Bent Petersen

Bent Petersen

Seniorforsker

ORCID: 0000-0002-2472-8317

Udgivelsesår:
Alle
1 - 25 ud af 68Pr. side: 25
Sortering: Udgivelsesår
  1. 2024
  2. Udgivet

    Complete genome sequence of plant growth-promoting Bacillus stratosphericus AIMST-CREST02 isolated from bulk soil of a paddy field

    Sivaprakasam, S., Khan, N. A. M. A., Fan, T. Y., Kumarasan, Y., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Hata, E. M., Vadamalai, G., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2024, I: Microbiology resource announcements. 13, 4, 3 s., e0113723.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes

    Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G., Gao, R. & 32 flere, Zhou, C., Xie, Y., Huang, Z., Cao, Z., Yan, Z., Ogilvie, H. A., Nakhleh, L., Lindow, Bent Erik Kramer, Morel, B., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, da Fonseca, R. R., Petersen, Bent, Tobias, J. A., Székely, T., Kennedy, J. D., Reeve, A. H., Liker, A., Stervander, M., Antunes, A., Tietze, D. T., Bertelsen, Mads, Lei, F., Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Schierup, M. H., Warnow, T., Braun, E. L., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Mirarab, S. & KU, thw266, 1 apr. 2024, I: Nature.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. 2023
  5. Udgivet

    Large haploblocks underlie rapid adaptation in the invasive weed Ambrosia artemisiifolia

    Battlay, P., Wilson, J., Bieker, V. C., Lee, C., Prapas, D., Petersen, Bent, Craig, S., van Boheemen, L., Scalone, R., de Silva, N. P., Sharma, A., Konstantinović, B., Nurkowski, K. A., Rieseberg, L. H., Connallon, T., Martin, M. D. & Hodgins, K. A., 2023, I: Nature Communications. 14, 15 s., 1717.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Population genomics of the island thrush elucidates one of earth's great archipelagic radiations

    Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Evolution Letters. 7, 1, s. 24-36 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Phenotypic Characterization and Comparative Genomic Analysis of Novel Salmonella Bacteriophages Isolated from a Tropical Rainforest

    Mutusamy, P., Singh, K. K. B., Yin, L. S., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Clokie, M. R. J., Loke, S., Millard, A., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2023, I: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 15 s., 3678.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    The formation of the Indo-Pacific montane avifauna

    Reeve, A. H., Kennedy, J. D., Pujolar, J. M., Petersen, Bent, Blom, M. P. K., Alström, P., Haryoko, T., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Nylander, J. A. A. & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Nature Communications. 14, 15 s., 8215.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros

    Sánchez-Barreiro, F., Westbury, Binia De Cahsan, Westbury, Michael Vincent, Sun, Xin, Margaryan, Ashot, Fontsere, Claudia, Bruford, M. W., Russo, I. M., Kalthoff, D. C., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Dalén, L., KU, thw266, Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Moodley, Y., 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, 19 s., msad180.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. 2022
  11. Udgivet

    Uncovering the genomic basis of an extraordinary plant invasion

    Bieker, V. C., Battlay, P., Petersen, B., Sun, X., Wilson, J., Brealey, J. C., Bretagnolle, F., Nurkowski, K., Lee, C., Barreiro, F. S., Owens, G. L., Lee, J. Y., Kellner, F. L., van Boheeman, L., Gopalakrishnan, S., Gaudeul, M., Mueller-Schaerer, H., Lommen, S., Karrer, G., Chauvel, B. & 8 flere, Sun, Y., Kostantinovic, B., Dalén, L., Poczai, P., Rieseberg, L. H., Gilbert, M Thomas P, Hodgins, K. A. & Martin, M. D., 2022, I: Science Advances. 8, 34, 18 s., eabo5115.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin’s giant daisies

    Cerca, J., Petersen, B., Lazaro-Guevara, J. M., Rivera-Colón, A., Birkeland, S., Vizueta, J., Li, S., Li, Q., Loureiro, J., Kosawang, C., Díaz, P. J., Rivas-Torres, G., Fernández-Mazuecos, M., Vargas, P., McCauley, R. A., Petersen, G., Santos-Bay, L., Wales, N., Catchen, J. M., Machado, D. & 9 flere, Nowak, M. D., Suh, A., Sinha, N. R., Nielsen, Lene Rostgaard, Seberg, Ole, Gilbert, M Thomas P, Leebens-Mack, J. H., Rieseberg, L. H. & Martin, M. D., 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3729.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    The population genomic legacy of the second plague pandemic

    Gopalakrishnan, S., Ebenesersdóttir, S. S., Lundstrøm, I. K. C., Turner-Walker, G., Moore, K. H. S., Luisi, P., Margaryan, A., Martin, M. D., Ellegaard, M. R., Magnússon, Ó., Sigurðsson, Á., Snorradóttir, S., Magnúsdóttir, D. N., Laffoon, J. E., van Dorp, L., Liu, X., Moltke, I., Ávila-Arcos, M. C., Schraiber, J. G., Rasmussen, S. & 40 flere, Juan, D., Gelabert, P., de-Dios, T., Fotaki, Anna Katerina, Iraeta Orbegozo, Miren, Vågene, Åshild Joanne, Denham, S. D., Christophersen, A., Stenøien, H. K., Vieira, Filipe Garrett, Liu, Shanlin, Günther, T., Kivisild, T., Moseng, O. G., Skar, B., Cheung, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Wales, N., Schroeder, Hannes, Campos, P. F., Guðmundsdóttir, V. B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Halgunset, J., Gilbert, E., Cavalleri, G. L., Hovig, E., Kockum, I., Olsson, T., Alfredsson, L., Hansen, Thomas Folkmann, Werge, Thomas, Willerslev, Eske, Balloux, F., Marques-Bonet, T., Lalueza-Fox, C., Nielsen, Rasmus, Stefánsson, K., Helgason, A. & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 21, s. 4743-4751.e6

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Population genomics of the island thrush elucidates one of earth’s great archipelagic radiations

    Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2022, bioRxiv, 46 s.

    Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

  15. Udgivet

    NetSurfP-3.0: accurate and fast prediction of protein structural features by protein language models and deep learning

    Høie, M. H., Kiehl, E. N., Petersen, Bent, Nielsen, M., Winther, Ole, Nielsen, H., Hallgren, J. & Marcatili, P., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W510-W515 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    PhageLeads: Rapid Assessment of Phage Therapeutic Suitability Using an Ensemble Machine Learning Approach

    Yukgehnaish, K., Rajandas, Heera, Parimannan, Sivachandran, Manickam, R., Marimuthu, K., Petersen, Bent, Clokie, M. R. J., Millard, A. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2022, I: Viruses. 14, 2, 16 s., 342.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. 2021
  18. Udgivet

    An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms

    Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    The Tetragnatha kauaiensis Genome Sheds Light on the Origins of Genomic Novelty in Spiders

    Cerca, J., Armstrong, E. E., Vizueta Moraga, Joel, Fernández, R., Dimitrov, D., Petersen, Bent, Prost, S., Rozas, J., Petrov, D. & Gillespie, R. G., 2021, I: Genome Biology and Evolution. 13, 12, 17 s., evab262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    SinEx DB 2.0 update 2020: database for eukaryotic single-exon coding sequences

    Jorquera, R., Gonzalez, C., Clausen, P. T. L. C., Petersen, Bent & Holmes, D. S., 2021, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2021, 5 s., baab002.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Complete Genome Sequence of Salmonella enterica Bacteriophage PRF-SP1

    Mutusamy, P., Jothi, S. J., Lee, S. Y., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Clokie, M. R. J., Loke, S., Millard, A., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2021, I: Microbiology resource announcements. 10, 47, 3 s., e00965-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    The pangenome of the fungal pathogen Neonectria neomacrospora

    Nielsen, Knud Nor, Sirén, K., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Gilbert, M Thomas P, Korneliussen, Thorfinn Sand & Hansen, Ole Kim, 12 mar. 2021, 30 s. (bioRxiv).

    Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

  23. Udgivet

    From Trees to Clouds: PhageClouds for Fast Comparison of ∼640,000 Phage Genomic Sequences and Host-Centric Visualization Using Genomic Network Graphs

    Rangel Piñeros, Guillermo Andres, Millard, A., Michniewski, S., Scanlan, D., Sirén, K., Reyes, A., Petersen, Bent, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 2, 4, s. 194-203

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Kouprey (Bos sauveli) genomes unveil polytomic origin of wild Asian Bos

    Sinding, M. S., Ciucani, M. M., Ramos Madrigal, Jazmin, Carmagnini, A., Rasmussen, Jacob Agerbo, Feng, S., Chen, G., Vieira, Filipe Garrett, Mattiangeli, V., Ganjoo, R. K., Larson, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Frantz, L., Gilbert, M Thomas P & Bradley, D. G., 2021, I: iScience. 24, 11, 18 s., 103226.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning

    Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. 2020
  27. Udgivet

    Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics

    Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, Sinding, Mikkel Holger Strander, Puetz, Lara Christine, Cavill, Emily Louisa, Ribeiro, Â. M., Eckhart, L., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Brumfield, R. T., Christidis, L., Bertelsen, Mads Frost, Sicheritz-Pontén, Thomas, Tietze, D. T., Robertson, B. C., Song, G., Borgia, G., Claramunt, S., Lovette, I. J., Cowen, S. J., Njoroge, P., Dumbacher, J. P., Ryder, O. A., Fuchs, J., Bunce, M., Burt, D. W., Cracraft, J., Meng, G., Hackett, S. J., Ryan, P. G., Jønsson, Knud Andreas, Jamieson, I. G., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Braun, E. L., Houde, P., Mirarab, S., Suh, A., Hansson, B., Ponnikas, S., Sigeman, H., Stervander, M., Frandsen, P. B., van der Zwan, H., van der Sluis, R., Visser, C., Balakrishnan, C. N., Clark, A. G., Fitzpatrick, J. W., Bowman, R., Chen, N., Cloutier, A., Sackton, T. B., Edwards, S. V., Foote, D. J., Shakya, S. B., Sheldon, F. H., Vignal, A., Soares, A. E. R., Shapiro, B., González-Solís, J., Ferrer-Obiol, J., Rozas, J., Riutort, M., Tigano, A., Friesen, V., Dalén, L., Urrutia, A. O., Székely, T., Liu, Y., Campana, M. G., Corvelo, A., Fleischer, R. C., Rutherford, K. M., Gemmell, N. J., Dussex, N., Mouritsen, H., Thiele, N., Delmore, K., Liedvogel, M., Franke, A., Hoeppner, M. P., Krone, O., Fudickar, A. M., Milá, B., Ketterson, E. D., Fidler, A. E., Friis, G., Parody-Merino, Á. M., Battley, P. F., Cox, M. P., Lima, N. C. B., Prosdocimi, F., Parchman, T. L., Schlinger, B. A., Loiselle, B. A., Blake, J. G., Lim, H. C., Day, L. B., Fuxjager, M. J., Baldwin, M. W., Braun, M. J., Wirthlin, M., Dikow, R. B., Ryder, T. B., Camenisch, G., Keller, L. F., Dacosta, J. M., Hauber, M. E., Louder, M. I. M., Witt, C. C., McGuire, J. A., Mudge, J., Megna, L. C., Carling, M. D., Wang, B., Taylor, S. A., Del-Rio, G., Aleixo, A., Vasconcelos, A. T. R., Mello, C. V., Weir, J. T., Haussler, D., Li, Q., Yang, H., Wang, J., Lei, F., Rahbek, Carsten, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R., Jarvis, E. D., Paten, B. & KU, thw266, 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet

    Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, Dalén, L., Marquès-Bonet, T., KU, thw266, Antunes, A., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    The tuatara genome reveals ancient features of amniote evolution

    Gemmell, N. J., Rutherford, K., Prost, S., Tollis, M., Winter, D., Macey, J. R., Adelson, D. L., Suh, A., Bertozzi, T., Grau, J. H., Organ, C., Gardner, P. P., Muffato, M., Patricio, M., Billis, K., Martin, F. J., Flicek, P., Petersen, B., Kang, L., Michalak, P. & 31 flere, Buckley, T. R., Wilson, M., Cheng, Y., Miller, H., Schott, R. K., Jordan, M. D., Newcomb, R. D., Arroyo, J. I., Valenzuela, N., Hore, T. A., Renart, J., Peona, V., Peart, C. R., Warmuth, V. M., Zeng, L., Kortschak, R. D., Raison, J. M., Zapata, V. V., Wu, Z., Santesmasses, D., Mariotti, M., Guigo, R., Rupp, S. M., Twort, V. G., Dussex, N., Taylor, H., Abe, H., Bond, D. M., Paterson, J. M., Mulcahy, D. G. & Ngatiwai Trust Board, N. T. B., 2020, I: Nature. 584, s. 403–409, +19 26 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Connecting moss lipid droplets to patchoulol biosynthesis

    Peramuna, A., Bae, H., Quiñonero López, C., Fromberg, A., Petersen, Bent & Simonsen, H. T., 2020, I: PLoS ONE. 15, 12, 19 s., e0243620.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 203154234