Gabriel Renaud

Gabriel Renaud

Postdoc


  1. 2024
  2. Udgivet

    100 ancient genomes show repeated population turnovers in Neolithic Denmark

    Allentoft, M. E., Sikora, M., Fischer, A., Sjögren, K-G., Ingason, A., Macleod, R., Rosengren, A., Schulz Paulsson, B., Jørkov, M. L. S., Novosolov, M., Stenderup, J., Price, T. D., Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Sørensen, L., Nielsen, P. O., Rasmussen, P., Jensen, T. Z. T., Refoyo-Martínez, A. & 48 flere, Irving-Pease, Evan, Barrie, William, Pearson, A., Sousa da Mota, B., Demeter, Fabrice, Henriksen, Rasmus Henrik Amund, Vimala, Tharsika, McColl, Hugh, Vaughn, Andrew Howland, Vinner, Lasse, Renaud, Gabriel, Stern, A., Johannsen, N. N., Ramsøe, Abigail Daisy, Schork, A. J., Ruter, Anthony Henry, Gotfredsen, Anne Birgitte, Nielsen, B. H., Petersen, Erik Brinch, Kannegaard, E., Hansen, J., Pedersen, K. B., Pedersen, L., Klassen, L., Meldgaard, Morten, Johansen, M., Uldum, O. C., Lotz, P., Lysdahl, P., Bangsgaard, Pernille, Petersen, P. V., Maring, R., Iversen, Rune, Wåhlin, S., Sørensen, S. A., Andersen, S. H., Jørgensen, T., Lynnerup, Niels, Lawson, D. J., Rasmussen, Simon, Korneliussen, Thorfinn Sand, Kjær, Kurt H., Durbin, R., Nielsen, Rasmus, Delaneau, O., Werge, Thomas, Kristiansen, Kristian & Willerslev, Eske, 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 329-337 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Population genomics of post-glacial western Eurasia

    Allentoft, M. E., Sikora, M., Refoyo-Martínez, A., Irving-Pease, E. K., Fischer, A., Barrie, W., Ingason, A., Stenderup, J., Sjögren, K-G., Pearson, A., da Mota, B. S., Paulsson, B. S., Halgren, A., Macleod, R., Jørkov, M. L. S., Demeter, F., Sørensen, L., Nielsen, P. O., Henriksen, R. A., Vimala, T. & 144 flere, McColl, Hugh, Margaryan, Ashot, Ilardo, M., Vaughn, Andrew Howland, Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Johannsen, N. N., Rasmussen, P., Vinner, Lasse, Renaud, Gabriel, Stern, A., Jensen, Theis Zetner Trolle, Scorrano, Gabriele, Schroeder, Hannes, Lysdahl, P., Ramsøe, Abigail Daisy, Skorobogatov, A., Schork, A. J., Rosengren, A., Ruter, Anthony Henry, Outram, A., Timoshenko, A. A., Buzhilova, A., Coppa, A., Zubova, A., Silva, A. M., Hansen, Anders Johannes, Gromov, A., Logvin, A., Gotfredsen, Anne Birgitte, Nielsen, B. H., González-Rabanal, B., Lalueza-Fox, C., McKenzie, C. J., Gaunitz, Charleen, Blasco, C., Liesau, C., Martinez-Labarga, C., Pozdnyakov, D. V., Cuenca-Solana, D., Lordkipanidze, D. O., En’shin, D., Salazar-García, D. C., Price, T. D., Borić, D., Kostyleva, E., Veselovskaya, E. V., Usmanova, E. R., Cappellini, Enrico, Petersen, Erik Brinch, Kannegaard, E., Radina, F., Yediay, Fulya Eylem, Duday, H., Gutiérrez-Zugasti, I., Merts, I., Potekhina, I., Shevnina, I., Altinkaya, Isin, Guilaine, J., Hansen, J., Tortosa, J. E. A., Zilhão, J., Vega, J., Pedersen, K. B., Tunia, K., Zhao, Lei, Mylnikova, L. N., Larsson, L., Metz, L., Yepiskoposyan, L., Pedersen, L., Sarti, L., Orlando, L., Slimak, L., Klassen, L., Blank, M., González-Morales, M., Silvestrini, M., Vretemark, M., Nesterova, M. S., Rykun, M., Rolfo, M. F., Szmyt, M., Przybyła, M., Calattini, M., Sablin, M., Dobisíková, M., Meldgaard, Morten, Johansen, M., Berezina, N., Card, N., Saveliev, N. A., Poshekhonova, O., Rickards, O., Lozovskaya, O. V., Gábor, O., Uldum, O. C., Aurino, P., Kosintsev, P., Courtaud, P., Ríos, P., Mortensen, P., Lotz, P., Persson, P., Bangsgaard, Pernille, de Barros Damgaard, P., Vang Petersen, P., Martinez, P. P., Włodarczak, P., Smolyaninov, R. V., Maring, R., Menduiña, R., Badalyan, R., Iversen, Rune, Turin, R., Vasilyev, S., Wåhlin, S., Borutskaya, S., Skochina, S., Sørensen, S. A., Andersen, S. H., Jørgensen, T., Serikov, Y. B., Molodin, V. I., Smrcka, V., Merts, V., Appadurai, V., Moiseyev, V., Magnusson, Y., Kjær, Kurt H., Lynnerup, Niels, Lawson, D. J., Sudmant, P. H., Rasmussen, Simon, Korneliussen, Thorfinn Sand, Durbin, R., Nielsen, Rasmus, Delaneau, O., Werge, Thomas, Racimo, Fernando, Kristiansen, Kristian & Willerslev, Eske, 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 301-311

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. 2022
  5. Udgivet

    Benchmarking freely available HLA typing algorithms across varying genes, coverages and typing resolutions

    Thuesen, N. H., Klausen, M. S., Gopalakrishnan, Shyam, Trolle, T. & Renaud, Gabriel, 2022, I: Frontiers in Immunology. 13, 15 s., 987655.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Population Genomics of Stone Age Eurasia

    Allentoft, M. E., Sikora, M., Refoyo-Martínez, A., Irving-Pease, E. K., Fischer, A., Barrie, W., Ingason, A., Stenderup, J., Sjögren, K-G., Pearson, A., Mota, B., Paulsson, B. S., Halgren, A., Macleod, R., Schjellerup Jørkov, M. L., Demeter, F., Novosolov, M., Sørensen, L., Nielsen, P-O., Henriksen, R. H. A. & 143 flere, Vimala, Tharsika, McColl, Hugh, Margaryan, Ashot, Ilardo, M., Vaughn, A., Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Rasmussen, P., Vinner, Lasse, Renaud, Gabriel, Stern, A., Jensen, Theis Zetner Trolle, Johannsen, N. N., Scorrano, Gabriele, Schroeder, Hannes, Lysdahl, P., Ramsøe, Abigail Daisy, Skorobogatov, A., Schork, A. J., Rosengren, A., Ruter, Anthony Henry, Outram, A., Timoshenko, A. A., Buzhilova, A., Coppa, A., Zubova, A., Silva, A. M., Hansen, Anders Johannes, Gromov, A., Logvin, A., Gotfredsen, Anne Birgitte, Nielsen, B. H., González-Rabanal, B., Lalueza-Fox, C., McKenzie, C. J., Gaunitz, Charleen, Blasco, C., Liesau, C., Martinez-Labarga, C., Pozdnyakov, D. V., Cuenca-Solana, D., Lordkipanidze, D. O., En’shin, D., Salazar-García, D. C., Price, T. D., Borić, D., Kostyleva, E., Veselovskaya, E. V., Usmanova, E. R., Cappellini, Enrico, Petersen, Erik Brinch, Kannegaard, E., Radina, F., Yediay, Fulya Eylem, Duday, H., Gutiérrez-Zugasti, I., Potekhina, I., Shevnina, I., Altinkaya, Isin, Guilaine, J., Hansen, J., Tortosa, J. E. A., Zilhão, J., Vega, J., Pedersen, K. B., Tunia, K., Zhao, Lei, Mylnikova, L. N., Larsson, L., Metz, L., Yeppiskoposyan, L., Pedersen, L., Sarti, L., Orlando, L., Slimak, L., Klassen, L., Blank, M., González-Morales, M., Silvestrini, M., Vretemark, M., Nesterova, M. S., Rykun, M., Rolfo, M. F., Szmyt, M., Przybyła, M., Calattini, M., Sablin, M., Dobisíková, M., Meldgaard, Morten, Johansen, M., Berezina, N., Card, N., Saveliev, N. A., Poshekhonova, O., Rickards, O., Lozovskaya, O. V., Uldum, O. C., Aurino, P., Kosintsev, P., Courtaud, P., Ríos, P., Mortensen, P., Lotz, P., Persson, P. Å., Bangsgaard, Pernille, Damgaard, P. D. B., Petersen, P. V., Martinez, P. P., Włodarczak, P., Smolyaninov, R. V., Maring, R., Menduiña, R., Badalyan, R., Iversen, Rune, Turin, R., Vasilyiev, S., Wåhlin, S., Borutskaya, S., Skochina, S., Sørensen, S. A., Andersen, S. H., Jørgensen, T., Serikov, Y. B., Molodin, V. I., Smrcka, V., Merz, V., Appadurai, V., Moiseyev, V., Magnusson, Y., Kjær, Kurt H., Lynnerup, Niels, Lawson, D. J., Sudmant, P. H., Rasmussen, Simon, Korneliussen, Thorfinn Sand, Durbin, R., Nielsen, R., Delaneau, O., Werge, Thomas, Racimo, Fernando, Kristiansen, K. & Willerslev, Eske, 2022, s. 1-71, (bioRxiv).

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  7. 2020
  8. Udgivet

    A likelihood method for estimating present-day human contamination in ancient male samples using low-depth X-chromosome data

    Moreno-Mayar, J. V., Korneliussen, Thorfinn Sand, Dalal, J., Renaud, Gabriel, Albrechtsen, Anders, Nielsen, Rasmus & Malaspinas, A., 2020, I: Bioinformatics. 36, 3, s. 828-841 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Population genomics of the Viking world: [incl. correction]

    Margaryan, A., Lawson, D. J., Sikora, M., Racimo, F., Rasmussen, S., Moltke, I., Cassidy, L. M., Jørsboe, E., Ingason, A., Pedersen, M. W., Korneliussen, T., Wilhelmson, H., Buś, M. M., de Barros Damgaard, P., Martiniano, R., Renaud, G., Bhérer, C., Moreno-Mayar, J. V., Fotakis, A. K., Allen, M. & 30 flere, Allmäe, R., Molak, M., Cappellini, Enrico, Scorrano, Gabriele, McColl, Hugh, Buzhilova, A., Fox, A., Albrechtsen, Anders, Schütz, B., Skar, B., Arcini, C., Lundstrøm, I., Cheng, J., Stenderup, Jesper Tandberg, Iversen, K. H., Arge, S. V., Ellingvåg, S., Orlando, L., Pentz, P., Jessen, M. D., Pedersen, A., Jørkov, M L S, Lynnerup, Niels, Gilbert, M Thomas P, Allentoft, Morten Erik, Sindbæk, S. M., Kristiansen, K., Nielsen, Rasmus, Werge, Thomas & Willerslev, Eske, 2020, I: Nature. 585, 7825, s. 390-396 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. 2019
  11. Udgivet

    The repertoire of family A-peptide GPCRs in archaic hominins

    Mata, X., Renaud, Gabriel & Mollereau, C., dec. 2019, I: Peptides. 122, 16 s., 170154.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Authentication and assessment of contamination in ancient DNA

    Renaud, Gabriel, Schubert, Mikkel, Sawyer, S. & Orlando, L., 2019, Ancient DNA: Methods and Protocols. Shapiro, B., Barlow, A., Heintzman, P. D., Hofreiter, M., Paijmans, J. L. A. & Soares, A. E. R. (red.). 2. ed. udg. Humana Press, s. 163-194 32 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1963).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    DamMet: ancient methylome mapping accounting for errors, true variants, and post-mortem DNA damage

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, Renaud, Gabriel, Albrechtsen, Anders & Orlando, L., 2019, I: GigaScience. 8, 4, 6 s., giz025.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Joint Estimates of Heterozygosity and Runs of Homozygosity for Modern and Ancient Samples

    Renaud, Gabriel, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Korneliussen, Thorfinn Sand, Willerslev, Eske & Orlando, L., 2019, I: Genetics (Print). 212, 3, s. 587-614 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    The genetic origins of Saint Helena’s liberated Africans

    Sandoval-Velasco, Marcela, Jagadeesan, A., Ávila-Arcos, M. C., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Moreno Mayar, J. Víctor, Renaud, Gabriel, Cruz-Dávalos, D. I., Johannesdóttir, E., Watson, J., Robson-Brown, K., Pearson, A., Helgason, A., Gilbert, M Thomas P & Schroeder, Hannes, 2019, bioRxiv, 16 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  16. Udgivet

    The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene

    Sikora, M., Pitulko, V. V., Sousa, V. C., Allentoft, M. E., Vinner, L., Rasmussen, S., Margaryan, A., Damgaard, P. D. B., de la Fuente Castro, C., Renaud, G., Yang, M. A., Fu, Q., Dupanloup, I., Giampoudakis, K., Nogues, D. B., Rahbek, C., Kroonen, G., Peyrot, M., McColl, H., Vasilyev, S. V. & 27 flere, Veselovskaya, E., Gerasimova, M., Pavlova, E. Y., Chasnyk, V. G., Nikolskiy, P. A., Gromov, A. V., Khartanovich, V. I., Moiseyev, V., Grebenyuk, P. S., Fedorchenko, A. Y., Lebedintsev, A. I., Slobodin, S. B., Malyarchuk, B. A., Martiniano, R., Meldgaard, Morten, Arppe, L., Palo, J. U., Sundell, T., Mannermaa, K., Putkonen, M., Alexandersen, V., Primeau, C., Baimukhanov, N., Malhi, R. S., Sjögren, K. G., Nielsen, Rasmus & Willerslev, Eske, 2019, I: Nature. 570, s. 182–188

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. 2018
  18. Udgivet

    137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes

    Damgaard, P. D. B., Marchi, N., Rasmussen, S., Peyrot, M., Renaud, G., Korneliussen, T. S., Moreno-Mayar, J. V., Pedersen, M. W., Goldberg, A., Usmanova, E., Baimukhanov, N., Loman, V., Hedeager, L., Pedersen, A. G., Nielsen, K., Afanasievl, G., Akmatov, K., Aldashev, A., Alpaslan, A., Baimbetov, G. & 55 flere, Bazaliiskii, V. I., Beisenov, A., Boldbaatar, B., Boldgiv, B., Dorzhu, C., Ellingvag, S., Erdenebaatar, D., Dajani, R., Dmitriev, E., Evdokimov, V., Frei, K. M., Gromov, A., Goryachev, A., Hakonarson, H., Hegay, T., Khachatryan, Z., Khaskhanov, R., Kitov', E., Kolbina, A., Kubatbek, T., Kukushkin, A., Kukushkin, I., Lau, N., Margaryan, Ashot, Merkyte, Inga, Mertz, I. V., Mertz, V. K., Mijiddorj, E., Moiyesev, V., Mukhtarova, G., Nurmukhanbetov, B., Orozbekova, Z., Panyushkina, I., Pieta, K., Smrčka, V., Shevnina, I., Logvin, A., Sjögren, K., Štolcová, T., Tashbaeva, K., Tkachev, A., Tulegenov, T., Voyakin, D., Yepiskoposyan, L., Undrakhbold, S., Varfolomeev, V., Weber, A., Kradin, N., Allentoft, Morten Erik, Orlando, L. A. A., Nielsen, Rasmus, Sikora, Martin, Heyer, E., Kristiansen, K. & Willerslev, Eske, 2018, I: Nature. 557, 7705, s. 369-374 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Glactools: a command-line toolset for the management of genotype likelihoods and allele counts

    Renaud, Gabriel, 2018, I: Bioinformatics (Online). 34, 8, s. 1398-1400 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Improved de novo genomic assembly for the domestic donkey

    Renaud, Gabriel, Petersen, Bent, Seguin-orlando, A., Bertelsen, Mads Frost, Waller, A., Newton, R., Paillot, R., Bryant, N., Vaudin, M., Librado, P. & Orlando, L., 2018, I: Science Advances. 4, 4, eaaq0392.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Origins and genetic legacies of the Caribbean Taino

    Schroeder, H., Sikora, M., Gopalakrishnan, S., Cassidy, L. M., Delserc, P. M., Velasco, M. S., Schraiber, J. G., Rasmussen, S., Homburger, J. R., Avila-Arcos, M. C., Allentoft, M. E., Moreno Mayar, J. V., Renaud, G., Gomez-Carballa, A., Laffoon, J. E., Hopkins, R. J. A., Higham, T. F. G., Carr, R. S., Schaffer, W. C., Day, J. S. & 7 flere, Hoogland, M., Salas, A., Bustamante, C. D., Nielsen, R., Bradley, D. G., Hofman, C. L. & Willerslev, Eske, 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 10, s. 2341-2346 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. 2017
  23. Udgivet

    Ancient genomes show social and reproductive behavior of early Upper Paleolithic foragers

    Sikora, M., Seguin-Orlando, A., Sousa, V. C., Albrechtsen, A., Korneliussen, T. S., Ko, A., Rasmussen, S., Dupanloup, I., Nigst, P. R., Bosch, M. D., Renaud, G., Allentoft, M. E., Margaryan, A., Vasilyev, S. V., Veselovskaya, E. V., Borutskaya, S. B., Deviese, T., Comeskey, D., Higham, T., Manica, A. & 7 flere, Foley, R., Meltzer, D. J., Nielsen, Rasmus, Excoffler, L., Lahr, M. M., Orlando, L. A. A. & Willerslev, Eske, 3 nov. 2017, I: Science. 358, 6363, s. 659-662 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    gargammel: a sequence simulator for ancient DNA

    Renaud, Gabriel, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Willerslev, Eske & Orlando, L. A. A., 2017, I: Bioinformatics. 33, 4, s. 577-579 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 159691865