Jakob Nybo Nissen

Jakob Nybo Nissen

Adjunkt, Adjungeret professor

Medlem af:


    Udgivelsesår:
    1. 2023
    2. Udgivet

      Adversarial and variational autoencoders improve metagenomic binning

      Piera Líndez, Pau, Johansen, Joachim, Kutuzova, Svetlana, Sigurdsson, Arnór Ingi, Nissen, Jakob Nybo & Rasmussen, S., 2023, I: Communications Biology . 6, 10 s., 1073.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Discovery of drug-omics associations in type 2 diabetes with generative deep-learning models: [with Author Correction]

      Allesøe, R. L., Lundgaard, A. T., Hernández Medina, R., Aguayo-Orozco, A., Johansen, J., Nissen, J. N., Brorsson, C., Mazzoni, G., Niu, L., Biel, J. H., Brasas, V., Webel, H., Benros, M. E., Pedersen, A. G., Chmura, P. J., Jacobsen, U. P., Mari, A., Koivula, R., Mahajan, A., Vinuela, A. & 31 flere, Tajes, J. F., Sharma, S., Haid, M., Hong, M., Musholt, P. B., De Masi, F., Vogt, J., Pedersen, H. K., Gudmundsdottir, V., Jones, A., Kennedy, G., Bell, J., Thomas, E. L., Frost, G., Thomsen, Henrik S., Hansen, E., Hansen, T. H., drb459, drb459, Muilwijk, M., Blom, M. T., 't Hart, L. M., Pattou, F., Raverdy, V., Brage, S., Ridderstråle, M., Pedersen, Oluf Borbye, Hansen, Torben, Banasik, Karina, Rasmussen, Simon, Brunak, Søren & IMI-DIRECT consortium, I. C., 2023, I: Nature Biotechnology. 41, 3, s. 399–408 18 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Experimental infection of pigs and ferrets with "pre-pandemic," human-adapted, and swineadapted variants of the H1N1pdm09 influenza A virus reveals significant differences in viral dynamics and pathological manifestations

      Kristensen, Charlotte, Laybourn, H. A., Crumpton, J. C., Martiny, Karen, Webb, A., Ryt-Hansen, Pia, Trebbien, R., Jensen, Henrik Elvang, Nissen, Jakob Nybo, Skovgaard, K., Webby, R. J. & Larsen, Lars, 2023, I: PLoS Pathogens. 19, 12, 23 s., e1011838.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. 2022
    6. Udgivet

      Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges

      Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. & 83 flere, Darling, A. E., Egan, R., Eskin, E., Georganas, E., Goltsman, E., Gray, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Hofmeyr, S., Huang, P., Irber, L., Jia, H., Jørgensen, T. S., Kieser, S. D., Klemetsen, T., Kola, A., Kolmogorov, M., Korobeynikov, A., Kwan, J., LaPierre, N., Lemaitre, C., Li, C., Limasset, A., Malcher-Miranda, F., Mangul, S., Marcelino, V. R., Marchet, C., Marijon, P., Meleshko, D., Mende, D. R., Milanese, A., Nagarajan, N., Nissen, Jakob Nybo, Nurk, S., Oliker, L., Paoli, L., Peterlongo, P., Piro, V. C., Porter, J. S., Rasmussen, Simon, Rees, E. R., Reinert, K., Renard, B., Robertsen, E. M., Rosen, G. L., Ruscheweyh, H. J., Sarwal, V., Segata, N., Seiler, E., Shi, L., Sun, F., Sunagawa, S., Sørensen, Søren Johannes, Thomas, A., Tong, C., Trajkovski, M., Tremblay, J., Uritskiy, G., Vicedomini, R., Wang, Z., Wang, Z., Wang, Z., Warren, A., Willassen, N. P., Yelick, K., You, R., Zeller, G., Zhao, Z., Zhu, S., Zhu, J., Garrido-Oter, R., Gastmeier, P., Hacquard, S., Häußler, S., Khaledi, A., Maechler, F., Mesny, F., Radutoiu, S., Schulze-Lefert, P., Smit, N., Strowig, T., Bremges, A., Sczyrba, A. & McHardy, A. C., 2022, I: Nature Methods. 19, 4, s. 429-440

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Severe Human Case of Zoonotic Infection with Swine-Origin Influenza A Virus, Denmark, 2021

      Andersen, K. M., Vestergaard, L. S., Nissen, Jakob Nybo, George, Sophie Joanna, Ryt-Hansen, Pia, Hjulsager, C. K., Krog, J. S., Skov, M. N., Alexandersen, S., Larsen, Lars & Trebbien, R., 2022, I: Emerging Infectious Diseases . 28, 12, s. 2561-2564 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    ID: 301778210