Bent Petersen

Bent Petersen

Lektor


  1. 2021
  2. Afsendt

    A Novel and Direct Metamobilome Approach improves the Detection of Larger-sized Circular Elements across Kingdoms

    Alanin, K. S., Jørgensen, T. S., Browne, P., Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, (Afsendt) I: bioRxiv. 761098.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  3. Udgivet

    An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms

    Alanin, Katrine Wacenius Skov, Jørgensen, T. S., Browne, P. D., Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    SinEx DB 2.0 update 2020: database for eukaryotic single-exon coding sequences

    Jorquera, R., Gonzalez, C., Clausen, P. T. L. C., Petersen, Bent & Holmes, D. S., 2021, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2021, 5 s., baab002.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. 2020
  6. Udgivet

    A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, Bent, Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C., Osório, H., Winkelmann, I., Simakov, O., Rasmussen, Simon, Rahman, M. Z., Pisani, D., Vinther, J., Jarvis, E., Zhang, Guojie, Strugnell, J. M., Castro, L. F. C., Fedrigo, O., Patricio, M., Li, Q., Rocha, S., Antunes, A., Wu, Y., Ma, B., Sanges, R., Vinar, T., Blagoev, B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Nielsen, Rasmus & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition

    Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, Filipe Garrett, Niemann, Jonas, Samaniego Castruita, J. A., Carøe, Christian, Andersen-Ranberg, Emilie Ulrikka, Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, Eske, Skoglund, P., Fredholm, Merete, Wennerberg, S. E., Heide-Jørgensen, M. P., Dietz, R., Sonne, C., Meldgaard, Morten, Dalén, L., Larson, G., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Connecting moss lipid droplets to patchoulol biosynthesis

    Peramuna, A., Bae, H., Quiñonero López, C., Fromberg, A., Petersen, Bent & Simonsen, H. T., 2020, I: PLoS ONE. 15, 12, 19 s., e0243620.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics

    Feng, S., Stiller, Josefin, DENG, Yuan, Armstrong, J., Fang, Qi, Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, Bent, Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, Ashot, Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G., Sinding, Mikkel Holger Strander, Puetz, L., Cavill, Emily Louisa, Ribeiro, Â. M., Eckhart, L., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Brumfield, R. T., Christidis, L., Bertelsen, Mads Frost, Sicheritz-Pontén, Thomas, Tietze, D. T., Robertson, B. C., Song, G., Borgia, G., Claramunt, S., Lovette, I. J., Cowen, S. J., Njoroge, P., Dumbacher, J. P., Ryder, O. A., Fuchs, J., Bunce, M., Burt, D. W., Cracraft, J., Meng, G., Hackett, S. J., Ryan, P. G., Jønsson, Knud Andreas, Jamieson, I. G., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Braun, E. L., Houde, P., Mirarab, S., Suh, A., Hansson, B., Ponnikas, S., Sigeman, H., Stervander, M., Frandsen, P. B., van der Zwan, H., van der Sluis, R., Visser, C., Balakrishnan, C. N., Clark, A. G., Fitzpatrick, J. W., Bowman, R., Chen, N., Cloutier, A., Sackton, T. B., Edwards, S. V., Foote, D. J., Shakya, S. B., Sheldon, F. H., Vignal, A., Soares, A. E. R., Shapiro, B., González-Solís, J., Ferrer-Obiol, J., Rozas, J., Riutort, M., Tigano, A., Friesen, V., Dalén, L., Urrutia, A. O., Székely, T., Liu, Y., Campana, M. G., Corvelo, A., Fleischer, R. C., Rutherford, K. M., Gemmell, N. J., Dussex, N., Mouritsen, H., Thiele, N., Delmore, K., Liedvogel, M., Franke, A., Hoeppner, M. P., Krone, O., Fudickar, A. M., Milá, B., Ketterson, E. D., Fidler, A. E., Friis, G., Parody-Merino, Á. M., Battley, P. F., Cox, M. P., Lima, N. C. B., Prosdocimi, F., Parchman, T. L., Schlinger, B. A., Loiselle, B. A., Blake, J. G., Lim, H. C., Day, L. B., Fuxjager, M. J., Baldwin, M. W., Braun, M. J., Wirthlin, M., Dikow, R. B., Ryder, T. B., Camenisch, G., Keller, L. F., Dacosta, J. M., Hauber, M. E., Louder, M. I. M., Witt, C. C., McGuire, J. A., Mudge, J., Megna, L. C., Carling, M. D., Wang, B., Taylor, S. A., Del-Rio, G., Aleixo, A., Vasconcelos, A. T. R., Mello, C. V., Weir, J. T., Haussler, D., Li, Q., Yang, H., Wang, J., Lei, F., Rahbek, Carsten, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R., Jarvis, E. D., Paten, B. & Zhang, Guojie, 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet

    Gelabert, P., Sandoval-Velasco, Marcela, Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, Ashot, Stiller, Josefin, de-Dios, T., Fang, Qi, Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, Bent, Olsen, R., Navarro, A., DENG, Yuan, Dalén, L., Marquès-Bonet, T., Zhang, Guojie, Antunes, A., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Genomes of Pleistocene Siberian Wolves Uncover Multiple Extinct Wolf Lineages

    Ramos Madrigal, Jazmin, Sinding, M. S., Carøe, Christian, Mak, Sarah Siu Tze, Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Fedorov, S., Kandyba, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Feuerborn, T. R., Pitulko, V. V., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Larson, G., Frantz, L. A. F., Willerslev, Eske, Meldgaard, Morten, Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes, Gilbert, M Thomas P & Gopalakrishnan, Shyam, 2020, I: Current biology : CB. 31, s. 198-206

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    The tuatara genome reveals ancient features of amniote evolution

    Gemmell, N. J., Rutherford, K., Prost, S., Tollis, M., Winter, D., Macey, J. R., Adelson, D. L., Suh, A., Bertozzi, T., Grau, J. H., Organ, C., Gardner, P. P., Muffato, M., Patricio, M., Billis, K., Martin, F. J., Flicek, P., Petersen, Bent, Kang, L., Michalak, P., Buckley, T. R., Wilson, M., Cheng, Y., Miller, H., Schott, R. K., Jordan, M. D., Newcomb, R. D., Arroyo, J. I., Valenzuela, N., Hore, T. A., Renart, J., Peona, V., Peart, C. R., Warmuth, V. M., Zeng, L., Kortschak, R. D., Raison, J. M., Zapata, V. V., Wu, Z., Santesmasses, D., Mariotti, M., Guigo, R., Rupp, S. M., Twort, V. G., Dussex, N., Taylor, H., Abe, H., Bond, D. M., Paterson, J. M., Mulcahy, D. G. & Ngatiwai Trust Board, N. T. B., 2020, I: Nature. 584, s. 403–409, +19 26 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. 2019
  14. Udgivet

    Comparative analyses identify genomic features potentially involved in the evolution of birds-of-paradise

    Prost, S., Armstrong, E. E., Nylander, J., Thomas, G. W. C., Suh, A., Petersen, Bent, Dalen, L., Benz, B. W., Blom, M. P. K., Palkopoulou, E., Ericson, P. G. P. & Irestedt, M., 2019, I: GigaScience. 8, 5, 12 s., giz003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Genomic analyses reveal an absence of contemporary introgressive admixture between fin whales and blue whales, despite known hybrids

    Westbury, M. V., Petersen, Bent & Lorenzen, Eline, 2019, I: PLoS ONE. 14, 9, 13 s., e0222004.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Global monitoring of antimicrobial resistance based on metagenomics analyses of urban sewage

    Hendriksen, R. S., Munk, P., Njage, P., van Bunnik, B., McNally, L., Lukjancenko, O., Röder, T., Nieuwenhuijse, D., Pedersen, S. K., Kjeldgaard, J., Kaas, R. S., Clausen, P. T. L. C., Vogt, Josef Korbinian, Leekitcharoenphon, P., van de Schans, M. G. M., Zuidema, T., de Roda Husman, A. M., Rasmussen, Simon, Petersen, Bent, Bego, A., Rees, C., Cassar, S., Coventry, K., Collignon, P., Allerberger, F., Rahube, T. O., Oliveira, G., Ivanov, I., Vuthy, Y., Sopheak, T., Yost, C. K., Ke, C., Zheng, H., Baisheng, L., Jiao, X., Donado-Godoy, P., Coulibaly, K. J., Jergović, M., Hrenovic, J., Karpíšková, R., Villacis, J. E., Legesse, M., Eguale, T., Heikinheimo, A., Malania, L., Nitsche, A., Brinkmann, A., Saba, C. K. S., Kocsis, B., Solymosi, N., Thorsteinsdottir, T. R., Hatha, A. M., Alebouyeh, M., Morris, D., Cormican, M., O’Connor, L., Moran-Gilad, J., Alba, P., Battisti, A., Shakenova, Z., Kiiyukia, C., Ng’eno, E., Raka, L., Avsejenko, J., Bērziņš, A., Bartkevics, V., Penny, C., Rajandas, H., Parimannan, S., Haber, M. V., Pal, P., Jeunen, G. J., Gemmell, N., Fashae, K., Holmstad, R., Hasan, R., Shakoor, S., Rojas, M. L. Z., Wasyl, D., Bosevska, G., Kochubovski, M., Radu, C., Gassama, A., Radosavljevic, V., Wuertz, S., Zuniga-Montanez, R., Tay, M. Y. F., Gavačová, D., Pastuchova, K., Truska, P., Trkov, M., Esterhuyse, K., Keddy, K., Cerdà-Cuéllar, M., Pathirage, S., Norrgren, L., Örn, S., Larsson, D. G. J., Heijden, T. V. D., Kumburu, H. H., Sanneh, B., Bidjada, P., Njanpop-Lafourcade, B. M., Nikiema-Pessinaba, S. C., Levent, B., Meschke, J. S., Beck, N. K., Van, C. D., Phuc, N. D., Tran, D. M. N., Kwenda, G., Tabo, D. A., Wester, A. L., Cuadros-Orellana, S., Amid, C., Cochrane, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Schmitt, H., Alvarez, J. R. M., Aidara-Kane, A., Pamp, S. J., Lund, O., Hald, T., Woolhouse, M., Koopmans, M. P., Vigre, H., Petersen, T. N. & Aarestrup, F. M., 2019, I: Nature Communications. 10, 1, 12 s., 1124.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    MobiSeq: De novo SNP discovery in model and non-model species through sequencing the flanking region of transposable elements

    Rey de la Iglesia, Alba, Gopalakrishan, S., Carøe, Christian, Alquezar-Planas, D. E., Nielsen, A. A., Röder, T., Pedersen, L. B., Næsborg-Nielsen, C., Sinding, Mikkel Holger Strander, Rath, Martin Fredensborg, Li, Z., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Bunce, M., Mourier, T. & Hansen, Anders Johannes, 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 2, s. 512-525 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Narwhal Genome Reveals Long-Term Low Genetic Diversity despite Current Large Abundance Size

    Westbury, M. V., Petersen, Bent, Garde, E., Heide-Jørgensen, M. P. & Lorenzen, Eline, 2019, I: iScience. 15, s. 592-599

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    NetSurfP-2.0: improved prediction of protein structural features by integrated deep learning

    Klausen, M. S., Jespersen, M. C., Nielsen, H., Jensen, K. K., Jurtz, V. I., Sønderby, C. K., Sommer, M. O. A., Winther, Ole, Nielsen, M., Petersen, Bent & Marcatili, P., 2019, I: Proteins: Structure, Function and Bioinformatics. 87, 6, s. 520-527

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Palaeogenomic insights into the origins of French grapevine diversity

    Ramos Madrigal, Jazmin, Runge, Anne Kathrine Wiborg, Bouby, L., Lacombe, T., Samaniego Castruita, J. A., Adam-Blondon, A., Figueiral, I., Hallavant, C., Schaal, C., Töpfer, R., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., This, P., Bacilieri, R., Gilbert, M Thomas P & Wales, N., 2019, I: Nature Plants. 5, 6, s. 595-603 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    The Genome and mRNA Transcriptome of the Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartia tonsa Dana Improve the Understanding of Copepod Genome Size Evolution

    Jørgensen, T. S., Petersen, Bent, Petersen, H. C. B., Browne, P. D., Prost, S., Stillman, J. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Hansen, B. W., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 5, s. 1440-1450

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The Whole Genome Sequence and mRNA Transcriptome of the Tropical Cyclopoid Copepod Apocyclops royi

    Jorgensen, T. S., Nielsen, B. L. H., Petersen, Bent, Browne, P. D., Hansen, B. W. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2019, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 9, 5, s. 1295-1302

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. 2018
  24. Genome analyses show strong selection on coloration, morphological and behavioral phenotypes in birds-of-paradise

    Prost, S., Armstrong, E. E., Nylander, J., Thomas, G. W. C., Suh, A., Petersen, Bent, Dalen, L., Benz, B. W., Blom, M. P. K., Palkopoulou, E., Ericson, P. G. P. & Irestedt, M., 16 maj 2018, (Accepteret/In press) I: bioRxiv.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    "Out of the Can": A Draft Genome Assembly, Liver Transcriptome, and Nutrigenomics of the European Sardine, Sardina pilchardus

    Machado, A. M., Tørresen, O. K., Kabeya, N., Couto, A., Petersen, Bent, Felicio, M., Campos, P. F., Fonseca, E., Bandarra, N., Lopes-Marques, M., Ferraz, R., Ruivo, R., Fonseca, M. M., Jentoft, S., Monroig, Ó., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Castro, L. F. C., 2018, I: Genes. 9, 10, s. 1-13 485.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Accurate genotyping across variant classes and lengths using variant graphs

    Sibbesen, J. A., Maretty, L., Krogh, Anders, Petersen, Bent, Sibbesen, J. A., Liu, S., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Guo, X., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J. & Brunak, Søren, 2018, I: Nature Genetics. 50, s. 1054-1059 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Antibodies to intercellular adhesion molecule 1-binding Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1-DBLβ are biomarkers of protective immunity to malaria in a cohort of young children from Papua New Guinea

    Tessema, S. K., Utama, D., Chesnokov, O., Hodder, A. N., Lin, C. S., Harrison, G. L. A., Jespersen, Jakob Schmidt, Petersen, Bent, Tavul, L., Siba, P., Kwiatkowski, D., Lavstsen, Thomas, Hansen, D. S., Oleinikov, A. V., Mueller, I. & Barry, A. E., 2018, I: Infection and Immunity. 86, 8, s. 1-14 14 s., e00485-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Benchmarking the HLA typing performance of Polysolver and Optitype in 50 Danish parental trios

    Matey-Hernandez, M. L., Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Brunak, Søren, Izarzugaza, J. M. G., Sørensen, L. M., Petersen, Bent, Sibbesen, J. A., Liu, S., Belling, Kirstine G, Have, C. T., Bork-Jensen, J., Sun, J., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff & Kristiansen, Karsten, 2018, I: BMC Bioinformatics. 19, s. 1-12 239.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Improved de novo genomic assembly for the domestic donkey

    Renaud, Gabriel, Petersen, Bent, Seguin-orlando, A., Bertelsen, Mads Frost, Waller, A., Newton, R., Paillot, R., Bryant, N., Vaudin, M., Librado, P. & Orlando, L., 2018, I: Science Advances. 4, 4, eaaq0392.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 203154234