Finn Cilius Nielsen

Molecular subtyping improves breast cancer diagnosis in the Copenhagen Breast Cancer Genomics Study

Berg, T., Jensen, M. B., Celik, A., Talman, M. L., Misiakou, M. A., Knoop, A. S., Nielsen, Finn Cilius, Ejlertsen, Bent Laursen & Rossing, Caroline Maria, 2024, I: JCI insight. 9, 7, 13 s., e178114.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Multigene profiles to guide the use of neoadjuvant chemotherapy for breast cancer: a Copenhagen Breast Cancer Genomics Study

Jensen, M., Pedersen, C. B., Misiakou, M., Talman, M. L. M., Gibson, L., Tange, U. B., Kledal, H., Vejborg, I., Kroman, Niels Thorndahl, Nielsen, Finn Cilius, Ejlertsen, Bent Laursen & Rossing, M., 2023, I: npj Breast Cancer. 9, 8 s., 47.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Neoepitope load, T cell signatures and PD-L2 as combined biomarker strategy for response to checkpoint inhibition immunotherapy

Borch, A., Bjerregaard, A. M., Araujo Barbosa de Lima, V., Østrup, O., Yde, C. W., Eklund, A. C., Mau-Sørensen, M., Barra, C., Svane, Inge Marie, Nielsen, Finn Cilius, Funt, S. A., Lassen, Ulrik Niels & Hadrup, S. R., 2023, I: Frontiers in Genetics. 14, 13 s., 1058605.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

New pathogenic germline variants identified in mesothelioma

Belcaid, L., Bertelsen, B., Wadt, Karin Anna Wallentin, Tuxen, I., Spanggaard, I., Højgaard, M., Sørensen, Jens Benn, Ravn, J., Lassen, Ulrik Niels, Nielsen, Finn Cilius, Rohrberg, K. & Westmose Yde, C., 2023, I: Lung Cancer. 179, 8 s., 107172.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Ovarian cancer pathology characteristics as predictors of variant pathogenicity in BRCA1 and BRCA2

AOCS Group, A. G., CZECANCA Consortium, C. C., The Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2, T. C. O. I. O. M. O. B., Evidence-based Network for the Interpretation of Germline Mutant Alleles Consortium, E. N. F. T. I. O. G. M. A. C., HEBON Investigators, H. I. & GEMO Study Collaborators, G. S. C., 2023, I: British Journal of Cancer. 128, 12, s. 2283-2294 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Incidence, Survival, and HPV Impact of Second Primary Cancer following Primary Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma: A 20-Year Retrospective and Population-Based Study

Andersen, L., Jakobsen, K. K., Carlander, A. L. F., Garset-Zamani, M., Friborg, Jeppe Tang, Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius, Andersen, E., Grønhøj, Christian & von Buchwald, Christian, 2023, I: Viruses. 15, 1, 34.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Intestinal metaplasia is a precursor lesion for sinonasal intestinal-type adenocarcinoma: genomic investigation of a case proving this hypothesis

Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, Filipe Garrett, Woller, N. C., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, jan. 2022, I: APMIS. 130, 1, s. 53-56 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

A catalog of curated breast cancer genes

Bose, M., Benada, Jan, Thatte, Jayashree Vijay, Kinalis, S., Ejlertsen, Bent Laursen, Nielsen, Finn Cilius, Sørensen, Claus Storgaard & Rossing, Caroline Maria, 2022, I: Breast Cancer Research and Treatment. 191, s. 431-441

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Benchmarking full-length transcript single cell mRNA sequencing protocols

Probst, V., Simonyan, Arman, Pacheco, F., Guo, Yuliu, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: BMC Genomics. 23, 860.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Differences in gene expression despite identical histomorphology in sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and metastases from colorectal adenocarcinoma

Sjöstedt, S., Vieira, Filipe Garrett, Karnov, K., Agander, T. K., Willemoe, G. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, 2022, I: APMIS. 130, 9, s. 551-559

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Extensive genomic analysis in patients with KRAS-mutated solid tumors shows high frequencies of concurrent alterations and potential targets but has limited clinical impact

Jacobsen, I. C., Spanggaard, I., Højgaard, M., Belcaid, L., Qvortrup, Camilla, Yde, C. W., Schmidt, A. Y., Nielsen, Finn Cilius, Willemoe, G. L., Dam, M. S., Lassen, Ulrik Niels & Staal Rohrberg, K., 2022, I: Acta Oncologica. 61, 12, s. 1499-1506 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Impact of specific high-risk human papillomavirus genotypes on survival in oropharyngeal cancer

Garset-Zamani, M., Carlander, A. F., Jakobsen, K. K., Friborg, Jeppe Tang, Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius, Andersen, E., Grønhøj, Christian & von Buchwald, Christian, 2022, I: International Journal of Cancer. 150, 7, s. 1174-1183

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Interpretable autoencoders trained on single cell sequencing data can transfer directly to data from unseen tissues

Walbech, J. S., Kinalis, S., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: Cells. 11, 12 s., 85.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

MicroRNA-9-3p: a novel predictor of neurological outcome after cardiac arrest

Beske, R. P., Bache, S., Meyer, M. A. S., Kjærgaard, Jesper, Bro-Jeppesen, J., Obling, L., Olsen, M. H., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Møller, Kirsten, Nielsen, N. & Hassager, Christian, 2022, I: European Heart Journal: Acute Cardiovascular Care. 11, 8, s. 609-616 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Personalized circulating tumor DNA in patients with hepatocellular carcinoma: a pilot study

Pommergaard, Hans-Christian L, Yde, C. W., Ahlborn, L. B., Andersen, C. L., Henriksen, T., Hasselby, Jane Preuss, Rostved, A. A., Sorensen, C. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, Finn Cilius & Rasmussen, Anne, 2022, I: Molecular Biology Reports. 49, 2, s. 1609-1616 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

Polygenic risk modeling for prediction of epithelial ovarian cancer risk

Dareng, E. O., Tyrer, J. P., Barnes, D. R., Jones, M. R., Yang, X., Aben, K. K. H., Adank, M. A., Agata, S., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antonenkova, N. N., Aravantinos, G., Arun, B. K., Augustinsson, A., Balmaña, J., Bandera, E. V., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Beckmann, M. W., Beeghly-Fadiel, A. & 39 flere, Benitez, J., Bermisheva, M., Bernardini, M. Q., Bjorge, L., Black, A., Bogdanova, N. V., Bonanni, B., Borg, A., Brenton, J. D., Budzilowska, A., Butzow, R., Buys, S. S., Cai, H., Caligo, M. A., Campbell, I., Cannioto, R., Cassingham, H., Chang-Claude, J., Chanock, S. J., Chen, K., Chiew, Y. E., Chung, W. K., Claes, K. B. M., Colonna, S., Hansen, Thomas van Overeem, Høgdall, Estrid Vilma Solyom, Høgdall, Claus Kim, Jensen, A., Kjær, Susanne Krüger, Nielsen, Finn Cilius, GEMO Study Collaborators, G. S. C., GC-HBOC Study Collaborators, G. S. C., EMBRACE Collaborators, E. C., OPAL Study Group, O. S. G., AOCS Group, A. G., kConFab Investigators, K. I., HEBON Investigators, H. I., OCAC Consortium, O. C. & CIMBA Consortium, C. C., 2022, I: European journal of human genetics : EJHG. 30, 3, s. 349-362 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Targeting the tumor mutanome for personalized vaccination in a TMB low non-small cell lung cancer

McCann, K., Von Witzleben, A., Thomas, J., Wang, C., Wood, O., Singh, D., Boukas, K., Bendjama, K., Silvestre, N., Nielsen, Finn Cilius, Thomas, G., Sanchez-Elsner, T., Greenbaum, J., Schoenberger, S., Peters, B., Vijayanand, P., Savelyeva, N. & Ottensmeier, C., 2022, I: Journal for ImmunoTherapy of Cancer. 10, 3, 14 s., e003821.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tumor mutational burden and purity adjustment before and after treatment with temozolomide in 27 paired samples of glioblastoma: a prospective study

Nørøxe, D. S., Flynn, A., Yde, C. W., Østrup, O., Nielsen, Finn Cilius, Skjøth, Jane, Brennum, J., Hamerlik, P., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Skovgaard Poulsen, H. & Lassen, Ulrik Niels, 2022, I: Molecular Oncology. 16, 1, s. 206-218

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers

GEMO Study Collaborators, G. S. C., EMBRACE Collaborators, E. C., kConFab Investigators, K. I., HEBON Investigators, H. I. & ABCTB Investigators, A. I., dec. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 22 s., 1078.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Clinical implications of intrinsic molecular subtypes of breast cancer for sentinel node status

Rossing, M., Pedersen, C. B., Tvedskov, Tove Filtenborg, Vejborg, I., Talman, M. L., Olsen, L. R., Kroman, Niels Thorndahl, Nielsen, Finn Cilius, Jensen, M. B. & Ejlertsen, Bent Laursen, dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 12 s., 2259.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Major driver mutations are shared between sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and the morphologically identical colorectal adenocarcinoma

Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, Filipe Garrett, Willemoe, G. L., Agander, T. K., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, apr. 2021, I: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology. 147, 4, s. 1019-1027 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Achromobacter spp. genetic adaptation in cystic fibrosis

Gabrielaite, M., Nielsen, Finn Cilius, Johansen, Helle Krogh & Marvig, R. L., 2021, I: Microbial genomics. 7, 7, 13 s., 000582.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data

Gabrielaite, M., Torp, M. H., Rasmussen, Malthe Sebro, Andreu-Sánchez, S., Vieira, Filipe Garrett, Pedersen, C. B., Kinalis, S., Madsen, M. B., Kodama, M., Demircan, G. S., Simonyan, A., Yde, C. W., Olsen, L. R., Marvig, R. L., Østrup, O., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2021, I: Cancers. 13, 24, 6283.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A simple, safe and sensitive method for SARS-CoV-2 inactivation and RNA extraction for RT-qPCR

Kalnina, L., Mateu-Regué, À., Oerum, S., Hald, A., Gerstoft, Jan, Oerum, H., Nielsen, Finn Cilius & Iversen, A. K. N., 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 393-400 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genomic alterations in human papillomavirus-positive and -negative conjunctival squamous cell carcinomas

Ramberg, Ingvild Margrethe Sellæg, Vieira, Filipe Garrett, Toft, Peter Bjerre, von Buchwald, Christian, Funding, M., Nielsen, Finn Cilius & Heegaard, Steffen, 2021, I: Investigative Ophthalmology and Visual Science. 62, 14, 11.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Transmission and Antibiotic Resistance of Achromobacter in Cystic Fibrosis

Gabrielaite, M., Bartell, J. A., Nørskov-Lauritsen, N., Pressler, T., Nielsen, Finn Cilius, Johansen, Helle Krogh & Marviga, R. L., 2021, I: Journal of Clinical Microbiology. 59, 4, e02911-20.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Unveiling mRNP composition by fluorescence correlation and cross-correlation spectroscopy using cell lysates

Mateu-Regué, À., Christiansen, Jan, Bagger, F. O., Hellriegel, C. & Nielsen, Finn Cilius, 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 20, 15 s., e119.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Polygenic risk scores and breast and epithelial ovarian cancer risks for carriers of BRCA1 and BRCA2 pathogenic variants

Barnes, D. R., Rookus, M. A., Mcguffog, L., Leslie, G., Mooij, T. M., Dennis, J., Mavaddat, N., Adlard, J., Ahmed, M., Aittomäki, K., Andrieu, N., Andrulis, I. L., Arnold, N., Arun, B. K., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Benitez, J., Berthet, P. & 31 flere, Białkowska, K., Blanco, A. M., Blok, M. J., Bonanni, B., Boonen, S. E., Borg, Å., Bozsik, A., Bradbury, A. R., Brennan, P., Brewer, C., Brunet, J., Buys, S. S., Caldés, T., Caligo, M. A., Campbell, I., Christensen, L. L., Chung, W. K., Claes, K. B. M., Colas, C., Collonge-rame, M., Cook, J., Daly, M. B., Davidson, R., De La Hoya, M., De Putter, R., Delnatte, C., Devilee, P., Ejlertsen, Bent Laursen, Gerdes, Anne-Marie Axø, Nielsen, Finn Cilius & Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA and BRCA2, C. O. I. O. M. O. B. A. B., 1 okt. 2020, I: Genetics in Medicine. 22, 10, s. 1653-1666 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Germline RBBP8 variants associated with early-onset breast cancer compromise replication fork stability

Zarrizi, R., Higgs, M. R., Voßgröne, Karolin, Rossing, M., Bertelsen, B., Bose, M., Kousholt, A. N., Rösner, Heike Ilona, Network, T. C., Ejlertsen, Bent Laursen, Stewart, G. S., Nielsen, Finn Cilius & Sørensen, Claus Storgaard, 3 aug. 2020, I: The Journal of Clinical Investigation. 130, 8, s. 4069-4080 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genome-wide association study identifies 32 novel breast cancer susceptibility loci from overall and subtype-specific analyses

Zhang, H., Ahearn, T. U., Lecarpentier, J., Barnes, D., Beesley, J., Qi, G., Jiang, X., O'Mara, T. A., Zhao, N., Bolla, M. K., Dunning, A. M., Dennis, J., Wang, Q., Ful, Z. A., Aittomäki, K., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Arndt, V., Aronson, K. J., Arun, B. K. & 31 flere, Auer, P. L., Azzollini, J., Barrowdale, D., Becher, H., Beckmann, M. W., Behrens, S., Benitez, J., Bermisheva, M., Bialkowska, K., Blanco, A., Blomqvist, C., Bogdanova, N. V., Bojesen, Stig Egil, Bonanni, B., Bondavalli, D., Borg, A., Brauch, H., Brenner, H., Briceno, I., Broeks, A., Brucker, S. Y., Brüning, T., Burwinkel, B., Buys, S. S., Byers, H., Caldés, T., Caligo, M. A., Christiansen, H., Lænkholm, Anne-Vibeke, Nielsen, Finn Cilius & kConFab Investigators, K. I., jun. 2020, I: Nature Genetics. 52, 6, s. 572-581 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tumor miRNA expression profile is related to vestibular schwannoma growth rate

Sass, H. C. R., Hansen, M., Borup, R., Nielsen, Finn Cilius & Cayé-Thomasen, Per, maj 2020, I: Acta Neurochirurgica. 162, 5, s. 1187-1195 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Number of Signaling Pathways Altered by Driver Mutations in Chronic Lymphocytic Leukemia Impacts Disease Outcome

Brieghel, C., da Cunha-Bang, C., Yde, C. W., Schmidt, A. Y., Kinalis, S., Nadeu, F., Andersen, M. A., Jacobsen, L. O., Andersen, M. K., Pedersen, L. B., Delgado, J., Baumann, T., Mattsson, M., Mansouri, L., Rosenquist, R., Campo, E., Nielsen, Finn Cilius & Niemann, Carsten, 15 mar. 2020, I: Clinical Cancer Research. 26, 6, s. 1507-1515 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Association of Genomic Domains in BRCA1 and BRCA2 with Prostate Cancer Risk and Aggressiveness

Patel, V. L., Busch, E. L., Friebel, T. M., Cronin, A., Leslie, G., McGuffog, L., Adlard, J., Agata, S., Agnarsson, B. A., Ahmed, M., Aittomäki, K., Alducci, E., Andrulis, I. L., Arason, A., Arnold, N., Artioli, G., Arver, B., Auber, B., Azzollini, J., Balmaña, J. & 243 flere, Barkardottir, R. B., Barnes, D. R., Barroso, A., Barrowdale, D., Belotti, M., Benitez, J., Bertelsen, B., Blok, M. J., Bodrogi, I., Bonadona, V., Bonanni, B., Bondavalli, D., Boonen, S. E., Borde, J., Borg, A., Bradbury, A. R., Brady, A., Brewer, C., Brunet, J., Buecher, B., Buys, S. S., Cabezas-Camarero, S., Caldés, T., Caliebe, A., Caligo, M. A., Calvello, M., Campbell, I. G., Carnevali, I., Carrasco, E., Chan, T. L., Chu, A. T. W., Chung, W. K., Claes, K. B. M., Collaborators, G. S., Collaborators, E., Cook, J., Cortesi, L., Couch, F. J., Daly, M. B., Damante, G., Darder, E., Davidson, R., de la Hoya, M., Puppa, L. D., Dennis, J., Díez, O., Ding, Y. C., Ditsch, N., Domchek, S. M., Donaldson, A., Dworniczak, B., Easton, D. F., Eccles, D. M., Eeles, R. A., Ehrencrona, H., Ejlertsen, Bent Laursen, Engel, C., Evans, D. G., Faivre, L., Faust, U., Feliubadaló, L., Foretova, L., Fostira, F., Fountzilas, G., Frost, D., García-Barberán, V., Garre, P., Gauthier-Villars, M., Géczi, L., Gehrig, A., Gerdes, Anne-Marie Axø, Gesta, P., Giannini, G., Glendon, G., Godwin, A. K., Goldgar, D. E., Greene, M. H., Gutierrez-Barrera, A. M., Hahnen, E., Hamann, U., Hauke, J., Herold, N., Hogervorst, F. B. L., Honisch, E., Hopper, J. L., Hulick, P. J., Investigators, K., Investigators, H., Izatt, L., Jager, A., James, P., Janavicius, R., Jensen, U. B., Jensen, T. D., Johannsson, O. T., John, E. M., Joseph, V., Kang, E., Kast, K., Kiiski, J. I., Kim, S., Kim, Z., Ko, K., Konstantopoulou, I., Kramer, G., Krogh, L., Kruse, T. A., Kwong, A., Larsen, M., Lasset, C., Lautrup, C., Lazaro, C., Lee, J., Lee, J. W., Lee, M. H., Lemke, J., Lesueur, F., Liljegren, A., Lindblom, A., Llovet, P., Lopez-Fernández, A., Lopez-Perolio, I., Lorca, V., Loud, J. T., Ma, E. S. K., Mai, P. L., Manoukian, S., Mari, V., Martin, L., Matricardi, L., Mebirouk, N., Medici, V., Meijers-Heijboer, H. E. J., Meindl, A., Mensenkamp, A. R., Miller, C., Gomes, D. M., Montagna, M., Mooij, T. M., Moserle, L., Mouret-Fourme, E., Mulligan, A. M., Nathanson, K. L., Navratilova, M., Nevanlinna, H., Niederacher, D., Nielsen, Finn Cilius, Nikitina-Zake, L., Offit, K., Olah, E., Olopade, O. I., Ong, K., Osorio, A., Ott, C., Palli, D., Park, S. K., Parsons, M. T., Pedersen, I. S., Peissel, B., Peixoto, A., Pérez-Segura, P., Peterlongo, P., Petersen, A. H., Porteous, M. E., Pujana, M. A., Radice, P., Ramser, J., Rantala, J., Rashid, M. U., Rhiem, K., Rizzolo, P., Robson, M. E., Rookus, M. A., Rossing, C. M., Ruddy, K. J., Santos, C., Saule, C., Scarpitta, R., Schmutzler, R. K., Schuster, H., Senter, L., Seynaeve, C. M., Shah, P. D., Sharma, P., Shin, V. Y., Silvestri, V., Simard, J., Singer, C. F., Skytte, A., Snape, K., Solano, A. R., Soucy, P., Southey, M. C., Spurdle, A. B., Steele, L., Steinemann, D., Stoppa-Lyonnet, D., Stradella, A., Sunde, L., Sutter, C., Tan, Y. Y., Teixeira, M. R., Teo, S. H., Thomassen, M., Tibiletti, M. G., Tischkowitz, M., Tognazzo, S., Toland, A. E., Tommasi, S., Torres, D., Toss, A., Trainer, A. H., Tung, N., van Asperen, C. J., van der Baan, F. H., van der Kolk, L. E., van der Luijt, R. B., van Hest, L. P., Varesco, L., Varon-Mateeva, R., Viel, A., Vierstraete, J., Villa, R., von Wachenfeldt, A., Wagner, P., Wang-Gohrke, S., Wappenschmidt, B., Weitzel, J. N., Wieme, G., Yadav, S., Yannoukakos, D., Yoon, S., Zanzottera, C., Zorn, K. K., D'Amico, A. V., Freedman, M. L., Pomerantz, M. M., Chenevix-Trench, G., Antoniou, A. C., Neuhausen, S. L., Ottini, L., Nielsen, H. R. & Rebbeck, T. R., 1 feb. 2020, I: Cancer Research. 80, 3, s. 624-638 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Amplicon-Based NGS Panels for Actionable Cancer Target Identification in Follicular Cell-Derived Thyroid Neoplasia

Madsen, M. B., Kiss, K., Nielsen, Finn Cilius, Bennedbæk, F. N. & Rossing, M., 2020, I: Frontiers in Endocrinology. 11, 8 s., 146.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Chromothripsis and DNA Repair Disorders

Nazaryan, Lusine, Bjerregaard, Victoria Alexandra, Nielsen, Finn Cilius, Tommerup, Niels & Tümer, Asuman Zeynep, 2020, I: Journal of Clinical Medicine. 9, 3, 9 s., 613.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Cytoplasmic mRNPs revisited: Singletons and condensates

Mateu-Regue, A., Nielsen, Finn Cilius & Christiansen, Jan, 2020, I: BioEssays. 42, 12, 13 s., 2000097.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Fine-mapping of 150 breast cancer risk regions identifies 191 likely target genes

Fachal, L., Aschard, H., Beesley, J., Barnes, D. R., Allen, J., Kar, S., Pooley, K. A., Dennis, J., Michailidou, K., Turman, C., Soucy, P., Lemaçon, A., Lush, M., Tyrer, J. P., Ghoussaini, M., Marjaneh, M. M., Jiang, X., Agata, S., Aittomäki, K., Alonso, M. R. & 35 flere, Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antonenkova, N. N., Arason, A., Arndt, V., Aronson, K. J., Arun, B. K., Auber, B., Auer, P. L., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Beeghly-Fadiel, A., Benitez, J., Bermisheva, M., Białkowska, K., Blanco, A. M., Blomqvist, C., Blot, W., Bogdanova, N. V., Bojesen, Stig Egil, Bolla, M. K., Bonanni, B., Borg, A., Bosse, K., Brauch, H., Flyger, H., Nielsen, Finn Cilius, Wang, Q., ABCTB Investigators, A. I., GEMO Study Collaborators, G. S. C., EMBRACE Collaborators, E. C., kConFab Investigators, K. I. & HEBON Investigators, H. I., 2020, I: Nature Genetics. 52, 1, s. 56-73 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Gene loss and acquisition in lineages of pseudomonas aeruginosa evolving in cystic fibrosis patient airways

Gabrielaite, M., Johansen, Helle Krogh, Molin, S., Nielsen, Finn Cilius & Marvig, R. L., 2020, I: mBio. 11, 5, s. 1-16 16 s., e02359-20.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genomic profiling of newly diagnosed glioblastoma patients and its potential for clinical utility – a prospective, translational study

Nørøxe, D. S., Yde, C. W., Østrup, O., Michaelsen, Signe Regner, Schmidt, A. Y., Kinalis, S., Torp, M. H., Skjøth‐Rasmussen, J., Brennum, J., Hamerlik, P., Poulsen, H. S., Nielsen, Finn Cilius & Lassen, Ulrik Niels, 2020, I: Molecular Oncology.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Spectrum of FANCM Protein Truncating Variants in European Breast Cancer Cases

Figlioli, G., Kvist, A., Tham, E., Soukupova, J., Kleiblova, P., Muranen, T. A., Andrieu, N., Azzollini, J., Balmaña, J., Barroso, A., Benítez, J., Bertelsen, B., Blanco, A., Bonanni, B., Borg, Å., Brunet, J., Calistri, D., Calvello, M., Chvojka, S., Cortesi, L. & 31 flere, Darder, E., Del Valle, J., Diez, O., Eon-Marchais, S., Fostira, F., Gensini, F., Houdayer, C., Janatova, M., Kiiski, J. I., Konstantopoulou, I., Kubelka-Sabit, K., Lázaro, C., Lesueur, F., Manoukian, S., Marcinkute, R., Mickys, U., Moncoutier, V., Myszka, A., Nguyen-Dumont, T., Nielsen, Finn Cilius, Norvilas, R., Olah, E., Osorio, A., Papi, L., Peissel, B., Peixoto, A., Plaseska-Karanfilska, D., Pócza, T., Rossing, M., Rudaitis, V. & ENIGMA Consortium, E. C., 2020, I: Cancers. 12, 2, 10 s., 292.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The current epidemic of HPV-associated oropharyngeal cancer: An 18-year Danish population-based study with 2,169 patients

Zamani, M., Grønhøj, C., Jensen, D. H., Carlander, A. F., Agander, T., Kiss, K., Olsen, C., Baandrup, L., Nielsen, Finn Cilius, Andersen, E. V., Friborg, Jeppe Tang & von Buchwald, Christian, 2020, I: European Journal of Cancer. 134, s. 52-59

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Transcriptome-wide association study of breast cancer risk by estrogen-receptor status

Feng, H., Gusev, A., Pasaniuc, B., Wu, L., Long, J., Abu-full, Z., Aittomäki, K., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antoniou, A. C., Arason, A., Arndt, V., Aronson, K. J., Arun, B. K., Asseryanis, E., Auer, P. L., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir, R. B., Barnes, D. R. & 37 flere, Barrowdale, D., Beckmann, M. W., Behrens, S., Benitez, J., Bermisheva, M., Białkowska, K., Blanco, A., Blomqvist, C., Boeckx, B., Bogdanova, N. V., Bojesen, Stig Egil, Bolla, M. K., Bonanni, B., Borg, A., Brauch, H., Brenner, H., Briceno, I., Broeks, A., Brüning, T., Burwinkel, B., Cai, Q., Caldés, T., Caligo, M. A., Campbell, I., Canisius, S., Christiansen, H., Ejlertsen, Bent Laursen, Flyger, H., Nielsen, Finn Cilius, Wang, Q., ABCTB Investigators, A. I., HEBON Investigators, H. I., BCFR Investigators, B. I., OCGN Investigators, O. I., GEMO Study Collaborators, G. S. C., EMBRACE Collaborators, E. C. & GC-HBOC Study Collaborators, G. S. C., 2020, I: Genetic Epidemiology. 44, 5, s. 442-468

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ultra-fast detection and quantification of nucleic acids by amplification-free fluorescence assay

Uhd, J., Miotke, L., Ji, H. P., Dunaeva, M., Pruijn, G. J. M., Jørgensen, C. D., Kristoffersen, E. L., Birkedal, V., Yde, C. W., Nielsen, Finn Cilius, Hansen, J. & Astakhova, K., 2020, I: Analyst. 145, 17, s. 5836-5844 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Variant in ERAP1 promoter region is associated with low expression in a patient with a Behçet-like MHC-I-opathy

Dimopoulou, C., Lundgren, Jens, Sundal, J., Ullum, H., Aukrust, P., Nielsen, Finn Cilius & Marvig, R. L., 2020, I: Journal of Human Genetics. 65, 3, s. 325-335 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Deep targeted sequencing of TP53 in chronic lymphocytic leukemia: clinical impact at diagnosis and at time of treatment

Brieghel, C., Kinalis, S., Yde, C. W., Schmidt, A. Y., Jønson, L., Andersen, M. A., da Cunha-Bang, C., Pedersen, L. B., Geisler, C. H., Nielsen, Finn Cilius & Niemann, Carsten, apr. 2019, I: Haematologica. 104, 4, s. 789-796 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Application of cell-free DNA for genomic tumor profiling: a feasibility study

Ahlborn, L. B., Rohrberg, K. S., Gabrielaite, M., Tuxen, I. V., Yde, C. W., Spanggaard, I., Santoni Rugiu, Eric, Nielsen, Finn Cilius, Lassen, Ulrik Niels, Mau-Sorensen, M. & Østrup, O., feb. 2019, I: OncoTarget. 10, 14, s. 1388-1398

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Shared heritability and functional enrichment across six solid cancers

Jiang, X., Finucane, H. K., Schumacher, F. R., Schmit, S. L., Tyrer, J. P., Han, Y., Michailidou, K., Lesseur, C., Kuchenbaecker, K. B., Dennis, J., Conti, D. V., Casey, G., Gaudet, M. M., Huyghe, J. R., Albanes, D., Aldrich, M. C., Andrew, A. S., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antoniou, A. C. & 313 flere, Antonenkova, N. N., Arnold, S. M., Aronson, K. J., Arun, B. K., Bandera, E. V., Barkardottir, R. B., Barnes, D. R., Batra, J., Beckmann, M. W., Benitez, J., Benlloch, S., Berchuck, A., Berndt, S. I., Bickeböller, H., Bien, S. A., Blomqvist, C., Boccia, S., Bogdanova, N. V., Bojesen, Stig Egil, Bolla, M. K., Brauch, H., Brenner, H., Brenton, J. D., Brook, M. N., Brunet, J., Brunnström, H., Buchanan, D. D., Burwinkel, B., Butzow, R., Cadoni, G., Caldés, T., Caligo, M. A., Campbell, I., Campbell, P. T., Cancel-Tassin, G., Cannon-Albright, L., Campa, D., Caporaso, N., Carvalho, A. L., Chan, A. T., Chang-Claude, J., Chanock, S. J., Chen, C., Christiani, D. C., Claes, K. B. M., Claessens, F., Clements, J., Collée, J. M., Correa, M. C., Couch, F. J., Cox, A., Cunningham, J. M., Cybulski, C., Czene, K., Daly, M. B., deFazio, A., Devilee, P., Diez, O., Gago-Dominguez, M., Donovan, J. L., Dörk, T., Duell, E. J., Dunning, A. M., Dwek, M., Eccles, D. M., Edlund, C. K., Edwards, D. R. V., Ellberg, C., Evans, D. G., Fasching, P. A., Ferris, R. L., Liloglou, T., Figueiredo, J. C., Fletcher, O., Fortner, R. T., Fostira, F., Franceschi, S., Friedman, E., Gallinger, S. J., Ganz, P. A., Garber, J., García-Sáenz, J. A., Gayther, S. A., Giles, G. G., Godwin, A. K., Goldberg, M. S., Goldgar, D. E., Goode, E. L., Goodman, M. T., Goodman, G., Grankvist, K., Greene, M. H., Gronberg, H., Gronwald, J., Guénel, P., Håkansson, N., Hall, P., Hamann, U., Hamdy, F. C., Hamilton, R. J., Hampe, J., Haugen, A., Heitz, F., Herrero, R., Hillemanns, P., Hoffmeister, M., Høgdall, Estrid Vilma Solyom, Hong, Y., Hopper, J. L., Houlston, R., Hulick, P. J., Hunter, D. J., Huntsman, D. G., Idos, G., Imyanitov, E. N., Ingles, S. A., Isaacs, C., Jakubowska, A., James, P., Jenkins, M. A., Johansson, M., Johansson, M., John, E. M., Joshi, A. D., Kaneva, R., Karlan, B. Y., Kelemen, L. E., Kühl, T., Khaw, K., Khusnutdinova, E., Kibel, A. S., Kiemeney, L. A., Kim, J., Kjær, Susanne Krüger, Knight, J. A., Kogevinas, M., Kote-Jarai, Z., Koutros, S., Kristensen, V. N., Kupryjanczyk, J., Lacko, M., Lam, S., Lambrechts, D., Landi, M. T., Lazarus, P., Le, N. D., Lee, E., Lejbkowicz, F., Lenz, H., Leslie, G., Lessel, D., Lester, J., Levine, D. A., Li, L., Li, C. I., Lindblom, A., Lindor, N. M., Liu, G., Loupakis, F., Lubiński, J., Maehle, L., Maier, C., Mannermaa, A., Marchand, L. L., Margolin, S., May, T., McGuffog, L., Meindl, A., Middha, P., Miller, A., Milne, R. L., MacInnis, R. J., Modugno, F., Montagna, M., Moreno, V., Moysich, K. B., Mucci, L., Muir, K., Mulligan, A. M., Nathanson, K. L., Neal, D. E., Ness, A. R., Neuhausen, S. L., Nevanlinna, H., Newcomb, P. A., Newcomb, L. F., Nielsen, Finn Cilius, Nikitina-Zake, L., Nordestgaard, Børge, Nussbaum, R. L., Offit, K., Olah, E., Olama, A. A. A., Olopade, O. I., Olshan, A. F., Olsson, H., Osorio, A., Pandha, H., Park, J. Y., Pashayan, N., Parsons, M. T., Pejovic, T., Penney, K. L., Peters, W. H. M., Phelan, C. M., Phipps, A. I., Plaseska-Karanfilska, D., Pring, M., Prokofyeva, D., Radice, P., Stefansson, K., Ramus, S. J., Raskin, L., Rennert, G., Rennert, H. S., van Rensburg, E. J., Riggan, M. J., Risch, H. A., Risch, A., Roobol, M. J., Rosenstein, B. S., Rossing, M. A., De Ruyck, K., Saloustros, E., Sandler, D. P., Sawyer, E. J., Schabath, M. B., Schleutker, J., Schmidt, M. K., Setiawan, V. W., Shen, H., Siegel, E. M., Sieh, W., Singer, C. F., Slattery, M. L., Sorensen, K. D., Southey, M. C., Spurdle, A. B., Stanford, J. L., Stevens, V. L., Stintzing, S., Stone, J., Sundfeldt, K., Sutphen, R., Swerdlow, A. J., Tajara, E. H., Tangen, C. M., Tardon, A., Taylor, J. A., Teare, M. D., Teixeira, M. R., Terry, M. B., Terry, K. L., Thibodeau, S. N., Thomassen, M., Bjørge, L., Tischkowitz, M., Toland, A. E., Torres, D., Townsend, P. A., Travis, R. C., Tung, N., Tworoger, S. S., Ulrich, C. M., Usmani, N., Vachon, C. M., Van Nieuwenhuysen, E., Vega, A., Aguado-Barrera, M. E., Wang, Q., Webb, P. M., Weinberg, C. R., Weinstein, S., Weissler, M. C., Weitzel, J. N., West, C. M. L., White, E., Whittemore, A. S., Wichmann, H., Wiklund, F., Winqvist, R., Wolk, A., Woll, P., Woods, M., Wu, A. H., Wu, X., Yannoukakos, D., Zheng, W., Zienolddiny, S., Ziogas, A., Zorn, K. K., Lane, J. M., Saxena, R., Thomas, D., Hung, R. J., Diergaarde, B., McKay, J., Peters, U., Hsu, L., García-Closas, M., Eeles, R. A., Chenevix-Trench, G., Brennan, P. J., Haiman, C. A., Simard, J., Easton, D. F., Gruber, S. B., Pharoah, P. D. P., Price, A. L., Pasaniuc, B., Amos, C. I., Kraft, P. & Lindström, S., 25 jan. 2019, I: Nature Communications. 10, 1, 23 s., 431.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Cell-free DNA in newly diagnosed patients with glioblastoma - a clinical prospective feasibility study

Nørøxe, D. S., Østrup, O., Yde, C. W., Ahlborn, L. B., Nielsen, Finn Cilius, Michaelsen, Signe Regner, Larsen, V. A., Skjøth-Rasmussen, J., Brennum, J., Hamerlik, P., Poulsen, H. S. & Lassen, Ulrik Niels, 2019, I: OncoTarget. 10, 43, s. 4397-4406 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Completeness of RET testing in patients with medullary thyroid carcinoma in Denmark 1997–2013: A nationwide study

Danish Thyroid Cancer Group (DATHYRCA), D. T. C. G. (., 2019, I: Clinical Epidemiology. 11, s. 93-99 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt