Finn Cilius Nielsen

Finn Cilius Nielsen

Klinisk professor

Medlem af:

  • Klinisk biokemi


  1. 2024
  2. Udgivet

    Molecular subtyping improves breast cancer diagnosis in the Copenhagen Breast Cancer Genomics Study

    Berg, T., Jensen, M. B., Celik, A., Talman, M. L., Misiakou, M. A., Knoop, A. S., Nielsen, Finn Cilius, Ejlertsen, Bent Laursen & Rossing, Caroline Maria, 2024, I: JCI insight. 9, 7, 13 s., e178114.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    Multigene profiles to guide the use of neoadjuvant chemotherapy for breast cancer: a Copenhagen Breast Cancer Genomics Study

    Jensen, M., Pedersen, C. B., Misiakou, M., Talman, M. L. M., Gibson, L., Tange, U. B., Kledal, H., Vejborg, I., Kroman, Niels Thorndahl, Nielsen, Finn Cilius, Ejlertsen, Bent Laursen & Rossing, M., 2023, I: npj Breast Cancer. 9, 8 s., 47.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Neoepitope load, T cell signatures and PD-L2 as combined biomarker strategy for response to checkpoint inhibition immunotherapy

    Borch, A., Bjerregaard, A. M., Araujo Barbosa de Lima, V., Østrup, O., Yde, C. W., Eklund, A. C., Mau-Sørensen, M., Barra, C., Svane, Inge Marie, Nielsen, Finn Cilius, Funt, S. A., Lassen, Ulrik Niels & Hadrup, S. R., 2023, I: Frontiers in Genetics. 14, 13 s., 1058605.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    New pathogenic germline variants identified in mesothelioma

    Belcaid, L., Bertelsen, B., Wadt, Karin Anna Wallentin, Tuxen, I., Spanggaard, I., Højgaard, M., Sørensen, Jens Benn, Ravn, J., Lassen, Ulrik Niels, Nielsen, Finn Cilius, Rohrberg, K. & Westmose Yde, C., 2023, I: Lung Cancer. 179, 8 s., 107172.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Ovarian cancer pathology characteristics as predictors of variant pathogenicity in BRCA1 and BRCA2

    AOCS Group, A. G., CZECANCA Consortium, C. C., The Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2, T. C. O. I. O. M. O. B., Evidence-based Network for the Interpretation of Germline Mutant Alleles Consortium, E. N. F. T. I. O. G. M. A. C., HEBON Investigators, H. I. & GEMO Study Collaborators, G. S. C., 2023, I: British Journal of Cancer. 128, 12, s. 2283-2294 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    The Incidence, Survival, and HPV Impact of Second Primary Cancer following Primary Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma: A 20-Year Retrospective and Population-Based Study

    Andersen, L., Jakobsen, K. K., Carlander, A. L. F., Garset-Zamani, M., Friborg, Jeppe Tang, Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius, Andersen, E., Grønhøj, Christian & von Buchwald, Christian, 2023, I: Viruses. 15, 1, 34.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. 2022
  10. Udgivet

    Intestinal metaplasia is a precursor lesion for sinonasal intestinal-type adenocarcinoma: genomic investigation of a case proving this hypothesis

    Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, Filipe Garrett, Woller, N. C., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, jan. 2022, I: APMIS. 130, 1, s. 53-56 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A catalog of curated breast cancer genes

    Bose, M., Benada, Jan, Thatte, Jayashree Vijay, Kinalis, S., Ejlertsen, Bent Laursen, Nielsen, Finn Cilius, Sørensen, Claus Storgaard & Rossing, Caroline Maria, 2022, I: Breast Cancer Research and Treatment. 191, s. 431-441

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Benchmarking full-length transcript single cell mRNA sequencing protocols

    Probst, V., Simonyan, Arman, Pacheco, F., Guo, Yuliu, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: BMC Genomics. 23, 860.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Differences in gene expression despite identical histomorphology in sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and metastases from colorectal adenocarcinoma

    Sjöstedt, S., Vieira, Filipe Garrett, Karnov, K., Agander, T. K., Willemoe, G. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, 2022, I: APMIS. 130, 9, s. 551-559

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Extensive genomic analysis in patients with KRAS-mutated solid tumors shows high frequencies of concurrent alterations and potential targets but has limited clinical impact

    Jacobsen, I. C., Spanggaard, I., Højgaard, M., Belcaid, L., Qvortrup, Camilla, Yde, C. W., Schmidt, A. Y., Nielsen, Finn Cilius, Willemoe, G. L., Dam, M. S., Lassen, Ulrik Niels & Staal Rohrberg, K., 2022, I: Acta Oncologica. 61, 12, s. 1499-1506 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Impact of specific high-risk human papillomavirus genotypes on survival in oropharyngeal cancer

    Garset-Zamani, M., Carlander, A. F., Jakobsen, K. K., Friborg, Jeppe Tang, Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius, Andersen, E., Grønhøj, Christian & von Buchwald, Christian, 2022, I: International Journal of Cancer. 150, 7, s. 1174-1183

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Interpretable autoencoders trained on single cell sequencing data can transfer directly to data from unseen tissues

    Walbech, J. S., Kinalis, S., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: Cells. 11, 12 s., 85.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    MicroRNA-9-3p: a novel predictor of neurological outcome after cardiac arrest

    Beske, R. P., Bache, S., Meyer, M. A. S., Kjærgaard, Jesper, Bro-Jeppesen, J., Obling, L., Olsen, M. H., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Møller, Kirsten, Nielsen, N. & Hassager, Christian, 2022, I: European Heart Journal: Acute Cardiovascular Care. 11, 8, s. 609-616 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Personalized circulating tumor DNA in patients with hepatocellular carcinoma: a pilot study

    Pommergaard, Hans-Christian L, Yde, C. W., Ahlborn, L. B., Andersen, C. L., Henriksen, T., Hasselby, Jane Preuss, Rostved, A. A., Sorensen, C. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, Finn Cilius & Rasmussen, Anne, 2022, I: Molecular Biology Reports. 49, 2, s. 1609-1616 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Polygenic risk modeling for prediction of epithelial ovarian cancer risk

    Dareng, E. O., Tyrer, J. P., Barnes, D. R., Jones, M. R., Yang, X., Aben, K. K. H., Adank, M. A., Agata, S., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antonenkova, N. N., Aravantinos, G., Arun, B. K., Augustinsson, A., Balmaña, J., Bandera, E. V., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Beckmann, M. W., Beeghly-Fadiel, A. & 39 flere, Benitez, J., Bermisheva, M., Bernardini, M. Q., Bjorge, L., Black, A., Bogdanova, N. V., Bonanni, B., Borg, A., Brenton, J. D., Budzilowska, A., Butzow, R., Buys, S. S., Cai, H., Caligo, M. A., Campbell, I., Cannioto, R., Cassingham, H., Chang-Claude, J., Chanock, S. J., Chen, K., Chiew, Y. E., Chung, W. K., Claes, K. B. M., Colonna, S., Hansen, Thomas van Overeem, Høgdall, Estrid Vilma Solyom, Høgdall, Claus Kim, Jensen, A., Kjær, Susanne Krüger, Nielsen, Finn Cilius, GEMO Study Collaborators, G. S. C., GC-HBOC Study Collaborators, G. S. C., EMBRACE Collaborators, E. C., OPAL Study Group, O. S. G., AOCS Group, A. G., kConFab Investigators, K. I., HEBON Investigators, H. I., OCAC Consortium, O. C. & CIMBA Consortium, C. C., 2022, I: European journal of human genetics : EJHG. 30, 3, s. 349-362 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Targeting the tumor mutanome for personalized vaccination in a TMB low non-small cell lung cancer

    McCann, K., Von Witzleben, A., Thomas, J., Wang, C., Wood, O., Singh, D., Boukas, K., Bendjama, K., Silvestre, N., Nielsen, Finn Cilius, Thomas, G., Sanchez-Elsner, T., Greenbaum, J., Schoenberger, S., Peters, B., Vijayanand, P., Savelyeva, N. & Ottensmeier, C., 2022, I: Journal for ImmunoTherapy of Cancer. 10, 3, 14 s., e003821.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Tumor mutational burden and purity adjustment before and after treatment with temozolomide in 27 paired samples of glioblastoma: a prospective study

    Nørøxe, D. S., Flynn, A., Yde, C. W., Østrup, O., Nielsen, Finn Cilius, Skjøth, Jane, Brennum, J., Hamerlik, P., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Skovgaard Poulsen, H. & Lassen, Ulrik Niels, 2022, I: Molecular Oncology. 16, 1, s. 206-218

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. 2021
  23. Udgivet

    A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers

    GEMO Study Collaborators, G. S. C., EMBRACE Collaborators, E. C., kConFab Investigators, K. I., HEBON Investigators, H. I. & ABCTB Investigators, A. I., dec. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 22 s., 1078.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Clinical implications of intrinsic molecular subtypes of breast cancer for sentinel node status

    Rossing, M., Pedersen, C. B., Tvedskov, Tove Filtenborg, Vejborg, I., Talman, M. L., Olsen, L. R., Kroman, Niels Thorndahl, Nielsen, Finn Cilius, Jensen, M. B. & Ejlertsen, Bent Laursen, dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 12 s., 2259.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Major driver mutations are shared between sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and the morphologically identical colorectal adenocarcinoma

    Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, Filipe Garrett, Willemoe, G. L., Agander, T. K., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, apr. 2021, I: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology. 147, 4, s. 1019-1027 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Achromobacter spp. genetic adaptation in cystic fibrosis

    Gabrielaite, M., Nielsen, Finn Cilius, Johansen, Helle Krogh & Marvig, R. L., 2021, I: Microbial genomics. 7, 7, 13 s., 000582.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data

    Gabrielaite, M., Torp, M., Rasmussen, M., Andreu-Sánchez, S., Vieira, Filipe Garrett, Pedersen, C., Kinalis, S., Madsen, M., Yde, C., Rønn, O. L., Marvig, R., Østrup, O., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2021, bioRxiv, 29 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  28. Udgivet

    A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data

    Gabrielaite, M., Torp, M. H., Rasmussen, Malthe Sebro, Andreu-Sánchez, S., Vieira, Filipe Garrett, Pedersen, C. B., Kinalis, S., Madsen, M. B., Kodama, M., Demircan, G. S., Simonyan, A., Yde, C. W., Olsen, L. R., Marvig, R. L., Østrup, O., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2021, I: Cancers. 13, 24, 6283.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    A simple, safe and sensitive method for SARS-CoV-2 inactivation and RNA extraction for RT-qPCR

    Kalnina, L., Mateu-Regué, À., Oerum, S., Hald, A., Gerstoft, Jan, Oerum, H., Nielsen, Finn Cilius & Iversen, A. K. N., 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 393-400 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 6 7 8 ...10 Næste

ID: 6797