete set of orientations in R3

    Sporring, Jon, 2018, Copenhagen: Department of Computer Science, University of Copenhagen. 6 s. (Technical Report; Nr. 1, Bind 2018).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  38. 2017
  39. Udgivet

    Reduction of variable-truncation artifacts from beam occlusion during in situ x-ray tomography

    Borg, L., Jørgensen, J. S., Frikel, J. & Sporring, Jon, dec. 2017, I: Measurement Science and Technology. 28, 12, 19 s., 124004.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Synchrotron radiation μCT and histology evaluation of bone-to-implant contact

    Neldam, C. A., Sporring, Jon, Rack, A., Lauridsen, T., Hauge, E. M., Jørgensen, H. L., Jørgensen, Niklas Rye, Feidenhans'l, Robert Krarup & Pinholt, E. M., sep. 2017, I: Journal of Cranio-Maxillofacial Surgery. 45, 9, s. 1448-1457 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Towards characterizing and reducing artifacts caused by varying projection truncation

    Borg, L., Jørgensen, J. S. & Sporring, Jon, 24 feb. 2017, Department of Computer Science, University of Copenhagen. 42 s. (Datalogisk Institut. Københavns Universitet. Technical Reports; Nr. 1, Bind 2017).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  42. Udgivet

    3D analysis of synaptic vesicle density and distribution after acute foot-shock stress by using serial section transmission electron microscopy

    Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    3D estimation of synaptic vesicle distributions in serial section transmission electron microscopy

    Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Estimation of sample spacing in stochastic processes

    Rønn-Nielsen, A., Sporring, Jon & Jensen, E. B. V., 2017, I: Image Analysis and Stereology. 36, 1, s. 43-49 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Reducing artifacts from varying projection truncations

    Borg, L., Jørgensen, J. S., Frikel, J., Quinto, E. T. & Sporring, Jon, 2017. 2 s.

    Publikation: KonferencebidragPaperForskningfagfællebedømt

  46. 2016
  47. Udgivet

    Combining the boundary shift integral and tensor-based morphometry for brain atrophy estimation

    Michalkiewicz, M. D., Pai, A. S. U., Leung, K. K., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, Medical imaging 2016: Image processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 978406. (Progress in Biomedical Optics and Imaging).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Deformation-based atrophy computation by surface propagation and its application to Alzheimer’s disease

    Pai, A. S. U., Sporring, Jon, Darkner, Sune, Dam, Erik Bjørnager, Lillholm, Martin, Jørgensen, D., Oh, J., Chen, G., Suhy, J., Sørensen, L. & Nielsen, Mads, 2016, I: SPIE Journal of Medical Imaging. 3, 1, 11 s., 014005.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Kernel bundle diffeomorphic image registration using stationary velocity fields and Wendland basis functions

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 35, 6, s. 1369-1380 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Recovery of missing information in diffusion magnetic resonance imaging data

    Siddiqi, K., Piuze-Phaneuf, E. & Sporring, Jon, 2016, Patentnr. US 2016/0335786 A1, 17 nov. 2016

    Publikation: Patent

  51. 2015
  52. Udgivet

    Adaptive time-stepping in dieomorphic image registration with bounded inverse consistency error

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015) . INRIA, s. 35-47

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    Adaptive time-stepping in diffeomorphic image registration with bounded inverse consistency error

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L. E. B. L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, The 18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention: proceedings. Technische Universität München , s. 35-47 13 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Analysis of shape and spatial interaction of synaptic vesicles using data from focused ion beam scanning electron microscopy (FIB-SEM)

    Khanmohammadi, M., Waagepetersen, R. P. & Sporring, Jon, 2015, I: Frontiers in Neuroanatomy. 9, 11 s., 116.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Comparison of several computational pipelines for atrophy computation in longitudinal Alzheimers studies

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L. E. B. L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    Connection forms for beating the heart

    Mensch, A., Piuze, E., Lehnert, L., Backermans, A. J., Sporring, Jon, Strijkers, G. J. & Siddiqi, K., 2015, Statistical Atlases and Computational Models of the Heart - Imaging and Modelling Challenges: 5th International Workshop, STACOM 2014, Held in Conjunction with MICCAI 2014, Boston, MA, USA, September 18, 2014, Revised Selected Papers. Camara, O., Mansi, T., Pop, M., Rhode, K., Sermesant, M. & Young, A. (red.). Springer, s. 83-92 10 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8896).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    Diffeomorphic image registration with automatic time-step adjustment

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, 2015 IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 1085-1088 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    Image registration using stationary velocity fields parameterized by norm-minimizing Wendland kernel

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Medical Imaging 2015: Image Processing. SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. (Proceedings of S P I E - International Society for Optical Engineering, Bind 9413).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    Matematik på hjertet: bedre diagnosticering af hjertesygdomme

    Sporring, Jon, 2015, Naturen i computeren. Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet, s. 12-13 2 s. (Temahæfte, Bind 2015).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiUndervisning

  60. Udgivet

    Maurer-cartan forms for fields on surfaces: application to heart fiber geometry

    Piuze, E., Sporring, Jon & Siddiqi, K., 2015, I: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 37, 12, s. 2492-2504 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  61. Udgivet

    Method of modelling and characterising heart fiber geometry, involves determining whether new fitting energy meets predetermined threshold when predetermined threshold is met iterative process is terminated

    Siddiqi, K., Piuze-Phaneuf, E., Sporring, Jon, Savadjiev, P., Strijkers, G. & Zucker, S., 2015, IPC nr. G06T-011/00, Patentnr. US2015332483-A1, 19 nov. 2015, Prioritetsdato 15 maj 2014, Prioritetsnr. US993600P

    Publikation: Patent

  62. Udgivet

    Moving frames for heart fiber reconstruction

    Piuze, E., Sporring, Jon & Siddiqi, K., 2015, Information Processing in Medical Imaging: 24th international conference, IPMI 2015, Sabhal Mor Ostaig, Isle of Skye, UK, June 28 - July 3, 2015, Proceedings. Ourselin, S., Alexander, D. C., Westin, C-F. & Cardoso, M. J. (red.). Springer, s. 527-539 13 s. (Lecture notes in computer science, Bind 9123).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  63. Udgivet

    Novel approach to measure the size of plasma-membrane nanodomains in single molecule localization microscopy

    Ziomkiewicz, I., Sporring, Jon, Pomorski, Thomas Guenther & Schulz, Alexander, 2015, I: Cytometry. Part A. 87, 9, s. 868-877

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  64. 2014
  65. Udgivet

    Analysing the distribution of synaptic vesicles using a spatial point process model

    Khanmohammadi, M., Waagepetersen, R., Nava, N., Nyengaard, J. & Sporring, Jon, 2014, Proceedings of the 5th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics. Association for Computing Machinery, s. 73-78 6 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  66. Udgivet

    Estimating the thickness of ultra thin sections for electron microscopy by image statistics

    Sporring, Jon, Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R. & Jensen, E. B. V., 2014, 2014 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. IEEE, s. 157-160 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  67. Udgivet

    Photon differential splatting for rendering caustics

    Frisvad, J. R., Schjøth, L., Erleben, Kenny & Sporring, Jon, 2014, I: Computer Graphics Forum. 33, 6, s. 252-263 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  68. Udgivet

    Stepwise inverse consistent Euler’s scheme for diffeomorphic image registration

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2014, Biomedical Image Registration: 6th International Workshop, WBIR 2014, London, UK, July 7-8, 2014. Proceedings. Ourselin, S. & Modat, M. (red.). Springer, s. 223-230 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8545).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  69. Udgivet

    White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P75-P76 2 s., IC-P-131.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  70. Udgivet

    White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P414 1 s., P1-285.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  71. 2013
  72. Udgivet

    Atlases of cardiac fiber differential geometry

    Piuze, E., Lombaert, H., Sporring, Jon, Strijkers, G. J., Bakermans, A. J. & Siddiqi, K., 2013, Functional Imaging and Modeling of the Heart: 7th International Conference, FIMH 2013, London, UK, June 20-22, 2013. Proceedings. Ourselin, S., Rueckert, D. & Smith, N. (red.). Springer, s. 442-449 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7945).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  73. Udgivet

    Automatic measurement of wrist synovitis from contrast-enhanced MRI: a registration-centered approach

    Mysling, P., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Dam, E. & Lillholm, Martin, 2013, Medical Imaging 2013: Image Processing. Ourselin, S. & Haynor, D. R. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 86692U. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 36, Bind 14).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  74. Udgivet

    Cardiac fiber inpainting using cartan forms

    Piuze, E., Lombaert, H., Sporring, Jon & Siddiqi, K., 2013, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2013: 16th International Conference, Nagoya, Japan, September 22-26, 2013, Proceedings, Part II. Moru, K., Sakuma, I., Sato, Y., Barillot, C. & Navab, N. (red.). Springer, s. 509-517 9 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8150).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  75. Udgivet

    Cube propagation for focal brain atrophy estimation

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Mysling, P., Jørgensen, D. R., Dam, E. B., Lillholm, Martin, Oh, J., Chen, G., Suhy, J., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, 2013 IEEE 10th International Symposium on Biomedical Imaging. IEEE, s. 402-405 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  76. Udgivet

    Diffeomorphic spectral matching of cortical surfaces

    Lombaert, H., Sporring, Jon & Siddiqi, K., 2013, Information Processing in Medical Imaging: 23rd International Conference, IPMI 2013, Asilomar, CA, USA, June 28–July 3, 2013. Proceedings. Gee, J. C., Joshi, S., Pohl, K. M., Wells, W. M. & Zöllei, L. (red.). Springer, s. 376-389 14 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7917).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  77. Udgivet

    Evaluation of WBAA with registration-based cube propagation for brain atrophy quantification

    Lillholm, Martin, Pai, A. S. U., Sørensen, L., Nielsen, Mads, Sporring, Jon, Darkner, Sune & Dam, E., 2013. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  78. Udgivet

    Hippocampus atrophy in early Alzheimer's disease quantified using non-rigid registration with cube propagation

    Pai, A. S. U., Sørensen, L. E. B. L., Mysling, P., Erleben, L. L., Sporring, Jon, Dam, E., Lillholm, M., Jørgensen, D. R., Chen, G., Oh, J., Suhy, J. & Nielsen, Mads, 2013.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  79. Udgivet

    Localized cerebral atrophy acceleration during Alzheimer’s disease

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Lillholm, Martin, Dam, E. B., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, I: Alzheimer's & Dementia. 9, 4, Supplement, s. P36–P37 2 s., IC-P-059.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  80. Udgivet

    Localized cerebral atrophy acceleration during Alzheimer’s disease

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Lillholm, Martin, Dam, E. B., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, I: Alzheimer's & Dementia. 9, 4, Supplement, s. P151 1 s., O1-10-06.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  81. Udgivet

    Locally orderless registration

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2013, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 35, 6, s. 1437-1450 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  82. Udgivet

    Moving frames for heart fiber geometry

    Piuze, E., Sporring, Jon & Siddiqi, K., 2013, Information Processing in Medical Imaging: 23rd International Conference, IPMI 2013, Asilomar, CA, USA, Proceedings. Gee, J. C., Joshi, S., Pohl, K. M., Wells, W. M. & Zöllei, L. (red.). Springer, s. 524-535 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7917).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  83. Udgivet

    Truncation error for simplex propagation

    Sporring, Jon, 2013, Datalogisk Institut. 8 s. (Koebenhavns Universitet. Datalogisk Institut. Rapport; Nr. 01/2013).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  84. 2012
  85. Udgivet

    Evaluation of bias in brain atrophy estimation

    Pai, A. S. U., Darkner, Sune, Sørensen, L., Erleben, L. L., Mysling, P., Sporring, Jon, Dam, E. & Nielsen, Mads, 2012, NIBAD '12: MICCAI 2012 Workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer’s Disease and Related Disorders. Wang, L., Yushkevich, P. & Ourselin, S. (red.). MICCAI , s. 198-206 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  86. Udgivet

    Locally Orderless Registration

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012, arxiv.org, 14 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  87. Udgivet

    Locally orderless registration code: fast normalized mutual information and P-Norm for MATLAB

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstformSoftwareprogramForskning

  88. Udgivet

    Mass preserving image registration for lung CT

    Gorbunova, V., Sporring, Jon, Lo, P. C. P., Loeve, M., Tiddens, H. A., Nielsen, Mads, Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2012, I: Medical Image Analysis. 16, 4, s. 786-795 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  89. Udgivet

    Maximum a posteriori covariance estimation using a power inverse wishart prior

    Nielsen, S. F. & Sporring, Jon, 2012, 29 s. (arXiv.org: Statistics).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  90. 2011
  91. Udgivet

    Evaluation of registration methods on thoracic CT: the EMPIRE10 challenge

    Murphy, K., van Ginneken, B., Reinhardt, J., Kabus, S., Ding, K., Deng, X., Cao, K., Du, K., Christensen, G., Garcia, V., Vercauteren, T., Ayache, N., Commowick, O., Malandain, G., Glocker, B., Paragios, N., Navab, N., Gorbunova, V., Sporring, J., de Bruijne, M. & 34 flere, Han, X., Heinrich, M., Schnabel, J., Jenkinson, M., Lorenz, C., Modat, M., McClelland, J., Ourselin, S., Muenzing, S., Viergever, M., De Nigris, D., Collins, D., Arbel, T., Peroni, M., Li, R., Sharp, G., Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R., Smeets, D., Loeckx, D., Song, G., Tustison, N., Avants, B., Gee, J., Staring, M., Klein, S., Stoel, B., Urschler, M., Werlberger, M., Vandemeulebroucke, J., Rit, S., Sarrut, D. & Pluim, J., 2011, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 30, 11, s. 1901-1920 20 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  92. Udgivet

    Generalized Partial Volume: an inferior density estimator to Parzen Windows for normalized mutual information

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2011, Information Processing in Medical Imaging: 22nd International Conference, IPMI 2011, Kloster Irsee, Germany, July 3-8, 2011. Proceedings. Székely, G. & Hahn, H. K. (red.). Springer, s. 436-447 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6801).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  93. Udgivet

    Jacobians for Lebesgue registration for a range of similarity measures

    Sporring, Jon & Darkner, Sune, 2011, Department of Computer Science, University of Copenhagen. 8 s. (Koebenhavns Universitet. Datalogisk Institut. Rapport; Nr. 04/2011).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  94. Udgivet

    Maximum a posteriori estimation of linear shape variation with application to vertebra and cartilage modeling

    Crimi, A., Lillholm, Martin, Nielsen, Mads, Ghosh, A., de Bruijne, Marleen, Dam, E. B. & Sporring, Jon, 2011, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 30, 8, s. 1514-1526 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  95. 2010
  96. Udgivet

    Anisotropic diffusion tensor applied to temporal mammograms: an application to breast cancer risk assessment

    Karemore, G., Brandt, S., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2010, 2010 Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC). IEEE, s. 3178-3181 4 s. (I E E E Engineering in Medicine and Biology Society. Conference Proceedings).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  97. Udgivet

    Mass preserving image registration: results of Evaluation of Methods for Pulmonary Image Registration 2010 Challenge

    Gorbunova, V., Sporring, Jon, Lo, P. C. P., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2010, Medical image analysis for the clinic: a grand challenge: workshop proceedings from the 13th International Conference on Medical Image Computing And Computer Assisted Intervention. van Ginneken, B., Murphy, K., Heimann, T., Pekar, V. & Deng, X. (red.). CreateSpace Independent Publishing Platform , s. 155-164 10 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  98. Udgivet

    Photon differentials in space and time

    Schjøth, L., Frisvad, J. R., Erleben, Kenny & Sporring, Jon, 2010, Computer Vision, Imaging and Computer Graphics. Theory and Applications: International Joint Conference, VISIGRAPP 2010, Angers, France, May 17-21, 2010. Revised Selected Papers. Richard, P. & Braz, J. (red.). Springer, s. 274-286 13 s. (Communications in Computer and Information Science, Bind 229).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  99. Udgivet

    Vessel-guided airway tree segmentation: a voxel classification approach

    Lo, P. C. P., Sporring, Jon, Ashraf, H., Pedersen, J. J. H. & de Bruijne, Marleen, 2010, I: Medical Image Analysis. 14, 4, s. 527-538 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  100. 2009
  101. Udgivet

    Bayes estimation of shape model with application to vertebrae boundaries

    Crimi, A., Ghosh, A., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2009, Medical Imaging 2009: Image Processing (Proceedings Volume). Bind 7259. 8 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  102. Udgivet

    Airway Tree Extraction with Locally Optimal Paths

    Lo, P. C. P., Sporring, Jon, Pedersen, J. J. H. & de Bruijne, Marleen, 2009, MICCAI 2009. s. 51-58 8 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  103. Udgivet

    Content-Aware Video Editing in the Temporal Domain

    Slot, K., Truelsen, R. & Sporring, Jon, 2009, Scandinavian Conference on Image Analysis (SCIA '09). 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  104. Udgivet

    Learning COPD Sensitive Filters in Pulmonary CT

    Sørensen, L. E. B. L., Lo, P. C. P., Ashraf, H., Sporring, Jon, Nielsen, Mads & de Bruijne, Marleen, 2009, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2009. 7 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  105. Udgivet

    Mass Preserving Registration for lung CT

    Gorbunova, V., Lo, P. C. P., Loeve, M., Tiddens, H., Sporring, Jon, Nielsen, Mads & de Bruijne, Marleen, 2009, Proceedings of the SPIE: Medical Imaging 2009: Image Processing. Bind 7259. 10 s. (Proceedings of the SPIE, Bind 7259).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  106. Udgivet

    Multiscale Vessel-guided Airway Tree Segmentation

    Lo, P. C. P., Sporring, Jon & de Bruijne, Marleen, 2009, Proceedings of Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis. Brown, M., de Bruijne, M., van Ginneken, B., Kiraly, A., Kuhnigk, J-M., Lorenz, C., McClelland, J. R., Mori, K., Reeves, A. & Reinhardt, J. M. (red.). CreateSpace, s. 323-332 10 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  107. Udgivet

    Prior knowledge regularization in statistical medical image tasks

    Crimi, A., Sporring, Jon, de Bruijne, Marleen, Lillholm, Martin & Nielsen, Mads, 2009, Proceedings of the MICCAI Workshop on Probabilistic Models for Medical Image Analysis. 12 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  108. Udgivet

    Spatial and Temporal Ray Differentials

    Sporring, Jon, Schjøth, L. & Erleben, Kenny, 2009, Department of Computer Science: Department of Computer Science, University of Copenhagen. 14 s. (Technical Report; Nr. 04, Bind 2009).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  109. 2008
  110. Udgivet

    Bayes PCA Revisited

    Sporring, Jon, 2008, Department of Computer Science: Museum Tusculanum. 12 s. (Department of Computer Science. University of Copenhagen. Technical Report; Nr. 08-09).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  111. Udgivet

    Bayes reconstruction of missing teeth

    Sporring, Jon & Jensen, K. H., 2008, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 13, 2-3, s. 245-254

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  112. Udgivet

    Diffusion Based Photon Mapping

    Schjøth, L., Sporring, Jon & Fogh Olsen, O., 2008, I: Computer Graphics Forum. 27, 8, s. 2114-2127 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  113. Udgivet

    Guessing tangents in normal flows

    Markussen, Bo, Sporring, Jon & Erleben, Kenny, 2008, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 31, 2-3, s. 195-205 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  114. Udgivet

    Special Issue on Tribute Workshop for Peter Johansen

    Nielsen, Mads, de Bruijne, Marleen, Jørgensen, Camilla Holm, Olsen, Søren Ingvor, Steenstrup Pedersen, Kim & Sporring, Jon, 2008, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 31, 2-3, s. 119-120

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskning

  115. Udgivet

    Tribute Workshop for Peter Johansen

    Nielsen, Mads (red.), de Bruijne, Marleen (red.), Jørgensen, Camilla Holm (red.), Olsen, Søren Ingvor (red.), Steenstrup Pedersen, Kim (red.) & Sporring, Jon (red.), 2008, Berlin: Springer. 151 s. (Journal of Mathematical Imaging and Vision; Nr. 31(2-3)p.119-269).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportAntologiForskning

  116. Udgivet

    Vessel-guided airway segmentation based on voxel classification

    Lo, P. C. P., Sporring, Jon, Ashraf, H., Holst Pedersen, J. J. & de Bruijne, Marleen, 2008, The first International Workshop on Pulmonary Image Analysis: New York, September 6, 2008. Brown, M., de Bruijne, M., van Ginneken, B., Kiraly, A., Kuhnigk, J-M., Lorenz, C., Mori, K. & Reinhardt, J. (red.). Lulu.com, s. 113-122

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  117. Udgivet

    Voxel Classification Based Vessel-guided Airway Segmentation

    Lo, P. C. P., Sporring, Jon, Ashraf, H., Pedersen, J. H. J. & de Bruijne, Marleen, 2008, Proceedings of the Danish Conference on Pattern Recognition and Image Analysis: Organised by Danish Society for Automatic Pattern Recognition (Dansk Selskab for automatisk genkendelse af mønstre), Departmen of Computer Science, University of Copenhagen, Thursday 21 August 2008. Olsen, S. I. (red.). Museum Tusculanum, s. 8-9 (Datalogisk Institut. Københavns Universitet. Technical Reports; Nr. 08-10).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskning

Forrige 1 2 Næste

ID: 13303