Jan Sørensen
Professor emeritus
Microbial Ecology and Biotechnology
Thorvaldsensvej 40
1871 Frederiksberg C
- 2018
- Udgivet
Biological control of rice sheath blight using hyphae-associated bacteria: development of an in planta screening assay to predict biological control agent performance under field conditions
Nicolaisen, Mette Haubjerg, Nguyen Duc Cuong, Herschend, J., Jensen, Birgit, Le Cam Loan, Pham Van Du, Sørensen, Jan, Sørensen, Helle & Olsson, S., 2018, I: BioControl. 63, 6, s. 843-853Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Back to the future of soil metagenomics
Nesme, J., Achouak, W., Agathos, S. N., Bailey, M., Baldrian, P., Brunel, D., Frostegard, A., Heulin, T., Jansson, J. K., Jurkevitch, E., Kruus, K. L., Kowalchuk, G. A., Lagares, A., Lappin-Scott, H. M., Lemanceau, P., Le Paslier, D., Mandic-Mulec, I., Murrell, J. C., Myrold, D. D., Nalin, R. & 28 flere, , 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 5 s., 73.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diversity and biogeographic patterns of the bryozoan fauna of the Faroe Islands
Denisenko, N. V., Hayward, P. J., Tendal, O. S. & Sørensen, Jan, 2016, I: Marine Biology Research. 12, 4, s. 360-378 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
Centimeter-scale spatial variability in 2-methyl-4-chlorophenoxyacetic acid mineralization increases with depth in agricultural soil
Badawi, N., Johnsen, A. R., Sørensen, Jan & Aamand, J., 2013, I: Journal of Environmental Quality. 42, 3, s. 683-689 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hydraulically active biopores stimulate pesticide mineralization in agricultural subsoil
Badawi, N., Johnsen, A. R., Brandt, Kristian Koefoed, Sørensen, Jan & Aamand, J., 2013, I: Soil Biology & Biochemistry. 57, s. 533-541 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Improving Griffith's protocol for co-extraction of microbial DNA and RNA in adsorptive soils
Paulin, M. M., Nicolaisen, Mette Haubjerg, Jacobsen, C. S., Gimsing, A. L., Sørensen, Jan & Bælum, J., 2013, I: Soil Biology & Biochemistry. 63, s. 37-49 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Effects of alternating wetting and drying versus continuous flooding on fertilizer nitrogen fate in rice fields in the Mekong Delta, Vietnam
Nguyen, M. D., Brandt, Kristian Koefoed, Sørensen, Jan, Hung, N. N., Hach, C. V., Tan, P. S. & Dalsgaard, T., 2012, I: Soil Biology & Biochemistry. 47, s. 166-174 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Intermediate accumulation of metabolites results in a bottleneck for mineralisation of the herbicide metabolite 2,6-dichlorobenzamide (BAM) by Aminobacter spp.
Simonsen, A., Badawi, N., Anskjær, G. G., Albers, C. N., Sørensen, S. R., Sørensen, Jan & Aamand, J., 2012, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 94, 1, s. 237-245 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protozoan predation in soil slurries compromises determination of contaminant mineralization potential
Badawi, N., Johnsen, A. R., Brandt, Kristian Koefoed, Sørensen, Jan & Aamand, J., 2012, I: Environmental Pollution. 170, s. 32-38 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
(R,S)-dichlorprop herbicide in agricultural soil induces proliferation and expression of multiple dioxygenase-encoding genes in the indigenous microbial community
Paulin, M. M., Nicolaisen, Mette Haubjerg & Sørensen, Jan, 2011, I: Environmental Microbiology. 13, 6, s. 1513-1523 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hyphae-colonizing Burkholderia sp. - a new source of biological control agents against sheath blight disease (Rhizoctonia solani AG1-IA) in rice
Nguyen, D. C., Nicolaisen, Mette Haubjerg, Sørensen, Jan & Olsson, S., 2011, I: Microbial Ecology. 62, 2, s. 425-434 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid and sensitive Nitrosomonas europaea biosensor assay for quantification of bioavailable ammonium Sensu Strictu in soil
Nguyen, M. D., Risgaard-Petersen, N., Sørensen, Jan & Brandt, Kristian Koefoed, 2011, I: Environmental Science & Technology (Washington). 45, 3, s. 1048-1054 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
- Udgivet
2,6-Dichlorobenzamide (BAM) herbicide mineralisation by Aminobacter sp. MSH1 during starvation depends on a subpopulation of intact cells maintaining vital membrane functions
Sjøholm, O. R., Nybroe, O., Aamand, J. & Sørensen, Jan, 2010, I: Environmental Pollution. 158, 12, s. 3618-3625 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Abundance and expression of enantioselective rdpA and sdpA dioxygenase genes during degradation of the racemic herbicide (R,S)-2-(2,4-dichlorophenoxy)propionate in soil
Paulin, M. M., Nicolaisen, Mette Haubjerg & Sørensen, Jan, 2010, I: Applied and Environmental Microbiology. 76, 9, s. 2873-2883 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Degrader density determines spatial variability of 2,6-dichlorobenzamide mineralisation in soil
Sjøholm, O. R., Aamand, J., Sørensen, Jan & Nybroe, O., 2010, I: Environmental Pollution. 158, 1, s. 292-298 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbiology 2010: Block 3: manual of laboratory exercises
Jørgensen, Niels O. G., Sørensen, Jan & Nybroe, O., 2010, Department of Agriculture and Ecology, University of Copenhagen. 53 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Kompendium/lecture notes › Undervisning
- Udgivet
Novel assay to assess permissiveness of a soil microbial community toward receipt of mobile genetic elements
Musovic, S., Dechesne, A., Sørensen, Jan & Smets, B. F., 2010, I: Applied and Environmental Microbiology. 76, 14, s. 4813-4818 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
- Udgivet
Direct transcript analysis by quantitative real-time PCR to study phenoxyalcanoic acid degrader gene expression in agricultural soil and rhizosphere
Nicolaisen, Mette Haubjerg, Bælum, J., Paulin, M. M., Jacobsen, C. S. & Sørensen, Jan, 2009, Conference abstracts. s. 1Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
- Udgivet
Molecular tools in rhizosphere microbiology - from single-cell to whole-community analysis
Sørensen, Jan, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Ron, E. & Simonet, P., 2009, I: Plant and Soil. 321, 1-2, s. 483-512 30 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multiple physiological states of a Pseudomonas fluorescens DR54 biocontrol inoculant monitored by a new flow cytometry protocol
Nielsen, T. H., Sjøholm, O. R. & Sørensen, Jan, 2009, I: FEMS Microbiology Ecology. 67, 3, s. 479-490 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
What factors influence the health status of patients with rheumatoid arthritis measured by the SF-12v2 Health Survey and the Health Assessment Questionnaire?
Linde, L., Sørensen, Jan, Østergaard, Mikkel, Hørslev-Petersen, K., Rasmussen, C., Jensen, D. V., Hetland, Merete Lund, Linde, L., Sørensen, J., Østergaard, Mikkel, Hørslev-Petersen, K., Rasmussen, C., Jensen, D. V. & Hetland, M. L., 2009, I: Journal of Rheumatology. 36, 10, s. 2183-9 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
- Udgivet
Antibiotika og østrogener fra gylle ender i miljøet
Rasmussen, S. B., Vestergaard, S. L., Jørgensen, S. S., Strobel, Bjarne W. & Sørensen, Jan, 2008, I: Aktuel Naturvidenskab. 5, s. 19-21 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
- Udgivet
Direct analysis of tfdA gene expression by indigenous bacteria in phenoxy acid amended agricultural soil
Bælum, J., Nicolaisen, Mette Haubjerg, Holben, W. E., Strobel, Bjarne W., Sørensen, Jan & Jacobsen, C. S., 2008, I: ISME Journal. 2, 6, s. 677-687 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Flow cytometry protocol to monitor several physiological states in inoculant Pseudomonas fluorescens biocontrol strain DR54 in culture and complex environmental samples
Nielsen, T. H., Sjøholm, O. R. & Sørensen, Jan, 2008.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Microbial degradation of the benzonitrile herbicides dichlobenil, bromoxynil and ioxynil in soil and subsurface environments - insights into degradation pathways, persistent metabolites and involved degrader organisms
Holtze, M. S., Sørensen, S. R., Sørensen, Jan & Aamand, J., 2008, I: Environmental Pollution. 154, 2, s. 155-168 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcription dynamics of the functional tfdA gene during MCPA herbicide degradation by Cupriavidus necator AEO106 (pRO101) in agricultural soil
Nicolaisen, Mette Haubjerg, Bælum, J., Jacobsen, C. S. & Sørensen, Jan, 2008, I: Environmental Microbiology. 10, 3, s. 571-579 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2007
- Udgivet
Biostimulation and enrichment of 2,6-dichlorobenzamide-mineralising soil bacterial communities from dichlobenil-exposed soil
Holtze, M. S., Sørensen, S. R., Sørensen, Jan, Hansen, Hans Chr. Bruun & Aamand, J., 2007, I: Soil Biology & Biochemistry. 39, 1, s. 216-223 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Induction of resistance in rice against Rhizoctonia solani
Jørgensen, Hans Jørgen Lyngs, Nguyen, D. K., Shetty, N. P., Sørensen, Jan, Thuy, T. T. T. & Collinge, David B., 2007, Ikke angivet. Indian Society of Mycology and Plant Pathology, s. 240 1 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
- Udgivet
Methods to detect and quantify bacteria in soil: chapter 11
Nybroe, O., Brandt, Kristian Koefoed, Nicolaisen, Mette Haubjerg & Sørensen, Jan, 2007, Modern soil microbiology. s. 283-316 34 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Microbial degradation and impact of Bracken toxin ptaquiloside on microbial communities in soil
Engel, P., Brandt, Kristian Koefoed, Rasmussen, L. H., Ovesen, R. G. & Sørensen, Jan, 2007, I: Chemosphere. 67, 1, s. 202-209 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial degradation pathways of the herbicide dichlobenil in soils with different history of dichlobenil-exposure
Holtze, M. S., Hansen, Hans Chr. Bruun, Juhler, R. K., Sørensen, Jan & Aamand, J., 2007, I: Environmental Pollution. 148, 1, s. 343-351 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity in the rhizosphere: highly resolving molecular methodology to study plant-beneficial rhizosphere bacteria
Hartmann, A., Smalla, K. & Sørensen, Jan, 2007, Biodiversity in agricultural production systems. Benckiser, G. & Schnell, S. (red.). Boca Raton: CRC Press, s. 101-130 30 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Plant-associated bacteria - lifestyle and molecular interactions
Sørensen, Jan & Sessitsch, A., 2007, Modern soil microbiology. Elsas, J. D. V., Jansson, J. K. & Trevors, J. T. (red.). 2. udg. Boca Raton: CRC Press, s. 211-236 26 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Studying functional diversity and specific activity of microbial phenoxy acid degraders through tfdA-mRNA extracted from a natural soil environment
Bælum, J., Nicolaisen, Mette Haubjerg, Holben, W. E., Sørensen, Jan, Strobel, Bjarne W. & Jacobsen, C. S., 2007. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Transcriptional analysis of the functional tfdA gene in Ralstonia eutropha AEO106(pRO101) during MCPA herbicide degradation in natural soil and rhizosphere
Nicolaisen, Mette Haubjerg, Bælum, J., Jacobsen, C. S. & Sørensen, Jan, 2007, Book of Abstracts. 1 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
- 2006
- Udgivet
Reporter genes in bacterial inoculants can monitor life conditions and functions in soil
Sørensen, Jan & Nybroe, O., 2006, Nucleic acids and proteins in soil. Nannipieri, P. & Smalla, K. (red.). Berlin: Kluwer Academic Publishers, s. 375-395 21 s. (Soil Biology, Bind 8).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Transformation of the herbicide 2,6-dichlorobenzonitrile to the persistent metabolite 2,6-dichlorobenzamide (BAM) by soil bacteria known to harbour nitrile hydratase or nitrilase
Holtze, M. S., Sørensen, Jan, Hansen, Hans Chr. Bruun & Aamand, J., 2006, I: Biodegradation. 17, 6, s. 503-510 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2005
- Udgivet
Direct microscopy in the rhizosphere microbial community: Recent developments and perspectives
Sørensen, Jan, 2005, Rhizosphere 2004 - Perspectives and challenges: A tribute to Lorenz Hiltner. Hartmann, A., Schmid, M., Wenzel, W. & Hinsinger, P. (red.). GSF, s. 247-251 5 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Genes involved in cyclic lipopeptide production are important for seed and straw colonization by Pseudomonas sp. strain DSS73
Nielsen, T. H., Nybroe, O., Koch, B., Hansen, M. & Sørensen, Jan, 2005, I: Applied and Environmental Microbiology. 71, 7, s. 4112-4116 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2004
- Udgivet
Chemical and microbiological soil characteristics controlling glyphosate mineralisation in danish surface soils
Gimsing, A. L., Borggaard, Ole K., Jacobsen, O. S., Aamand, J. & Sørensen, Jan, 2004, I: Applied Soil Ecology. 27, 3, s. 233-242 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Combined use of different Gfp reporters for monitoring single-cell activities of a genetically modified PCB degrader in the rhizosphere of alfalfa.
Boldt, T. S., Sørensen, Jan, Karlson, U., Molin, S. & Ramos, C., 2004, I: FEMS Microbiology Ecology. 48, 2, s. 139-148 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Influnce of soil moisture on linear alkylbenzene sulfonate-induced toxicity in ammonia-oxidizing bacteria
Nielsen, K. B., Brandt, Kristian Koefoed, Jacobsen, A., Mortensen, G. K. & Sørensen, Jan, 2004, I: Environmental Toxicology and Chemistry. 23, 2, s. 363-370 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Production of Cyclic Lipopeptides by Fluorescent Pseudomonads.
Nybroe, O. & Sørensen, Jan, 2004, I: Pseudomonas. 3, s. 147-172 25 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Pseudomonas in the Soil Environment.
Sørensen, Jan & Nybroe, O., 2004, I: Pseudomonas. 1, s. 369-402 33 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- 2003
- Udgivet
Activity and population dynamics of heterotrophic and ammonia-oxidizing microorganisms in soil surrounding sludge bands spiked with linear alkylbenzene sulfonate: A field study
Brandt, Kristian Koefoed, Krogh, P. H. & Sørensen, Jan, 2003, I: Environmental Toxicology and Chemistry. 22, 4, s. 821-829 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Production of Cyclic Lipopeptides by Pseudomonas fluorescens Strains in Bulk Soil and in the Sugar Beet Rhizosphere.
Nielsen, T. H. & Sørensen, Jan, 2003, I: Applied and Environmental Microbiology. 69, 2, s. 861-868 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Recycling of sewage sludge and household compost to arable land: fate and effects of organic contaminants, and impact on soil fertility.
Petersen, S. O., Henriksen, K., Mortensen, G. K., Krogh, P. H., Brandt, Kristian Koefoed, Sørensen, Jan, Madsen, T., Petersen, J. & Grøn, C., 2003, I: Soil & Tillage Research. 72, 2, s. 139-152 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2002
- Udgivet
Cyclic lipoundecapeptide lokisin from Pseudomonas sp. strain DSS41
Sørensen, D., Nielsen, T. H., Sørensen, Jan & Christophersen, C., 2002, I: Tetrahedron Letters. 43, 25, s. 4421-4423 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lipopeptide production in Pseudomonas sp. strain DSS73 is regulated by components of sugar beet seed exudate via the Gac two-component regulatory system
Koch, B., Nielsen, T. H., Sørensen, D., Andersen, J. B., Christophersen, C., Molin, S., Givskov, M., Sørensen, Jan & Nybroe, O., 2002, I: Applied and Environmental Microbiology. 68, 9, s. 4509-4516 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Solid-phase contact assay that uses a lux-marked Nitrosomonas europaea reporter strain to estimate toxicity of bioavailable linear alkylbenzene sulfonate in soil
Brandt, Kristian Koefoed, Pedersen, A. & Sørensen, Jan, 2002, I: Applied and Environmental Microbiology. 68, 7, s. 3502-3508 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4228089
Flest downloads
-
1472
downloads
Transcriptional analysis of the functional tfdA gene in Ralstonia eutropha AEO106(pRO101) during MCPA herbicide degradation in natural soil and rhizosphere
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
Udgivet -
744
downloads
Flow cytometry protocol to monitor several physiological states in inoculant Pseudomonas fluorescens biocontrol strain DR54 in culture and complex environmental samples
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
146
downloads
Back to the future of soil metagenomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet