Carsten Kirkeby
Seniorforsker
Sektion, Animal Welfare and Disease Control
Grønnegårdsvej 8
1870 Frederiksberg C
- 2024
- Udgivet
A simulation model for highly pathogenic avian influenza spread in Danish wild birds
Liu, Yangfan, Kjær, Lene Jung, Boklund, Anette, Clausen, P., Nygaard, T., Ward, M., Laffan, S. & Kirkeby, Carsten, 19 mar. 2024.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
The PAIR Project Charting Epidemic Frontiers with One Health Precision
Kirkeby, Carsten, Bjerrum, A., Madsen, M. & Boklund, Anette, 18 mar. 2024.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Using registry data to identify individual dairy cows with abnormal patterns in routinely recorded somatic cell counts
Henningsen, Maj Beldring, Reimert, Mossa Merhi, Denwood, Matt, Gussmann, Maya Katrin, Kirkeby, Carsten & Nielsen, Søren Saxmose, 21 feb. 2024, I: Journal of Theoretical Biology. 579, s. 1-7 7 s., 111718.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Are all avian influenza outbreaks in poultry the same? The predicted impact of poultry species and virus subtype
Kirkeby, Carsten, Boklund, Anette, Larsen, Lars & Ward, M. P., 16 feb. 2024, I: Zoonoses and Public Health.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Risk factors for avian influenza in Danish poultry and wild birds during the epidemic from June 2020 to May 2021
Liu, Yangfan, Kjær, Lene Jung, Boklund, Anette, Hjulsager, C. K., Larsen, Lars & Kirkeby, Carsten, feb. 2024, I: Frontiers in Veterinary Science. 11Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Accepteret/In press
Are all avian influenza outbreaks in poultry the same? The predicted impact of poultry species and virus subtype
Kirkeby, Carsten, Boklund, Anette, Larsen, Lars & Ward, M. P., 2024, (Accepteret/In press) I: Zoonoses and Public Health.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Photonic sensors reflect variation in insect abundance and diversity across habitats
Rydhmer, Klas Karl Gustav, Jansson, S., Still, L., Beck, B. D., Chatzaki, V., Olsen, K., Van Hoff, B., Grønne, C., Meier, Jakob Klinge, Montoro, M., Schmidt, Inger Kappel, Kirkeby, Carsten, Smith, H. G. & Brydegaard, M., 2024, I: Ecological Indicators. 158, 12 s., 111483.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Treatment of clinically severe bovine mastitis – a scoping review
Wilm, Jensine, Svennesen, Line, Kirkeby, Carsten & Krömker, Volker, 2024, I: Frontiers in Veterinary Science. 11, 1286461.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Lactational treatment of bovine mastitis: Development over time and factors influencing cytological cure
Wilm, Jensine, Krömker, Volker, Kirkeby, Carsten & Gussmann, Maya Katrin, 2023, I: Journal of Dairy Science. 106, 8, s. 5740-5752Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling transmission of Avian Influenza in wild birds using a spatiotemporal cellular automata model
Liu, Yangfan, Kjær, Lene Jung, Boklund, Anette, Clausen, P., Nyegaard, T., Ward, M. P., Laffan, S. & Kirkeby, Carsten, 2023, Abstract book of the GeoVet 2023 International Conference: Expanding boundaries: Interdisciplinary geospatial research for the One Health Era. Conte, A., Ippoliti, C. & Savini, L. (red.). Edizioni IZSTe-press, s. 97-98Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
- Udgivet
Remote Nanoscopy with Infrared Elastic Hyperspectral Lidar
Müller, L., Li, M., Månefjord, H., Salvador, J., Reistad, N., Hernandez, J., Kirkeby, Carsten, Runemark, A. & Brydegaard, M., 2023, I: Advanced Science. 10, 15, 2207110.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reservoirs of Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. Associated with Intramammary Infections of Dairy Cows
Woudstra, Svenja, Wente, N., Zhang, Y., Leimbach, S., Kirkeby, Carsten, Gussmann, Maya Katrin & Krömker, Volker, 2023, I: Pathogens. 12, 5, 699.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reservoirs of Corynebacterium spp. in the Environment of Dairy Cows
Woudstra, Svenja, Lücken, A., Wente, N., Zhang, Y., Leimbach, S., Gussmann, Maya Katrin, Kirkeby, Carsten & Krömker, Volker, 2023, I: Pathogens. 12, 1, 9 s., 139.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Strain diversity and infection durations of Staphylococcus spp. and Streptococcus spp. causing intramammary infections in dairy cows
Woudstra, Svenja, Wente, N., Zhang, Y., Leimbach, S., Gussmann, Maya Katrin, Kirkeby, Carsten & Krömker, Volker, 2023, I: Journal of Dairy Science. 106, 6, s. 4214-4231Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Surveillance data and early warning models of highly pathogenic avian influenza in East Asia, 2020-2022
Kjær, Lene Jung, Kirkeby, Carsten, Boklund, Anette & Ward, M. P., 2023, Abstract book of the GeoVet 2023 International Conference: Expanding boundaries: Interdisciplinary geospatial research for the One Health Era. Conte, A., Ippoliti, C. & Savini, L. (red.). Edizioni IZSTe-press, s. 102-103Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
- Udgivet
Transmission Pathways and Infection Dynamics of selected Staphylococcus and Streptococcus spp: Implications for the Prevention and Control of Intramammary Infections
Woudstra, Svenja, Wente, N., Zhang, Y., Leimbach, S., Ren, K., Gussmann, Maya Katrin, Kirkeby, Carsten & Krömker, Volker, 2023, EUROPEAN BUIATRICS CONGRESS AND ECBHM JUBILEE SYMPOSIUM: ABSTRACT-BOOK. Verlag der DVG Service, s. 247-249Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Treatment of mild to moderate clinical bovine mastitis caused by gram-positive bacteria: A noninferiority randomized trial of local penicillin treatment alone or combined with systemic treatment
Svennesen, Line, Skarbye, Alice Puk, Farre, M., Astrup, L. B., Halasa, T., Krömker, Volker, Denwood, Matt & Kirkeby, Carsten, 2023, I: Journal of Dairy Science. 106, 8, s. 5696-5714Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Use of Danish national somatic cell count data to assess the need for dry-off treatment in Holstein dairy cattle
Henningsen, Maj Beldring, Denwood, Matt, Kirkeby, Carsten & Nielsen, Søren Saxmose, 2023, I: Animals. 13, 15, 13 s., 2523.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Using surveillance data for early warning modelling of highly pathogenic avian influenza in Europe reveals a seasonal shift in transmission, 2016-2022
Kjær, Lene Jung, Ward, M. P., Boklund, Anette, Larsen, Lars, Hjulsager, C. K. & Kirkeby, Carsten, 2023, I: Scientific Reports. 13, 16 s., 15396.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Scheimpflug lidar range profiling of bee activity patterns and spatial distributions
Rydhmer, Klas Karl Gustav, Prangsma, J., Brydegaard, M., Smith, H. G., Kirkeby, Carsten, Schmidt, Inger Kappel & Boelt, B., dec. 2022, I: Animal Biotelemetry. 10, 1, 13 s., 14.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Treatment of clinical mastitis: intramammary or in comination with parenteral administration of penicillin?
Svennesen, Line, Skarbye, Alice Puk, Farre, Anders Michael & Kirkeby, Carsten, sep. 2022, s. 426-427. 2 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
The impact of on-farm biosecurity for BVDV in Australian beef production
Fountain, J., Brookes, V. J., Kirkeby, Carsten, Manyweathers, J., Maru, Y. & Hernandez-Jover, M., 8 aug. 2022.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Forecasting outbreaks of high pathogenic avian influenza in Europe
Kjær, Lene Jung, Boklund, Anette, Larsen, Lars, Hjulsager, C. K., Ward, M. P. & Kirkeby, Carsten, 23 mar. 2022.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
Transmission of SARS-CoV-2 Omicron VOC subvariants BA.1 and BA.2: Evidence from Danish Households
Lyngse, Frederik Plesner, Kirkeby, Carsten, Denwood, Matt, Christiansen, L. E., Mølbak, Kåre, Møller, C. H., Skov, R. L., Krause, Tyra Grove, Rasmussen, M., Sieber, R. N., Johannesen, T. B., Lillebaek, Troels, Fonager, J., Fomsgaard, A., Møller, F. T., Stegger, M., Overvad, M., Spiess, K. & Mortensen, Laust Hvas, 30 jan. 2022, 2 s.Publikation: Andet › Andet bidrag › Forskning
- Udgivet
3D-Printed Fluorescence Hyperspectral Lidar for Monitoring Tagged Insects
Manefjord, H., Muller, L., Li, M., Salvador, J., Blomqvist, S., Runemark, A., Kirkeby, Carsten, Ignell, R., Bood, J. & Brydegaard, M., 2022, I: IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics. 28, 5, 7100109.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A review of estimated transmission parameters for the spread of avian influenza viruses
Kirkeby, Carsten & Ward, M. P., 2022, I: Transboundary and Emerging Diseases. 69, 6, s. 3238-3246Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of vaccination on household transmission of SARS-CoV-2 Delta variant of concern
Lyngse, Frederik Plesner, Mølbak, Kåre, Denwood, Matt, Christiansen, L. E., Møller, C. H., Rasmussen, M., Cohen, A. S., Stegger, M., Fonager, J., Sieber, R. N., Ellegaard, K. M., Nielsen, C. & Kirkeby, Carsten, 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 3764.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evaluation of diagnostic test procedures for SARS-CoV-2 using latent class models
Stærk-Østergaard, J., Kirkeby, Carsten, Christiansen, L. E., Andersen, M. A., Møller, C. H., Voldstedlund, M. & Denwood, Matt, 2022, I: Journal of Medical Virology. 94, 10, s. 4754-4761Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Household transmission of SARS-CoV-2 Omicron variant of concern subvariants BA.1 and BA.2 in Denmark
Lyngse, Frederik Plesner, Kirkeby, Carsten, Denwood, Matt, Christiansen, L. E., Mølbak, Kåre, Holten Møller, C., Skov, R. L., Krause, Tyra Grove, Rasmussen, M., Sieber, R., Johannesen, T. B., Lillebaek, Troels, Fonager, J., Fomsgaard, A., Møller, F. T., Stegger, M., Overvad, M., Spiess, K. & Mortensen, Laust Hvas, 2022, I: Nature Communications. 13, 7 s., 5760 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Household transmission of the SARS-CoV-2 Omicron variant in Denmark
Lyngse, Frederik Plesner, Mortensen, Laust Hvas, Denwood, Matt, Christiansen, L. E., Møller, C. H., Skov, R. L., Spiess, K., Fomsgaard, A., Lassaunière, R., Rasmussen, M., Stegger, M., Nielsen, C., Sieber, R. N., Cohen, A. S., Møller, F. T., Overvad, M., Mølbak, Kåre, Krause, Tyra Grove & Kirkeby, Carsten, 2022, I: Nature Communications. 13, 5573.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Landscape effects and spatial patterns of avian influenza virus in Danish wild birds, 2006-2020
Kjær, Lene Jung, Hjulsager, C. K., Larsen, Lars, Boklund, Anette, Halasa, T., Ward, M. P. & Kirkeby, Carsten, 2022, I: Transboundary and Emerging Diseases. 69, 2, s. 706-719Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nationwide study on SARS-CoV-2 transmission within households from lockdown to reopening, Denmark, 27 February 2020 to 1 August 2020
Lyngse, Frederik Plesner, Kirkeby, Carsten, Halasa, T., Andreasen, V., Skov, R. L., Møller, F. T., Krause, Tyra Grove & Mølbak, Kåre, 2022, I: Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin. 27, 6, s. 1-12Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
One size does not fit all: Exploring the economic and non-economic outcomes of on-farm biosecurity for bovine viral diarrhoea virus in Australian beef production
Fountain, J., Brookes, V., Kirkeby, Carsten, Manyweathers, J., Maru, Y. & Hernandez-Jover, M., 2022, I: Preventive Veterinary Medicine. 208, 105758.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Weak population genetic structure in Eurasian spruce bark beetle over large regional scales in Sweden
Ellerstrand, S. J., Choudhury, S., Svensson, K., Andersson, M. N., Kirkeby, Carsten, Powell, D., Schlyter, F., Jönsson, A. M., Brydegaard, M., Hansson, B. & Runemark, A., 2022, I: Ecology and Evolution. 12, 7, e9078.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Spatial patterns of avian influenza in wild birds from Denmark, 2006-2020
Kjær, Lene Jung, Boklund, Anette, Kirkeby, Carsten, Hjulsager, C. K., Larsen, Lars, Halasa, T. & Ward, M. P., 25 mar. 2021.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
Spatial patterns of avian influenza in wild birds from Denmark, 2006-2020
Kjær, Lene Jung, Hjulsager, C., Larsen, Lars, Boklund, Anette, Halasa, T., Ward, M. P. & Kirkeby, Carsten, 11 mar. 2021, Society for Veterinary Epidemiology and Preventive Medicine: Proceedings: Online, 24-26 March 2021. Society for Veterinary Epidemiology and Preventive MedicinePublikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning
- Udgivet
Association between SARS-CoV-2 Transmissibility, Viral Load, and Age in Households
Lyngse, Frederik Plesner, Mølbak, Kåre, Franck, K. T., Nielsen, C., Skov, R. L., Voldstedlund, M., Cohen, A. S. & Kirkeby, Carsten, 5 mar. 2021.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
A Practical Introduction to Mechanistic Modeling of Disease Transmission in Veterinary Science
Kirkeby, Carsten, Brookes, V. J., Ward, M. P., Dürr, S. & Halasa, T., 2021, I: Frontiers in Veterinary Science. 7, 546651.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Advances in automatic identification of flying insects using optical sensors and machine learning
Kirkeby, Carsten, Rydhmer, Klas Karl Gustav, Cook, S. M., Strand, A., Torrance, M. T., Swain, J. L., Prangsma, J., Johnen, A., Jensen, M., Brydegaard, M. & Græsbøll, K., 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 1555.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Association between SARS-CoV-2 Transmission Risk, 2 Viral Load, and Age: A Nationwide Study in Danish Households
Lyngse, Frederik Plesner, Mølbak, K., Franck, K. T., Nielsen, C., Skov, R. L. & Kirkeby, Carsten, 2021, 34 s.Publikation: Working paper › Forskning
- Udgivet
Bark beetles as lidar targets and prospects of photonic surveillance
Li, M., Jansson, S., Runemark, A., Peterson, J., Kirkeby, Carsten, Jönsson, A. M. & Brydegaard, M., 2021, I: journal of biophotonics. 14, 4, e202000420.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
COVID-19 Transmission Within Danish Households: A Nationwide Study from Lockdown to Reopening
Lyngse, Frederik Plesner, Kirkeby, Carsten, Halasa, T., Andreasen, V., Skov, R. L., Møller, F. T., Krause, Tyra Grove & Mølbak, Kåre, 2021, 36 s. (Eurosurveillance).Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Comparison of the current abattoir surveillance system for detection of paratuberculosis in Australian sheep with quantitative PCR tissue strategies using simulation modelling
Ly, A., Kirkeby, Carsten, Sergeant, E., Plain, K., Smith, M. & Dhand, N., 2021, I: Preventive Veterinary Medicine. 196, 105495.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Delaying the peak of the COVID-19 epidemic with travel restrictions
Græsbøll, K., Christiansen, L. E., Thygesen, U. H. & Kirkeby, Carsten, 2021, I: Epidemiologic Methods. 10, s1, 4 s., 20200042.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of somatic cell count (SCC) and differential SCC during and following intramammary infections
Kirkeby, Carsten, Schwarz, D., Denwood, Matt, Farre, M., Nielsen, Søren Saxmose, Gussmann, Maya Katrin, Toft, N. & Halasa, T., 2021, I: Journal of Dairy Science. 104, s. 3427-3438 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimating Clinically Relevant Cut-Off Values for a High-Throughput Quantitative Real-Time PCR Detecting Bacterial Respiratory Pathogens in Cattle
Klompmaker, A. F., Brydensholt, M., Michelsen, Anne Marie, Denwood, Matt, Kirkeby, Carsten, Larsen, Lars, Goecke, Nicole Bakkegård, Dam Otten, Nina & Nielsen, Liza Rosenbaum, 2021, I: Frontiers in Veterinary Science. 8, 674771.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Factors associated with baseline mortality in Norwegian Atlantic salmon farming
Oliveira, V. H. S., Dean, K. R., Qviller, L., Kirkeby, Carsten & Bang Jensen, B., 2021, I: Scientific Reports. 11, 14702.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Increased Transmissibility of SARS-CoV-2 Lineage 2 B.1.1.7 by Age and Viral Load: Evidence from Danish Households
Lyngse, Frederik Plesner, Mølbak, K., Skov, R. L., Christiansen, L. E., Mortensen, Laust Hvas, Albertsen, M., Møller, C. H., Krause, T. G., Rasmussen, M., Michaelsen, T. Y., Voldstedlund, M., Fonager, J., Steenhard, N. & Kirkeby, Carsten, 2021, I: Nature Communications. 12, 8 s., 7251.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Increased transmissibility of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 by age and viral load
Lyngse, Frederik Plesner, Mølbak, Kåre, Skov, R. L., Christiansen, L. E., Mortensen, Laust Hvas, Albertsen, M., Møller, C. H., Krause, Tyra Grove, Rasmussen, M., Michaelsen, T. Y., Voldstedlund, M., Fonager, J., Steenhard, N., Kirkeby, Carsten & Danish Covid-19 Genome Consortium, D. C. G. C., 2021, I: Nature Communications. 12, 8 s., 7251.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 200170995
Flest downloads
-
516
downloads
Association of MAP specific ELISA-responses and productive parameters in 367 Danish dairy farms
Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning
Udgivet -
305
downloads
iCull - a herd-specific tool for financial evaluation of the impact of paratuberculosis
Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
Udgivet -
269
downloads
Models to estimate lactation curves of milk yield and somatic cell count in dairy cows at the herd level for the use in simulations and predictive models
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet