Finn Cilius Nielsen
Klinisk professor
- 2024
- Udgivet
Molecular subtyping improves breast cancer diagnosis in the Copenhagen Breast Cancer Genomics Study
Berg, T., Jensen, M. B., Celik, A., Talman, M. L., Misiakou, M. A., Knoop, A. S., Nielsen, Finn Cilius, Ejlertsen, Bent Laursen & Rossing, Caroline Maria, 2024, I: JCI insight. 9, 7, 13 s., e178114.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Multigene profiles to guide the use of neoadjuvant chemotherapy for breast cancer: a Copenhagen Breast Cancer Genomics Study
Jensen, M., Pedersen, C. B., Misiakou, M., Talman, M. L. M., Gibson, L., Tange, U. B., Kledal, H., Vejborg, I., Kroman, Niels Thorndahl, Nielsen, Finn Cilius, Ejlertsen, Bent Laursen & Rossing, M., 2023, I: npj Breast Cancer. 9, 8 s., 47.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Neoepitope load, T cell signatures and PD-L2 as combined biomarker strategy for response to checkpoint inhibition immunotherapy
Borch, A., Bjerregaard, A. M., Araujo Barbosa de Lima, V., Østrup, O., Yde, C. W., Eklund, A. C., Mau-Sørensen, M., Barra, C., Svane, Inge Marie, Nielsen, Finn Cilius, Funt, S. A., Lassen, Ulrik Niels & Hadrup, S. R., 2023, I: Frontiers in Genetics. 14, 13 s., 1058605.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
New pathogenic germline variants identified in mesothelioma
Belcaid, L., Bertelsen, B., Wadt, Karin Anna Wallentin, Tuxen, I., Spanggaard, I., Højgaard, M., Sørensen, Jens Benn, Ravn, J., Lassen, Ulrik Niels, Nielsen, Finn Cilius, Rohrberg, K. & Westmose Yde, C., 2023, I: Lung Cancer. 179, 8 s., 107172.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ovarian cancer pathology characteristics as predictors of variant pathogenicity in BRCA1 and BRCA2
AOCS Group, A. G., CZECANCA Consortium, C. C., The Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2, T. C. O. I. O. M. O. B., Evidence-based Network for the Interpretation of Germline Mutant Alleles Consortium, E. N. F. T. I. O. G. M. A. C., HEBON Investigators, H. I. & GEMO Study Collaborators, G. S. C., 2023, I: British Journal of Cancer. 128, 12, s. 2283-2294 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Incidence, Survival, and HPV Impact of Second Primary Cancer following Primary Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma: A 20-Year Retrospective and Population-Based Study
Andersen, L., Jakobsen, K. K., Carlander, A. L. F., Garset-Zamani, M., Friborg, Jeppe Tang, Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius, Andersen, E., Grønhøj, Christian & von Buchwald, Christian, 2023, I: Viruses. 15, 1, 34.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Intestinal metaplasia is a precursor lesion for sinonasal intestinal-type adenocarcinoma: genomic investigation of a case proving this hypothesis
Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, Filipe Garrett, Woller, N. C., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, jan. 2022, I: APMIS. 130, 1, s. 53-56 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A catalog of curated breast cancer genes
Bose, M., Benada, Jan, Thatte, Jayashree Vijay, Kinalis, S., Ejlertsen, Bent Laursen, Nielsen, Finn Cilius, Sørensen, Claus Storgaard & Rossing, Caroline Maria, 2022, I: Breast Cancer Research and Treatment. 191, s. 431-441Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Benchmarking full-length transcript single cell mRNA sequencing protocols
Probst, V., Simonyan, Arman, Pacheco, F., Guo, Yuliu, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: BMC Genomics. 23, 860.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differences in gene expression despite identical histomorphology in sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and metastases from colorectal adenocarcinoma
Sjöstedt, S., Vieira, Filipe Garrett, Karnov, K., Agander, T. K., Willemoe, G. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, 2022, I: APMIS. 130, 9, s. 551-559Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extensive genomic analysis in patients with KRAS-mutated solid tumors shows high frequencies of concurrent alterations and potential targets but has limited clinical impact
Jacobsen, I. C., Spanggaard, I., Højgaard, M., Belcaid, L., Qvortrup, Camilla, Yde, C. W., Schmidt, A. Y., Nielsen, Finn Cilius, Willemoe, G. L., Dam, M. S., Lassen, Ulrik Niels & Staal Rohrberg, K., 2022, I: Acta Oncologica. 61, 12, s. 1499-1506 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of specific high-risk human papillomavirus genotypes on survival in oropharyngeal cancer
Garset-Zamani, M., Carlander, A. F., Jakobsen, K. K., Friborg, Jeppe Tang, Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius, Andersen, E., Grønhøj, Christian & von Buchwald, Christian, 2022, I: International Journal of Cancer. 150, 7, s. 1174-1183Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interpretable autoencoders trained on single cell sequencing data can transfer directly to data from unseen tissues
Walbech, J. S., Kinalis, S., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: Cells. 11, 12 s., 85.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
MicroRNA-9-3p: a novel predictor of neurological outcome after cardiac arrest
Beske, R. P., Bache, S., Meyer, M. A. S., Kjærgaard, Jesper, Bro-Jeppesen, J., Obling, L., Olsen, M. H., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Møller, Kirsten, Nielsen, N. & Hassager, Christian, 2022, I: European Heart Journal: Acute Cardiovascular Care. 11, 8, s. 609-616 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Personalized circulating tumor DNA in patients with hepatocellular carcinoma: a pilot study
Pommergaard, Hans-Christian L, Yde, C. W., Ahlborn, L. B., Andersen, C. L., Henriksen, T., Hasselby, Jane Preuss, Rostved, A. A., Sorensen, C. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, Finn Cilius & Rasmussen, Anne, 2022, I: Molecular Biology Reports. 49, 2, s. 1609-1616 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Polygenic risk modeling for prediction of epithelial ovarian cancer risk
Dareng, E. O., Tyrer, J. P., Barnes, D. R., Jones, M. R., Yang, X., Aben, K. K. H., Adank, M. A., Agata, S., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antonenkova, N. N., Aravantinos, G., Arun, B. K., Augustinsson, A., Balmaña, J., Bandera, E. V., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Beckmann, M. W., Beeghly-Fadiel, A. & 39 flere, , 2022, I: European journal of human genetics : EJHG. 30, 3, s. 349-362 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Targeting the tumor mutanome for personalized vaccination in a TMB low non-small cell lung cancer
McCann, K., Von Witzleben, A., Thomas, J., Wang, C., Wood, O., Singh, D., Boukas, K., Bendjama, K., Silvestre, N., Nielsen, Finn Cilius, Thomas, G., Sanchez-Elsner, T., Greenbaum, J., Schoenberger, S., Peters, B., Vijayanand, P., Savelyeva, N. & Ottensmeier, C., 2022, I: Journal for ImmunoTherapy of Cancer. 10, 3, 14 s., e003821.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tumor mutational burden and purity adjustment before and after treatment with temozolomide in 27 paired samples of glioblastoma: a prospective study
Nørøxe, D. S., Flynn, A., Yde, C. W., Østrup, O., Nielsen, Finn Cilius, Skjøth, Jane, Brennum, J., Hamerlik, P., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Skovgaard Poulsen, H. & Lassen, Ulrik Niels, 2022, I: Molecular Oncology. 16, 1, s. 206-218Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers
GEMO Study Collaborators, G. S. C., EMBRACE Collaborators, E. C., kConFab Investigators, K. I., HEBON Investigators, H. I. & ABCTB Investigators, A. I., dec. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 22 s., 1078.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Clinical implications of intrinsic molecular subtypes of breast cancer for sentinel node status
Rossing, M., Pedersen, C. B., Tvedskov, Tove Filtenborg, Vejborg, I., Talman, M. L., Olsen, L. R., Kroman, Niels Thorndahl, Nielsen, Finn Cilius, Jensen, M. B. & Ejlertsen, Bent Laursen, dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 12 s., 2259.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Major driver mutations are shared between sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and the morphologically identical colorectal adenocarcinoma
Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, Filipe Garrett, Willemoe, G. L., Agander, T. K., Olsen, C., Nielsen, Finn Cilius & von Buchwald, Christian, apr. 2021, I: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology. 147, 4, s. 1019-1027 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Achromobacter spp. genetic adaptation in cystic fibrosis
Gabrielaite, M., Nielsen, Finn Cilius, Johansen, Helle Krogh & Marvig, R. L., 2021, I: Microbial genomics. 7, 7, 13 s., 000582.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data
Gabrielaite, M., Torp, M., Rasmussen, M., Andreu-Sánchez, S., Vieira, Filipe Garrett, Pedersen, C., Kinalis, S., Madsen, M., Yde, C., Rønn, O. L., Marvig, R., Østrup, O., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2021, bioRxiv, 29 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data
Gabrielaite, M., Torp, M. H., Rasmussen, Malthe Sebro, Andreu-Sánchez, S., Vieira, Filipe Garrett, Pedersen, C. B., Kinalis, S., Madsen, M. B., Kodama, M., Demircan, G. S., Simonyan, A., Yde, C. W., Olsen, L. R., Marvig, R. L., Østrup, O., Rossing, Caroline Maria, Nielsen, Finn Cilius, Winther, Ole & Bagger, F. O., 2021, I: Cancers. 13, 24, 6283.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A simple, safe and sensitive method for SARS-CoV-2 inactivation and RNA extraction for RT-qPCR
Kalnina, L., Mateu-Regué, À., Oerum, S., Hald, A., Gerstoft, Jan, Oerum, H., Nielsen, Finn Cilius & Iversen, A. K. N., 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 393-400 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 6797
Flest downloads
-
1513
downloads
IMP3 RNP safe houses prevent miRNA-directed HMGA2 mRNA decay in cancer and development
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
247
downloads
RNA assemblages orchestrate complex cellular processes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
235
downloads
Cancers of unknown primary origin (CUP) are characterized by chromosomal instability (CIN) compared to metastasis of know origin
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet