Jan Gorodkin

Jan Gorodkin

Professor

Medlem af:


    Udgivelsesår:
    Alle
    1 - 8 ud af 8Pr. side: 10
    Sortering: Udgivelsesdato
    1. 2017
    2. Udgivet

      Alignment-free comparative genomic screen for structured RNAs using coarse-grained secondary structure dot plots

      Kato, Y., Gorodkin, Jan & Havgaard, Jakob Hull, dec. 2017, I: BMC Genomics. 18, 1, 935.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. Udgivet

      Assessing the miRNA sponge potential of RUNX1T1 in t(8;21) acute myeloid leukemia

      Junge, A., Zandi, R., Havgaard, Jakob Hull, Gorodkin, Jan & Cowland, J. B., 2017, I: Gene. 615, s. 35-40 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    4. Udgivet

      Associating transcription factors and conserved RNA structures with gene regulation in the human brain

      Hecker, N., Seemann, Ernst Stefan, Silahtaroglu, Asli, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 16 s., 5776.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      CUDA-Sankoff: Using GPU to Accelerate the Pairwise Structural RNA Alignment

      Sundfeld, D., Havgaard, Jakob Hull, Gorodkin, Jan & De Melo, A. C. M. A., 2017, Proceedings: 2017 25th Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and Network-Based Processing, PDP 2017. IEEE, s. 295-302 8 s. 7912663

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      RAIN: RNA-protein Association and Interaction Networks

      Junge, A., Refsgaard, J. C., Garde, C., Pan, X., Santos, A., Alkan, F., Anthon, Christian, von Mering, C., Workman, C. T., Jensen, Lars Juhl & Gorodkin, Jan, 2017, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2017, 9 s., baw167.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      RIsearch2: suffix array-based large-scale prediction of RNA-RNA interactions and siRNA off-targets

      Alkan, F., Wenzel, Anne, Palasca, Oana, Kerpedjiev, P., Rudebeck, A. F., Stadler, P. F., Hofacker, I. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 8, 13 s., e60.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    8. Udgivet

      RNAscClust: Clustering RNA sequences using structure conservation and graph based motifs

      Miladi, M., Junge, A., Costa, F., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Gorodkin, Jan & Backofen, R., 2017, I: Bioinformatics. 33, 14, s. 2089-2096 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      The identification and functional annotation of RNA structures conserved in vertebrates

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Hansen, C., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Torarinsson, E., Yao, Z., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Nielsen, Henrik, Tommerup, Niels, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Genome Research. 27, s. 1371-1383 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    ID: 4356276