Bent Petersen

Bent Petersen

Seniorforsker

ORCID: 0000-0002-2472-8317

Udgivelsesår:
Alle
1 - 50 ud af 68Pr. side: 50
Sortering: 1. forfatter
  1. Udgivet

    A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux

    da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, Osório, H., Winkelmann, I., Simakov, O., Rasmussen, Simon, Rahman, M. Z., Pisani, D., Vinther, J., Jarvis, E., KU, thw266, Strugnell, J. M., Castro, L. F. C., Fedrigo, O., Patricio, M., Li, Q., Rocha, S., Antunes, A., Wu, Y., Ma, B., Sanges, R., Vinar, T., Blagoev, B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Nielsen, Rasmus & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    PhageLeads: Rapid Assessment of Phage Therapeutic Suitability Using an Ensemble Machine Learning Approach

    Yukgehnaish, K., Rajandas, Heera, Parimannan, Sivachandran, Manickam, R., Marimuthu, K., Petersen, Bent, Clokie, M. R. J., Millard, A. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2022, I: Viruses. 14, 2, 16 s., 342.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Genomic analyses reveal an absence of contemporary introgressive admixture between fin whales and blue whales, despite known hybrids

    Westbury, Michael Vincent, Petersen, Bent & Lorenzen, Eline, 2019, I: PLoS ONE. 14, 9, 13 s., e0222004.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Narwhal Genome Reveals Long-Term Low Genetic Diversity despite Current Large Abundance Size

    Westbury, Michael Vincent, Petersen, Bent, Garde, E., Heide-Jørgensen, M. P. & Lorenzen, Eline, 2019, I: iScience. 15, s. 592-599

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Genome sequence of Talaromyces atroroseus, which produces red colorants for the food industry

    Thrane, U., Rasmussen, K. B., Petersen, Bent, Rasmussen, Simon, Sicheritz-Pontén, Thomas & Mortensen, U. H., 2017, I: Genome Announcements. 5, 9, 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Antibodies to intercellular adhesion molecule 1-binding Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1-DBLβ are biomarkers of protective immunity to malaria in a cohort of young children from Papua New Guinea

    Tessema, S. K., Utama, D., Chesnokov, O., Hodder, A. N., Lin, C. S., Harrison, G. L. A., Jespersen, Jakob Schmidt, Petersen, Bent, Tavul, L., Siba, P., Kwiatkowski, D., Lavstsen, Thomas, Hansen, D. S., Oleinikov, A. V., Mueller, I. & Barry, A. E., 1 aug. 2018, I: Infection and Immunity. 86, 8, s. 1-14 14 s., e00485-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference

    Sørensen, L. M., Jensen, J. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Villesen, P., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R., Ye, W., Rao, J., Guo, X. & 39 flere, Sun, J., Cao, H., Ye, C., van Beusekom, J., Espeseth, T., Flindt, E., Friborg, R. M., Halager, A. E., Le Hellard, S., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Mailund, T., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, David, Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Bolund, L., Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Gupta, R., Rasmussen, Simon, Besenbacher, S., Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff, Kristiansen, Karsten, Brunak, Søren & Schierup, M. H., 2017, I: Nature. 548, 7665, s. 87-91 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros

    Sánchez-Barreiro, F., Westbury, Binia De Cahsan, Westbury, Michael Vincent, Sun, Xin, Margaryan, Ashot, Fontsere, Claudia, Bruford, M. W., Russo, I. M., Kalthoff, D. C., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Dalén, L., KU, thw266, Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Moodley, Y., 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, 19 s., msad180.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes

    Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G., Gao, R. & 32 flere, Zhou, C., Xie, Y., Huang, Z., Cao, Z., Yan, Z., Ogilvie, H. A., Nakhleh, L., Lindow, Bent Erik Kramer, Morel, B., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, da Fonseca, R. R., Petersen, Bent, Tobias, J. A., Székely, T., Kennedy, J. D., Reeve, A. H., Liker, A., Stervander, M., Antunes, A., Tietze, D. T., Bertelsen, Mads, Lei, F., Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Schierup, M. H., Warnow, T., Braun, E. L., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Mirarab, S. & KU, thw266, 1 apr. 2024, I: Nature.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Analysis of 62 hybrid assembled human Y chromosomes exposes rapid structural changes and high rates of gene conversion

    Skov, L., Schierup, M. H., Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Sørensen, L. M., Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Rasmussen, Simon, Kristiansen, Karsten & Brunak, Søren, 2017, I: PLOS Genetics. 13, 8, s. e1006834

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Complete genome sequence of plant growth-promoting Bacillus stratosphericus AIMST-CREST02 isolated from bulk soil of a paddy field

    Sivaprakasam, S., Khan, N. A. M. A., Fan, T. Y., Kumarasan, Y., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Hata, E. M., Vadamalai, G., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2024, I: Microbiology resource announcements. 13, 4, 3 s., e0113723.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning

    Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Population genomics of grey wolves and wolf-like canids in North America

    Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishan, S., Vieira, Filipe Garrett, Samaniego Castruita, J. A., Raundrup, K., Heide-Jørgensen, M. P., Meldgaard, Morten, Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Mikkelsen, J. B., Marquard-Petersen, U., Dietz, R., Sonne, C., Dalén, L., Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: PLOS Genetics. 14, 11, 23 s., e1007745.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Kouprey (Bos sauveli) genomes unveil polytomic origin of wild Asian Bos

    Sinding, M. S., Ciucani, M. M., Ramos Madrigal, Jazmin, Carmagnini, A., Rasmussen, Jacob Agerbo, Feng, S., Chen, G., Vieira, Filipe Garrett, Mattiangeli, V., Ganjoo, R. K., Larson, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Frantz, L., Gilbert, M Thomas P & Bradley, D. G., 2021, I: iScience. 24, 11, 18 s., 103226.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition

    Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, Fredholm, Merete, Wennerberg, S. E., Heide-Jørgensen, M. P., Dietz, R., Sonne, C., Meldgaard, Morten, Dalén, L., Larson, G., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Accurate genotyping across variant classes and lengths using variant graphs

    Sibbesen, Jonas Andreas, Maretty, L., Krogh, Anders, Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Guo, X., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J. & Brunak, Søren, 2018, I: Nature Genetics. 50, s. 1054-1059 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Prehistoric genomes reveal the genetic foundation and cost of horse domestication

    Schubert, M., Jónsson, H., Chang, D., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Ginolhac, A., Albrechtsen, A., Dupanloup, I., Foucal, A., Petersen, B., Fumagalli, M., Raghavan, M., Seguin-Orlando, A., Korneliussen, T. S., Velazquez, A. M. V., Stenderup, J., Hoover, C. A., Rubin, C-J., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A. & 15 flere, Al-Rasheid, K. A. S., MacHugh, D. E., Kalbfleisch, T., MacLeod, J. N., Rubin, E. M., Sicheritz-Ponten, T., Andersson, L., Hofreiter, M., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, R., Excoffier, L., Willerslev, Eske, Shapiro, B. & Orlando, L. A. A., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. E5661–E5669 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Tracking the origins of Yakutian horses and the genetic basis for their fast adaptation to subarctic environments

    Sanz, P. L., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Schubert, M., Jónsson, H., Albrechtsen, A., Fumagalli, M., Yang, M. A., Gamba, C., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C. D., Petersen, B., Hoover, C. A., Lorente-Galdos, B., Nedoluzhko, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Neuditschko, M., Jagannathan, V., Theves, C. & 20 flere, Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Sicheritz-Pontén, T., Popov, R., Grigoriev, S., Alekseev, A. N., Rubin, E. M., McCue, M., Rieder, S., Leeb, T., Tikhonov, A., Crubézy, E., Slatkin, M., Marques-Bonet, T., Nielsen, R., Willerslev, Eske, Kantanen, J., Prokhortchouk, E. & Orlando, L. A. A., 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 50, s. E6889-E6897 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    MobiSeq: De novo SNP discovery in model and non-model species through sequencing the flanking region of transposable elements

    Rey de la Iglesia, Alba, Gopalakrishan, S., Carøe, C., Alquezar-Planas, D. E., Nielsen, A. A., Röder, T., Pedersen, Lene Bruhn, Næsborg-Nielsen, C., Sinding, Mikkel Holger Strander, Rath, Martin Fredensborg, Li, Z., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Bunce, M., Mourier, T. & Hansen, Anders Johannes, 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 2, s. 512-525 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Improved de novo genomic assembly for the domestic donkey

    Renaud, Gabriel, Petersen, Bent, Seguin-orlando, A., Bertelsen, Mads Frost, Waller, A., Newton, R., Paillot, R., Bryant, N., Vaudin, M., Librado, P. & Orlando, L., 2018, I: Science Advances. 4, 4, eaaq0392.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    The formation of the Indo-Pacific montane avifauna

    Reeve, A. H., Kennedy, J. D., Pujolar, J. M., Petersen, Bent, Blom, M. P. K., Alström, P., Haryoko, T., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Nylander, J. A. A. & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Nature Communications. 14, 15 s., 8215.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Using expected sequence features to improve basecalling accuracy of amplicon pyrosequencing data

    Rask, T. S., Petersen, Bent, Chen, D. S., Day, K. P. & Pedersen, A. G., 22 apr. 2016, I: BMC Bioinformatics. 17, s. 176

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    From Trees to Clouds: PhageClouds for Fast Comparison of ∼640,000 Phage Genomic Sequences and Host-Centric Visualization Using Genomic Network Graphs

    Rangel Piñeros, Guillermo Andres, Millard, A., Michniewski, S., Scanlan, D., Sirén, K., Reyes, A., Petersen, Bent, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 2, 4, s. 194-203

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Palaeogenomic insights into the origins of French grapevine diversity

    Ramos Madrigal, Jazmin, Runge, Anne Kathrine Wiborg, Bouby, L., Lacombe, T., Samaniego Castruita, J. A., Adam-Blondon, A., Figueiral, I., Hallavant, C., Schaal, C., Töpfer, R., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., This, P., Bacilieri, R., Gilbert, M Thomas P & Wales, N., 2019, I: Nature Plants. 5, 6, s. 595-603 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Genomes of Pleistocene Siberian Wolves Uncover Multiple Extinct Wolf Lineages

    Ramos-Madrigal, J., Sinding, M-H. S., Carøe, C., Mak, S. S. T., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Fedorov, S., Kandyba, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Feuerborn, T. R., Pitulko, V. V., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Larson, G., Frantz, L. A. F., Willerslev, E., Meldgaard, M. & 7 flere, Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes, Gilbert, M Thomas P & Gopalakrishnan, Shyam, 2020, I: Current biology : CB. 31, s. 198-206

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Comparative analyses identify genomic features potentially involved in the evolution of birds-of-paradise

    Prost, S., Armstrong, E. E., Nylander, J., Thomas, G. W. C., Suh, A., Petersen, Bent, Dalen, L., Benz, B. W., Blom, M. P. K., Palkopoulou, E., Ericson, P. G. P. & Irestedt, M., 2019, I: GigaScience. 8, 5, 12 s., giz003.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Genome analyses show strong selection on coloration, morphological and behavioral phenotypes in birds-of-paradise

    Prost, S., Armstrong, E. E., Nylander, J., Thomas, G. W. C., Suh, A., Petersen, Bent, Dalen, L., Benz, B. W., Blom, M. P. K., Palkopoulou, E., Ericson, P. G. P. & Irestedt, M., 16 maj 2018, (Accepteret/In press) I: bioRxiv.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. NetTurnP - Neural Network Prediction of Beta-turns by Use of Evolutionary information and predicted Protein Sequence Features

    Petersen, Bent, Lundegaard, C. & Petersen, T. N., 2010, I: PLoS ONE. 5, 11, 9 s., e15079.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    A generic method for assignment of reliability scores applied to solvent accessibility predictions

    Petersen, Bent, Petersen, T. N., Andersen, P., Nielsen, M. & Lundegaard, C., 2009, I: BMC Structural Biology. 9, 10 s., 51.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Connecting moss lipid droplets to patchoulol biosynthesis

    Peramuna, A., Bae, H., Quiñonero López, C., Fromberg, A., Petersen, Bent & Simonsen, H. T., 2020, I: PLoS ONE. 15, 12, 19 s., e0243620.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse

    Orlando, L. A. A., Ginolhac, A., Zhang, G., Froese, D., Albrechtsen, A., Stiller, M., Schubert, M., Cappellini, E., Petersen, B., Moltke, I., Johnson, P. L. F., Fumagalli, M., Mouatt, J. T. V., Raghavan, M., Korneliussen, T. S., Malaspinas, A. S., Vogt, J., Szklarczyk, D. M., Kelstrup, C., Vinther, J. & 36 flere, Dolocan, A., Stenderup, Jesper Tandberg, Velazquez, A. M. V., Cahill, J., Rasmussen, M., Wang, X., Min, J., Zazula, G. D., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C., Magnussen, K., Thompson, J. F., Weinstock, J., Gregersen, K., Røed, K. H., Eisenmann, V., Rubin, C. J., Miller, D. C., Antczak, D. F., Bertelsen, M. F., Brunak, S., Al-Rasheid, K. A. S., Ryder, O., Andersson, L., Mundy, J., Krogh, Anders, Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Sicheritz-Pontén, T., Jensen, Lars Juhl, Olsen, Jesper Velgaard, Hofreiter, M., Nielsen, R., Shapiro, B., Wang, J. & Willerslev, Eske, 4 jul. 2013, I: Nature. 499, 7456, s. 74-78 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    The pangenome of the fungal pathogen Neonectria neomacrospora

    Nielsen, Knud Nor, Sirén, K., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Gilbert, M Thomas P, Korneliussen, Thorfinn Sand & Hansen, Ole Kim, 12 mar. 2021, 30 s. (bioRxiv).

    Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

  33. Udgivet

    Complete Genome Sequence of Salmonella enterica Bacteriophage PRF-SP1

    Mutusamy, P., Jothi, S. J., Lee, S. Y., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Clokie, M. R. J., Loke, S., Millard, A., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2021, I: Microbiology resource announcements. 10, 47, 3 s., e00965-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Phenotypic Characterization and Comparative Genomic Analysis of Novel Salmonella Bacteriophages Isolated from a Tropical Rainforest

    Mutusamy, P., Singh, K. K. B., Yin, L. S., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Clokie, M. R. J., Loke, S., Millard, A., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2023, I: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 15 s., 3678.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Benchmarking the HLA typing performance of Polysolver and Optitype in 50 Danish parental trios

    Matey-Hernandez, M. L., Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Brunak, Søren, Izarzugaza, J. M. G., Sørensen, L. M., Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Sun, J., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff & Kristiansen, Karsten, 2018, I: BMC Bioinformatics. 19, s. 1-12 239.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    Within-host microevolution of Pseudomonas aeruginosa in Italian cystic fibrosis patients

    Marvig, R. L., Dolce, D., Sommer, L. M., Petersen, Bent, Ciofu, Oana, Campana, S., Molin, S., Taccetti, G. & Johansen, Helle Krogh, 19 okt. 2015, I: B M C Microbiology. 15, 13 s., 218.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Comparative performance of the BGISEQ-500 vs Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing

    Mak, Sarah Siu Tze, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Geng, C., Liu, Shanlin, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Zhang, W., Fu, S., Vieira, Filipe Garrett, Germonpré, M., Bocherens, H., Fedorov, S., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Marques-Bonet, T., KU, thw266, Jiang, H. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2017, I: GigaScience. 6, 8, s. 1–13 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    "Out of the Can": A Draft Genome Assembly, Liver Transcriptome, and Nutrigenomics of the European Sardine, Sardina pilchardus

    Machado, A. M., Tørresen, O. K., Kabeya, N., Couto, A., Petersen, Bent, Felicio, M., Campos, P. F., Fonseca, E., Bandarra, N., Lopes-Marques, M., Ferraz, R., Ruivo, R., Fonseca, M. M., Jentoft, S., Monroig, Ó., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Castro, L. F. C., 2018, I: Genes. 9, 10, s. 1-13 485.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Structural Conservation Despite Huge Sequence Diversity Allows EPCR Binding by the PfEMP1 Family Implicated in Severe Childhood Malaria

    Lau, C. K. Y., Turner, Louise, Jespersen, Jakob Schmidt, Lowe, E. D., Petersen, Bent, Wang, Christian William, Petersen, J. E. V., Lusingu, J., Theander, Thor Grundtvig, Lavstsen, Thomas & Higgins, M. K., 14 jan. 2015, I: Cell Host & Microbe. 17, 1, s. 118-29 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    NetSurfP-2.0: improved prediction of protein structural features by integrated deep learning

    Klausen, M. S., Jespersen, M. C., Nielsen, H., Jensen, K. K., Jurtz, V. I., Sønderby, C. K., Sommer, M. O. A., Winther, Ole, Nielsen, M., Petersen, Bent & Marcatili, P., 2019, I: Proteins: Structure, Function and Bioinformatics. 87, 6, s. 520-527

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    The Genome and mRNA Transcriptome of the Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartia tonsa Dana Improve the Understanding of Copepod Genome Size Evolution

    Jørgensen, T. S., Petersen, Bent, Petersen, H. C. B., Browne, Patrick Denis, Prost, S., Stillman, J. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Hansen, B. W., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 5, s. 1440-1450

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Speciation with gene flow in equids despite extensive chromosomal plasticity

    Jónsson, H., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Ginolhac, A., Petersen, L., Fumagalli, M., Albrechtsen, A., Petersen, B., Korneliussen, T. S., Mouatt, J. T. V., Lear, T., Myka, J. L., Lundquist, J., Miller, D. C., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Stagegaard, J., Strauss, G., Bertelsen, M. F. & 6 flere, Sicheritz-Ponten, T., Antczak, D. F., Bailey, E., Nielsen, R., Willerslev, Eske & Orlando, L. A. A., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. 18655–18660 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Improved ontology for eukaryotic single-exon coding sequences in biological databases

    Jorquera, R., González, C., Clausen, P. T. L. C., Petersen, Bent & Holmes, D. S., 2018, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2018, 6 s., bay089.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    SinEx DB 2.0 update 2020: database for eukaryotic single-exon coding sequences

    Jorquera, R., Gonzalez, C., Clausen, P. T. L. C., Petersen, Bent & Holmes, D. S., 2021, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2021, 5 s., baab002.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    The Whole Genome Sequence and mRNA Transcriptome of the Tropical Cyclopoid Copepod Apocyclops royi

    Jorgensen, T. S., Nielsen, B. L. H., Petersen, Bent, Browne, Patrick Denis, Hansen, B. W. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2019, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 9, 5, s. 1295-1302

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Plasmodium falciparum var genes expressed in children with severe malaria encode CIDRα1 domains

    Jespersen, Jakob Schmidt, Wang, Christian William, Mkumbaye, S. I., Minja, D. T., Petersen, Bent, Turner, Louise, Petersen, J. E., Lusingu, J. P., Theander, Thor Grundtvig & Lavstsen, Thomas, 2016, I: EMBO Molecular Medicine. 8, 8, s. 839-850 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population

    Jensen, J. M., Villesen, P., Friborg, R. M., Mailund, T., Besenbacher, S., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R. & 39 flere, Ye, W., Rao, J., Guo, X., Sun, J., Cao, H., Ye, C., Beusekom, J. V., Espeseth, T., Flindt, E., Halager, A. E., Hellard, S. L., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, D., Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, Torben, Bolund, L., Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Gupta, R., Rasmussen, Simon, Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff, Kristiansen, Karsten, Brunak, Søren & Schierup, M. H., sep. 2017, I: Genome Research. 27, 9, s. 1597-1607 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds

    Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, Boussau, B., Bayzid, M. S., Zavidovych, V., Subramanian, S., Gabaldón, T., Capella-Gutiérrez, S., Huerta-Cepas, J., Rekepalli, B., Terkelsen, K. M., Schierup, M. H., Lindow, Bent Erik Kramer, Warren, W. C., Ray, D., Green, R. E., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Li, S., Li, N., Huang, Y., Derryberry, E. P., Bertelsen, Mads Frost, Sheldon, F. H., Brumfield, R. T., Mello, C. V., Lovell, P. V., Wirthlin, M., Schneider, M. P. C., Prosdocimi, F., Samaniego Castruita, J. A., Velazquez, A. M. V., Alfaro Nuñez, L. A., Campos, P., Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Pas, A., Bailey, T., Scofield, P., Bunce, M., Lambert, D. M., Zhou, Q., Perelman, P., Driskell, A. C., Shapiro, B., Xiong, Z., Zeng, Y., Liu, S., Li, Z., Liu, B., Wu, K., Xiao, J., Yinqi, X., Zheng, Q., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Smeds, L., Rheindt, F. E., Braun, M., Fjeldså, Jon, Orlando, L. A. A., Barker, F. K., Jønsson, Knud Andreas, Johnson, W., Koepfli, K. P., O'Brien, S., Haussler, D., Ryder, O. A., Rahbek, Carsten, Willerslev, Eske, Graves, G. R., Glenn, T. C., McCormack, J., Burt, D., Ellegren, H., Alström, P., Edwards, S. V., Stamatakis, A., Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, J., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    NetSurfP-3.0: accurate and fast prediction of protein structural features by protein language models and deep learning

    Høie, M. H., Kiehl, E. N., Petersen, Bent, Nielsen, M., Winther, Ole, Nielsen, H., Hallgren, J. & Marcatili, P., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W510-W515 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Global monitoring of antimicrobial resistance based on metagenomics analyses of urban sewage

    Hendriksen, R. S., Munk, P., Njage, P., van Bunnik, B., McNally, L., Lukjancenko, O., Röder, T., Nieuwenhuijse, D., Pedersen, S. K., Kjeldgaard, J., Kaas, R. S., Clausen, P. T. L. C., Vogt, J. K., Leekitcharoenphon, P., van de Schans, M. G. M., Zuidema, T., de Roda Husman, A. M., Rasmussen, S., Petersen, B., Bego, A. & 108 flere, Rees, C., Cassar, S., Coventry, K., Collignon, P., Allerberger, F., Rahube, T. O., Oliveira, G., Ivanov, I., Vuthy, Y., Sopheak, T., Yost, C. K., Ke, C., Zheng, H., Baisheng, L., Jiao, X., Donado-Godoy, P., Coulibaly, K. J., Jergović, M., Hrenovic, J., Karpíšková, R., Villacis, J. E., Legesse, M., Eguale, T., Heikinheimo, A., Malania, L., Nitsche, A., Brinkmann, A., Saba, C. K. S., Kocsis, B., Solymosi, N., Thorsteinsdottir, T. R., Hatha, A. M., Alebouyeh, M., Morris, D., Cormican, M., O’Connor, L., Moran-Gilad, J., Alba, P., Battisti, A., Shakenova, Z., Kiiyukia, C., Ng’eno, E., Raka, L., Avsejenko, J., Bērziņš, A., Bartkevics, V., Penny, C., Rajandas, H., Parimannan, S., Haber, M. V., Pal, P., Jeunen, G. J., Gemmell, N., Fashae, K., Holmstad, R., Hasan, R., Shakoor, S., Rojas, M. L. Z., Wasyl, D., Bosevska, G., Kochubovski, M., Radu, C., Gassama, A., Radosavljevic, V., Wuertz, S., Zuniga-Montanez, R., Tay, M. Y. F., Gavačová, D., Pastuchova, K., Truska, P., Trkov, M., Esterhuyse, K., Keddy, K., Cerdà-Cuéllar, M., Pathirage, S., Norrgren, L., Örn, S., Larsson, D. G. J., Heijden, T. V. D., Kumburu, H. H., Sanneh, B., Bidjada, P., Njanpop-Lafourcade, B. M., Nikiema-Pessinaba, S. C., Levent, B., Meschke, J. S., Beck, N. K., Van, C. D., Phuc, N. D., Tran, D. M. N., Kwenda, G., Tabo, D. A., Wester, A. L., Cuadros-Orellana, S., Amid, C., Cochrane, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Schmitt, H., Alvarez, J. R. M., Aidara-Kane, A., Pamp, S. J., Lund, O., Hald, T., Woolhouse, M., Koopmans, M. P., Vigre, H., Petersen, T. N. & Aarestrup, F. M., 2019, I: Nature Communications. 10, 1, 12 s., 1124.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 203154234